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Curso OPS- Fundación SABIN. 2013
Achievements and Future Challenges in the Surveillance of Respiratory Viruses
RSV surveillance in Chile
Dr. Luis Fidel Avendaño
PROGRAMA de VIROLOGIA. ICBM.
Facultad de Medicina. Universidad de Chile
30 Enero 2013
Conclusiones • La experiencia en Chile muestra que la vigilancia de
RSV es fácil, económica y de gran utilidad.
• La vigilancia debe hacerse todo el año; clínica y de
laboratorio; en 4 niveles de gravedad: ambulatorio,
hospitalizados , UCI, autopsias (centros centinelas).
Debería agregarse “en adultos”.
• La alta transmisibilidad del virus y la variedad de
técnicas de diagnóstico disponibles (IF) son ventajas
• La organización del sistema de salud – aunque no se
disponga de vacunas ni de antivirales – permite reducir
notablemente la letalidad, no así la incidencia del RSV.
Diagnóstico de Infección por VRS
- Diagnóstico clínico y epidemiológico (prensa)
- Inmunodiagnóstico: detección rápida de
antígenos: IF ($), ELISA ($$),
inmunocromatografía ($$)
- Aislamiento en cultivo celular: HEp-2 ($$$$)
- RT-PCR: RLFP, secuenciación ($$$$$$)
- Serología: neutralización, ELISA, IFI; respuesta
celular (LT, citokinas, otras)
Detección de VRS por IFI, aislamiento viral e
inmunocromatografía. Hosp. R. Río, Santiago. Julio 2004
n IFI AISLAM IC 1 IC 2
Muestras 140 66 47% 56 40%
Muestras 130 63 48% 52 40% 74 56%
Muestras 101 49 49% 40 40% 49 49%
Sensibilidad 91 90% 73% 90% 88%
Especificidad 91 93% 98% 74% 93%
Valor Predictivo (+) 91 93% 97% 80% 93%
Valor Predictivo (-) 91 89% 76% 86% 87%
Concordancia total 91 91% 85% 82% 90%
Gold standard (+ verdadero) para 91 muestras: 2 técnicas positivas
IC 1: RSV-1 step ORACHIM
IC 2: RSV Respi – strip, Coris Bio Concept
Yoyo: Cong Microbiol 2004
Hombre y mujer
Ambiente clima, contaminación
Virus
4.600 millones de años
1.000 millones de años 7 millones de años
VIGILANCIA a distintos niveles de población
Infecciones subclínicas:
TRANSMISION VIRAL
Infecciones leves
y moderadas:
consultorios y postas
UCI
Hospital
VRS
7%
0.1%
2 %
Ab5076Pt01
Árbol filogenético de
segmento de 266 nt
de gen G de
VRS A
por NJ
(MEGA) GA2
GA1 GA5
GA5
GA7
GA4
GA6
GA3
SAA1
33 VRS de Chile
250 VRS del mundo
Epidemiología en Area Norte de Santiago
• Se hospitaliza el 2% de los niños menores de 2 años.
“Gravedad dependiente del hospedero”:
• Hospitalización > 10 ds.= 15%
(83% con factores de riesgo clásicos)
• Ingresos a UCI para Ventilación Mecánica= 5.8%
(88% con factores de riesgo clásicos)
• Letalidad por VRS en < 2 años, “previamente sanos” 5/4607 = 0.1% (1988-2002)
Palomino MA, Avendaño LF: Pediatría (Stgo) 2003: 38-47
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ADV VRS FLU PIAvendaño et. al.
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VIGILANCIA DE VIRUS RESPIRATORIOS EN LACTANTES
HOSPITALIZADOS POR INFECCION RESPIRATORIA AGUDA BAJA.
Hospital R. Río. Santiago. 1989 - 2004.
Avendaño LF et al. J Clin Microbiol 2003;41:4879-82
RSV Epidemics Shapes. Santiago, 1989-2003.
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2003
Avendaño et al. J Clin Microbiol 2003; 41: 4879
Determinación de grupos A y B de VRS por IFI
Santiago, Hosp. Roberto del Río. 1994 - 2007
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A
B
Indet
%
Circulan A y B; predominio de A; aumento de B en años pares
Palomino et al. Rev Chil Pediatr 2004; 75: S 18- S 24
Correlación entre diagnóstico microscópico y detección
viral en 66 autopsias de niños fallecidos por neumonía.
Santiago , 1998-2011
AUTOPSIAS Casos Virus
Diagn. Microscópico Nº VRS ADV MPV FLU PI NEG
Neumonía por VRS 13 13 7 2 0 2 0
Neumonía por ADV 11 2 11 0 1 0 0
Neumonía tipo viral 12 5 3 0 1 2 3
Neumonía bacteriana 16 1 4 1 0 1 10
Neumonía mixta 14 1 4 1 0 1 10
Total 66 22 29 4 2 6 17
Virus detectado 74% NO = 26%
Detección de Virus y Bacterias en 356 ADULTOS con
Neumonía Adquirida en la Comunidad. Santiago, 2005-2007.
Casos estudiados (-) 124 35%
(+) 232 65%
Bacterias clásicas 98 27.5 %
S. pneumoniae 75 21.1 %
H. influenzae 3 0.8 %
Otros 20 5.6%
Bacterias atípicas 73 20.5 %
M. pneumoniae 32 9.0 %
Chlamydia sp 28 7.9 %
Legionella sp. 13 5.0 %
Virus 140 39.3 %
Sólo virus: 80 (22%)
Sólo bacterias: 92 (26%)
Mixtas: 60 (17%)
Picornavirus 41 11.5 % RT-PCR
Influenza 27 7.6 %
VRS 48 13.5 % RT-PCR
Metapneumovirus 41 11.5 % RT-PCR
Coronavirus 20 5.6 % RT-PCR
ADV 3 0,8%
CAMPAÑAS DE INVIERNO en Chile (desde 1994):
disminuir muertes por infecciones respiratorias
Se inicia la VACUNACION CONTRA INFLUENZA
NIVEL AMBULATORIO
- Educar al público (prensa, TV) para consulta precoz
(síntomas y población de riesgo)
- Extensión horaria de atención en consultorios ambulatorios
NIVEL HOSPITALARIO
1. Diagnóstico rápido (IF) permanente de virus respiratorios
2. Aumento de personal y dotación de camas en todo el país
- se postergan cirugías para reconvertir camas
- intercambio público privado
3. Disponibilidad de O2 y de ventiladores mecánicos
-
Girardi G. et al. Rev Chil Pediatr 2001; 73: 292-300.
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Dr. P Astudillo, 2008
Conclusiones • La experiencia en Chile muestra que la vigilancia de
RSV es fácil, económica y de gran utilidad.
• La vigilancia debe hacerse todo el año; clínica y de
laboratorio; en 4 niveles de gravedad: ambulatorio,
hospitalizados , UCI, autopsias (centros centinelas).
Debería agregarse “en adultos”.
• La alta transmisibilidad del virus y la variedad de
técnicas de diagnóstico disponibles (IF) son ventajas
• La organización del sistema de salud – aunque no se
disponga de vacunas ni de antivirales – permite reducir
notablemente la letalidad, no así la incidencia del RSV.
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Año 2002
Avendaño et al. Rev Méd Chile 2003;131: 902.
TEMPERATURA Y LLUVIAS
Relación entre hospitalizaciones y consultas
por IRAB y contaminación aérea. Santiago, Chile. 2002.
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Avendaño et al. Rev Méd Chile 2003;131: 902.
IMPACTO DEL VRS