Dorothy Crawfoot Hodgkin (1910 – 1994) · 2010. 7. 8. · R = Me (Methylcobalamin)...

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Dorothy Crawfoot Hodgkin (1910 – 1994)

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Dorothy Crawfoot Hodgkin(1910 – 1994)

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R = 5‘‐Desoxyadenosyl (Coenzym B12)R = CN (Cyanocobalamin: Vitamin B ) l k l k dR = CN  (Cyanocobalamin: Vitamin B12)R = Me (Methylcobalamin)

Molekülstruktur des Coenzym B12(P. G. Lenhert, 1968)

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Porphyrin16‐gliedrigzweibasig

Corrin15‐gliedrigeinbasigzweibasig einbasig

planarmit kleinen Metallionen

Sattelkonformationh l l hmit kleinen Metallionen chirale Zentren möglich

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EPR‐Spektroskopie

axiales Spektrum59Co: 100 %, I = 7/2Oktett durch H f i k lHyperfeinkopplung

CoN N

N N

N N

N

14N: 99.63 %, I = 1Triplett durch Superhyperfeinkopplungein einzelnes Stickstoffatom als Kopplungspartner 

J. Rétey et al., Angew. Chem. 1998, 110, 643.

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Frage: base‐on/base‐off ‐Form

15N: I = 1/2Dublett durch 

J. Rétey et al., Angew. Chem. 1998, 110, 643.

Superhyperfeinkopplung

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B12‐Bindungsdomäne der Methionin‐Synthase mit Methylcobalamin‐Funktion12 g y y

Substitution des Benzimidazols am Cobalt,separate Fixierung desOHN

N

Imidazol‐N‐Koordination  in apicaler Position durch Histidin aus dem Protein:Verbindung Coenzym + Apoenzym

separate Fixierung des Benzimidazol‐Zuckerphosphatresteszwischen –Helices und ‐Faltblättern

H: Histidin

CH2

NH

CC NH

H

HN

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Methylgruppe am Cobalt

hydrophober Deckel:NH

C C

HN

O

H

y g pp

Abschirmung der Methylgruppe gegen das Lösungsmittel

F: Phenylalanin

CH2

Ph

O

Acetamid‐Seitengruppen in H‐Brückenbindungsposition 

F: Phenylalanin

zur Protein‐Rückgrat

OC

O

O

- OHCH2NH

CC

CH2

OH

C O

HNC

C NH

H

S: SerinD: Aspartat

HN

Fixierung von Helix Faltblatt in Domäne II

M. L. Ludwig et al., Science 1994, 266,1669.

Fixierung von ‐Helix‐‐Faltblatt in Domäne II„Festkneifen“ des Phosphatzuckerrests

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Phosphatzucker‐Einheitpassend zwischenN C C

HNH

passend zwischen Glycinreste„gesteckt“

G: Glycin

H

NH

C CO

H‐Brücken‐Wechselwirkung HNH

gzwischen Serin und dem N3‐Atom des Benzimidazol‐Derivats, (genau dieses N‐Atom koordiniert 

CH2

OH

NH

C CO

(gim Coenzym an das Cobalt) S: Serin

M. L. Ludwig et al., Science 1994, 266,1669.

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Modellverbindungen 

Supernukleophil Co(I) wenig beständig

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Thermodynamik und Kinetik

Radikalfänger

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R. G. Finke, B. P. Hay, Inorg. Chem. 1984, 23, 3034.

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G‡exp (37°C) = 29.7 kcal/mol k1 ≈ 10–7 s–1

Enzym: Cofaktor + Apoenzym 

k 102 –1 G‡ (37°C) 15 k l/ l

R. G. Finke, B. P. Hay, Inorg. Chem. 1984, 23, 3034.

k1 ≈ 102 s–1 G‡exp (37°C) ≈ 15 kcal/mol

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Sterische Steuerung der Co‐C‐Bindungsstärke in Cobaloximen