Curso OPS- Fundación SABIN. 2013

Achievements and Future Challenges in the Surveillance of Respiratory Viruses

RSV surveillance in Chile

Dr. Luis Fidel Avendaño

lavendan@med.uchile.cl

PROGRAMA de VIROLOGIA. ICBM.

Facultad de Medicina. Universidad de Chile

30 Enero 2013

Conclusiones • La experiencia en Chile muestra que la vigilancia de

RSV es fácil, económica y de gran utilidad.

• La vigilancia debe hacerse todo el año; clínica y de

laboratorio; en 4 niveles de gravedad: ambulatorio,

hospitalizados , UCI, autopsias (centros centinelas).

Debería agregarse “en adultos”.

• La alta transmisibilidad del virus y la variedad de

técnicas de diagnóstico disponibles (IF) son ventajas

• La organización del sistema de salud – aunque no se

disponga de vacunas ni de antivirales – permite reducir

notablemente la letalidad, no así la incidencia del RSV.

Diagnóstico de Infección por VRS

- Diagnóstico clínico y epidemiológico (prensa)

- Inmunodiagnóstico: detección rápida de

antígenos: IF ($), ELISA ($$),

inmunocromatografía ($$)

- Aislamiento en cultivo celular: HEp-2 ($$$$)

- RT-PCR: RLFP, secuenciación ($$$$$$)

- Serología: neutralización, ELISA, IFI; respuesta

celular (LT, citokinas, otras)

Detección de VRS por IFI, aislamiento viral e

inmunocromatografía. Hosp. R. Río, Santiago. Julio 2004

n IFI AISLAM IC 1 IC 2

Muestras 140 66 47% 56 40%

Muestras 130 63 48% 52 40% 74 56%

Muestras 101 49 49% 40 40% 49 49%

Sensibilidad 91 90% 73% 90% 88%

Especificidad 91 93% 98% 74% 93%

Valor Predictivo (+) 91 93% 97% 80% 93%

Valor Predictivo (-) 91 89% 76% 86% 87%

Concordancia total 91 91% 85% 82% 90%

Gold standard (+ verdadero) para 91 muestras: 2 técnicas positivas

IC 1: RSV-1 step ORACHIM

IC 2: RSV Respi – strip, Coris Bio Concept

Yoyo: Cong Microbiol 2004

Hombre y mujer

Ambiente clima, contaminación

Virus

4.600 millones de años

1.000 millones de años 7 millones de años

VIGILANCIA a distintos niveles de población

Infecciones subclínicas:

TRANSMISION VIRAL

Infecciones leves

y moderadas:

consultorios y postas

UCI

Hospital

VRS

7%

0.1%

2 %

Ab5076Pt01

Árbol filogenético de

segmento de 266 nt

de gen G de

VRS A

por NJ

(MEGA) GA2

GA1 GA5

GA5

GA7

GA4

GA6

GA3

SAA1

33 VRS de Chile

250 VRS del mundo

Epidemiología en Area Norte de Santiago

• Se hospitaliza el 2% de los niños menores de 2 años.

“Gravedad dependiente del hospedero”:

• Hospitalización > 10 ds.= 15%

(83% con factores de riesgo clásicos)

• Ingresos a UCI para Ventilación Mecánica= 5.8%

(88% con factores de riesgo clásicos)

• Letalidad por VRS en < 2 años, “previamente sanos” 5/4607 = 0.1% (1988-2002)

Palomino MA, Avendaño LF: Pediatría (Stgo) 2003: 38-47

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ADV VRS FLU PIAvendaño et. al.

2001 20031995 1997 199919921990

1994 1996 1998 2000 2002

1989 2004

VIGILANCIA DE VIRUS RESPIRATORIOS EN LACTANTES

HOSPITALIZADOS POR INFECCION RESPIRATORIA AGUDA BAJA.

Hospital R. Río. Santiago. 1989 - 2004.

Avendaño LF et al. J Clin Microbiol 2003;41:4879-82

RSV Epidemics Shapes. Santiago, 1989-2003.

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J F M A M J J A S O N D

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dete

cti

on

1990

1992

1995

1997

1999

2001

2003

Avendaño et al. J Clin Microbiol 2003; 41: 4879

Determinación de grupos A y B de VRS por IFI

Santiago, Hosp. Roberto del Río. 1994 - 2007

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1994 1996 1998 2000 2002 2004 2006

A

B

Indet

%

Circulan A y B; predominio de A; aumento de B en años pares

Palomino et al. Rev Chil Pediatr 2004; 75: S 18- S 24

Correlación entre diagnóstico microscópico y detección

viral en 66 autopsias de niños fallecidos por neumonía.

Santiago , 1998-2011

AUTOPSIAS Casos Virus

Diagn. Microscópico Nº VRS ADV MPV FLU PI NEG

Neumonía por VRS 13 13 7 2 0 2 0

Neumonía por ADV 11 2 11 0 1 0 0

Neumonía tipo viral 12 5 3 0 1 2 3

Neumonía bacteriana 16 1 4 1 0 1 10

Neumonía mixta 14 1 4 1 0 1 10

Total 66 22 29 4 2 6 17

Virus detectado 74% NO = 26%

Detección de Virus y Bacterias en 356 ADULTOS con

Neumonía Adquirida en la Comunidad. Santiago, 2005-2007.

Casos estudiados (-) 124 35%

(+) 232 65%

Bacterias clásicas 98 27.5 %

S. pneumoniae 75 21.1 %

H. influenzae 3 0.8 %

Otros 20 5.6%

Bacterias atípicas 73 20.5 %

M. pneumoniae 32 9.0 %

Chlamydia sp 28 7.9 %

Legionella sp. 13 5.0 %

Virus 140 39.3 %

Sólo virus: 80 (22%)

Sólo bacterias: 92 (26%)

Mixtas: 60 (17%)

Picornavirus 41 11.5 % RT-PCR

Influenza 27 7.6 %

VRS 48 13.5 % RT-PCR

Metapneumovirus 41 11.5 % RT-PCR

Coronavirus 20 5.6 % RT-PCR

ADV 3 0,8%

CAMPAÑAS DE INVIERNO en Chile (desde 1994):

disminuir muertes por infecciones respiratorias

Se inicia la VACUNACION CONTRA INFLUENZA

NIVEL AMBULATORIO

- Educar al público (prensa, TV) para consulta precoz

(síntomas y población de riesgo)

- Extensión horaria de atención en consultorios ambulatorios

NIVEL HOSPITALARIO

1. Diagnóstico rápido (IF) permanente de virus respiratorios

2. Aumento de personal y dotación de camas en todo el país

- se postergan cirugías para reconvertir camas

- intercambio público privado

3. Disponibilidad de O2 y de ventiladores mecánicos

-

Girardi G. et al. Rev Chil Pediatr 2001; 73: 292-300.

760

45

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200

300

400

500

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700

800

1990 2007

N°

falle

cid

os

Dr. P Astudillo, 2008

Conclusiones • La experiencia en Chile muestra que la vigilancia de

RSV es fácil, económica y de gran utilidad.

• La vigilancia debe hacerse todo el año; clínica y de

laboratorio; en 4 niveles de gravedad: ambulatorio,

hospitalizados , UCI, autopsias (centros centinelas).

Debería agregarse “en adultos”.

• La alta transmisibilidad del virus y la variedad de

técnicas de diagnóstico disponibles (IF) son ventajas

• La organización del sistema de salud – aunque no se

disponga de vacunas ni de antivirales – permite reducir

notablemente la letalidad, no así la incidencia del RSV.

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n° egresos

nº consultas

tº media

Agua caida

Año 2002

Avendaño et al. Rev Méd Chile 2003;131: 902.

TEMPERATURA Y LLUVIAS

Relación entre hospitalizaciones y consultas

por IRAB y contaminación aérea. Santiago, Chile. 2002.

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Alerta o

pre-emergencia

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Año 2002

Avendaño et al. Rev Méd Chile 2003;131: 902.

IMPACTO DEL VRS