GG ACGCCGGG TTATTAACTTCCAomslag publieksboek-2.indd 1 12/15/08 7:18:24 PM

DNA etceteraallesoverDNA

Redactie Jop de Vrieze, Kristy van Lammeren & Frans van Dam

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

4

aL

Le

so

Ve

rD

na

BeeldmateriaalFotolia (bladzijden 15, 21, 26, 27, 93)123rf (bladzijden 17, 29, 30, 32, 37, 38, 40, 41, 43, 50, 51, 54, 57, 58 (rechts) 61, 63, 67, 70, 79, 81, 91, 92, 107, 111, 113, 114)Getty Images (bladzijde 11)Dick van aalst (bladzijde 82) the Venter Institute (bladzijde 94)De overige foto’s zijn aangeleverd door de auteur van het betreffende artikel of door de geïnterviewde onderzoeker.

Lijst van auteursDit boek bestaat uit bewerkingen van artikelen van de volgende auteurs.

tom arendsIngrid BaartMarije Blomjous Piet Boonekamparnaud BovyFrans van DamCarla van elFrancine GoversBerend HarmsenBram de JongeLinda KrijgsmanKristy van Lammerenedith Lammerts-van Buerenedwin nuijtenMarjan slobannelies speksnijderandrea thieleroald Verhoeff

aeneas Verropoulosandré VranckenLeonie WaandersHub Zwart

De algemene inleiding, de inleidingen op de thema’s en de tekst op de achterzijde zijn geschreven door Jop de Vrieze.

VoorwoordDna, genen, biotechnologie, genomics of genetisch veranderde gewassen. sla een krant open en je vindt hierover wel ergens een bericht. CsI – DNA does not lie! - is bijna elke avond op tV en in een beetje sF-film lopen genetisch aangepaste wezens rond.

Maar wat betekent ‘Dna’ of ‘gen’ nou eigenlijk? Wat voor Dna-onderzoek wordt er gedaan? Wie wordt er straks beter van en wie heeft last van de nadelen? Worden we straks allemaal ‘patiënt’ voordat we ziek zijn, omdat we weten dat we extra kans maken op ziekte x of y? Het Dna-onderzoek is in een enorme stroomversnelling terecht gekomen. onderzoekers bekijken tegenwoordig duizenden genen tegelijk.

tegelijkertijd spelen er ook maatschappelijke kwesties. Is het wel zo prettig om alles te willen weten? Van wie zijn genen nou eigenlijk? Wie heeft toegang tot een Dna-databank?

Deze en vele andere zaken kun je vinden op www.allesoverDna.nl, een website die sinds maart 2005 online is. Deze site is er ook voor scholieren, die er lesmateriaal en opdrachten kunnen vinden. Docenten kunnen er een reizend Dna-lab bestellen dat de klas een bezoek brengt.

Dit boek bevat een greep uit (bewerkte) artikelen van www.allesoverDna.nl. als bron van verwondering of stof tot nadenken.

Frans van Dam & Kristy van LammerenCentre for society and Genomics

aL

Le

so

Ve

rD

na

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

5

DNA: code in 4 letters 6

Het DNA ontrafeld 9 De strijd om het menselijk Dna 10apen krijgen geen aIDs 14Dna sequencen: een gevecht tegen de getallen 18Bouwstenen in 3D 22

Beter, sneller, knappers 25Mooier en slimmer met genomics 26smaak zit in de genen én tussen de oren 28Is dik-zijn genetisch bepaald? 31

De mens op het spoor 35Boeven vangen met Dna 36Dna geeft hints over uiterlijk 39Vanuit afrika de wijde wereld in 42nieuwsgierig naar Dna 44

Inhoudsopgave

Foutje bedankt 49Kankergenen opsporen 50Dna-reparatie in de strijd tegen kanker 53De wereld veroverd met een Dna-chip 56rekenen aan darmkanker 59Genen repareren 62

Koppie koppie 65Depressief, en nog hoofdpijn ook 66Genen en de zieke geest 69eiwit de mist in 72

Elk wat wils 77Medicijn op maat 78Dna testen via het internet 80een pleister van rna 84

Ecologisch verantwoord 89autorijden op landbouwafval en olifantenpoep 90Miljoen nieuwe genen in zeewater 92Plantaardige vampiers 95

Hap slik weg 99De aardappel: volksvoedsel en zorgenkindje 100Past genomics in biologische veredeling? 103Droge rijst voor afrikanen 106

Wereldwijd 109Microsoldaten sporen landmijnen op 110 Van wie is dat gen nou eigenlijk 112

aL

Le

so

Ve

rD

na

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

7

8

aL

Le

so

Ve

rD

na

al in 1869 werd Dna ontdekt. toen de Zwitserse biochemicus Johann Friedrich Miescher de stof uit witte bloedcellen isoleerde, werd zijn bevinding echter nog niet op waarde geschat. In de jaren die volgden ontstond het idee dat het molecuul bestond uit vier eiwitgroepen, nucleotiden genoemd, verbonden met een nucleïnezuur.

Dit bleek niet het geval. In 1953 werd de chemische structuur van desoxyribonucleïnezuur, want zo heet de stof eigenlijk, opgehelderd door James D. Watson, Francis Crick, Maurice Wilkins en rosalind Franklin. een jaar eerder hadden alfred Hershey en Martha Chase bewezen dat Dna de drager van erfelijke eigenschap-pen is. op basis van deze ontdekkingen stelde Crick vast dat eiwitten worden geproduceerd uit genen, Dna dus, en niet andersom. Met andere woorden: Dna is de basis.

DNAeen Dna-molecuul bestaat uit twee lange strengen die om elkaar heen gedraaid zijn en precies in elkaar pas-sen. Deze vorm wordt een dubbele helix genoemd. een Dna-streng is opgebouwd uit vier verschillende nucleo-tiden, namelijk adenine (a), thymine (t), Cytosine (C) en Guanine (G). Met de letters atCG wordt de taal van het Dna geschreven. De twee Dna strengen zijn als een soort ritssluiting met elkaar verbonden, waarbij een a altijd gekoppeld is aan een tegenoverliggende t en een C altijd aan een G.

DNA: code van 4 letters

Dn

a:

Co

De

Va

n 4

Le

tt

er

s

9

aL

Le

so

Ve

rD

na

In de vijftig jaren die volgden beleefde Dna-onderzoek een stormachtige periode. nadat in 1975 Frederick sanger een methode om de nucleotidenvolgorde van Dna te bepalen had ontwikkeld, was in 2001 het grote moment daar: de sequentie van het menselijk genoom was bekend!

Hiermee brak het genomics tijdperk aan. niet alleen de genen van de mens werden in kaart gebracht, ook planten, dieren en micro-organismen moesten er aan geloven. Dit leverde een berg aan kennis op. steeds beter weten we te doorgronden hoe organismen ontstaan, wat hen uniek maakt en hoe we gebruik van hen kunnen maken. Dna blijkt niet allesbepalend te zijn voor hoe organismen eruit zien. niet één gen, maar de samenhang van meerdere genen maakt ons tot wie wij zijn.

al deze nieuwe inzichten leidden ook tot discussies: in hoeverre mogen wij als mensheid de natuur naar onze hand zetten? Wat zouden de gevolgen kunnen zijn als onze experimenten mislopen? niet voor niets hebben wetenschappers die zich met genomics bezighouden altijd nadrukkelijk contact gezocht met de maatschap-pij. Het is duidelijk dat genomics-onderzoek inzicht en mogelijkheden biedt, waardoor we onszelf steeds een klein beetje beter begrijpen, en steeds iets beter voor onszelf kunnen zorgen.

Wat is genomics?Genomics is de nieuwe term voor grootschalig onderzoek naar erfelijkheid en de genen. De term ‘genomics’ is afgeleid van het woord ‘genoom’ (het totaal van genen in een organisme). Genomics-onderzoek kan betrekking hebben op genen van mens, dier, plant en micro-organismen.

Dn

a:

Co

De

Va

n 4

Le

tt

er

s

GC

ATCDe laatste jaren is de kennis die voortkwam uit het genomics-onderzoek in rap tempo vergroot. Cruciaal hierbij was de ontwikkeling van nieuwe technologieën. aan die ontwikkeling is nog geen einde gekomen. Grofweg heeft de technologie op twee manieren verbetering gebracht: onderzoekers kunnen steeds meer inzoomen, en steeds sneller grote hoeveelheden gegevens analyseren. Zonder hulp van de huidige krachtige computers had de wetenschap nu nog maar heel weinig over ons genoom geweten, en zonder bijvoorbeeld 3D-technieken hadden onderzoekers nooit kunnen bestuderen hoe eiwitten aan elkaar binden.Dankzij deze technieken weten we nu beter wat onze plaats is in het dierenrijk, en waarin we verschillen van of juist lijken op andere organismen.

Het DNA ontrafeld

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

12

aL

Le

so

Ve

rD

na

Het Human Genome Project mondde uit in een verwoede strijd tussen twee Amerikaanse onderzoeksconsortia.Het bleek dat het menselijk genoom geen 100.000 maar 22.500 genen bevat.Van het projectbudget werd 3-5% besteed aan ethisch onderzoek.

De strijd om het menselijk DNAHet was één van de meest grootschalige onderzoeksprogramma’s ooit, met een looptijd van veertien jaar en een budget van drie miljard dollar: het Human Genome Project. In 2003 – sneller dan voorzien – werd dit project voltooid. Doelstelling van dit megaproject was het menselijk genoom in kaart te brengen.De wetenschappelijke betekenis van het Human Genome Project is moeilijk te overschatten: de resultaten ervan vormen de basis voor het hedendaagse genomics-onderzoek bij de mens. Het Human Genome Project is echter om meer dan alleen wetenschappelijke redenen inte-ressant. Ook in andere opzichten hebben we er veel van geleerd.

GENOOmOORLOG

In de eerste plaats hebben we veel geleerd van de manier waarop het project werd georganiseerd. De Dna-volgorde van de mens vormde de inzet van een ware genoomoorlog, een Genome War, die vooral in de Verenigde staten werd uitgevochten. In 1998 mengde zich naast het National Human Genome

Research Institute onder leiding van Francis Collins ook Celera Genomics onder leiding van Craig Venter in de strijd. Deze oorlog was meer dan een competitie tussen twee concurrerende onderzoeksgroepen. Het was een strijd tussen twee stijlen van onderzoek. Bij Collins lag de nadruk op volledigheid, bij Venter op snelheid.

Craig Venter stelde dat zijn manier van werken veel sneller en goedkoper was, maar critici hadden veel wetenschappelijke bezwaren tegen zijn methode. De groep onder leiding van Francis Collins koos voor een meer traditionele werkwijze. Zijn onderzoek werd gefinancierd met overheidsgeld. De strijd spitste zich toe op de betrouwbaarheid van de gevonden Dna-volgorden. De onderzoeksresultaten van Collins’ groep werden direct openbaar. De groep onder leiding van Craig Venter daarentegen hield de resulaten een half jaar geheim. De groepen verschilden sterk van mening over de vraag of alle gevonden genen gepatenteerd konden en moesten worden. op 26 Juni 2000 kondig-

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

13

aL

Le

so

Ve

rD

na

den Collins en Venter echter gezamenlijk in aanwezig-heid van president Clinton de spoedige afronding van hun inspanningen aan. Het menselijk genoom was zo goed als in kaart gebracht.

SAmENSPEL

al snel werd duidelijk dat het Human Genome Project om nog andere redenen interessant was. Bij de start van het project schatten betrokken deskundigen het aantal genen van het menselijk genoom op ongeveer 100.000. Medio 2000 was dit getal al bijgesteld tot 40.000 of zelfs tot 36.000. en nu is duidelijk dat het

Geneneen gen is een bepaalde Dna-volgorde die codeert voor één of meerdere specifieke eiwitten. Het gen bevat informatie over hoe het bewuste eiwit wordt opgebouwd. Deze eiwitten kunnen een erfelijke eigenschap tot uiting brengen, zoals bloedgroep of oogkleur.

Genen komen in lichaamscellen in paren voor, één afkomstig van de vader en één van de moeder. De twee genen van een genenpaar bevatten informatie voor dezelfde erfelijke eigenschap. Genen komen in verschillende verschijningsvormen voor. Zo’n verschijningsvorm wordt een allel genoemd. De informatie op de twee allelen kan gelijk (homozygoot) of ongelijk (heterozygoot) zijn.

Het Dna van de genen wordt in de celkern afgelezen en vertaald in een rna-molecuul. Het mrna beweegt zich vervolgens naar de ribosomen buiten de celkern die de in-formatie vertalen naar de bijbehorende eiwitten.

Craig Venter (links) en Francis

Collins op de cover van Time

magazine van juli 2000

Het Human Genome Project mondde uit in een verwoede strijd tussen twee Amerikaanse onderzoeksconsortia.Het bleek dat het menselijk genoom geen 100.000 maar 22.500 genen bevat.Van het projectbudget werd 3-5% besteed aan ethisch onderzoek.

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

14

aL

Le

so

Ve

rD

na

menselijk genoom ongeveer 22.500 genen bevat. Dat onverwacht kleine aantal heeft een belangrijke betekenis voor ons inzicht in de relatie tussen genen en eigenschappen, en uiteindelijk voor ons mensbeeld.onderzoekers hebben lang gedacht dat er sprake zou zijn van één-op-één relaties tussen genen en eigen-schappen van organismen. Men dacht dat door een enkel gen wordt bepaald of we blauwe ogen hebben dan wel drager zijn van een genetisch defect. Het Human Genome Project maakt voorgoed duidelijk dat dit doorgaans te eenvoudig is. De meeste eigenschap-

pen van mensen worden niet door één enkel gen bepaald maar zijn multifactorieel; dat wil zeggen dat ze het gevolg zijn van een complex samenspel tussen meerdere genen, in combinatie met omgevingsfactoren zoals leefstijl en milieu. Dit geldt niet alleen voor de meeste ziekten en gezondheidsproblemen, maar ook voor eigenschappen, zoals intelligentie en muzikaliteit. omgekeerd zijn genen bij meer dan één eigenschap betrokken.

De bekende paleontoloog stephen Jay Gould heeft terecht opgemerkt dat het geringe aantal genen ons voorgoed van het genetisch determinisme heeft ver-lost. Beter dan voorheen beseffen we de complexiteit van het leven en van de mens in het bijzonder. ons lot bevindt zich niet zonder meer in onze genen. Het genoom is geen blauwdruk.

mAAtScHAPPELIjK ONDERzOEK

er was nog iets dat het Human Genome Project baanbrekend maakte. al in 1989 stelde de toenma-lige directeur James Watson voor om een bepaald percentage (tussen de 3 en de 5%) van het budget te reserveren voor onderzoek naar de ethische en maat-schappelijke aspecten van genomics (Ethical, Legal and Societal Issues, oftewel ELSI-onderzoek). Dit vormde het begin van een ontwikkeling die sindsdien bekend staat als elsificatie. Grote bètaonderzoeksprogramma’s reserveren een deel van hun budget (meestal 5%) voor maatschappelijk onderzoek. Dit heeft geleid tot Genenkaart

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

15

aL

Le

so

Ve

rD

na

intensievere samenwerkingen tussen genomics-on-derzoekers en sociale wetenschappers. Hierdoor kan men al in een vroeg stadium meer inzicht krijgen in de maatschappelijke betekenis van genomics-onderzoek en in de dynamiek van wetenschappelijke en technolo-gische vernieuwing, in interactie met de maatschappij. omgekeerd krijgt door deze samenwerking de samen-leving meer te zeggen in de sturing van het genomics-onderzoek.

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

16

aL

Le

so

Ve

rD

na

Apen krijgen geen AIDSDe mens is sterk verwant aan de gorilla en de chimpansee. Dat blijkt ook uit ons erfelijk materiaal. Sommige apensoorten kunnen, net als de mens, een koortslip, tuberculose en lepra krijgen. toch bestaan er ziektes die mensen kunnen krijgen, terwijl die bij onze naaste verwan-ten zelden of nooit voorkomen. zo kunnen chimpansees besmet raken met HIV, maar ontwikkelen ze bijna nooit AIDS. Onderzoek naar het DNA van de chimpansee zou ons kunnen vertellen hoe dat komt.

De mens stamt niet af van de mensaap, maar is een soort verre neef.Door de 2,7% verschil in het DNA kunnen wij bijvoorbeeld praten en AIDS krijgen, en chimpansees niet.Deze verschillen leren ons veel over onszelf.

mENSAAP

Veel mensen denken dat we ‘afstammen van de apen’. Dat klopt niet helemaal. De waarheid ligt iets genu-anceerder. De mens en bepaalde hoogontwikkelde apensoorten behoren tot de superfamilie Hominoidea. Deze superfamilie bestaat, naast de mens, uit gibbons, orang-oetans, gorilla’s, bonobo’s en chimpansees. Deze apen worden ook wel mensapen genoemd. De mens en de mensapen hebben hoogstwaarschijnlijk één ge-zamenlijke voorouder. er was dus ooit een aapachtige

die door de evolutie in verschillende soorten – de mens en de mensapen dus – is veranderd. overigens is het waarschijnlijk dat alle organismen één gemeenschap-pelijke voorouder hebben.

AFGESPLItSt

Zulke enorme veranderingen vinden natuurlijk niet van de ene op de andere dag plaats: er gaan vele miljoe-nen jaren overheen. Wetenschappers schatten dat zo’n twaalf miljoen jaar geleden de orang-oetan zich heeft afgesplitst van de gemeenschappelijke voor-ouder van de mens en de mensapen. Zo’n zeven tot acht miljoen jaar geleden deed de gorilla hetzelfde en de chimpansee/bonobo en de mens ontstonden zo’n vijf tot zeven miljoen jaar geleden. Vanaf dat moment zijn de mensachtigen en de chimpansee/bonobo zich gescheiden gaan ontwikkelen. De chimpansee en de bonobo zijn 2,5 miljoen geleden als aparte soorten uit elkaar gegaan.

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

17

aL

Le

so

Ve

rD

na

Chimpansees en mensen hebben dus wel dezelfde voorouder, maar we zijn niet direct uit chimpansees voortgekomen. We zijn dus een soort verre neven en geen achterkleinkinderen van chimpansees. Dankzij deze verwantschap is de chimpansee het dier dat qua erfelijk materiaal het meest op de mens lijkt. Maar ook de andere mensapen komen genetisch sterk overeen met de mens. Juist hierdoor kunnen ze ons veel leren over waar we vandaan komen en hoe bepaalde ziektes werken.

VERGELIjKEN

Het in kaart brengen van het genoom houdt in dat onderzoekers achterhalen wat de volgorde van de bouwstenen (G, a, t en C) in het Dna is. Doordat de mens en de chimpansee aan elkaar verwant zijn, is het verschil tussen beide genomen interessant. op een gegeven moment heeft een grote groep onderzoekers dan ook besloten het genoom van de chimpansee in kaart te brengen. In 2005 werd het project afgerond. omdat het menselijk genoom al in 2003 bekend was, kon het meteen met dat van de chimpansee vergeleken worden. Het bleek dat het erfelijke materiaal van de chimpansee voor ongeveer 97,3% overeenkomt met dat van de mens. Het verschil van 2,7% zou kunnen verklaren waarom mensen kunnen praten en waarom chimpansees geen aIDs of de ziekte van alzheimer kunnen krijgen. een jaar later is het volledige genoom van de rhesusaap in kaart gebracht. Het bleek voor ongeveer 93% overeen te komen met dat van de

mens. Meer dan 98% komt overeen met het genoom van de chimpansee. De genomen van andere mens-apen, waaronder de orang-oetan en de gorilla, zullen binnenkort bekend zijn.

Binnen een soort bestaat altijd variatie. Die variatie zorgt ervoor dat het Dna van het ene individu niet precies hetzelfde is als dat van een ander individu. als dat wel zo zou zijn, dan zou iedereen binnen een soort er vrijwel hetzelfde uitzien. Daarom bestaat er niet zoiets als ‘het genoom’ van een diersoort. als een

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

18

aL

Le

so

Ve

rD

na

onderzoeker het over ‘het genoom’ van een diersoort heeft, bedoelt hij daar het ‘gemiddelde’ genoom van enkele individuen mee. Dat gemiddelde genoom is re-presentatief voor die diersoort. tussen mensen bestaat ook variatie. De een is lang, de ander kort. De een heeft blond haar, de ander bruin. Die variatie zit ook in een ander punt: sommige mensen krijgen diabetes en anderen niet. Daarom is die variatie tussen individuen interessant. Wat kan de variatie in het Dna ons vertel-len over waarom die mensen ziek worden?

om een beter beeld te krijgen van wat de overeen-komsten en verschillen zijn binnen een soort en tussen soorten moeten de genomen van verschillende indivi-duen van verschillende soorten onder de loep genomen worden. Die kun je vervolgens met elkaar vergelijken. Het menselijk genoom – d.w.z. het ‘gemiddelde’ ge-noom van enkele individuen – kun je bijvoorbeeld ver-gelijken met de genomen van verschillende apensoor-ten, zoals chimpansees en gorilla’s. Je kijkt dan naar de overeenkomsten en verschillen binnen een soort, maar ook tussen aanverwante soorten.

INzIcHt IN zIEKtES

Bij de mens komen ziektes voor die apen zelden of nooit krijgen. Behalve de mens zijn alleen bepaalde apensoorten gevoelig voor infecties met bijvoorbeeld het menselijke hepatitis virus (een virus dat leveront-steking en leverkanker kan veroorzaken) en specifieke soorten van de malariaparasiet. Het ontwikkelen en

testen van nieuwe vaccins tegen deze ziektes zijn dus alleen mogelijk bij de mens en die apensoorten. ook lijken de hersenen van sommige apen sterk op die van de mens waardoor ze gebruikt kunnen worden voor onderzoek naar bijvoorbeeld de ziekte van alzheimer of Parkinson.

Chimpansees kunnen wel met HIV (het virus dat bij mensen aIDs kan veroorzaken) besmet worden, maar worden vervolgens vrijwel nooit ziek. Hoe kan dat? nadat chimpansees met HIV besmet zijn maken speciale cellen van hun afweersysteem antistoffen aan die ervoor zorgen dat het virus onschadelijk wordt gemaakt. Bij mensen wordt het virus door die antistof-fen niet onschadelijk gemaakt. een bepaald type cellen, dat onmisbaar is voor een effectief werkzaam afweer-systeem, gaat bij mensen met aIDs kapot. Bij chim-pansees gebeurt dat niet. In de besmette chimpansees worden minder virusdeeltjes gemaakt dan bij mensen. ook hebben chimpansees afweercellen die hard optre-den tegen de HIV-besmetting waardoor de levensbe-dreigende ziekte aIDs niet ontstaat. Vergelijking van het menselijke genoom met dat van de chimpansee zou ons een beter beeld kunnen geven over waarom chimpansees vrijwel nooit aIDs krijgen na besmetting met HIV. en die kennis zou mogelijk tot een aIDs-me-dicijn voor mensen kunnen leiden.

rhesusapen worden veel gebruikt voor het testen van nieuwe medicijnen tegen aIDs. Bij sommige apen komt

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

19

aL

Le

so

Ve

rD

na

een virus voor dat sterk lijkt op HIV. Dat virus heet sIV. rhesusapen worden, in tegenstelling tot chimpansees, wel ziek na besmetting met sIV. sterker nog, hun symptomen lijken sterk op die van mensen met aIDs. Hierdoor is de rhesusaap de meest geschikte diersoort om nieuwe medicijnen tegen aIDs te testen.

Chimpansees kunnen wel besmet

worden met HIV, maar krijgen

vervolgens vrijwel nooit AIDS.

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

20

aL

Le

so

Ve

rD

na

DNA sequencen: een gevecht tegen de getallen

Als onderdeel van een wereldwijd project ontrafelen Wageningse onderzoekers het DNA van de tomaat en de aardappel.Dit sequencen legt genen bloot die planten gevoelig maken of beschermen tegen ziekten en andere invloeden.Verrassend veel genen met dezelfde functies komen bij uiteenlopende soorten voor.

De verschillen in genoomgrootte zijn enorm. Het genoom van een lelie is ongeveer duizend keer groter dan dat van een andere plant, de zandraket. Een vergelijking tussen het lezen van de DNA-basen van een organisme en het lezen van letters brengt de verschillen mooi in beeld. Een kind dat naar de middelbare school gaat zal meer dan duizend minuten, dus meer dan zestien uur, nodig hebben om het kleinste genoom dat we nu kennen af te lezen: dat van de bacte-rie mycoplasma genitalium. Over het genoom van de mens zou de brugklasser meer dan tien jaar doen, over dat van de tulp meer dan vierhonderd jaar. De lengte van het DNA is dus enorm: in iedere cel van een tomaat zit 23 centimeter DNA en in iedere leliecel niet min-der dan dertien meter!

In Wageningen staat één van de snelste apparaten voor het aflezen van Dna-volgorden van planten in europa. Hiermee kunnen ze, per dag, de volgorde van één miljoen baseparen (de moleculaire bouwstenen van Dna) vaststellen. Dit apparaat wordt ingezet om

het hele genoom van de aardappel en de tomaat in kaart te brengen. Dat doet het instituut Plant Research International niet alleen – ook universiteiten en bedrij-ven in landen als de Verenigde staten, China, nieuw Zeeland en Ierland doen mee. Kennis die dit onderzoek oplevert, kan bijvoorbeeld de weg vrijmaken voor het kweken van aardappels met meer vitamines en een hogere voedingswaarde.

mILIEu

Door het grootschalige sequencen vinden onderzoe-kers plantengenen die betrokken zijn bij resistentie van planten tegen ziekten en plagen. resistente planten hoeven minder bespoten te worden – voordeel dus voor het milieu. Bovendien is er minder gewasschade. rassen die toleranter zijn tegen droogte of zout in de grond zijn essentieel om het productieareaal van gewassen zoals rijst en maïs in ontwikkelingslanden te kunnen vergroten.

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

21

aL

Le

so

Ve

rD

na

ENORmE VERScHILLEN

opmerkelijk is ook dat de lengte van het Dna van planten als tarwe, tulp en lelie vijf tot vijftigmaal langer is dan dat van de mens, terwijl alle vier organismen bij-na even veel genen bezitten als wij (ongeveer 25.000). simpel gezegd, ééncellige organismen hebben een genoom dat vrijwel geheel uit een klein aantal (1000 genen per miljoen baseparen) genen bestaat. Het Dna van de mens, maïs en lelie daarentegen bevat slechts hier en daar een gen. De rest wordt gezien als een soort genetische vulling, ook wel junk-Dna genoemd. De laatste jaren is gebleken dat junk-Dna ook van belang is voor het optimaal functioneren van de genen. alleen vele jaren onderzoek zal ons in de toekomst laten zien waar dit extra Dna echt voor dient.

IN DE GENEN

Van ongeveer tien procent van de zandraketgenen weten we dankzij laboratoriumexperimenten de exacte functie. Van 60% hebben we slechts een vermoeden. Door de Dna-volgorde van de zandraket te vergelijken met dat van andere organismen, komen onderzoekers tot verrassende ontdekkingen wat betreft de functies van genen. Zo lijken ongeveer honderd genen van de zandraket op genen van de mens die betrokken zijn bij erfelijke ziekten waaronder de taaislijmziekte (cystische fibrose) en borstkanker. Veel genen zijn echter uniek voor planten. De zandra-ket bezit bijvoorbeeld genen die veel te maken hebben

Organisme lengte DNA (basenparen)

Bacteriën Mycoplasma 580.000e. coli 4.600.000

Schimmels Gist 12.100.000aspergillus 25.400.000

Ongewerveld rondworm 100.000.000Fruitvlieg 140.000.000sprinkhaan 5.000.000.000

Gewerveld Mens 3.000.000.000Muis 3.000.000.000

Planten Zandraket 130.000.000rijst 420.000.000aardappel 850.000.000Maïs 5.000.000.000tarwe 17.000.000.000Lelie 120.000.000.000

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

22

aL

Le

so

Ve

rD

na

met herkenning van plagen, parasieten of ziekmakende schimmels en de resistentie daartegen. Gezien het aantal bacteriën, schimmels, insecten en nematoden op aarde is het verbazingwekkend dat planten, die niet weg kunnen lopen voor hun belagers, in staat zijn te overleven. Planten beschikken veel meer dan andere organismen over verdedigingsmechanismen als ant-woord op hun omgeving. alleen door de volgorde van alle 130.000.000 Dna-bouwstenen te bepalen komen we erachter waar al deze genen zitten. tot nu toe zijn meer dan tweeduizend zandraketgenen geïdentificeerd die informatie bevatten om te overleven. Deze genen zijn bijvoorbeeld ook bij de aardappel en rijst cruciaal voor een goede oogst.

Wanneer Dna-volgorden voor meerdere planten beschikbaar komen kunnen we deze informatie ook ge-bruiken om inzicht te krijgen in de evolutie van planten. onderzoekers hebben stukken van het zandraketge-noom vergeleken met dat van het verwante herders-tasje. Dit laat zien dat heel weinig veranderd is sinds het moment dat deze twee planten ongeveer zes tot tien miljoen jaar geleden van een gemeenschappelijke voor-ouder afsplitsten. Genen van verschillende koolsoorten (kool, broccoli, mosterd) en de zandraket, die beiden twaalf tot negentien miljoen jaar geleden zijn afgesplitst van een gemeenschappelijke voorouder, lijken ook nog veel op elkaar. er is zelfs veel gelijkenis tussen bepaalde genen van de tomaat en de zandraket, die honderdvijf-tig miljoen jaar geleden een eigen weg kozen.

DNA wordt op het

sequencen voorbereid

Sequencen sequencen is een techniek waarbij de basenvolgorde van een Dna-streng of de aminozuurvolgorde van een polypeptide (eiwit) wordt bepaald.

Deze techniek is in 1975 ontwikkeld en is in de loop van de jaren steeds beter en sneller geworden. In 1995 werd voor het eerst het Dna van een heel organisme gesequenced: Haemophilus influenza, een bacterie met een genoom van ongeveer 2 miljoen basenparen.

In 2001 werd de sequentie van het menselijk genoom gepubliceerd, 3 miljard basenparen lang. Van meer dan 400 organismen is nu de volledige Dna-volgorde bekend.

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

23

aL

Le

so

Ve

rD

na

BLOEmKOOL EN BROccOLI

Plantengenen van verwante planten zoals koolzaad, bloemkool, broccoli en mosterd lijken dus veel op elkaar. Wanneer we een gen in de zandraket ontdek-ken, bijvoorbeeld voor droogtetolerantie, dan is dit gen ook terug te vinden in de bloemkool. Dit komt omdat de Dna-volgorden binnen de genen van verwante planten hetzelfde zijn. ook is de volgorde van genen op het chromosoom vaak vergelijkbaar. Je kunt dus met behulp van sequencen gemakkelijk belangrijke ge-nen van de zandraket terugvinden op de chromosomen van andere planten zoals broccoli, aardappel, tomaten, granen, rijst, tarwe en maïs.

Pas ontkiemde zandraketten

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

24

aL

Le

so

Ve

rD

na

Repressor eiwit p63 (voorgrond) bindt aan DNA-spiraal.

Bouwsteen in 3D

Bioinformatica bespaart onderzoek aan DNA en eiwitten veel tijd en geld.Moleculen kunnen driedimensionaal bekeken worden.Dat levert relevante kennis over activiteit en bindingen van deze moleculen op.

Veel onderzoekers die zich bij het centre for molecular and Biomole-cular Informatics in Nijmegen melden, omdat zij willen weten hoe een eiwit er driedimensionaal uitziet, komen terecht bij Hanka Vense-laar. zij bestudeert de vraag hoe bioinformatici hun kennis het best kunnen overdragen op biologen, chemici en medisch onderzoekers. Haar project heeft dan ook een educatief en communicatief karakter. uiteindelijk is het de bedoeling dat deze onderzoekers zelf gebruik kunnen maken van de software waarmee je eiwitten in 3D (= driedi-mensionaal) kunt bekijken.

WERK BESPAREN

“Wij laten de onderzoekers zien hoe ze zichzelf veel werk kunnen besparen”, zegt Venselaar. Het is mogelijk om lukraak mutaties (veranderingen) aan te brengen in een gen en vervolgens te onderzoeken hoe de activiteit van het eiwit is veranderd. Dat is echter veel werk. “Wij kunnen met 3D software voorspellen welke mutanten al dan niet het gewenste effect zullen hebben.”

neem bijvoorbeeld de onderzoeksgroep organische Chemie die een chemische verbinding wilde kop-pelen aan methionine, één van de aminozuren in een

He

t

Dn

a o

nt

ra

Fe

LD

25

aL

Le

so

Ve

rD

na

eiwit. Venselaar: “Ik kon hen laten zien dat geen van de aanwezige methionines in het eiwit geschikt was voor de koppeling met de chemische stof. Dat kwam omdat ze op te grote afstand van de active site van het eiwit zaten of aan de binnenkant van het eiwit, waar geen plaats is voor een extra verbinding. Daarom is toen onderzocht of één van de andere aminozuren in methionine veranderd kon worden, door een mutatie in het Dna. Uiteindelijk heb ik hen, met hulp van het 3D-programma, verschillende suggesties kunnen doen voor deze mutaties. Zo hebben ze zelf kunnen bepalen waar de methionine in het eiwit terecht kon komen. natuurlijk moet je er dan ook nog rekening mee hou-den dat je de structuur van het eiwit niet verstoort.”

een tweede voorbeeld is het 3D-onderzoek aan het ‘re-pressoreiwit’ p63. Mutaties in het gen dat codeert voor dit eiwit kunnen leiden tot kinderen zonder darmen of misvormingen van handen, voeten en gehemelte. Met behulp van 3D-modeling wisten onderzoekers van het nijmeegse radboud Ziekenhuis deze afwijkingen te verklaren: het gemuteerde eiwit bleek van vorm te veranderen, waardoor het niet meer op zijn plek aan het Dna kon binden.

een laatste voorbeeld is dat van een schimmeleiwit. De activiteit van dat eiwit kan worden platgelegd door toediening van antibiotica. Dat bindt aan het eiwit, met als gevolg dat de schimmel niet langer kan groeien. De vraag is nu hoe het eiwit resistent wordt voor dit

antibioticum. als je dat weet dan kunnen onderzoekers op zoek gaan naar een antibioticum dat wel aan het resistent geworden eiwit kan binden.

tOEKOmSt

Venselaar draagt steeds haar steentje bij aan het onder-zoek van anderen. Zelf zal zij vooral overzichtsartikelen schrijven over de manier waarop mutaties de structuur van eiwitten beïnvloeden en hoe het gebruik van 3D-structuren daarin erg nuttig kan zijn. Voor jonge bioin-formatici als Hanka Venselaar is er zeker een toekomst. straks heeft zo’n beetje iedere groep op het terrein van de biologische wetenschappen bioinformatica nodig.

p63-eiwit (rechts) bindt

aan DNA-helix

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

26

aL

Le

so

Ve

rD

na GAC

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

27

aL

Le

so

Ve

rD

naTGKennis levert toepassingen. Wanneer je weet waar Dna voor codeert, is de stap snel gezet naar het

verbeteren van deze code. De vraag is echter wanneer ‘optimaliseren’ omslaat in manipuleren – wat een veel negatievere klank heeft. Hoewel we nog lang niet alles kunnen met Dna, is de discussie over de mogelijkheden en grenzen van Dna-veranderingen om ons leven aangenamer te maken al jaren in volle gang. nu al kunnen we onze ongeboren kinderen laten testen op gevaarlijke genetische aandoeningen. straks kunnen we ook meer eigenschappen laten bepalen. Hoe ver gaan we hierin? In de landbouw is het al heel lang gewoon om te veredelen, simpelweg door gewassen met elkaar te kruisen en de beste exemplaren door te kweken. Maar als we dit nu eens makkelijker doen, door het Dna aan te passen? Vinden we dat dit kán, en wat kunnen de gevolgen zijn voor milieu en gezondheid? Moeten we straks allemaal ons persoonlijk aangepaste dieet naar binnen werken, om slank en gezond te blijven? Het zijn stuk voor stuk vragen, waar meestal geen eenduidig antwoord op te geven valt.

Beter, sneller, knapperA

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

28

aL

Le

so

Ve

rD

na

Matchen we

straks onze

kinderen met ons

meubilair?

mooier en slimmer met genomicsStel je voor: je wilt kinderen, maar niet alleen dat. je wilt ook dat je toekomstige kind gezond is. Sterker nog, je wilt dat het goede genen heeft, want dit zou hem of haar een goede start in het leven kunnen geven. Via internet ben je er achter gekomen dat er mogelijkheden be-staan om embryo’s of foetussen op gezonde en goede genen te testen, waarna je de beste kunt selecteren. je stuurt een email, en dan gaat het balletje rollen.

Ongeboren kinderen kunnen op steeds meer genetische eigenschappen getest worden.Straks is het ook mogelijk om ‘goede’ eigenschappen te selecteren.Dat brengt allerlei ethische dilemma’s met zich mee.

SLImStE VAN DE KLAS

Het uitkiezen van het kind met de meest gunstige eigenschappen is nog toekomstmuziek; wel is het al mogelijk om het ongeboren kind te testen op de aan-wezigheid van genen die verantwoordelijk zijn voor het ontstaan van erfelijke aandoeningen. De wetenschap is nog niet zo ver dat op genen voor haarkleur, seksuele geaardheid of intelligentie getest kan worden. Het is zelfs de vraag of dat ooit gaat lukken. Dat lijkt mis-schien jammer, want wie wil nou niet dat zijn of haar kind de slimste of mooiste van de klas is? Maar ligt het

wel zo gemakkelijk?In nederland kunnen vrouwen, als zij dit willen, de ongeboren vrucht laten testen op ernstige erfelijke en aangeboren aandoeningen. Maar is de selectie van embryo’s eigenlijk wel zo’n goed idee, als er geen (ern-stige) ziekte in beeld is?

In het verleden werd ook geprobeerd te selecteren op basis van veronderstelde genetische kwaliteiten. Zo was

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

29

aL

Le

so

Ve

rD

na

er aan het begin van de twintigste eeuw een beweging in de Verenigde staten, die verbetering en zuivering van de rassen nastreefde door mensen voor te lichten over de juiste genetische combinaties. ook werden speciale wedstrijden georganiseerd waar families met de beste genetische kenmerken werden gekozen. Dat heet positieve eugenetica. In andere gevallen werd ‘inferieure’ mensen, zoals verstandelijk gehandicapten, verboden of verhinderd om kinderen te krijgen. In nazi-Duitsland werden ze gesteriliseerd of soms zelfs vermoord. Dit wordt negatieve eugenetica genoemd. tegenstanders van prenatale selectie verwijzen naar deze kwalijke geschiedenissen als argument om gene-tisch testen te verbieden.

LIFEStyLE KINDEREN

Zouden ouders hun kind niet gewoon moeten ac-cepteren zoals het is? Het samenspel van de genen van vader en moeder levert een nieuw mens op met zowel positieve als negatieve eigenschappen. Mensen ver-schillen nu eenmaal. Bij genenselectie hopen de ouders, dat het kind én zijzelf er beter van worden. Met als resultaat meer geluk in hun leven en dat van hun kind. Je ouders bepalen al veel in je leven: je hele opvoeding door, proberen je ouders het beste voor je te bereiken. Je wordt voor een groot deel door je ouders gevormd.stel dat het mogelijk wordt om te selecteren op de genetische kwaliteiten van kinderen. Misschien krijg je dan ooit modeprogramma’s op tV, die laten zien welke kleur baby’s goed bij je interieur passen. Worden

kinderen, net als andere dingen, in de toekomst life-styleproducten? We weten allemaal hoe sterk de mode kan veranderen, en bij prenatale testen op uiterlijke eigenschappen speelt mode vast een rol. straks kun je aan iemands kleur haar en ogen zien wat de mode was toen er geselecteerd werd, en wie die mode níet heeft gevolgd.

NOG EVEN NIEt

een kind-selectie-test is nog niet te bestellen via in-ternet. De wetenschap heeft alleen maar vermoedens over de relatie tussen genen en eigenschappen, zoals seksuele geaardheid en leervermogen. Bovendien zeg-gen genen niet alles; andere factoren, zoals opvoeding, onderwijs en levensstijl bepalen voor een groot deel wie je wordt. toch is het nadenken over deze kwestie hard nodig. We moeten weten wat we er van vinden voordat het zover is.

Zal genomics straks alleen nog

maar mooie mensen opleveren?

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

30

aL

Le

so

Ve

rD

na

Smaak zit in de genen én tussen de orenIn de jaren tachtig en negentig hadden de Nederlandse tomaten een zeer slechte reputatie. In Duitsland werden de Nederlandse tomaten ‘Holländische Wasserbomben’ genoemd: ze waren groot en waterig en hadden weinig smaak.

Tomatenveredelaars kunnen steeds beter selecteren op smaak.Iedereen kan straks zijn ultieme tomaat kopen.Onderzoekers speuren hiervoor naar smaakgenen in de plant.

WASSERBOmBEN

De nederlandse tomatenveredelingsbedrijven selecteer-den tot voor kort hun tomatenplanten vooral op een zo hoog mogelijke productie en een goede houdbaarheid, zodat ze over de hele wereld vervoerd konden worden. op smaak werd toen niet gelet; die eigenschap was veel te complex. De hetze tegen de wasserbomben was het begin van een trend waarin de consument steeds meer belang hecht aan de kwaliteit van zijn voedsel. De veredelaars zijn daarom steeds meer gaan letten op smaak. De komst van nieuwe genomics-technieken zoals de Dna-chip (zie kader ‘microarray op bladzijde 59) en metabolomics maakt nu veel meer mogelijk.

SmAKEN VERScHILLEN

smaak is een heel complex verschijnsel. De smaak van een tomaat wordt bepaald door zijn pallet van stoffen die invloed hebben op de geur, de smaak (zoals zoet, zout, zuur en bitter), de nasmaak en het mondgevoel. Maar wat een nederlander een lekkere tomaat vindt, vindt een Italiaan misschien te zoet, een amerikaan te bitter en een Chinees te stevig. erfelijke voorkeur van een bevolkingsgroep en eetcultuur - wat je van huis uit gewend bent - speelt ook een rol. en op vakantie smaakt het eten en drinken altijd beter, omdat je je heel prettig voelt. Kortom, de smaak van een tomaat wordt bepaald door de eigenschappen van de vrucht in combinatie met de voorkeur van degene die hem eet, de plaats en het tijdstip.

om aan ieders wens te kunnen voldoen is het be-langrijk om te weten wat de smaak van een tomaat nu precies bepaalt. Dit was tot voor kort heel moeilijk, omdat smaak zo’n complexe eigenschap is. De mo-

derne genomics-technieken maken het echter mogelijk om ook dit soort eigenschappen in kaart te brengen. onderzoekers werken nauw samen met tomatenver-edelaars om de smaak van tomaat te ontrafelen en om smaakgenen te identificeren. Die kunnen dan gebruikt worden om lekkerdere tomaten door te kweken. Dit zal leiden tot de ontwikkeling van goed smakende tomaten voor ieder volk met zijn eigen specifieke wen-sen. Wat dacht je van een vleestomaat met de smaak van een cherry tomaat?

mONDGEVOEL

om inzicht te krijgen in de variatie aan tomatensma-ken, is er bij het Centre for BioSystems Genomics nieuw onderzoek gestart. Daarbij hebben de onderzoe-kers honderd verschillende tomatenrassen vergeleken. allereerst zijn al deze rassen geproefd door een panel van specialisten die smaak kunnen onderscheiden en beoordelen op wel 25 verschillende aspecten. Het bleek dat er enorme verschillen waren in de smaak van die 100 rassen: sommige waren heel zoet, andere juist waterig, sommige leken rokerig, andere waren melig.

om deze smaakverschillen te begrijpen keken de onderzoekers welke stoffen in de tomaat belangrijk zijn voor bijvoorbeeld die typische geur, smaak of dat mondgevoel. De samenstelling van die stoffen wordt deels bepaald door de erfelijke aanleg, deels door het unieke pakket aan smaakgenen dat in iedere tomaat aanwezig is, maar ook door omgevingsfactoren, zoals

oV

er

aL

isD

na

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

31

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

32

aL

Le

so

Ve

rD

na

de temperatuur, het licht, het klimaat en het pluk- stadium.

op dit moment wordt er hard gewerkt aan het vinden van die smaakgenen. Wageningse onderzoekers kun-nen gelijktijdig van 20.000 verschillende tomatengenen vaststellen welke er een rol spelen bij het bepalen van goede of slechte smaak. Verder worden biochemische profielen van de verschillende tomaten bepaald. Zo ontstaat een totaalplaatje met informatie over smaak-eigenschappen, inhoudsstoffen en smaakgenen. Dat overzicht leert ons begrijpen wat de smaak van een tomaat bepaalt en zal ons helpen om in de toekomst nog lekkerdere tomaten te ontwikkelen.

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

33

aL

Le

so

Ve

rD

na

Is dik-zijn genetisch bepaald?Sommige mensen worden bij wijze van spreken al dik als ze naar eten kijken, terwijl anderen niet op de pondjes hoeven te letten en toch slank blijven. Dat zit ‘m deels in de genen. In 2005 introduceerde een Amerikaans bedrijf een afslankpil die was afgestemd op iemands per-soonlijke DNA-profiel. je kon de pil bestellen door een wattenstaafje met wangslijmvlies naar de producent te sturen die dan de genetische samenstelling analyseerde. Afhankelijk van die samenstelling bevatte de pil al dan niet bepaalde stoffen die jou zouden helpen af te vallen.

Overgewicht is deels erfelijk, maar een wonderpil is er voorlopig niet.Kennis over genen en omgeving kan ons wel helpen op gewicht te blijven.Het probleem zit vooral in onze westerse eetcultuur.

GENEtIScHE KWAKzALVERIj

Inmiddels is de nederlandse poot van het bedrijf ont-maskerd als oplichter. experts deden de pil af als we-tenschappelijke onzin. Genetische kwakzalverij dus. De pil was gebaseerd op vijf genen die een belangrijke rol zouden spelen in de stofwisseling. nog afgezien van de vraag hoe belangrijk die rol daadwerkelijk is, benadruk-ken genonderzoekers dat de stofwisseling een ingewik-keld proces is waarbij honderden genen betrokken zijn.

Welke dat zijn en wat ze met elkaar te maken hebben, is nog grotendeels onbekend. Bovendien werken genen in elke samenstelling en omgeving weer anders. een simpele Dna-pil is dus niet te verwachten als re-sultaat van wetenschappelijk onderzoek naar de rol van genen in het ontstaan van overgewicht. De overheid en het bedrijfsleven investeren wel veel geld in zulk onderzoek. In 2004 kreeg een nederlands samen-werkingsverband van kennisinstellingen en bedrijven bijvoorbeeld twintig miljoen euro voor onderzoek naar de relatie tussen voeding en de werking van genen. Wat doen die onderzoekers dan wel? Ze hebben al heel wat genen gevonden die op de een of andere manier te maken hebben met het ontstaan van overgewicht. Mensen met een bepaalde genetische opmaak zullen minder snel ‘genoeg’ hebben, meer vet opslaan, of minder geneigd zijn tot beweging. of ze daar ook dik van worden, hangt af van wat ze eten en doen. Genen alleen bepalen niet of iemand dik wordt of niet.

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

34

aL

Le

so

Ve

rD

na

RISIcOPROFIEL

of je dik wordt, is een gevolg van een combinatie van eten, bewegen én je genetische aanleg. De vraag is dus niet of je dik wordt van te veel eten óf van te weinig bewegen óf van verkeerde of kapotte genen. De vraag is wat eten, bewegen en genen met elkaar te maken hebben.Met moderne technieken kunnen onderzoekers honderden of duizenden genen tegelijk bestuderen en daarmee ook relaties tussen genen, cellen en de buitenwereld. op basis van dat onderzoek worden

bijvoorbeeld testen ontwikkeld waarmee de activiteit van genen kan worden gemeten, zodat je kunt zien of er een risico is op diabetes, hart- en vaatziekten, nierziekten of kanker, voordat er sprake is van gezond-heidsschade.

op dit moment kan er getest worden of er al schade is, bijvoorbeeld hoe dik de wanden van bloedvaten zijn, of hoeveel (slecht) cholesterol er in het bloed zit. nieuwe testen zullen dus een fase eerder zijn. als de relaties tussen genen en omgeving beter zichtbaar worden, zal blijken dat er heel veel soorten overgewicht zijn die allemaal om een specifieke aanpak vragen. Dat kunnen voedingsmiddelen of leefregels zijn die bijdragen aan een langer en gezonder leven omdat ze beter aanslui-ten bij iemands genetisch risicoprofiel.

Iemand die een verhoogde kans heeft op hart- en vaat-ziekten, doet er goed aan om al op jonge leeftijd de in-name van slechte cholesterol te beperken. en wanneer bekend is dat iemand relatief langzaam vet verbrandt, is het beperken van de vetopname misschien een effec-tievere manier om af te vallen dan een dagelijks bezoek aan de sportschool. Dat wil echter niet zeggen dat je dat laatste dan maar moet laten zitten: gezondheid is meer dan gewicht alleen. Bovendien eten en bewegen mensen niet alleen om gezond te blijven, maar ook omdat ze het leuk of lekker vinden. toch zou het mooi zijn om te weten of datgene wat jij of je kind leuk of lekker vinden, past bij hoe je eigen

Be

te

r,

sn

eL

Le

r,

Kn

aP

Pe

r

35

aL

Le

so

Ve

rD

na

lichaam werkt. Het maken van een persoonlijk gene-tisch profiel valt echter nog lang niet mee. naarmate het duidelijker wordt hoe ingewikkeld de relaties tussen genen en hun omgeving zijn, des te moeilijker het is om alle beschikbare informatie te vertalen in voeding en leefregels.

Het is ook veel te duur om voor iedereen een dieet op maat te maken. en als het al zou kunnen, dan is natuurlijk de vraag: willen mensen dat wel? Willen wij onszelf en onze kinderen genetisch laten screenen om te kunnen kiezen voor die manieren van leven en eten die voor ons het beste zijn? en wat is dat eigenlijk: het beste? Hebben we daar echt al dat onderzoek voor nodig? Kunnen we niet beter gewoon wat minder vet en suiker eten, en wat meer bewegen? Bovendien is eten niet alleen een kwestie van gezond-heid. Kunnen we nog wel van ons eten genieten als voeding vooral verantwoord moet zijn?

cuLtuuR

overgewicht is ook het gevolg van een eenzijdige eetcultuur. Veel kinderen leren niet om te genieten van lekker eten en verschillende smaken. Ze raken ‘ver-slaafd’ aan vet en suiker. Is er in de strijd tegen over-gewicht niet veel meer te verwachten van onderzoek naar smaakontwikkeling en lichamelijke en geestelijke verzadiging? en hebben genen daar misschien ook iets mee te maken?

ATC

AGC als er de afgelopen jaren een vakgebied grote belangstelling van het publiek heeft gehad, is het wel de forensische wetenschap. Dna op zichzelf is geen rechtsgeldig bewijsmateriaal, maar misdaadbestrijders kunnen zich haast geen beter hulpmiddel wensen. Dna is namelijk uniek. alleen eeneiige tweelingen hebben hetzelfde Dna. tegelijk met de introductie van nieuwe opsporingstechnieken, barstte een heftige discussie los over de privacygevoeligheid van deze informatie. We gebruiken, met uitzondering van het geslacht, alleen informatie die niets zegt over de persoonskenmerken, voerden speurders ter verdediging aan. Dat was waar; ze gebruikten alleen stukken junk-Dna, Dna dat in principe niet codeert voor menselijke eigenschappen. Maar heel voorzichtig werd kortgeleden een nieuwe toepassing gelanceerd: aan de hand van Dna mag de politie bepalen tot welke bevolkingsgroep iemand behoort. Waar gaat dit eindigen? Krijgen we straks een volledig signalement van een dader? Hoe betrouwbaar kan zo’n signalement worden, gezien het feit dat de omgeving ook een grote rol speelt bij het tot stand komen van ons uiterlijk? een heel andere toepassing van forensische wetenschap laat ons niet vol argwaan naar onze buurman kijken, maar naar het verleden. Met genetische markers kunnen onderzoekers vele millennia terugkijken, op zoek naar onze verre voorouders. Dit leert ons niet alleen veel over de mensheid, maar ook over onszelf.

De mens op het spoor

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

38

aL

Le

so

Ve

rD

na

Boeven vangen met DNA

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

Van de jaarlijks ruim driehonderd in Nederland gepleegde moorden, wordt zo’n 80% gepleegd in de huiselijke kring. Vaak is het bewijs snel gevonden, maar soms is het met het traditionele opsporingswerk erg moeilijk om een verdachte op te sporen. DNA-analyse biedt in die gevallen soms uitkomst. Op basis van biologische sporen zoals een microscopisch klein stukje huid, een haarwortel, een druppeltje bloed of wat sperma, is een DNA-profiel te vervaardigen. Dit profiel is vrijwel uniek voor iedere mens en kan de sleutel tot de oplossing van het misdrijf zijn.

Het lukt steeds vaker om na misdrijven bruikbare DNA-sporen te vinden.Het unieke DNA-profiel dat wordt gebruikt zegt niets over persoonskenmerken.Zo kan bijvoorbeeld een dader in een grote populatie worden geïdentificeerd.

DE WAARHEID

Forensisch of gerechtelijk onderzoek is wetenschap-pelijk onderzoek dat specialisten deels doen op en rond plaatsen waar men sporen denkt te kunnen vinden zoals de plaats van een delict (ook wel PD, de plek waar een misdaad is begaan), de plaats waar een lijk is gevonden, de woning van een verdachte, en deels in een laboratorium zoals het nederlands Forensisch Instituut. De onafhankelijke onderzoekers zoeken in

opdracht van justitie naar de waarheid. Ze zoeken uit wat er werkelijk is gebeurd en speuren naar bloed, brandresten, wapens, drugs, etc. De resultaten komen in een deskundigenrapport dat bij de rechtszaak als bewijs kan worden gebruikt.

HEt KLEINStE SPOORtjE

De laatste jaren zijn de methoden om biologisch materiaal te vinden en hiervan het Dna te analyseren met sprongen vooruit gegaan. Daardoor kunnen de forensisch onderzoekers steeds meer met minder spo-renmateriaal. Het kleinst denkbare biologische spoor is vaak voldoende voor een Dna-onderzoek; bloedspo-ren op kledingstukken en wapens van verdachten van mishandeling of doodslag bijvoorbeeld, of sperma-sporen op de kleding en uitstrijkjes van slachtoffers van verkrachting. Zelfs van oude sporen of sporen van slechte kwaliteit kan vaak nog een Dna-profiel worden gemaakt.

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

39

aL

Le

so

Ve

rD

na

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

DE PERFEctE mAtcH

Forensische onderzoekers maken een Dna-pro-fiel door bepaalde delen van het gevonden Dna te vermeerderen met behulp van een chemische reactie: de Polymerase Chain Reaction (PCr). Deze delen van het menselijk Dna verschillen zo sterk van persoon tot persoon dat ze een nagenoeg persoonsspecifiek Dna-patroon opleveren. Daarin is een Dna-profiel net een vingerafdruk. Je kunt er geen medische gegevens of persoonlijke kenmerken uit aflezen, maar ieders profiel is vrijwel uniek.

als de onderzoekers een Dna-profiel hebben gemaakt van bijvoorbeeld materiaal dat is gevonden op de plaats van het misdrijf, dan vergelijken ze dat met het Dna-profiel van de verdachte in de zaak. Wanneer het Dna-profiel van het biologische spoor matcht met het profiel van een verdachte, dan wordt het erg aanne-melijk dat het spoor van deze verdachte afkomstig is. of de dader schuldig is, bepaalt de rechter, die daarbij alle belastende en ontlastende bewijsmiddelen in overweging neemt. als het Dna-profiel van het spoor niet matcht met het Dna-profiel van de verdachte, dan wordt het profiel van het spoor opgenomen in de nederlandse Dna-databank voor strafzaken. ook het Dna-profiel van de verdachte wordt opgenomen in de databank en vergeleken met alle daarin al aanwezige Dna-profielen. Zo kan meteen gecheckt worden of de verdachte mogelijk iets te maken heeft met eerdere misdrijven.

PCR PCr (Polymerase Chain Reaction) is begin jaren tach-tig uitgevonden en heeft heel veel bijgedragen aan de enorme vooruitgang die de moleculaire biologie de laatste twintig jaar heeft gekend. PCr wordt on-der andere gebruikt om kleine hoeveelheden van een specifiek stuk Dna een groot aantal keren te vermeer-deren. Vaak kun je maar een klein beetje Dna uit een weefsel isoleren. Maar voor verder onderzoek heb je voor de analyses van het Dna meer materiaal nodig. Met PCr laat je het kleine beetje Dna zichzelf verme-nigvuldigen tot een grotere hoeveelheid.

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

40

aL

Le

so

Ve

rD

na

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

Hoe forensisch Dna-onderzoek in nederland moet worden uitgevoerd, is wettelijk vastgelegd. onder-zoekers mogen dit alleen in opdracht van de rechter-commissaris of de officier van justitie doen en dan ook alleen volgens vastgestelde testmethoden. niet alleen bij het oplossen van criminaliteit kijken fo-rensische onderzoekers naar Dna-profielen, ook voor het aantonen van een ouder-kindrelatie en het iden-tificeren van slachtoffers gebruiken ze deze profielen. Daarnaast gebruiken onderzoekers die familiebanden bestuderen mitochondriaal Dna of kijken specifiek naar het mannelijke Y-chromosoom.

IN DE BuuRt

stel, er is iemand vermoord en de politie weet niet wie de dader is. Ze vermoedt dat de dader woont in

het dorp van het slachtoffer. Dan kunnen forensisch rechercheurs een Dna-bevolkingsonderzoek doen: ze vragen een vastgestelde groep mensen – in dit geval de inwoners van het dorp – om mee te werken aan dit onderzoek. op vrijwillige basis staan mensen een beetje Dna-materiaal af en forensische onderzoekers kijken of het Dna-profiel van deze mensen matcht met dat van de sporen bij de moord.een Dna-bevolkingsonderzoek leidt soms naar de dader. Maar als geen enkel Dna-profiel matcht met dat van het Dna-spoor dan weet justitie in ieder geval dat deze mensen de moord niet hebben gepleegd. Het openbaar Ministerie (oM) wil in de toekomst vaker gebruik maken van grootschalig Dna-onderzoek.

OuDE zAAK

Van veel oude zaken (1984 -1996) is nog biologisch sporenmateriaal aanwezig, dat gebruikt kan worden voor het moderne Dna-onderzoek. Het openbaar Ministerie heeft een aantal onopgeloste zaken uit het verleden heropend en Dna-onderzoeksopdrachten ge-geven. Dit heeft in een aantal gevallen tot de oplossing van een oude moordzaak geleid.

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

41

aL

Le

so

Ve

rD

na

Nieuwe technieken maken het mogelijk om een signalement op te stellen aan de hand van DNA-sporen.Voorlopig mogen alleen geslacht en etnische achtergrond gebruikt worden.De mogelijkheden voor de toekomst hangen af van de betrouwbaarheid en onze ethische grenzen.

DNA geeft hints over uiterlijk

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

Voor het opsporen van criminelen bestaat sinds kort een nieuwe opsporingsmethode. Politie en justitie mogen bij ernstige misdrijven namelijk een ‘signalement’ van de verdachte opstellen op basis van het DNA uit het sporenmateriaal. Dat ‘signalement’ is nog zeer be-perkt. Op dit moment kan men al bepalen of het DNA van een man of vrouw is. Bovendien kunnen onderzoekers nu ook een grove inschat-ting maken van de bevolkingsgroep waartoe de verdachte behoort. Het is nog de vraag of straks ook kenmerken als de haar- en oogkleur of de lichaamslengte van de verdachte kunnen worden vastgesteld op basis van het DNA.

IDENtItEIt

In september 2003 is in nederland een wet aangeno-men, die politie en justitie het recht geeft om uiterlijke persoonskenmerken uit het Dna af te leiden voor strafrechtelijk onderzoek. Hiermee hoopt justitie meer strafzaken op te lossen. Het gebruiken van Dna voor

het vaststellen van uiterlijke kenmerken is een nieuwe ontwikkeling en met de nieuwe wet loopt nederland, samen met Groot-Brittannië, voor op het gebied van strafrechtelijk Dna-onderzoek en de technische moge-lijkheden.

Justitie mag zo’n uiterlijk profiel alleen opstellen als andere opsporingsmethoden geen of te weinig aan-wijzingen hebben opgeleverd over de identiteit van de verdachte. Met de tests die nu of binnenkort beschik-baar zijn, kan ze alleen het geslacht en de etnische achtergrond bepalen en daarom staan deze kenmerken beschreven in de wet. als we in de toekomst ook tests hebben voor andere uiterlijke kenmerken, dan moet justitie deze eerst laten vastleggen in de wet. Daarvoor moet worden aangetoond dat het nieuwe kenmerk bijdraagt aan de opsporing. Bovendien moeten de tests betrouwbaar

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

42

aL

Le

so

Ve

rD

na

Kunnen we straks deze

beslissing nemen op

grond van DNA?

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

zijn. Kenmerken die je niet kunt zien, zoals verborgen erfelijke aandoeningen en erfelijke ziekten, mag justitie nu en in de toekomst niet gebruiken voor het opstellen van het signalement.

mIStER y

Zoals gezegd, kunnen onderzoekers op dit moment bepalen of een Dna monster afkomstig is van een man of een vrouw. Dat kan door te kijken naar het Y-chro-mosoom, dat alleen voorkomt bij mannen.

Het tweede uiterlijke kenmerk, de etnische afkomst, kunnen onderzoekers binnenkort stukken beter voor-spellen. onderzoekers van het Forensisch laboratorium voor Dna-onderzoek in Leiden zijn nog druk bezig met het ontwikkelen van zo’n test. In die test kijken ze naar combinaties van Dna-kenmerken, die bij sommige

bevolkingsgroepen vaker voorkomen en bij een andere juist weinig. Het zal waarschijnlijk niet mogelijk zijn om die afkomst met volledige zekerheid vast te stellen, maar de informatie kan voor justitie wel een aan-knopingspunt zijn voor verder onderzoek. Bovendien kan deze informatie het aantal mogelijke verdachten terugbrengen.

andere uiterlijke kenmerken kunnen we op dit moment nog niet vaststellen, maar wetenschappers zijn er al wel naar op zoek. Britse onderzoekers kijken bijvoor-beeld naar de kleurstoffen (pigmenten) die zorgen voor de kleur van oog, haar en huid. Ze onderzoeken de genen die zorgen voor rood haar en sproeten. en die informatie is vooral in Groot-Brittannië en Ierland erg waardevol! Wat we niet mogen vergeten is dat voedsel en omge-ving ook een grote invloed hebben; die zorgen voor veel variatie. omdat niet iedereen met genen om lang te worden uiteindelijk de twee meter bereikt, is het ook nog maar de vraag of onderzoekers voor al deze ken-merken wel betrouwbare tests kunnen ontwikkelen.

Maar zelfs al is er een test beschikbaar om nieuwe kenmerken vast te stellen, dan mag justitie die pas gebruiken wanneer die nieuwe kenmerken in de wet zijn opgenomen. Zonder wettelijke toestemming mag justitie er niets mee doen.

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

43

aL

Le

so

Ve

rD

na

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

HOE VER GAAN WE?

Wat wel en niet mogelijk is, dat zal de toekomst ons leren, maar we kunnen wel vast nadenken welke informatie we zouden willen gebruiken. De staat heeft namelijk de plicht om zowel de samenleving als haar individuele burgers te beschermen, maar waar ligt de grens? Wanneer komt onze privacy in het geding? of wordt die niet aangetast? Zijn uiterlijk waarneembare kenmerken eigenlijk wel privé? tegelijkertijd weten we dat het onderzoek naar uiterlijk waarneembare per-soonskenmerken in veel gevallen alleen een voorspel-ling doet. Leidt deze informatie dan wel naar de dader? Hoe gaan de rechercheurs met de informatie om?tilburgse onderzoekers vragen zich daarnaast af

waarom justitie geen gegevens over iemands gedrag of erfelijke ziekten mag gebruiken. Zouden we niet juist naar psychologische kenmerken moeten zoeken? Dit geeft misschien informatie over de leefstijl van de verdachte. Is dat niet in het belang van de opsporing? of raken we dan echt onze privacy kwijt?

Zijn deze roodharigen straks makkelijker op te sporen?

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

44

aL

Le

so

Ve

rD

na

Door analyse van ons eigen DNA kunnen we onze vroege voorouders opsporen.Zo kunnen we ook zien hoe ze zich ooit over de wereld verspreidden.Door kleine veranderingen in het DNA weten we ook hoe lang die migratie geduurd heeft.

Vanuit Afrika de wijde wereld in

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

Vroeger, minstens 60.000 jaar geleden, was de mens alleen te vin-den op de savanne in centraal Afrika. In die tijd leefden nog meer mensachtigen zoals de Homo neanderthalensis (de neanderthalers) en mogelijk ook nog de Homo erectus. We weten dat uiteindelijk de Homo sapiens (de moderne mens) als enige nu nog bestaat en dat deze mens uiteindelijk de hele wereld bevolkte.

OVERBLIjFSELEN

Vanuit afrika trok de mens lang geleden naar de an-dere delen van de wereld. tijdens deze grote migratie liet de mens sporen achter. Zo zijn er overblijfselen van menselijke skeletten gevonden. ook stenen werktuigen en andere spulletjes zijn bewaard gebleven. Dankzij deze sporen is al veel bekend over de route die de mens heeft gevolgd en ook gedeeltelijk hoe lang deze migratie heeft geduurd. Deze informatie kan sinds kort aangevuld worden met informatie uit een ander soort spoor die deze migratie heeft achtergelaten: een spoor in ons Dna!

tijdens de migratie van de mens ontstonden zo nu en dan herkenbare herhalingen in de Dna-sequentie. Dit zijn vaak herhalingen van drietallen Dna-bouwstenen die niet voor een erfelijke eigenschap coderen (bij-voorbeeld aCtaCtaCtaCt). Wanneer deze repetities eenmaal in de sequentie zitten gaan ze er maar heel moeilijk uit. alle nakomelingen krijgen dus diezelfde herkenbare sequentie. Zo’n herkenbaar stuk Dna wordt een marker genoemd. Deze markers kunnen gebruikt worden om de route van de migratie te ach-terhalen.

De migratie van de mens heeft dus niet alleen sporen in de omgeving achtergelaten, maar ook in het Dna. Wanneer op een gegeven moment een marker ontstond in het Dna van een familie kreeg iedere nakomeling vervolgens diezelfde marker mee. Mensen aan het eind van de migratie hebben dus de verzameling van alle markers van hun voorouders, terwijl mensen aan het begin van de migratie geen van die markers hebben.

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

45

aL

Le

so

Ve

rD

na

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

De aanwezigheid (en afwezigheid) van markers in de hedendaagse mens is dus een aanwijzing voor de plek waarop hun voorouders in de migratie zijn blijven hangen. Mensen uit India bijvoorbeeld hebben wel nog de verzameling van markers die ontstaan zijn tijdens de migratie van afrika naar India. alle markers die na-derhand ontstaan zijn, van India naar andere delen van azië bijvoorbeeld, hebben ze niet. Zo is aan de com-binatie van markers af te lezen welke route iemands voorouders hebben afgelegd, vanaf de oorsprong in afrika naar de plek waar ze nu wonen.

Met Dna kunnen we niet alleen de route van de migratie bepalen; het is ook mogelijk om vast te stellen hoeveel generaties deze migratie heeft geduurd. tij-dens de migratie ontstaan namelijk niet alleen markers in het Dna. De héle Dna sequentie verandert gestaag met elke nieuwe generatie. Hoeveel het Dna van twee mensen verschilt, is een maat voor hoe lang geleden zij een gezamenlijke voorouder hebben. Wanneer de migratie van de ene naar de andere plek heel kort heeft geduurd, in de tijd van enkele generaties, zal het Dna niet veel zijn veranderd. Wanneer een migratie vele generaties heeft geduurd, zal het Dna veel meer zijn veranderd. op die manier kan een tijdlijn worden gemaakt die past bij de migratie van de mens.

REcONStRuctIE

De migratieroute is nu compleet. Door te kijken naar de genetische markers kan de route worden bepaald

die de mens heeft afgelegd. Door te kijken naar klei-nere verschillen in het Dna kan de tijdslijn van deze route worden gereconstrueerd. Zo kan aan de hand van de markers die iemand in het Dna heeft worden nagegaan welke route zijn of haar voorouders hebben afgelegd in de migratie uit afrika, en ook hoe lang iedere afstand heeft geduurd.

Van oorsprong zijn we

allemaal Afrikaans

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

46

aL

Le

so

Ve

rD

na

Om genetica toe te kunnen passen is het belangrijk om te weten hoe het genetisch landschap eruit ziet.Een genetische kaart van het Y-chromosoom in Nederland anno 2008 is zo goed als af.Deze kan gebruikt worden bij forensisch onderzoek.

Nieuwsgierig naar DNANiet alleen onderzoekt Peter de Knijff, hoogleraar populatiegenetica aan het Leids universitair medisch centrum, DNA-sporen, hij bestu-deert ook sporen in DNA. Regelmatig verschijnt hij voor de rechter om resultaten van DNA-onderzoek in moordzaken te presenteren. Ondertussen werkt hij ook samen met archeologen, taalkundigen, geologen, klimatologen, geschiedkundigen en andere genetici om de ontstaansgeschiedenis van de mens in kaart te brengen. DNA alleen vertelt namelijk niet genoeg. Andere vakgebieden zijn nodig om waar-nemingen te kunnen verklaren.

Peter de Knijff’s voornaamste studieobject is het Y-chromosoom, het geslachtschromosoom dat alleen bij de man voorkomt. “Binnen twee jaar kunnen we complete Y-chromosomen sequencen. Door dit wil-lekeurig te doen, kunnen er nog zoveel andere dingen ontdekt worden.” en dat terwijl er nu al veel interes-sante ontdekkingen gedaan zijn. Maar de wetenschap houdt nooit op, zeker niet voor Peter de Knijff: “Je kunt zoveel leuke dingen doen! Qua technologie is er

al zoveel mogelijk. eigenlijk is je fantasie de beperkende factor.”

GENEtIScHE KAARt

op het lab van Peter de Knijff zijn onderzoekers bezig met zowel forensisch onderzoek als onderzoek naar de ontstaansgeschiedenis van de mens op basis van markers in het Dna. ook richten zij zich op het in kaart brengen van genetische variaties tussen bevolkingen. Peter de Knijff: “Je kunt pas zinvol genetica toepassen als je het basislandschap in kaart hebt gebracht. Geen enkele erfelijke ziekte komt bijvoorbeeld in nederland even vaak voor. er zijn regionale en lokale verschillen. Deze kunnen veroorzaakt worden door omgevingsfac-toren, maar ook door genetische verschillen. Zodra je dit weet, kun je hiervoor corrigeren. Dan begrijp je de incidentie van ziektes van a tot Z.”

op dit moment is er weinig bekend over de genetische variaties in nederland. “Het is moeilijk om voldoende

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

47

aL

Le

so

Ve

rD

na

informatie te krijgen over hoe divers nederland is en waar we vandaan komen.” Peter de Knijff is nu druk bezig met het maken van genetische kaarten van nederland. Dit doet hij in eerste instantie voor het Y-chromosoom. Maar het is ook de bedoeling dat er een overzicht komt van autosomaal Dna (van de niet-geslachtschromosomen) en mitochondriaal Dna. Voor het Y-chromosoom is het overzicht anno 2008 zo goed als klaar.

jANSEN, BAKKERS, DE BOER.. .

om meer zicht te krijgen op de migratiestromen in nederland heeft Peter de Knijff ook een onderzoek opgezet om een genetische kaart te maken van ne-derland 300 jaar geleden. “Voor dit onderzoek kun je Dna uit skeletten en botten onderzoeken, maar dat is ontzettend veel en lastig werk. Meer dan 95% van wat je vindt bij Dna isolatie uit tanden van skeletten is Dna van bacteriën en planten. Vaak is slechts maar 1% menselijk Dna.” Vandaar dat De Knijff het op een heel andere manier aanpakt. “We gaan gebruik maken van achternamen. 300 jaar geleden werden namelijk voor het eerst achternamen ingevoerd.”

een Italiaanse taalkundige heeft de geografische verspreiding van duizenden achternamen in nederland bekeken. De achternamen Jansen en Bakkers komen bijvoorbeeld in heel nederland voor, maar er zijn ook achternamen die alleen lokaal algemeen voorkomen. Dit zijn achternamen die op die plek zijn ontstaan en

100%

95%

90%

85%

80%

75%

70%

25%

20%

15%

10%

5%

0%

Resultaat van DNA-test onder

2.000 mannen. Percentages:

mannen met voorvaderen die in

het Oude (boven) dan wel het

Nieuwe Stenen Tijdperk (onder)

Nederland zijn binnengekomen.

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

48

aL

Le

so

Ve

rD

na

daar zijn gebleven. Het Y-chromosoom is dus waar-schijnlijk ook in die regio’s op zijn plek gebleven. “Ik hoop dat de kaarten van nu en van 300 jaar geleden anders zijn, want dan is het resultaat te zien van 300 jaar migratie.”

IN DE REcHtSzAAL

De kennis over de migratie en Y-chromosomaal Dna komt van pas bij het analyseren van forensische Dna-sporen. op basis van autosomaal Dna, dat persoon-specifiek is, is te zeggen of het forensisch spoor van de verdachte afkomstig is. Bij Y-chromosomaal Dna en mitochondriaal Dna is dat een ander verhaal. Gege-vens over hoe vaak een bepaald profiel voorkomt op een bepaalde locatie zijn nodig om een betrouwbare

schatting te maken. een overeenkomst in Y-chromoso-maal of mitochondriaal Dna kan namelijk toeval zijn. Peter de Knijff haalt er een voorbeeld bij: “In de Put-tense moordzaak was er een mitochondriale match tus-sen een haar en een van de twee verdachten. Dit zegt echter nog niets. Het kan zijn dat dit mitochrondriale Dna profiel algemeen is voor Putten.”

In een moordzaak wordt Peter de Knijff gevraagd om Dna sporen te analyseren. Vaak krijgt hij een stukje materiaal aangeleverd zoals een haar of een bloedvlek op een kledingstuk. Meer weet hij meestal niet van de moordzaak. Hij zoekt uit of het Dna spoor overeen-komt met een verdachte. Daarmee is de zaak echter niet opgelost. “een match tussen een forensisch spoor

Deel van een forensisch DNA-profiel

De

Me

ns

oP

He

t s

Po

or

49

aL

Le

so

Ve

rD

na

en een persoon zegt alleen maar dat het spoor van die persoon af kan komen, meer niet.” Dat is dan ook wat Peter de Knijff in de rechtszaal meedeelt. Daar vertelt hij vooral iets over de kracht van het bewijs.

NIEuWSGIERIG

Het lijkt erop dat Peter de Knijff alle facetten van het Dna-onderzoek mag toepassen. Hij werkt met veel partijen samen om zowel de humane migratie als moordzaken uit te pluizen. Zijn drijfveer: nieuwsgierig-heid. “Ik ben wetenschapper omdat ik geïnteresseerd en nieuwsgierig ben. Door niet alleen in het lab te zijn, maar ook in de rechtszaal ben je veel meer dan wie dan ook doordrongen van de maatschappelijke aspecten van je eigen onderzoek.”

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

50

aL

Le

so

Ve

rD

na CTG

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

51

aL

Le

so

Ve

rD

naACKanker komt door fouten in het Dna. Door een verzameling van schadelijke veranderingen ontspoort

het normaal zo goede mechanisme dat zorgt voor celdeling. De oplossing lijkt eenvoudig: herstel de fouten en de deling stopt. Dit blijkt moeilijker dan verwacht. De tweede optie klinkt nog eenvoudiger: voorkom Dna-schade. Maar ook dat is makkelijker gezegd dan gedaan, want schade ontstaat op alle mogelijke manieren, door omstandigheden die we vaak niet kunnen voorkomen. sterker nog, een van de belangrijkste veroorzakers van Dna-schade is de energieproductie in onze eigen cellen. soms heeft iemand ‘aanleg’ voor een bepaalde kankersoort. eén of meer van de schadelijke veranderingen in het Dna is dan al overgeërfd van één van de ouders. ook bij veel andere ziektes speelt zo’n overerving een rol. Bij sommige aandoeningen, zoals spierziekte Duchenne, ligt de oorzaak zelfs in één of enkele genen. Zou gentherapie hier uitkomst kunnen bieden?

Foutje bedanktT

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

52

aL

Le

so

Ve

rD

na

Kanker ontstaat door ontsporing van celgroei.Schade aan DNA is hier de oorzaak van.Herstel hiervan is lastig, maar er zijn steeds meer mogelijkheden om in te grijpen.

Kankergenen opsporenKanker ontstaat door boze gedachten, zei men vroeger. Volgens de middeleeuwse geleerde Paracelsus kwam kanker door het onderdruk-ken van wensen en behoeften, zoals seks. Inmiddels weten we dat kanker iedereen kan overkomen. Om kanker te voorkomen at Linus Pauling, een bekende chemicus en Nobelprijswinnaar, iedere dag tien gram vitamine c. toch overleed hij aan kanker. zo makkelijk is het dus niet. Eeuwenlang hebben wetenschappers en artsen geprobeerd de oorzaak van kanker op te sporen, maar pas sinds we weten hoe onze genen werken, krijgen we een idee wat er werkelijk gebeurt.

EERStE KANKERGEN

Het eerste kankergen - het src gen - werd in 1976 ont-dekt door amerikaanse onderzoekers die werkten aan kippenvirussen. Ze bestudeerden zogenoemde retro-virussen; virussen die hun eigen genen toevoegen aan die van de geïnfecteerde cellen. De geïnfecteerde cellen veranderen hierdoor in kankercellen. De onderzoekers concludeerden dat het virus een gen bevat dat kanker veroorzaakt. omdat virussen maar weinig genen heb-

ben, werd het verantwoordelijke gen snel geïdentifi-ceerd. Vervolgens ontdekten de onderzoekers dat het kankerverwekkende virusgen bijna identiek was aan een gen dat niet alleen in normale kippencellen, maar in de cellen van alle dieren voorkomt. Dat gen speelt een rol bij het regelen van de celdeling. Het zorgt voor

Delende kankercellen

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

53

aL

Le

so

Ve

rD

na

de productie van een eiwit, dat een belangrijke rol speelt bij het doorgeven van groeisignalen in een cel. Zodra zogenoemde groeifactoren aan de buitenkant van de cel vasthechten, start dit eiwit de celdeling. In kankercellen bevat het gen fouten waardoor het eiwit zodanig veranderd is, dat het ook zonder groeifac-toren de cellen tot deling aanzet. In 1989 kregen de onderzoekers Harold Varmus en Michael Bishop voor de ontdekking van het eerste kankergen de nobelprijs. tegenwoordig kennen we een lange lijst van genen die op de een of andere manier betrokken zijn bij de regulatie van celdeling en die in tumoren zo veranderd zijn dat ze de cellen continu tot celdeling aanzetten.

GEN INBRENGEN

De oplossing voor dit probleem lijkt voor de hand te liggen: herstel de fouten in het gen. Deze aanpak wordt ‘gentherapie’ genoemd. Hierbij wordt het goede, ongemuteerde gen in een cel ingebracht, waardoor het goede eiwit wordt aangemaakt en de cel zijn normale functie kan uitvoeren. Maar dat blijkt toch ingewik-kelder dan gedacht. Het is moeilijk om genen in li-chaamscellen in te brengen. Genen zijn vergeleken met bijvoorbeeld medicijnen ontzettend groot. Daardoor is het lastig om ervoor te zorgen dat ze in de kankercellen terecht komen. er wordt gewerkt aan nieuwe manieren om gentherapie toe te passen, maar het is nog onzeker of dat gaat lukken. Lukt het wel, dan duurt het zeker nog tientallen jaren voordat het een routinebehande-ling is.

Celdelingtijdens de zogenaamde mitose deelt één cel zich in twee dochtercellen. Deze dochtercellen zijn genetisch identiek aan de oorspronkelijke oudercel. In normale cellen sturen twee regelmechanismen de celdeling. Vergelijk het met het gaspedaal en het rempedaal van een auto. Het gaspedaal bestaat uit een netwerk van signalen die de cellen aanzetten te gaan delen. Deze signalen zijn groeifactoren die door omringende cellen zijn afgegeven. Die groeifactoren sturen een signaal naar de kern van de cel, waar het Dna is opgeslagen. Daar wordt de groei en celdeling geactiveerd.

Het moleculaire rempedaal bestaat uit genen die de groei en celdeling remmen. ook hun bijdrage is erg belangrijk voor de regeling van de celdeling.

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

54

aL

Le

so

Ve

rD

na

De voorkeur gaat uit naar het ingrijpen in de pro-cessen die fout gaan doordat een gen is veranderd. Bijvoorbeeld door een stof te ontwikkelen die het eiwit blokkeert dat cellen continu tot celdeling aanzet. Maar er zijn veel verschillende manieren waarop eiwitten continue celgroei kunnen veroorzaken. Dat betekent dat we in detail moeten begrijpen hoe het hele proces werkt om nieuwe kankergeneesmiddelen te ontwik-kelen die echt goed werken. een auto kan je ook alleen repareren als je weet waar je mee bezig bent.

LEEF GEzOND

afwijkingen in de genen ontstaan weliswaar toevallig, maar er zijn wel factoren die genveranderingen kunnen beïnvloeden. Daarom hadden Paracelsus en Pauling ook wel een beetje gelijk. Het door Pauling geslikte vitamine C blijkt inderdaad te werken tegen bepaalde schadelijke stoffen die in Dna veranderingen veroorza-ken. ons eigen afweersysteem kan genveranderingen herkennen en repareren. en kennelijk werkt dat beter als wij lekker in ons vel zitten en zoals Paracelsus zei, naar onze wensen en behoeften leven. Dus, blij leven en gezond eten zijn weliswaar geen therapie tegen kanker, maar helpen misschien de kans op kanker te verkleinen. Volgens Linus Pauling was de kanker bij hem twintig jaar uitgesteld.

GentherapieGentherapie is een behandeling om aandoeningen te genezen, waarbij genen worden vervangen of toege-voegd aan cellen. De eiwitten die deze genen produce-ren helpen bij de therapie. een kapot gen in bepaalde cellen kan vervangen worden door een goed werkend gen. of genen worden toegevoegd in cellen van een tumor.

Bij deze therapie wordt een gen op een specifieke plaats in het lichaam ingebracht. Dit gebeurt door-gaans met behulp van een virus. Virussen bouwen van nature Dna in een gastheercel in om zich te kunnen voortplanten en zijn daarom geschikt voor gentherapie. onderzoekers maken eerst een geschikt virus onscha-delijk. Vervolgens wordt het gewenste menselijke gen in het Dna van het virus geplaatst. tot slot injecteren artsen het virus in het lichaam van de patiënt.

Gentherapie bevindt zich nog in experimentele fase. Men verwacht dat de therapie in de toekomst bruik-baar is voor bepaalde stofwisselingsziekten en ziekten waarvan één enkel gen de boosdoener is, zoals hemo-filie en problemen met de vetstofwisseling. ook is er op dit gebied veel onderzoek naar kanker.

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

55

aL

Le

so

Ve

rD

na

In levende cellen ontstaat altijd DNA-schade.Meestal repareert de cel dit zelf, maar niet altijd.Door je reparatiesysteem te optimaliseren kun je kanker en veroudering remmen.

DNA reparatie in de strijd tegen kankerOns DNA wordt voortdurend gebombardeerd met stoffen die het kapot maken. Bovendien ontstaan er ook fouten als een cel zich deelt doordat er iets mis gaat bij het kopiëren van het DNA. Ondanks al deze fouten zijn er maar heel weinig cellen die ontsporen en overgaan in een kankercel. Het geheim: iedere cel bevat een ingenieuze repara-tiedienst die de schade steeds weer herstelt.

OP DE RAILS

Dna is het enige molecuul in een cel dat gerepareerd wordt. alle andere grote moleculen, zoals rna, eiwit-ten en koolhydraten, worden regelmatig afgebroken en opnieuw aangemaakt op basis van de genetische code die in het Dna is opgeslagen. schade aan het Dna veroorzaakt een verandering van de genetische code, waardoor de verkeerde eiwitten worden gemaakt in een cel. Dat kan leiden tot ontsporen van de cel en het ontstaan van kanker. om een cel gezond te houden moet het Dna intact blijven.

Cellen hebben een grote klus om zichzelf op de rails te houden. Zelfs als we contact met schadelijke stoffen of straling (zoals sigarettenrook en UV-straling) helemaal vermijden, dan ontstaan er in iedere cel in ons lichaam dagelijks wel tienduizend Dna-beschadigingen. Die worden veroorzaakt door moleculen die ons lichaam zelf aanmaakt. Het gaat om een soort veranderde zuurstofmoleculen, bijproducten van onze normale energiehuishouding. Deze moleculen maken het Dna kapot, ongeveer net zoals zuurstof ijzer doet roesten.

en dat is nog niet alles. schade ontstaat ook door fou-ten tijdens de celdeling. Het Dna in iedere menselijke cel bestaat uit twee strengen met totaal zes miljard bouwstenen. Met zoveel bouwstenen is de kans dat er iets mis gaat tijdens het kopiëren best groot. en vooral bij snel delende cellen, zoals die in het darmepitheel, tikt dat aardig aan.

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

56

aL

Le

so

Ve

rD

na

als al deze fouten in het Dna zich zouden opstapelen dan zou ons leven niet lang duren. Maar gelukkig heb-ben cellen diverse reparatiemechanismen die continu bezig zijn de fouten te herstellen. Deze systemen zijn gekoppeld aan het netwerk van signalen die celde-ling regelen, waardoor de deling zelfs uitgesteld kan worden totdat alle Dna gerepareerd is. als de schade te groot is dan wordt het zelfmoordprogramma in de cel geactiveerd.

Bij de reparatie zijn heel veel eiwitten betrokken, ieder met hun eigen taak. Zo zijn er eiwitten die de fout in het Dna herkennen, doordat ze de knik kunnen

voelen die ontstaat als er een verkeerde bouwsteen ingebouwd is tijdens het kopiëren. Zodra er een fout gevonden is, worden andere eiwitten ingeschakeld. Deze eiwitten verwijderen de verkeerde bouwstenen zonder de rest van het Dna te vernielen. en tenslotte zijn er eiwitten die ervoor zorgen dat het ontstane gat opgevuld wordt met de juiste bouwsteen.

OuDERDOm

Bij het ouder worden hoort dat alles minder goed gaat werken. en dat geldt helaas ook voor de Dna-repara-tiesystemen. Hierdoor wordt de Dna-schade niet goed meer hersteld. Het gevolg is dat fouten zich opstapelen

Zelfmoord bij cellenVrijwel iedere gezonde cel is in staat een zelfmoordpro-ces in gang te zetten. Dit proces, ook wel geprogram-meerde celdood of apoptose genoemd, is essentieel. Zou dit niet gebeuren, dan zat ons lichaam vol met overbodige oude of kapotte cellen. Verschillende signa-len kunnen het zelfmoordprogramma aanzetten. eerst worden eiwitten en het Dna afgebroken. Daarna valt de cel uit elkaar in kleine stukjes die opgegeten worden door de omringende cellen. naar schatting komen in een volwassen mens iedere dag 50 tot 70 miljard cellen om het leven, op een totaal van zo’n tien- tot honderd-duizend miljard.

DNA repair houdt onze

cellen op de rails

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

57

aL

Le

so

Ve

rD

na

en juist dat vergroot de kans op kanker. Daarom wordt kanker ook wel een ouderdomsziekte genoemd. ouder worden is iets dat we moeilijk kunnen voorkomen. on-derzoek aan muizen heeft echter laten zien dat we het misschien wél kunnen vertragen, door minder te eten. Muizen die onbeperkt voedsel voorgeschoteld krijgen, leven veel korter en zien er eerder oud uit dan muizen die maar een beperkt aantal calorieën per dag mogen eten. Bovendien neemt in de groep veelvraten de Dna-schade ook veel sneller toe. onderzoekers den-ken dat dit komt door een sneller verbrandingsproces waardoor er meer bijproducten ontstaan die het Dna beschadigen. Minder eten vermindert ook de kans op kanker. Muizen met een mutatie in een bepaald gen, het tumorsupressor-gen (tumoronderdrukkend) aPC, krijgen heel veel poliepen. Dat zijn gezwellen in de darmen die uit kunnen groeien tot een tumor.

EEt BEtER

echter, als zulke muizen 40% minder eten krijgen dan ze normaal kunnen verorberen, dan is hun kans om zulke poliepen te krijgen wel 60% kleiner. Het lijkt er dus op dat een dieet met een beperkt aantal calorieën veroudering vertraagt en de kans op darmkanker verlaagt. Denk je dat jij niet minder kan gaan eten? eet dan beter. Muizen die zoveel aten als ze wilden van een dieet rijk aan olijfolie, fruit en groenten hadden 33 procent minder darmpoliepen dan de muizen die zich volvraten aan een gewoon muizendieet.

Een beschadiging in het DNA is in het

geel weergegeven. Eiwitten herkennen

deze beschadiging en verwijderen

deze en zorgen voor de reparatie die

helemaal onderaan te zien is. Illustra-

tie Graham Johnson (graham@fivth.

com) gemaakt voor het Howard

Hughes Medical Institute

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

58

aL

Le

so

Ve

rD

na

Met DNA-chips kun je de activiteit van genen in beeld brengen.Dit is een doorbraak in de opsporing van uitzaaiingen bij borstkanker.Mogelijk kan de chip straks ook de kans op borstkanker voorspellen.

De wereld veroverd met een DNA-chipVolgens eigen zeggen duurde het drie jaar voordat ze werkelijk begreep op welke vragen artsen en patiënten een antwoord zoeken. maar intussen heeft moleculair biologe Laura van ‘t Veer internationa-le roem verworven met haar onderzoek naar de genetische oorsprong van kanker. ze ontwikkelde een test die de kans op terugkeer van de ziekte na een borstkankeroperatie voorspelt.

GROtE StAP

als onderzoeker van de afdeling moleculaire patho-logie van het antoni van Leeuwenhoek ziekenhuis is Laura van ‘t Veer zich dagelijks bewust van het belang van moleculaire kennis voor patiënten. De toepassing van de Dna-chip technologie bij borstkanker vormt een schoolvoorbeeld van hoe ontdekkingen achter de labtafel direct van nut kunnen zijn voor de behande-ling van de patiënt. Van ‘t Veer: “een belangrijke vraag bij kanker betreft het risico dat de ziekte naar verloop van tijd terugkeert. In de praktijk leest men dit risico af aan de leeftijd van de patiënt, de grootte van een

tumor, hoe de tumor er uitziet onder de microscoop en nog een paar van dat soort kenmerken. Met Dna-chips (ook wel microarrays) hebben we een grote stap vooruit kunnen zetten doordat je met één experiment naar de activiteit van alle genen kunt kijken. Daarmee kunnen we agressieve en minder agressieve tumoren van elkaar onderscheiden.” Zie ook kader ‘microarray’ op bladzijde 59.

sinds haar publicatie in het vakblad Nature is de naam van Van ‘t Veer onlosmakelijk verbonden met de Dna-test voor borstkanker. De ontdekking van het genetisch borstkankerprofiel heeft uiteindelijk een impact gehad die de verwachtingen van Van ‘t Veer overstegen: “Uiteindelijk bleek dat het artikel over het borstkanker-profiel een veel breder publiek aansprak dan verwacht. Voor biologen was het interessant omdat het iets vertelde over de processen die bij uitzaaiing betrokken zijn. Voor artsen was het voorspellen van het risico op uitzaaiing van belang. Het bleek ook voor bio-infor-

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

59

aL

Le

so

Ve

rD

na

matici interessant omdat we allerlei nieuwe analyse-technieken gebruikten.” Dit toont het multidisciplinaire karakter van dit onderzoek aan. “De samenwerking met pathologen, medisch oncologen, chirurgen en radiotherapeuten is essentieel om de resultaten te interpreteren en te presenteren zodat het door anderen wordt opgepikt.”

KAPItAAL

Dat haar onderzoeksresultaten worden opgepikt, bewees de ‘Lifetime achievement award’ die ze in juli 2007 ontving van de europese vereniging van medisch oncologen, samen met haar collega onderzoeker rené Bernards. De prijs, waaraan een bedrag van 50.000 euro is verbonden, vormt volgens Van ‘t Veer de bekroning op het succesvolle teamwerk van biologen, statistici en artsen. Dit teamwerk wordt voortgezet bin-nen het bedrijf agendia, waarvan Van ‘t Veer mededi-recteur is. “onze vinding om bij borstkankerpatiënten het wel of niet krijgen van uitzaaiingen te kunnen voorspellen, werd door iedereen gezien als belangrijke informatie die van nut was voor patiënten. We hadden destijds de keuze dat het nederlands Kanker Instituut deze Dna-chip alleen bij zijn eigen patiënten ging toepassen of dat we het groter gingen aanpakken. om het voor meer patiënten beschikbaar te maken was ka-pitaal nodig en dat is de reden geweest om een bedrijf op te zetten.” op de vraag of ze wel eens spanning voelt tussen commerciële belangen en de belangen van de patiënt, antwoordt ze ontkennend. “Je moet

je bewust zijn van beide belangen, maar uiteindelijk levert de combinatie tussen commercieel inzicht en academische kennis meerwaarde die ten goede komt aan patiënten.”

HOOP OF HyPE?

In nederland en andere europese landen kan de borst-kanker Dna-test sinds 2004 worden aangevraagd. Deze vorm van diagnostiek behoort in ons land nog niet tot de standaardonderzoeken, maar de behande-lend arts kan vaststellen wanneer een patiënt ervoor in aanmerking komt. na de FDa-goedkeuring in februari 2007 is de Dna-test intussen ook doorgedrongen tot de amerikaanse klinieken. na het aanvragen van de test, stuurt de oncoloog of patholoog een stukje van de tumor naar het laboratorium van agendia. Vervolgens wordt het materiaal daar geanalyseerd met de Dna-

borstkankerpatiënt

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

60

aL

Le

so

Ve

rD

na

chip en krijgt de arts de uitslag: hoog of laag risico. op basis daarvan kan het vervolgbehandeltraject van de patiënt worden bepaald en eventuele onno-dige chemotherapie worden voorkomen.

tot op heden wordt de microchiptechniek alleen gebruikt bij borstkankerpatiënten. ondanks dat dit de meest voorkomende kankersoort onder vrouwen is, schat Van ‘t Veer dat in nederland ‘slechts’ een paar honderd patiënten per jaar baat hebben bij de test. tijdens een publieksmanifestatie waarschuwde ze dan ook een publiek van 1.500 pa-tiënten en betrokkenen voor het creëren van een hype. “De Dna-chip techniek heeft zich intussen bewezen als belangrijke ondersteuning bij behandelingsvragen van individuele borstkankerpatiënten. Maar er zal op

korte termijn geen genetische test worden ontwikkeld voor bevolkingsonderzoek. “In dat verband verwijst Van ‘t Veer naar de vijf nieuwe ‘kankergenen’ die onlangs zijn ontdekt en een rol spelen bij het ontstaan van borstkanker, oftewel het voorspellen of je risico loopt de ziekte te krijgen.” Veel vrouwen (10 tot 60 procent) hebben één van deze ‘defecte varianten’ van de vijf genen, en een zeer licht verhoogd risico. Wel-licht is binnen twee tot drie jaar de chiptechnologie zover ontwikkeld dat er ook kan worden getest op

deze genen, maar “of dit in de praktijk gebruikt zal worden valt nog te bezien”, waarschuwt Van ‘t Veer, “want wat moet een vrouw met de kennis dat haar risico licht verhoogd is?”

DNA-chip of microarray

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

61

aL

Le

so

Ve

rD

na

Met microarrays kijken onderzoekers naar de activiteit van genen.Dat is bijvoorbeeld nuttig bij het opsporen van darmkankergenen.Hierdoor kan al heel vroeg gezien worden of iemand deze kanker ontwikkelt.

Rekenen aan darmkankerIn de speurtocht naar de genen die betrokken zijn bij het ontstaan van darmkanker vergelijkt judith Boer duizenden genen van patiënten met die van gezonde mensen. Een hele tour. Daarom zijn slimme compu-terprogramma’s een must.

Judith Boer is per toeval in de bioinformatica gerold. Ze had de computer nodig bij haar onderzoek aan darmkankergenen bij het Leids Universitair Medisch Centrum. Ze gebruikte daarvoor microarrays of Dna-chips, waarmee je van duizenden verschillende genen tegelijkertijd de activiteit kan bepalen.

BOttLENEcK

een Dna-chip lijkt wel op een groot vier-op-een-rij, maar dan met duizenden vakjes of spotjes.elk van deze spotjes (plekjes) op een microarray stelt de activiteit van één gen voor. Dat gen kan extra actief zijn in tumorweefsel en daardoor kan het bijbehorende spotje rood kleuren op de microarray. Kleurt het spotje

groen, dan is het gen juist meer actief in normaal weefsel. Maar wanneer is een beetje rood nog steeds rood en een beetje groen groen? naast de software die nodig is om de kleur van de microarray spots te meten, heb je ook software nodig die bepaalt welke intensiteit de spotjes hebben. nu is er voor het analyseren van microarray resultaten geen computerprogramma dat precies doet wat je wilt. Daarom begon Judith Boer met het maken van haar eigen programma’s.

ERFELIjKE DARmKANKER

eén van de toepassingen waar ze de software voor ontwikkelde is het onderzoek aan erfelijke darmkanker. er zijn patiënten met erfelijke darmkanker die maar één kopie (in plaats van twee) bezitten van het aPC-gen, een gen dat de vorming van tumoren onderdrukt. Deze mensen lopen een extra grote kans op het krijgen van een tumor. Zodra in een lichaamscel de ene kopie van het gen gemuteerd wordt of verdwijnt, is de kans gro-ter dat die cel zich ontwikkelt tot een tumorcel.

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

62

aL

Le

so

Ve

rD

na

Wanneer het aPC-gen niet langer actief is, is het totale Dna van zo’n cel (het genoom) minder stabiel. er vallen dan gemakkelijk stukken Dna weg of er komen extra stukken Dna bij. In zo’n situatie kan een cel extra snel een tumor opleveren. Voordat er tumoren in de darm ontstaan, vormen zich poliepen, een soort goedaardige uitstulpingen.

POLIEPEN

Boer en collega’s onderzoeken nu of je aan een poliep al kunt zien of het genoom instabiel is en er dus een groter risico op kanker is. Met behulp van microarrays onderzoeken ze of er delen van het genoom zijn weg-gevallen en of er bepaalde genen extra of verminderd actief zijn geworden. Door te zoeken in gebieden waar die ‘gaten’ en delen met veranderde activiteit bij elkaar in de buurt zitten hoopt men genen te vinden die belangrijk zijn in het ontstaan van darmkanker. om de gegevens met elkaar te combineren is software nodig. Dat is nu waar de bioinformatica te hulp komt.

cHROmOSOOm 13

Inmiddels heeft de groep van Boer een gebied ontdekt op chromosoom 13 waar zich mogelijk nieuwe genen, kandidaatgenen, bevinden die een rol spelen in erfelijke darmkanker. omdat chromosoom 13 ook vaak in extra kopieën aanwezig is in niet-erfelijke darmkanker, is deze vondst mogelijk ook van belang voor veel meer darmkankerpatiënten. Zo’n kandidaatgen moet nog uitgebreid onderzocht worden voordat je weet of het

Microarray een microarray is een klein (micro) recht-hoeking plaatje met daarop kleine drup-peltjes / stipjes met Dna in een matrixpa-troon (array). Ieder stipje op de microarray bevat een stukje van het Dna van één specifiek gen van bijvoorbeeld de mens. alle stipjes samen vertegenwoordigen het complete genoom van de mens of een deel ervan. een microarray wordt ook wel eens ‘Dna-chip’ genoemd. Met een microarray kun je meten welke genen in een bepaald weefsel actief zijn en welke niet. omdat alle genen uit een genoom op een microar-ray staan, kun je met één experiment alle genen tegelijkertijd testen. Dit wordt bij-voorbeeld gebruikt in het onderzoek naar kanker. Kanker wordt vaak veroorzaakt door overactieve genen. als onderzoeker wil je graag weten welke specifieke genen de kanker veroorzaken. Dit kun je bepalen door de activiteit van de genen in gezonde cellen met behulp van een microarray te vergelijken met de activiteit van genen in tumorcellen.

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

63

aL

Le

so

Ve

rD

na

echt een rol speelt bij darmkanker. Daarvoor is vaak nodig meer patiënten in het onderzoek te betrekken om te zien of het gen bij hen ook veranderd is.

GIGA

sinds 2007 staat er op een lab binnen het Leids Uni-versitair Medisch Centrum een zogenaamde megase-quencer, een apparaat dat in één nacht één miljard (1 giga-) basenparen kan sequencen (de volgorde van de basen bepalen). ter vergelijking, het menselijk genoom heeft drie miljard basenparen. Boer: “Hiermee kunnen we in potentie heel snel mutaties vinden bij patiënten. Het probleem is dat we de gegevens nog niet kunnen analyseren. De hoeveelheid gegevens is zelfs zo groot dat ze niet eens meer op de harde schijf van mijn pc bleken te passen. Gelukkig krijgen we binnenkort een krachtig computer cluster. In andere woorden: zonder bioinformatica, geen genoomonderzoek.”

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

64

aL

Le

so

Ve

rD

na

Bij gentherapie wordt via een virus een menselijk gen vervangen.Dit moet dan wel op de goede plek gebeuren.Of gentherapie ooit in geslachtcellen mag worden toegepast, is nog geen uitgemaakte zaak.

Genen reparerenSommige erfelijke aandoeningen worden veroorzaakt door een be-schadiging aan één enkel gen. Als dat ene gen vervangen wordt door een goed exemplaar dan zou die ziekte genezen zijn. Voorbeelden van dergelijke ziekten zijn taaislijmziekte (een longaandoening) en sikkel-celanemie (een bloedziekte). De moeilijkheid van gentherapie, zoals het vervangen van kapotte genen wordt genoemd, is om de nieuwe genen in de celkernen van de cellen van patiënten te krijgen.

VIRuS ALS VERVOERmIDDEL

Virussen zijn heel geschikt om Dna in cellen van men-sen te brengen. Ze hebben in de loop van de evolutie allerlei trucs ontwikkeld om cellen te infecteren. Virus-sen planten zich voort door hun Dna in de celkern te laten nestelen en zo de cel te dwingen om kopieën van het virus te maken. Uit het virus worden de genen verwijderd die ervoor zorgen dat de geïnfecteerde cel kopieën van het virus gaat maken. nu is het een ideaal transportmiddel geworden om nieuwe genen in een cel te brengen. Het vervangende gen wordt in

het virusdeeltje gezet. Het virus besmet de cel met het nieuwe gen en de ziekte geneest. althans, zo gaat het in theorie. De praktijk is veel weerbarstiger.

Bij in-vitro-gentherapie wordt er bij de patiënt een aantal cellen weggenomen. Die cellen worden op het laboratorium in een kweekbakje in leven gehouden. Daar infecteren onderzoekers de cellen met het virus met het nieuwe gen. De geïnfecteerde cellen die het nieuwe gen in hun Dna hebben opgenomen wor-den vervolgens weer teruggeplaatst in de patiënt. Bij de eerste succesvolle toepassing van gentherapie, begin jaren negentig, werd van deze techniek gebruik gemaakt. De patiënt, een tienjarig meisje, leed aan een ziekte van haar afweersysteem. Hierdoor was ze ex-treem gevoelig voor infecties. een paar beenmergcellen kregen een gen ingebouwd en werden teruggeplaatst. Die paar cellen waren voldoende om het afweersys-teem te herstellen.

Fo

Ut

Je B

eD

an

Kt

65

aL

Le

so

Ve

rD

na

Bij in-vivo-gentherapie wordt het virus rechtstreeks aan de patiënt toegediend. Door het virus slim te kiezen kan ervoor worden gezorgd dat het virus alleen de zieke cellen infecteert. Bij taaislijmziekte, een aandoening die voornamelijk de longen aantast, hoeven bijvoorbeeld alleen de cel-len van de longen te worden behandeld. Het gen is weliswaar in alle cellen van het lichaam defect, maar hoeft alleen in de longen te worden vervangen. De eerste resultaten met in-vivo-gentherapie vielen tegen. toch blijven de verwachtingen hooggespan-nen. Bij experimenten in muizen blijkt de bloedziekte sikkelcelanemie met gentherapie bijvoorbeeld volledig te genezen.

VEEL ONBEKEND

er zijn nog veel onbeantwoorde vragen over genthera-pie. Zo is het van groot belang om te weten waar het nieuwe gen in het Dna van de patiënt terecht komt. als het gen door het virus op een willekeurige plaats wordt gezet is er een kleine kans dat het de werking van andere genen gaat verstoren. Dat kan allerlei on-gewenste effecten hebben, zoals het ontstaan van kan-ker. Bij een Frans gentherapie-experiment met kinderen

kregen twee patiëntjes bloedkan-ker als gevolg van de genthera-pie. onderzoekers verwachten dat dit probleem oplosbaar is.

een defect aan een gen hoeft niet alleen maar slecht te zijn. som-

mige ziekten blijken ook een functie te hebben. De bloedziekte sikkelcelanemie

bijvoorbeeld, geeft de dragers van het ziekmakende gen weerstand tegen malaria. Het is niet ondenkbaar dat andere erfelijke aandoeningen ook verborgen voordelen hebben.

NAGESLAcHt

In principe worden bij gentherapie alleen cellen gere-pareerd die hun taken door het beschadigde gen niet meer kunnen uitvoeren. De zaad- of eicellen van de patiënt veranderen dus niet. toch blijkt er een kans te zijn dat het nieuwe gen in de voortplantingscellen te-recht komt. op die manier komt het ingebouwde gen in het nageslacht terecht. Dit betekent dat het nage-slacht ook beschermd is tegen de ziekte. Het is echter ook het begin van genetisch ingrijpen in de menselijke soort. Zo’n ingrijpende stap zal eerst in de maatschappij moeten worden besproken en geaccepteerd.

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

66

aL

Le

so

Ve

rD

naGC

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

67

aL

Le

so

Ve

rD

naTACKoppie koppie

Dat veel hersenaandoeningen een genetische component hebben, vermoedden wetenschappers al. Veel kwalen komen immers in bepaalde families vaker voor. De speurtocht naar ziektegenen heeft echter weinig harde resultaten opgeleverd. er spelen vaak meerdere genen een rol en bovendien hangt veel van de omgeving af. Het neurogenetisch onderzoek leerde ons dat psychiatrische aandoeningen helemaal niet zo zwartwit zijn: het zijn extreme gevallen van menselijke karaktereigenschappen. eigenlijk zijn we allemaal op onze eigen manier een beetje gek.

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

68

aL

Le

so

Ve

rD

na

Migraine en depressie hebben beide genetische oorzaken. Waarschijnlijk zit de oorzaak in dezelfde genen.Tweelingonderzoek laat zien dat die invloed belangrijker is dan de omgeving.

Depressief, en nog hoofdpijn ook

migraine is een ernstige vorm van hoofdpijn. Kenmerkend is dat de pijn eenzijdig, in de linker- of rechterhersenhelft van het hoofd, be-gint. Vaak gaat migraine gepaard met misselijkheid, het zien van licht-flitsen en een tijdelijke, gedeeltelijke uitval van het gezichtsvermogen. Een depressie of stemmingsstoornis kan tijdelijk zijn, bijvoorbeeld als gevolg van een ingrijpende gebeurtenis. Sommige mensen hebben last van terugkerende depressies.

IN DE FAmILIE

“Van zowel depressie als migraine is bekend dat ze familiaal zijn; als het voorkomt in je familie, heb je een verhoogde kans om de aandoening te krijgen”, zegt Dorret Boomsma, hoogleraar biologische psychologie aan de Vrije Universiteit. “Die kans is groter als je een eerstegraads verwant hebt met depressie of migraine (bijvoorbeeld een van de ouders of kinderen) dan bij een tweedegraads verwant (bijvoorbeeld een grootou-der).”

Veel inzichten in de rol van de genen bij depressie en migraine zijn afkomstig van tweelingenstudies. eeneiige tweeling paren hebben vrijwel identieke genen (Dna sequentie), twee-eiige tweeling paren hebben evenveel genen gemeen als alle andere broer en zus paren. De genetische verwantschap bij eeneiige tweelingen is dus groter dan bij twee-eiige, terwijl de omgeving (bij-voorbeeld de prenatale omstandigheden, de ouderlijke omgeving of de opvoeding) in grote lijnen hetzelfde is. Dorret Boomsma beheert samen met haar collega eco de Geus het nederlands tweelingenregister, waarin de gegevens van rond de 30.000 jonge tweelingparen en van 25.000 volwassen tweelingen en hun familieleden zijn opgeslagen. Dit register heeft als doel weten-schappelijk onderzoek naar de familiale en genetische determinanten van ziekte en gezondheid. Wetenschap-pers gebruiken het register voor onderzoek naar de ontwikkeling van de hersenen, intelligentie, gedrags- en emotionele problemen van kinderen, gezondheid en

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

69

aL

Le

so

Ve

rD

na

leefgewoonten, angst en depressie, persoonlijkheid en veroudering.

Uit onderzoek met het register blijkt dat, wanneer de ene helft van een tweeling migraine of depressie heeft, de kans bij eeneiige tweelingen het grootst is dat ook de ander het heeft. “De vergelijking tussen eeneiige en twee-eiige tweelingen laat zien dat familiale verwant-schap van depressie en migraine het gevolg is van ge-netische verwantschap. Het komt dus niet doordat de tweelingen opgroeien en leven in eenzelfde omgeving of omdat kinderen het depressieve gedrag van ouders ‘imiteren’.”

mIGRAINE mEt DEPRESSIE?

een belangrijke observatie is dat migraine en depres-sie vaak bij dezelfde persoon voorkomen. De vraag was of depressie misschien migraine veroorzaakt of andersom: kan migraine leiden tot depressie? Geen van beide bleek op te gaan; er is een derde factor in het spel. “Beide aandoeningen worden waarschijnlijk beïnvloed door eenzelfde set genen. als je eeneiige tweelingzus migraine heeft is jouw kans op depressie bijna net zo groot als wanneer je zelf migraine hebt”, aldus Boomsma.

eeneiige tweelingen spelen niet alleen een belangrijke rol bij het onderzoek naar genen, ook voor het onder-zoek aan omgevingsfactoren is het van belang. als de

ene helft van een eeneiige tweeling een aandoening heeft en de ander niet, dan moet daar een reden voor zijn. nu hebben wij geen aanwijzingen dat de depres-sieve persoon iets is overkomen dat de ander niet heeft meegemaakt. ondersteuning door de omgeving lijkt echter wel een rol spelen. De depressieve persoon heeft minder steun van de sociale omgeving dan zijn of haar tweelingbroer of zus.

OmGEVING

De omgeving van een persoon is nog steeds belang-rijk, ook al zijn de genen sterk bepalend voor het tot uiting komen van een aandoening. “Hetzelfde zie je bij

Deze twee hebben vrijwel evenveel kans op depressie en migraine

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

70

aL

Le

so

Ve

rD

na

astma; de kwetsbaarheid voor astma is zeer sterk ge-netisch bepaald. Het stofvrij houden van de omgeving kan de ernst van de aandoening doen verminderen. als je aanleg hebt voor depressie, is het verstandig om situaties met stress zoveel mogelijk te voorkomen en, waar dat niet lukt, in elk geval goede sociale onder-steuning te zoeken.”

er zijn nog geen genen voor depressie ontdekt. op dit moment wordt wel de eerste genoomwijde analyse uitgevoerd door nederlanse en amerikaanse onderzoe-kers, waarin gezocht wordt naar genen voor depres-sie. Voor de meest ernstige vorm van migraine zijn al genen bekend. onderzoekers in Leiden hebben op chromosoom 19 een gen ontdekt dat samenhangt met migraine. De onderzoekers van het tweelingenregister (Boomsma en De Geus) werken nu samen met psychiatrische on-derzoekers (Penninx en Van Dijck). Door het vergelij-ken van de genetische profielen van families met veel depressie of migraine probeert men de regio’s op de chromosomen in kaart te brengen die hiervoor verant-woordelijk zijn. Uiteindelijk hopen de onderzoekers de betreffende genen te vinden. Zowel bij depressie als migraine wordt ook hersenonderzoek gedaan.

Het feit dat er een genetische basis voor depressie en migraine is, wil overigens niet zeggen dat je er niets aan kunt doen. Psychologen en psychiaters blijven ge-

woon aan het werk: “Het is heel goed mogelijk dat een aandoening met een genetische oorzaak, zoals depres-sie, gebaat is bij gedragstherapie. tegelijkertijd zijn er psychische aandoeningen die niet door de genetische aanleg worden veroorzaakt, waarbij het toedienen van geneesmiddelen kan helpen.”“De wetenschap dat hun aandoening een genetische oorzaak heeft is vaak voor patiënten en hun familiele-den een verademing. Het ligt niet aan de opvoeding, dus is de aandoening niet bijvoorbeeld de schuld van de ouders,” zegt Boomsma. Genetica verklaart overi-gens ook waarom iemand zonder depressieve familiele-den de aandoening kan krijgen (door recombinatie van genen) of waarom binnen een gezin de ene broer wel en de andere broer geen migraine heeft. “Met een ge-netische aanleg voor depressie ben je niet voorbestemd om depressief te zijn, maar je risico zou wel groter kunnen zijn dan dat van een ander; en het is verstandig daar rekening mee te houden.”

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

71

aL

Le

so

Ve

rD

na

De zoektocht naar genen achter geestesziektes levert geen zwartwit beeld.Het lijkt erop dat de kwalen in allerlei vormen en maten voorkomen.Eigenlijk zijn we allemaal een beetje gek.

Genen en de zieke geest

Alles wat je als mens voelt, doet en denkt is in principe terug te voeren tot de reacties van cellen in je lichaam. En de werking van jouw cellen is weer het gevolg van het pakketje genen dat je van je ouders hebt meegekregen. Hoe de genen in je lichaam tot uitdruk-king komen, hangt af van heel veel factoren. te veel om te kunnen overzien, ook voor wetenschappers. maar dat is misschien slechts een praktisch probleem. De droom ‘genen als oorzaak van al ons gedrag’ blijft overeind.

PSycHIAtRIScH

als die droom klopt, dan zijn ook ziekten van de geest te begrijpen door de genen van psychiatrische patiënten te bestuderen. en als wetenschappers heb-ben begrepen hoe een bepaalde set genen leidt tot een bepaalde geestesziekte, dan hebben zij een belangrijke stap gedaan op weg naar genezing. Want dan snappen ze waarschijnlijk ook waar ze moeten ingrijpen in de keten van oorzaak en gevolg die leidt tot gekte - en

met welk medicijn ze dat moeten doen. Dat zou heel mooi zijn, want veel mensen lijden aan een psychische ziekte en psychiaters kunnen die klachten nu zelden genezen.

Dit is in het kort het ideaal van wat psychiatrische genomics wordt genoemd. Psychiatrische genomics bestaat ongeveer tien jaar en doet onderzoek naar de genetische grondslag van geestesziekten. Het frap-pante is, dat het onderzoek tot nu toe niet heeft geleid tot de ontdekking van genen die iemand gek maken. Bovenstaande droom is dus niet uitgekomen. Integen-deel: het lijkt er eerder op dat psychiatrische genomics aan het aantonen is dat invloeden uit de omgeving cruciaal zijn voor het ontstaan van geestesziekten. Iro-nisch genoeg veranderen de onderzoeksresultaten uit de psychiatrische genomics dus de ideeën die de motor waren voor het eigen vakgebied.

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

72

aL

Le

so

Ve

rD

na

ANtISOcIAAL

niet dat genen er niets toe doen. sommige mensen blijken kwetsbaar; zij krijgen relatief snel psychiatrische klachten. Dat heeft onder meer te maken met hun genetisch profiel. Maar genen zijn slechts één factor temidden van een heel veld van andere factoren. ook de buurt waarin je bent geboren, de gewoonten in het gezin, jouw manier om met tegenslagen om te gaan en de eisen die de maatschappij aan je stelt kunnen van invloed zijn. er is zelden of nooit één oorzaak voor een geestesziekte, en al die verschillende oorzaken blijken ook nog eens op een heel ingewikkelde manier op elkaar in te werken. Zo kunnen ze elkaar versterken of dempen. een duidelijk en invloedrijk voorbeeld geeft het onderzoek van Caspi en Moffitt uit 2002. eerdere onderzoekers hadden gedacht dat het zogenoemde Mao-a-gen (een bepaalde variant van het mono-amino oxidase-gen), zou samenhangen met antisociaal gedrag. Dat bleek niet zo te zijn. er was ook al eerder onderzoek gedaan naar de relatie tussen mishandeling in de vroege jeugd en antisociaal gedrag van jongens op latere leeftijd. ook dit verband bleek nauwelijks aantoonbaar. Caspi en Moffitt kwamen op het idee om de twee variabelen (gen en mishandeling) te combine-ren. Zij toonden aan dat vijfentachtig procent van de jongens met de a-variant van het Mao-gen die in hun vroege jeugd waren mishandeld als ouderen antisociaal gedrag vertonen. Dus: de combinatie van mishandeling

én dragerschap van een Mao-a-gen voorspelt opeens heel goed hoe iemand zich zal gedragen.

Het is dus soms niet handig om de effecten van de omgeving (mishandeling) en de effecten van aanleg (drager zijn van een bepaald gen) apart te onderzoeken en bij elkaar op te tellen. niet alleen omdat de afzon-derlijke effecten zo klein zijn dat er niet veel valt op te tellen. Maar ook, en vooral, omdat de factoren samen een vermenigvuldiging van de effecten laten zien.

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

73

aL

Le

so

Ve

rD

na

Het vermoeden is dat juist veel psychiatrische aandoe-ningen het gevolg zijn van factoren die op deze manier op elkaar inwerken. Dit heeft grote gevolgen voor psychiatrische genomics. Het zou betekenen dat het in principe nauwelijks zin heeft om genen geïsoleerd te onderzoeken. Genen doen er wel toe, maar om de werking van genen te achterhalen, moet de onder-zoeker de omgeving van de patiënt in zijn onderzoek betrekken. Genen en omgeving maken elkaar als het ware pas zichtbaar. Je kunt je voorstellen dat dit de manier van onderzoek doen in de psychiatrie flink door elkaar schudt. onderzoekers zullen hun methodes en denkwijzen moeten aanpassen.

GEK

Uiteindelijk zou dit er ook wel eens toe kunnen leiden dat het beeld verandert dat er in de maatschappij van psychiatrische patiënten leeft. een mens is niet absoluut gek (of normaal). De overgang tussen gekte en norma-liteit is vloeiend Je kunt pech of geluk hebben met je genetische profiel, de manier waarop je bent opge-voed, de dingen die je in je leven hebt meegemaakt en de buurt waaruit je komt. Die dingen samen kunnen de weegschaal naar gekte doen doorslaan. als dit bij het grote publiek doordringt, kan dit leiden tot meer begrip en minder veroordeling van mensen die ‘gek’ worden. In wezen zijn wij helemaal niet zo anders.

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

74

aL

Le

so

Ve

rD

na

Hersenaandoening Huntington is erfelijk, maar het ziekteverloop varieert.Het Huntingtine eiwit hoopt zich op in de hersenen.Onderzoekers proberen dit op verschillende manieren te voorkomen.

Eiwit de mist in

De ziekte van Huntington: dat krijg je of dat krijg je niet, zo was lang de gedachte. Oorzaak: een foute variant van een gen, gekregen van vader of moeder. maar van de mensen met een erfelijke aanleg voor de hersenziekte krijgen sommigen het al op jonge leeftijd, anderen pas later of zelfs niet. Symptomen kunnen iets verlicht worden, maar behandeling van de oorzaak, het afsterven van weefsel in een deel van de hersenen, bestaat nog niet.

HERSENENzIEKtE

De ziekte van Huntington is een erfelijke hersenaan-doening die meestal op volwassen leeftijd begint en ge-leidelijk in de loop van de jaren verergert. symptomen bij deze ziekte zijn ongewilde, soms sierlijk uitziende bewegingen over het gehele lichaam, veranderingen in het gedrag en geheugenverlies. In de latere fase van de ziekte vermagert iemand en worden de spieren stijver. Huntington wordt veroorzaakt door het geleidelijk

afsterven van zenuwcellen in delen van de hersenen die verantwoordelijk zijn voor verstandelijke vaardighe-den en de aansturing van bewegingen. nadat de eerste symptomen van de ziekte zich voordoen, leven patiën-ten nog 15-20 jaar, terwijl ze geleidelijk aan een aantal functies verliezen, zoals motoriek en denkvermogen. ook kan hun persoonlijkheid veranderen. De kinderen van een vader of moeder met de ziekte hebben 50% kans om de ziekte ook te krijgen; daarmee erft het gen dominant over. Deze kinderen kunnen zich hierop vanaf achttienjarige leeftijd laten testen.

HuNtINGtINE

De ziekte gaat gepaard met ophoping van het eiwit huntingtine in zenuwcellen en bepaalde delen van de hersenen, zoals de nucleus caudatus, zijn meer aange-daan dan andere. De nucleus caudatus is betrokken bij de coördinatie van beweging, maar ook bij verschil-lende cognitieve functies. Huntingtine is een eiwit

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

75

aL

Le

so

Ve

rD

na

dat we allemaal hebben en dat belangrijke functies vervult in de cellen van de hersenen maar ook elders in het lichaam. als het gen voor dit eiwit gemuteerd is, gaat het mis. De zenuwcellen breken een deel van het veranderde eiwit in stukken. een van de afge-splitste eiwitdelen is giftig voor de zenuwcellen en is waarschijnlijk de oorzaak van het afsterven ervan. De huntingtine-eiwitten hopen zich ook op in de cellen en zijn als aggregaten zichtbaar onder de microscoop.

“Mogelijk is het opeenhopen van het eiwit een reactie van de cellen om het vrijkomen van het giftige deel van huntingtine te neutraliseren”, zegt Willeke van roon, Huntingtononderzoeker bij het Leids Universitair Medisch Centrum. Dat huntingtine levert ook aankno-pingspunten voor onderzoek naar een behandeling. “Je zou kunnen proberen om het klieven van het eiwit te voorkomen. Daarmee wordt het afsplitsen van het giftige deel tegengegaan. een tweede mogelijkheid is om de ophoping van het toxische eiwit te bevorderen.”

muIzEN

een derde aangrijpingspunt is het beïnvloeden van de activiteit van het (foute) gen voor huntingtine. Het is de vraag of je de activiteit van dit gen helemaal moet uitschakelen, want het heeft mogelijk ook essentiële functies. Maar het gen is cruciaal voor de ziekte, zo bleek uit onderzoek in genetisch gemodificeerde mui-zen die waren voorzien van een aan- en uitschakelbaar

gen voor het veranderde huntingtine. Van roon: “Bij muizen die de ziekte ontwikkelen leidt het uitschakelen van het gemuteerde gen tot een omkering van de ziek-te. De onderzoekers zagen hoe de ophopingen van het eiwit verdwenen. op een gegeven moment echter - in een vergevorderd stadium van de ziekte - kon de ziekte

Doorsnede van de hersenen van een Huntingtonpatiënt (rechts) en gezonde

hersenen

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

76

aL

Le

so

Ve

rD

na

niet meer worden geremd door het gen uit te schake-len. Voor jonge mensen die recent hebben ontdekt dat zij straks Huntington zullen krijgen zijn deze resultaten hoopvol; als er over een aantal jaren een manier ge-vonden wordt om te voorkomen dat het mutante eiwit aangemaakt wordt, dan kan het ziekteproces wellicht nog worden omgekeerd.”

mODIFIER GENEN

Het eiwit huntingtine bevat van nature een aantal ami-nozuren glutamine op een rijtje. Zijn het er minder dan 36, dan is er niets aan de hand. Zijn het er veertig of meer dan krijgt iemand de ziekte geheid, waarschijnlijk tussen zijn 40e en 50e jaar. Bij iemand met een groot aantal glutamines, bijvoorbeeld meer dan vijftig, kan Huntington al voor het 20e levensjaar optreden. Bij 36-39 ligt een grijs gebied. sommige mensen in deze

groep zullen de ziekte wel krijgen en sommige niet, om nog onduidelijke redenen. In ieder geval bepaalt nooit alleen het aantal glutamines wanneer de eerste symp-tomen zich openbaren en hoe erg het ziekteverloop zal zijn. Waarschijnlijk zijn daar ook nog andere genen bij betrokken. Van deze zogenaamde modifier genen zijn er een aantal bekend, maar er bestaat onder weten-schappers geen overeenstemming over het belang van de verschillende genen. Huntington behoort tot een familie van polyglutami-neziekten, erfelijke ziekten waarbij zich een eiwit op-hoopt, dat een te lange serie glutamines bevat. Voor-beelden hiervan zijn de ziekte van Kennedy en sCa17. Bij deze ziektes worden de hersenen aangetast en lijken de mechanismen die de ziekte veroorzaken sterk op elkaar. Kennis over de ene ziekte kan van belang zijn voor de andere. “Zo blijkt het eiwit dat zich bij sCa17 in hersencellen ophoopt, bij Huntingtonpatiënten te binden aan huntingtine,” zegt Willeke van roon. “er zijn ook hersenziekten waarbij zich een eiwit ophoopt, zonder een lange keten van glutamines. De bekendste daarvan is alzheimer. De kennis over het mechanisme achter alzheimer kan weer wel waardevolle inzichten opleveren voor het Huntingtononderzoek en omge-keerd.”

tHERAPIE

er zijn wel klinische proeven met enig succes, maar die pakken nog niet de kern van het probleem aan; we

Ophoping van huntingtine-

eiwit in cel (microscopische

opname)

Ko

PP

Ie K

oP

PIe

77

aL

Le

so

Ve

rD

na

weten nog niet precies wat de belangrijkste stappen zijn in het ontstaan van het giftige eiwit en wat dat gif-tige eiwit precies doet in de cel. Hoe meer onderzoek gedaan wordt, hoe meer functies van de cel beïnvloed blijken te worden door het mutante huntingtine. “nu is het meer dweilen met de kraan open”, stelt Willeke van roon. “Het zal nog minstens vijf jaar duren voor-dat we op het spoor zijn van een therapie die de ziekte bij de bron aanpakt en echt hoop biedt op een grote verbetering voor patiënten.”

GC

TACMet zijn allen zijn we gemiddeld. Maar ieder voor zich, is een unieke persoonlijkheid. toch krijgen we als we ziek zijn nog altijd meestal de ‘gemiddelde’ dosis van het medicijn dat bij de meeste mensen het beste werkt. Die behandelingen kunnen veel beter, door rekening te houden met genetische variatie tussen mensen. Genomics, samen met proteomics en metabolomics, biedt hier mogelijkheden voor. Met een genoom- en metaboolprofiel kunnen we straks zien waar we gevoelig voor zijn, hoe we waarschijnlijk zullen reageren op de middelen die we toegediend krijgen. niet meer allemaal dezelfde pilletjes dus, en zeker niet allemaal dezelfde dosis. Helaas kleven er ook nadelen aan deze aanpak: het is veel duurder dan de gestandaardiseerde middelen die nu de norm zijn. een ander gebied van personalized genomics is de groei van het aantal beschikbare genetische tests. Van steeds meer ziektes kunnen we voorspellen hoeveel kans we hebben ze te ontwikkelen. Maar willen we dat wel weten?

Elk wat wils

eL

K W

at

WIL

s

80

aL

Le

so

Ve

rD

na

Iedereen reageert anders op medicijnen.Genetische tests kunnen in theorie voorspellen wat voor elk de beste dosis en het beste middel is.Dan moet bekend zijn welke genen bij ziekte en medicijnverwerking betrokken zijn.

medicijn op maatBijwerkingen van medicijnen kent iedereen wel. De bijsluiters van drankjes of doosjes pillen staan vol met waarschuwingen over mogelijke hoofdpijn, misselijkheid, diarree en andere onaangename effecten. maar die bijwerkingen gelden niet voor iedereen. Kennelijk reageren wij niet allemaal hetzelfde op medicijnen.

HOEzO uNIEK?

Dat iedereen anders op medicatie reageert heeft veel oorzaken. Het heeft alles te maken met omgevingsin-vloeden, maar ook met eetgedrag, leeftijd, gewicht, geslacht en de algemene gezondheidstoestand. Dat deze en andere factoren de werking van geneesmid-delen beïnvloeden houdt ook verband met onze genen. De erfelijke eigenschappen die daarin vast liggen bepalen hoe iemand reageert op een middel. Het onderzoeksterrein dat zich hiermee bezig houdt, heet farmacogenomics: het onderzoek naar de wisselwer-king tussen geneesmiddelen en onze genen.

als artsen over een genetische test beschikken die voorspelt hoe iemand op een bepaald middel zal rea-geren, kunnen bijwerkingen beperkt blijven. Hetzelfde geldt voor de dosering van een middel. op dit moment is de enige echte indicatie voor een dosering het ge-wicht van de patiënt. Maar gewicht zegt niet alles over de juiste dosering. ook hier kan een genetische test wellicht meer informatie verschaffen.

LEVER

De lever, die zorgt voor de afbraak van schadelijke stoffen, maakt enzymen aan. enzymen beïnvloeden de snelheid waarmee geneesmiddelen uit het lichaam verdwijnen. Bij sommige mensen gaat dat proces traag. Zij lopen het risico op een overdosis van het middel (en worden bijvoorbeeld misselijk). omgekeerd kan ook: te snelle afbraak, waardoor er een tekort aan de werk-zame stof ontstaat. Met een genetische test is vast te stellen hoe snel het middel bij een patiënt wordt afge-broken. Vervolgens kan de arts een exacte benodigde

eL

K W

at

WIL

s

81

aL

Le

so

Ve

rD

na

dosering uitrekenen. Bij dergelijke tests wordt gebruik gemaakt van zogenoemde microarrays. Dat zijn kleine plaatjes waarop de aanwezigheid of activiteit van honderden genen in bijvoorbeeld een bloedmonster gelijktijdig kan worden bepaald.

tOEKOmStmuzIEK?

De uitdagingen van de farmacogenomics zijn groot. niet alleen moet in kaart worden gebracht welke genetische verschillen tussen de individuen er bestaan. ook moet worden uitgezocht welke genen er allemaal bij een ziekte betrokken zijn. alle mogelijke effecten moeten in kaart worden gebracht. Bij het bepalen of chemotherapie bij borstkanker zinvol is wordt farma-cogenomics al ingezet (zie bladzijde 56). een andere ziekten waar dergelijke technieken wellicht kunnen helpen is het hebben van een erfelijk bepaald zeer hoog cholesterolgehalte. Hoe medicijnen aanslaan bij patiënten hangt sterk af van het genetisch patroon. Bij verschillende patiënten moeten verschillende medi-cijnen worden voorgeschreven. Daarbij moet de arts echter niet vergeten ook rekening te houden met omgevingsinvloeden als eetgedrag en gewicht.

eL

K W

at

WIL

s

82

aL

Le

so

Ve

rD

na

Tegenwoordig kun je allerlei genetische tests via internet kopen.Ook bij officiële instanties kun je steeds meer testen.De uitslagen van deze tests kunnen een gigantische impact hebben.

DNA testen via het internetVoor een slordige 300 Euro kun je je bij dnadirect.com laten testen of je een genetische aanleg hebt voor botproblemen of gevoeligheid voor suikerziekte. Oudere mannen kunnen zich nu zelf testen op pros-taatkanker. Weten we straks alles over onszelf na een paar muisklik-ken en handelingen?

DOE HEt zELF

In nederland is de genetische test via internet nieuw. De aankoop is eenvoudig, de test is vaak niet moeilijk. Je kunt bijvoorbeeld een beetje wangslijmvlies op een staafje doen en opsturen naar een laboratorium. er wordt hard gewerkt aan nieuwe testen op makkelijk verkrijgbaar lichaamsmateriaal als speeksel, en in de toekomst zijn nog meer tests te verwachten.

We kennen in nederland op dit moment twee vormen van genetisch testen: - Je wordt doorverwezen door je huisarts naar een klinisch genetisch centrum als je klachten hebt of er in

je familie erfelijke aandoeningen voorkomen; - Je krijgt samen met een grote groep andere mensen een test aangeboden vanuit de gezondheidszorg, ook wel bevolkingsonderzoek of screening genoemd. Voor dit laatste gelden strikte regels, omdat je gezonde mensen ongevraagd medisch onderzoek aanbiedt. Bevolkingsonderzoek naar kanker mag alleen met een vergunning. Dat geldt ook voor onderzoek naar aandoeningen waarvoor geen behandeling mogelijk is. Zulk onderzoek mag alleen aangeboden worden in hele speciale gevallen.

Door de ontwikkelingen op internet en de nieuwe doe-het-zelf-testen vervaagt het onderscheid tussen een test waar je zelf om vraagt en het ongevraagde aanbod van een test. er is sprake van een aanbod, namelijk door een bedrijf, maar in feite krijg je alleen de informatie over de test aangeboden. Je krijgt niet, zoals bij bevolkingsonderzoek, een uitnodiging in de brievenbus, maar moet er zelf over gaan lezen en de

eL

K W

at

WIL

s

83

aL

Le

so

Ve

rD

na

test zelf aanschaffen.Zowel voor testen die je kunt aanvragen bij de arts als voor bevolkingsonderzoek zijn de afgelopen jaren voorwaarden opgesteld. Deze voorwaarden kunnen ook gebruikt worden om de nieuwe tests kritisch te bekijken. Probleem daarbij is wel dat tot nu toe artsen en beleidsmakers beoordeelden of een test of scree-ning wel zinvol was. Het is de vraag of bij de nieuwe ontwikkelingen de internetter zelf kan afwegen wat de zin of onzin van een genetische test is. Wanneer je zelf met klachten bij de arts komt, moet je goede informatie en zo nodig begeleiding krijgen (genetic counseling) bij de beslissing om een genetische test te laten doen en te leren omgaan met de conse-quenties. ook is vastgelegd dat je zelf op basis van alle relevante informatie je keus moet kunnen maken.

Bij bevolkingsonderzoek moeten er goede redenen zijn om ongevraagd screening aan te bieden aan grote groepen mensen die (nog) geen klachten hebben. Wil de overheid een dergelijk onderzoek toestaan dan moet er voor de bevolking gezondheidswinst te behalen zijn, en de voordelen moeten opwegen tegen de nadelen. nadelen zijn bijvoorbeeld hoge kosten, onnodige on-rust, verkeerde testuitslagen met eventueel onnodige ingrepen, of juist valse geruststelling doordat de uitslag ten onrechte negatief was. De aanbieder moet de kosten en de baten per aan-doening afwegen. Het is altijd lastig om de voor- en nadelen van de groep af te wegen tegen die van

het individu. Hoeveel mensen mag je aan lastige of vervelende (vervolg)onderzoeken blootstellen om één mensenleven te redden? en hoe vaak moet een ziekte vóórkomen om er mensen op te screenen?

GENEtIScH BELASt, LEEFStIjL AANGEPASt

Het maakt nogal verschil op welke aandoening je test. Bij sommige aandoeningen zou je actie kunnen ondernemen na een ongunstig testresultaat. Je kunt in overleg met een arts je dieet veranderen of medicijnen nemen, of verder onderzoek laten verrichten. Kennis over je genetische aanleg kan zinvol zijn om preven-tief maatregelen te nemen. Volgens Martina Cornel, Hoogleraar Community Genetics van het VU medisch centrum in amsterdam geldt: genetisch belast, leefstijl aangepast. Het probleem is dat testen vaak slechts een verhoogde kans kunnen aantonen op een erfelijke aandoening. Het is dus niet zeker of je de ziekte ook

eL

K W

at

WIL

s

84

aL

Le

so

Ve

rD

na

krijgt. als er niet alleen genetische fatoren maar ook omgevingsfactoren zoals voeding en leefstijl meespelen heb je te maken met een multifactoriële aandoening. Veel voorkomende ziekten als diabetes en bepaalde vormen van kanker zijn multifactoriële aandoeningen, waarvoor testen voor het publiek in de maak zijn. onduidelijk is nog of de voordelen wel opwegen tegen de nadelen. De leveranciers van de doe-het-zelf testen hameren op de voordelen van het tijdig weten zodat je kunt ingrijpen. Misschien kun je dan het optreden van klachten of orgaanschade voorkomen.

er is nog vrij weinig bekend over de manier waarop mensen omgaan met de informatie dat ze een ver-hoogde kans hebben op een aandoening later in het leven. Zullen ze echt hun leefstijl aanpassen of (ten

onrechte) denken dat er niets meer aan te doen is? Zullen ze jaren lang bezorgd zijn? en hoe groot moet de kans zijn, voordat mensen bezorgd worden? Zullen ze bij een gunstige testuitslag juist heel ongezond gaan leven, omdat ze denken dat hen niets kan overkomen? en hoe zinnig is het om preventief maatregelen te nemen als de kans uiteindelijk toch klein is dat je ziek wordt? Bijvoorbeeld bij voedselintolerantie krijgen maar weinig mensen die de genetische aanleg hebben ook echt klachten. Je zou ook kunnen wachten tot je echt klachten krijgt. screening en testen kunnen dus ook veel onzekerheid, bezorgdheid of zelfs schadelijke gevolgen met zich meebrengen.

ONBEHANDELBAAR, WIL jE DAt WEtEN?

sommige mensen zullen overwegen om zich te laten testen op aandoeningen die niet te behandelen zijn. In dat geval kunnen plannen voor levensloop of carrière worden afgestemd aan de hand van het resultaat. Wanneer er in een familie een ernstige aandoening voorkomt, zou iemand die zwanger wil worden mis-schien willen weten wat de kans is dat een kindje de aandoening ook krijgt.

In nederland kun je daarvoor terecht bij een klinisch genetisch centrum. Daar wordt met een arts besproken wat de voor- en nadelen van testen zijn en kan goede psychische ondersteuning gegeven worden. testen naar onbehandelbare aandoeningen bestaan dus wel; je moet er zelf om vragen bij de arts, maar het is bij

Een genetisch

testje

eL

K W

at

WIL

s

85

aL

Le

so

Ve

rD

na

wet verboden om ze aan te bieden via bevolkings-onderzoek, omdat het zo gevoelig ligt. op sommige amerikaanse websites worden tests voor levensbedrei-gende aandoeningen zoals erfelijke borstkanker aan de consument aangeboden. Daar kun je vaak via de verzekering vergoeding voor krijgen. Probleempunt bij dit soort testen is de begeleiding. Je krijgt de uitslag schriftelijk of telefonisch.

VERENIGDE StAtEN

In de Verenigde staten is meer vrijheid om je op allerlei aandoeningen te testen, en is het officiële screenings-aanbod breder dan in nederland. De nederlandse overheid en gezondheidszorg zijn terughoudender. tot nu toe werd door overheid en artsen bepaald wat voor screening en testen voor de gemiddelde nederlander verantwoord zouden zijn. Door de nieuwe testen die via internet verkrijgbaar zijn wordt er aan dat systeem nu gemorreld. Je kunt meer zelf kiezen, maar er is op het internet niet één internationale instantie die de redelijkheid van het uitvoeren van verschillende testen in de gaten kan houden.

Voordeel van zelf-testen is dat je buiten de arts om kunt gaan, maar dit kan ook precies een nadeel zijn. Wanneer je eerst naar een huisarts gaat, kan deze de angst voor een aantal klachten wellicht wegnemen. Je kunt profiteren van zijn of haar brede kennis.

eL

K W

at

WIL

s

86

aL

Le

so

Ve

rD

na

Door een specifiek klein stukje RNA in te spuiten, kan mogelijk de ziekte van Duchenne worden bestreden.Bij deze spierziekte werkt een bepaald spiereiwit niet meer goed.Dit komt door een mutatie op het X-chromosoom, die fout RNA aflevert.

Een pleister van RNAEerst verbonden aan het Leids universitair medisch centrum en nu werkzaam bij Prosensa therapeutics B.V. (Leiden) doet judith van Deutekom onderzoek naar een nieuwe behandeling van de erfelijke ziekte van Duchenne. Dat doen ze door een soort RNA-pleister in te spuiten. Bij muizen en in menselijke cellen slaat de therapie aan. De eerste resultaten bij patiënten zijn hoopgevend.

SPIERKRAcHt

spiercellen bevatten een ingewikkeld mechanisme van eiwitten die er samen voor zorgen dat de spiercel kan samentrekken. Bij patiënten met de ziekte van Du-chenne (Duchenne Musculaire Dystrofie) ontbreekt één van deze eiwitten, het dystrofine. Gevolg: de spieren zijn niet goed in staat om samen te trekken en breken zelfs af. In de loop van hun leven wordt de spiermassa en spierkracht steeds minder. Uiteindelijk, als ook de spieren voor de ademhaling en het hart in kracht afnemen, leidt de ziekte tot de dood. Patiënten leven tegenwoordig wel langer omdat de beademingsappa-

ratuur sterk is verbeterd.“Het dystrofine-eiwit heeft een kop en een staart,” zegt Judith van Deutekom, hoofd onderzoek bij Prosensa therapeutics B.V.. De kop van het dystrofine-eiwit bindt aan actine, een ander, zeer belangrijk eiwit in de spiercel. De staart is verbonden met een complex van eiwitten in het membraan (omhulsel) van de cel. Het dystrofine-eiwit en de membraaneiwitten zorgen samen voor de stevigheid van het membraan van de spiercel en van de spiervezel. Bij afwezigheid van het

Dystrofine (groen) bindt actine (rood) aan de celmembraan

eL

K W

at

WIL

s

87

aL

Le

so

Ve

rD

na

dystrofine vallen er gaten in het membraan van de spiervezel en sterft deze uiteindelijk af.In de eerste jaren van het leven van een patiënt vangen reservecellen in de wand van de spiervezels het gebrek aan stevigheid op. Deze zogenaamde satellietcellen vullen de ontstane gaten in het membraan op. Dit kan maar tot rond het achtste levensjaar, daarna zijn de satellietcellen opgebruikt en sterven de spieren af. rond het dertiende levensjaar belanden patiënten in de rolstoel. Vaak wordt bij Duchenne-patiënten hormoon-therapie toegepast, waarmee het ziekteproces iets kan worden vertraagd.

LANGStE GEN

Duchenne-patiënten zijn vrijwel altijd jongens. Dat komt omdat zij een mutatie hebben in het DMD-gen en dat ligt op het X-chromosoom, één van de ge-slachtschromosomen. een vrouw heeft twee X-chro-mosomen (van vader en van moeder). Wanneer het DMD-gen op één van de X-chromosomen gemuteerd is, kan ze doorgaans terugvallen op een goed werkend DMD-gen op het andere chromosoom. een man heeft maar één X-chromosoom en kan dat niet.

Het DMD-gen is het langste gen bij de mens. Het gen is 2,4 miljoen basenparen lang. Het bestaat uit tiental-len exonen (stukken die coderen voor het eiwit) met daar tussenin lange intronen (de niet coderende delen van het gen).Het DMD-gen is verantwoordelijk voor de aanmaak

van het dystrofine-eiwit. Bij patiënten bevat dit gen fouten. Dat heeft tot gevolg dat de volgorde van het rna-molecuul, dat van het gen wordt afgeschreven, niet klopt; het is out-of-frame. Van dit rna kan de cel vervolgens geen werkend dystrofine-eiwit maken; de code voor de aminozuren van de rest van het eiwit

Injectie van RNA in been van Duchenne-patiënt

eL

K W

at

WIL

s

88

aL

Le

so

Ve

rD

na

klopt niet meer. Daardoor ontstaat een korter, niet werkend dystrofine-eiwit.

ANtISENSE-RNA

In Leiden hebben Van Deutekom en collega’s ontdekt hoe zij er voor kunnen zorgen dat spiercellen met de

mutatie weer een werkend rna en dus ook dystrofine-eiwit kunnen aanmaken. Dat doen zij door een speciaal stukje rna in de spieren of spiercellen in te brengen.

Dit antisense-rna past precies op het deel van het rna van het DMD-gen in de buurt van de fout. Het gevolg hiervan is dat de cel bij het aflezen nog meer van het rna-molecuul overslaat. Uiteindelijk wordt een ingekort rna-molecuul door de cel afgelezen. Dat is nu echter wel in-frame en kan worden vertaald in een korter maar redelijk goed werkend dystrofine-eiwit.

Van Deutekom heeft laten zien dat toediening van antisense-rna werkt in muizen met de ziekte van Duchenne en in spiercellen die zijn afgenomen van patiënten. Zowel de muizen als de menselijke spiercel-len gingen na toevoeging van het rna een korte maar werkende versie van het dystrofine-eiwit aanmaken. In het najaar van 2006 heeft Prosensa therapeutics, samen met LUMC, een eerste experiment uitgevoerd in vier jonge patiëntjes. De Leidse neuroloog Jan Verschuuren heeft bij vier jongens in een klein stukje spierweefsel in het been een kleine hoeveelheid van het rna ingespoten. na vier weken werd er uit de spier een klein stukje weefsel afgenomen. Daarin werd in alle behandelde patiënten heel duidelijk de aanwe-zigheid van dystrofine aangetoond. ook bleek deze methode veilig voor de patiënten. De resultaten van het onderzoek werden eind 2007 gepubliceerd in de New England Journal of Medicine.

mEERDERE PLEIStERS

Zelfs als het antisense-rna werkt bij patiënten, zijn ze daarmee niet volledig genezen. Zij moeten het medicijn

Dwarsdoorsnedes van spierbiopten van de vier behandelde patiëntjes

(Pt.1 t/m Pt.4), van een gezond persoon (HC) en van een onbehandelde

DMD patiënt (DMD).De groene kleur wijst op de aanwezigheid van

dystrofine.

eL

K W

at

WIL

s

89

aL

Le

so

Ve

rD

na

hun leven lang blijven gebruiken en bovendien zullen hun spieren nooit helemaal meer als gezond kunnen functioneren. Het onderzoek van Prosensa thera-peutics en LUMC zit er nog lang niet op. er bestaan groepen verschillende mutaties in het DMD-gen. Iedere groep heeft weer een andere rna-pleister nodig. Voor elk rna-pleister moeten de onderzoekers een apart molecuul ontwikkelen. Het betekent ook dat bij iedere Duchenne patiënt van tevoren de precieze mutatie be-paald moet worden.Van Deutekom waarschuwt echter dat niet alles is te verklaren op basis van de mutatie in het DMD-gen. er zijn gevallen bekend van twee broers met dezelfde mutatie, maar met een verschillende ernst en ziekteverloop. Blijkbaar zijn er ook andere factoren in het spel.” In augustus 2008 begon een volgende klinische studie in DMD patiëntjes waarin Prosensa therapeutics het antisense-rna zo toedient dat het in alle spieren terechtkomt, middels wekelijkse onder-huidse injecties. Van Deutekom: “In het ideale geval ontwikkelen we een type antisense-rna geschikt voor grote groepen patiënten.” Prosensa therapeutics en het LUMC hebben de eerste klinische studie kunnen uitvoeren met financiering onder andere het Duchenne Parent Project. Het zal nog een paar jaar duren voordat de methode voldoende getest is. Pas als alle lichten op groen staan kan het geneesmiddel op de markt gebracht worden.

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

90

aL

Le

so

Ve

rD

na GTC

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

91

aL

Le

so

Ve

rD

naAGEcologisch verantwoord

Veel mensen associëren de term ‘genomics’ met ‘gemanipuleerd voedsel’ en de natuur naar je hand zetten. Wat ze op dat moment niet beseffen is dat het aanpassen van Dna ook allerlei ecologisch verantwoorde toepassingen oplevert. Het basisprincipe is eenvoudig: verander het Dna van een organisme zo, dat het iets gaat consumeren of produceren wat jij wilt. De mogelijkheden zijn oneindig: van biobrandstof producerende gist en bacteriën die landmijnen opruimen tot landbouwgewassen die onvindbaar worden voor parasieten. T

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

92

aL

Le

so

Ve

rD

na

Onderzoekers bouwden een olifantenpoep-enzym in bakkergist.Die gist zet daardoor plantensuikers en zetmeel sneller om in alcohol.Onderzoekers willen gistcellen zelfs afbreekbaar plastic laten maken.

Autorijden op landbouwafval en olifantenpoepOoit gedacht dat je je auto kan laten rijden op benzine gemaakt van snoeihout of voor consumptie afgekeurde groenten? Het klinkt misschien futuristisch, maar een kleine club automobilisten rijdt al op benzine vermengd met alcohol die gemaakt is van plantaardig materiaal. maar onderzoekers moeten nog een hindernis nemen: de productie ervan verloopt traag en inefficiënt.

GIStEN

Zowel fossiele brandstoffen, zoals olie, gas en steen-kool, als biobrandstoffen worden gemaakt uit planten. Fossiele brandstoffen ontstaan na het eeuwenlang fossiliseren (verstenen) van plantenresten. De productie van biobrandstoffen verloopt vele malen sneller. Daar-bij worden plantensuikers en zetmeel door vergisting in enkele dagen omgezet in alcohol (brandstof).niet alle plantensuikers zijn even makkelijk om te zet-ten in alcohol. Planten bestaan voor 80% uit makkelijk verwerkbare suikers: suikers met zes of meer kool-

stofatomen. Voor 20% bestaan planten uit moeilijk verwerkbare suikers met maar vijf koolstofatomen, waarvan xylose het belangrijkste suiker is.Het micro-organisme Saccharomyces cerevisiae, beter bekend als bakkersgist, is een handig en veelgebruikt hulpje voor de omzetting van suikers in alcohol. nadat allereerst de plantensuikers uit plantenresten zijn vrijgemaakt, zet bakkersgist de makkelijke suikers in een handomdraai om in alcohol. Met het taaie suiker xylose heeft bakkersgist echter meer moeite, omdat het daarvoor een essentieel enzym mist. Lukt het om ook xylose te verteren, dan schiet de alcoholproductie met maar liefst 20% omhoog.

OLIFANt

een ontdekking van een groep nijmeegse microbio-logen bood uitkomst. Zij troffen in olifantenpoep de schimmel Piromyces aan. Deze schimmel kan dankzij het enzym xylose-isomerase xylose wél omzetten. Deze vondst bracht microbioloog Marko Kuyper van de

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

93

aL

Le

so

Ve

rD

na

technische Universiteit Delft op het idee om het enzym uit de schimmel in het genoom van bakkersgist in te bouwen zodat het xylose kan omzetten. Het tergend langzaam groeiend bakkersgist moest vervolgens leren sneller te groeien in een zuurstofloze omgeving. Zo kweekte Kuyper een supergist dat niet alleen weet te overleven in een voor alcoholproductie noodzakelijke zuurstofloze omgeving, maar ook sneller groeit en daardoor vele malen sneller biobrandstof kan maken. Wel zo handig als je heel wat liters nodig hebt om al die brandstoftanks te vullen. autorijden op biobrandstof is milieuvriendelijker dan gewone brandstof. Planten nemen Co2 via hun blade-ren op uit de atmosfeer en gebruiken het als bouw-steen. Bij verbranding van uit planten gemaakte brand-stof komt ditzelfde Co2 weer vrij. De netto uitstoot van het broeikasgas Co2 is dus minimaal. Het Co2 wordt als het ware gerecycled. Het Co2 dat daarentegen vrijkomt bij de verbranding van fossiele brandstoffen lag miljoenen jaren opgehoopt in de aardkorst en zorgt voor een toename van het broeikasgas in de atmos-feer. In europees kader moet in 2010 ruim 5% van alle brandstof verbruikt voor transport biobrandstof zijn. Het bedrijf Koninklijke nedalco, dat het patent op het enzym isomerase heeft, gaat samen met een coalitie van bedrijven vanaf begin 2008 jaarlijks 220 miljoen liter biobrandstof produceren.

muLtIFuNctIONEEL

Door genetisch modificatie kan bakkersgist getraind worden ook andere interessante chemicaliën om te zetten. Zo kunnen onderzoekers de gistcellen trainen om polyhydroxyalkanoaten (PHPs) te maken. Dat zijn plastics met uiteenlopende materiaaleigenschappen: van uiterst flexibel tot rigide. ook kunnen gistcellen onder zure omstandigheden het stofje melkzuur ma-ken. De industrie is erg geïnteresseerd in de productie van polymelkzuur, een bioplastic dat snel en biologisch afbreekbaar is. Zwerfafval wordt zo een oplosbaar probleem.

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

94

aL

Le

so

Ve

rD

na

Onderzoekers kunnen nu het DNA van een heel ecosysteem bestuderen.Zo bevatte 1500 liter zeewater 1,2 miljoen nieuwe genen van 1800 soorten.Dit levert veel kennis op over micro-organismen in zee.

miljoen nieuwe genen in zeewatermaak kennis met de nieuwe tak van sport in het genetisch onderzoek: de ‘metagenomics’. Niet het DNA van één organisme, maar van een volledig ecosysteem wordt hierbij in kaart gebracht. De Amerikaanse onderzoeker craig Venter vond zo ruim een miljoen nieuwe genen in 1500 liter zeewater.

GROEIPROBLEEm

Bacteriën zijn lastpakken. Ze weigeren in het labora-torium te groeien. De eigenschappen van de meeste bacteriën zijn daarom volstrekt onbekend. slechts 1% van de bacteriesoorten laat zich in het laboratorium onder de loep nemen. Bekend is dat micro-organismen het klimaat beïnvloeden. Daarom zijn onderzoekers erop gebrand om meer micro-organismen te identifice-ren om zo milieuverschijnselen beter te begrijpen.Met de nieuwste technieken hoeft dat kweken in het laboratorium niet meer. onderzoekers redeneren nu andersom. Ze nemen een schep aarde of een emmer water uit de sloot. Die bodem- en watermonsters zitten

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

95

aL

Le

so

Ve

rD

na

bomvol micro-organismen. Vervolgens isoleren ze het Dna uit alle organismen. Het Dna wordt op een grote hoop geveegd en levert een totaal-Dna op. aan de hand van dat Dna proberen onderzoekers af te lezen welke genen en welke bacteriesoorten er in de bodem of het slootwater zitten. Deze nieuwe tak van sport in het genenonderzoek heet ‘metagenomics’ en staat sinds het begin van dit millennium volop in de belang-stelling. Wetenschappers kijken niet naar de volledige genetische code van één organisme (genoom), maar ze bestuderen de genen van alle organismen binnen een bepaald ecosysteem (metagenoom). Het wordt daarom ook wel ecogenomics genoemd.

OcEAANWAtER

een indrukwekkend voorbeeld van dit metageno-mics-onderzoek is een onderzoeksproject van de amerikaanse onderzoeker Craig Venter die in 2000 al furore maakte met het razendsnel in kaart brengen van het menselijke genoom. Venter en zijn collega-on-derzoekers zeilden in 2003 met hun onderzoeksboot the sorcerer II naar de sargassozee waar zij 1500 liter oceaanwater aan boord pompten. De sargassozee, in de buurt van de noord-atlantische Bermuda-eilanden, is een van de best bestudeerde mariene regio’s ter wereld.Van de micro-organismen die hij uit het zeewater filterde, bracht hij het totaal-Dna in kaart. Wat bleek? De monsters uit de sargassozee bevatten meer dan 1,2 miljoen nieuwe genen. Door het Dna uit de monsters

te vergelijken met Dna van micro-organismen die al bekend zijn, wist Venter ruim 1800 verschillende micro-organismen te identificeren, waaronder 148 nieuwe soorten. alhoewel de functies van de meeste genen nog ontrafeld moeten worden, begrijpen we het leven in de sargassozee en de oceaan in ieder geval een stuk beter.

mILIEuPROBLEmEN OPLOSSEN

Geïnspireerd door Darwins ontdekkingsreizen is the sorcerer II sindsdien de wereld omgevaren en heeft

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

96

aL

Le

so

Ve

rD

na

het schip meer oceaanmonsters genomen. Venter hoopt nieuwe genen en bacteriën te ontdekken die de juiste eigenschappen bezitten om bijvoorbeeld schadelijke stoffen in het milieu zoals de explosieve stof trinitrotolueen (tnt) af te breken of om waterstofgas te produceren. Waterstofgas wordt wel gezien als de energiebron van de toekomst, omdat bij verbranding daarvan niet het broeikasgas koolstofdioxide vrijkomt. In theorie is het mogelijk om in het laboratorium een soortgelijk gen in een makkelijk hanteerbare bacterie in te bouwen. Zo kan de bacterie aangepast worden om op commando waterstofgas te maken. Metagenomics kan ons helpen bij het vinden van creatieve oplossin-gen voor onze milieuvraagstukken.

Filterapparaat

aan boord van de

Sorcerer II

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

97

aL

Le

so

Ve

rD

na

Parasitaire planten speuren naar gastheren door hen ‘af te luisteren’.De negatieve gevolgen hiervan voor de landbouw zijn groot.Meer kennis over plantencommunicatie kan de gastheerplant onvindbaar maken.

Plantaardige vampiersPlanten die bloed drinken? Niet helemaal, maar er zijn planten die zichzelf niet kunnen bedruipen en voor hun overleven afhankelijk zijn van een andere plant. Deze parasitaire planten maken op ingenieuze wijze misbruik van de communicatie van hun potentiële gastheren met andere, voor de plant wel nuttige, bodemorganismen. Parasitaire planten veroorzaken miljarden euro’s schade in de landbouw en zijn mede de oorzaak van hongersnood in grote delen van Afrika. Om deze parasieten aan te kunnen pakken moeten we ze eerst beter leren kennen.

VAtENStELSEL

Parasitaire planten zoals striga en bremraap zijn vaak heel bijzondere plantjes. Dit mooie uiterlijk is echter nogal misleidend, want we hebben hier te maken met echte killers. De parasitaire planten groeien namelijk op de wortels van een andere plant, hun gastheer. Via een speciaal daarvoor ontwikkeld orgaan, een haustorium, sluit de parasiet aan op het vatenstelsel van de gast-heer. Vervolgens ontdoen ze hun gastheer vakkundig van voedsel en water. Deze lijdt daar soms flink onder:

de zaadopbrengst van een geparasiteerde gastheer kan zelfs volledig verloren gaan. In afrika leidt dat soms tot volledig mislukte oogsten van sorghum, maïs en gierst. De parasitaire planten kunnen niet zelf voor voeding en water zorgen. Zij hebben zich volledig gespecialiseerd in het uitvreten en laten het werken graag over aan hun gastheer. De specialisatie in het uitvreten brengt voor de parasiet ook risico’s met zich mee, want hij is echt volledig afhankelijk van zijn gastheer. als de zaden van deze parasieten kiemen terwijl er geen gastheerwortel in de buurt is, dan zijn ze ten dode opgeschreven. Parasitaire planten hebben daarom nóg een speciale eigenschap ontwikkeld. Hun zaden kiemen alleen als ze een stofje waarnemen dat wordt geproduceerd door de wortels van hun gastheer. normale plantenzaden kiemen als er voldoende water, licht en nitraat aanwezig is. De para-sieten zijn uiterst gevoelig voor dit stofje en kunnen er zelfs extreem kleine hoeveelheden van aantonen.

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

98

aL

Le

so

Ve

rD

na

zELFmOORD?

Waarom produceert de gastheer deze stof eigenlijk, zou je je kunnen afvragen. Dat was tot een half jaar geleden onduidelijk. tot een Japanse onderzoeksgroep ontdekte dat planten deze stoffen, strigolactonen ge-noemd, produceren om nuttige bodemschimmels aan te trekken. Deze bodemschimmels worden mycorrhiza-schimmels genoemd. Ze groeien op en in de wortels van hun gastheer en gaan met hun mycelium-draden de grond in. Daarmee helpen ze de plant om voedings-stoffen uit de bodem op te nemen. In ruil daarvoor bezorgt de plant de schimmel suikers, die hij produ-ceert met behulp van de fotosynthese. net als bij de parasitaire planten heeft de mycorrhiza-schimmel een signaalstof nodig om te merken dat zijn gastheer in de

buurt is. Komen sporen van de schimmel met die stof in aanraking dan beginnen ze te kiemen, te vertakken en in of over de wortels van de gastheer te groeien. De parasitaire planten maken simpelweg misbruik van dit signaal om hun gastheer te kunnen vinden, en de gastheer kan het signaal niet missen omdat hij de mycorrhiza-schimmels nodig heeft.

DRIEHOEKSRELAtIE

De sleutel voor een oplossing van het parasitaire plan-ten probleem ligt in een beter begrip van deze ingewik-kelde driehoeksrelatie tussen plant, parasiet en schim-mel. De Wageningse onderzoeker Harro Bouwmeester heeft eind 2005 een belangrijke nWo beurs gekregen om hier onderzoek naar te doen. samen met nijmeegse organisch chemici en Wageningse moleculair biologen gaat Bouwmeester achterhalen hoe de strigolactonen, de signaalstoffen om schimmels aan te trekken, wor-den gemaakt in de wortels van de gastheer. Met die wetenschappelijke kennis hoopt hij planten te kunnen maken die de parasieten niet meer uit hun sluimer zul-len wekken. Belangrijke fundamentele vragen die met het onderzoek moeten worden beantwoord zijn verder hoe flexibel de parasieten met de signaalstof kunnen omspringen; kunnen ze zich bijvoorbeeld snel aanpas-sen aan een nieuwe of veranderde signaalstof?

‘OmIcS’

Het is duidelijk dat dit een zeer complexe studie is waarvoor alle moderne technieken uit de kast moeten

Parasitaire plantjes op

de wortels van een

gastheerplant

99

aL

Le

so

Ve

rD

na

eC

oL

oG

IsC

H V

er

an

tW

oo

rD

worden gehaald. Bouwmeester is dan ook van plan alle zogenaamde omics-technieken in te schakelen: meta-bolomics om uit te vinden hoe de signaalstof gemaakt wordt en transcriptomics om de genen te vinden die de productie van de signaalstof sturen. omdat het onderzoek erg veel gegevens oplevert, zal Bouwmees-ter bioinformatica nodig hebben voor het aan elkaar verbinden van deze gegevens. ook hopen de onder-zoekers om onder de grond de rol van signaalstoffen op te helderen - in de relatie tussen gastheer, parasi-taire plant en mycorrhiza schimmel. Uiteindelijk moet de inspanningen leiden tot een oplossing van een groot probleem in de afrikaanse landbouw.

Ha

P s

LIK

We

G

100

aL

Le

so

Ve

rD

na TAC

Ha

P s

LIK

We

G

101

aL

Le

so

Ve

rD

naTGCVoedsel is niet alleen iets dat je in je mond stopt en doorslikt. Het geeft ons een smaaksensatie, maar

nog belangrijker: voeding houdt ons gezond! Dna-onderzoek helpt bij het verbeteren van voedsel. We kunnen bijvoorbeeld onze gewassen wapenen tegen hun vijanden. De vraag is echter welke invloed aanpassingen hebben op natuur en milieu. Zijn zulke gespecialiseerde gewassen wel bestand tegen grillige omstandigheden? Is het eten van zulk ‘gemanipuleerd voedsel’ wel zo gezond?

Hap slik weg

Ha

P s

LIK

We

G

102

aL

Le

so

Ve

rD

na

De aardappel staat voortdurend onder druk.Ziektes als de aardappelziekte liggen op de loer.Onderzoekers proberen het genie van deze ziekte te omzeilen.

De aardappel: volksvoedsel en zorgenkindjeDe aardappel is tegelijkertijd volksvoedsel en zorgenkindje. Op de akker wordt de aardappel voortdurend bedreigd door plagen als de aardappelziekte en aardappelmoeheid. Gangbare boeren zijn daarom sterk afhankelijk van de gifspuit. In Wageningen proberen onderzoe-kers hier wat aan te doen.

toen halverwege de zestiende eeuw de spaanse ver-overaars het Incarijk in de andes innamen, namen zij van daar de aardappel mee naar West-europa. Daar at men de aardappel aanvankelijk maar mondjesmaat. Pas laat in de 18e eeuw, in tijden van grote voedseltekor-ten, realiseerden wetenschappers zich dat de aardappel hulp zou kunnen bieden. al gauw was een groot deel van de europese bevolking afhankelijk van de aardap-pel. Zo aten de arme Ieren in de 19e eeuw vrijwel niets anders.

HONGERSNOOD

oorspronkelijk komt de aardappel niet uit de andes in Zuid-amerika, maar uit centraal Mexico. Die streek

is ook de broedplaats van de belangrijkste plaag, de aardappelziekte. Deze ziekte wordt veroorzaakt door een waterschimmel met de Latijnse naam Phytoph-thora infestans. De in cultuur gebrachte aardappel is zeer gevoelig voor de aardappelziekte. aanvankelijk hadden de europeanen er weinig last van. Dat kwam doordat men aardappelen afkomstig van de andes teelde, een gebied waar de schimmel weinig voorkomt. Dit veranderde toen er in de 19e eeuw een aantal misoogsten optraden. er werden nieuwe aardappels uit Mexico geïmporteerd. Deze waren echter besmet met aardappelziekte. Dat leidde in 1845 tot hongersnood in geheel europa en in Ierland tot de dood van een derde van de bevolking.

mEt OF zONDER SEKS

Uiteindelijk overwon de aardappel de ziekte. som-mige aardappelrassen hadden het juiste resistentiegen en werden niet aangetast. Vanuit deze rassen werd de aardappelteelt opnieuw opgezet. een geluk bij een

Ha

P s

LIK

We

G

103

aL

Le

so

Ve

rD

na

ongeluk was dat de variant van de aardappelziekte die was meegelift van Mexico naar europa zich niet snel kon aanpassen. Dat kwam omdat deze variant zich niet geslachtelijk (via seks) kon voortplanten. Daardoor was hij niet in staat om snel nieuwe (combinaties) van genen te maken.

totdat men in 1975 opnieuw aardappelen uit Mexico in europa importeerde. Dit keer reisden er varianten mee die wel aan seks deden. Dat gaf de veroorzaker van de aardappelziekte in europa een enorme voorsprong. Het duurde jaren voordat de cultuuraardappel er weer bo-venop kwam. Veredelaars zijn druk bezig om resistentie-genen vanuit wilde aardappelen in de cultuurvariëteiten te kruisen, een proces dat decennia duurt.

FAmILIE VAN GENEN

De waterschimmel Phytophthora doet zijn werk door op de aardappelplant een eiwit uit te scheiden dat

de aardappelcellen binnen dringt. Daarmee wordt de verdediging van de aardappel uitgeschakeld en kan de schimmel naar binnen dringen, zich voeden en nageslacht in de vorm van grote aantallen sporen pro-duceren. De aardappelplant kan zich moeilijk tegen de binnen dringende eiwitten verdedigen, omdat er meer dan 500 verschillende van zijn (de rxLr-eiwitten). Die eiwitten worden aangemaakt door genen die tot een zogenaamde ‘superfamilie’ behoren. een aardappelras dat resistent is voor één eiwit van de waterschimmel, kan dus het loodje leggen, wanneer de planten besmet worden met sporen van een iets andere waterschim-mel. Zo blijft de aardappelziekte rondwaren.”

Uit het genoomonderzoek weten we nu over welke wapens de waterschimmel beschikt. nu moeten we

Microscopische

opname van schim-

meldraden van de

aardappelziekte

‘Phytophthora in-

festans’

Aardappel aangetast

door de aardappelziekte

Ha

P s

LIK

We

G

104

aL

Le

so

Ve

rD

na

precies te weten komen hoe hij die wapens gebruikt. De geraffineerdheid waarmee hij te werk gaat is ver-bluffend. De illusie dat hij zich voor altijd laat verslaan is niet reëel.

Uit het genoomonderzoek blijkt dat Phytophthora, naast de rxLr eiwitten, nog vele andere eiwitten heeft die uniek zijn. Ze komen niet in planten en dieren voor en ook niet in echte schimmels of in bacteriën. Zo zijn er eiwitten die bestaan uit een soort antenne die op de buitenkant van de cel verankerd zit. De antenne kan signalen uit de omgeving opvangen en het anker kan de signalen doorsluizen naar de regelkamer, de kern van de cel. onderzoekers in Wageningen werken nu aan manieren om deze signalen te verstoren. Zo mislei-den ze de regelkamer van de waterschimmel en op die manier tracht men te voorkomen dat hij de aardappel-plant gaat infecteren.

Ha

P s

LIK

We

G

105

aL

Le

so

Ve

rD

na

Moleculaire merkers tonen aan of planten goede eigenschappen bezitten.Om deze merkers te maken zijn gemanipuleerde bacteriën nodig.De vraag is of dit ‘biologisch’ is.

Past genomics in biologische veredeling?Genetische modificatie van gewassen is niet toegestaan in de verede-ling van biologische gewassen. In theorie zou je genomics kunnen ge-bruiken om het proces van selectie van nieuwe gewassen te versnel-len. De vraag is echter of de praktijk hier op zit te wachten.

mERKERS

Plantenveredelaars maken veel gebruik van molecu-laire merkers. Dat zijn eigenlijk niet meer dan kleine specifieke stukjes Dna in de plant die geassocieerd zijn met een bepaalde eigenschap, bijvoorbeeld opbrengst, bladgrootte of schimmelresistentie. Heeft een plant dit bepaalde stukje Dna dan zal hij hoogstwaarschijnlijk ook de gewenste eigenschap hebben. In het laborato-rium kan je dan al bij de jonge plantjes snel zien welke wel of niet het gewenste stuk Dna hebben. Zo kan je een voorselectie maken, voordat de plant geheel vol-groeid is. De planten die door deze selectie heenkomen worden verder getest in het veld.

De techniek van moleculaire merkers is nog sterk in ontwikkeling. In de praktijk wordt merkergestuurde selectie nog slechts toegepast in de veredeling van nieuwe groenterassen. en dan vooral bij de selectie van ziekteresistenties die het gevolg zijn van de aanwezig-heid van één enkel gen. Vooral bij het kruisen van een plantenras met wilde soorten biedt de merkertechnolo-gie grote voordelen. na zo’n kruising moet de verede-laar het gros van de wilde genen weer kwijt zien te ra-ken. Dat doet hij door een groot aantal keren terug te kruisen met het gecultiveerde ras. Moleculaire merkers vertellen hem welke planten naast het gewenste gen ook veel of weinig van de ongewenste wilde genen bevatten. Bij de groenteveredeling is het een niet meer weg te denken hulpmiddel. De merkertechnologie maakt het mogelijk de duur van de rasontwikkeling te verkorten van twaalf tot mogelijk acht jaar.De samenstelling van het Dna van organismen kan in een bandjespatroon zichtbaar gemaakt worden met gelelectroforese.

Ha

P s

LIK

We

G

106

aL

Le

so

Ve

rD

na

Door bandjespatronen van verschillende planten met de veldeigenschappen van de desbetreffende planten te vergelijken kunnen bandjes (dit zijn Dna fragmen-ten) gevonden worden die verbonden zijn met bepaal-de kenmerken van de plant. De stukjes Dna kunnen (een deel van) het gen voor die eigenschap bevatten of daar vlak in de buurt liggen. Deze ‘merkers’ kunnen vervolgens in een selectieprogramma gebruikt worden om gekruiste planten te testen op aanwezigheid van het gen (bandje) voor de gewenste eigenschap.

BIOLOGIScH?

officiële regels voor biologische plantenveredeling be-staan nog niet. aan welke eisen een dergelijk systeem van veredeling zou moeten voldoen is al enige jaren onderwerp van discussie. Daarbij wordt ook nagedacht over de rol van moleculaire merkers. Het gaat niet alleen om de vraag wat voor rassen de sector nodig

heeft, maar ook hoe die verkregen worden. Voor de bi-ologische landbouw is van groot belang of een ras nog als ‘natuurlijk’ mag worden beschouwd. ‘natuurlijk’ wil zeggen: dat er geen chemisch-synthetische middelen worden gebruikt (geen-chemie), dat de rassen robuust en sterk zijn (agro-ecologische benadering) en dat het wezen van de plant, de integriteit, niet is aangetast. Wat veel mensen niet weten is dat er voor de ontwik-keling van moleculaire merkers altijd genetisch gemani-puleerde bacteriën, gisten of planten nodig zijn. en dat voor de toepassing ervan, in veel gevallen, kankerver-wekkende of radioactieve stoffen gebruikt worden, afhankelijk van het type Dna-merker. alleen al op grond van de geen-chemie en geen GMo benadering past deze techniek dus niet binnen de biologische plantenveredeling.

ROBuuStE RASSEN

In plaats van chemie past de biologische landbouw een agro-ecologische benadering toe. Dat betekent dat de biologische landbouw minder gemakkelijk even snel kan bijsturen tijdens de teelt. Daarom heeft de biologi-sche sector aangepaste, robuuste rassen nodig met een goede plantgezondheid. eigenschappen die daartoe bijdragen zijn opbrengststabiliteit, een goed ontwik-keld wortelstelsel, onkruidonderdrukkend vermogen en een brede weerstand tegen ziekten en plagen. Dit zijn complexe eigenschappen die deels bepaald worden door meerdere genen op meerdere chromosomen en

Links: zaailingen van een wilde resi-

stente tomaat. Rechts: zaailingen van

een kruising tussen deze wilde tomaat en

een modern, vatbaar ras. In dit stadium

manifesteert de ziekte zich nog niet, maar

met moleculaire merkers kan getoetst

worden welke planten het resistentiegen

bevatten.

Ha

P s

LIK

We

G

107

aL

Le

so

Ve

rD

na

deels door de omstandigheden op de akker. Hiervoor zijn nog geen Dna-merkers beschikbaar, en deze zijn ook niet eenvoudig te ontwikkelen. Fundamentele onderzoekers moeten nog veel werk verzetten om het samenspel van genen, de plant en zijn omgeving te doorgronden. robuustheid is bij uitstek een verzame-ling van eigenschappen die zich alleen in gezamenlijk-heid op het veld kan tonen, in het samenspel tussen het genotype en de teeltomgeving. Dat is juist in de biologische landbouw zo belangrijk, omdat de biologi-sche teeltomgeving minder voorspelbaar reageert dan in de gangbare teelt. Dus ook vanuit een agro-ecologi-sche benadering zijn moleculaire merkers geen logische en bruikbare stap in de biologische veredeling. In de biologische landbouw spelen ethische aspecten zoals respect voor de integriteit van het leven een rol

in de productie. Zo zijn naast ecologische argumenten ook ethische argumenten bepalend voor de afwijzing van genetische modificatie van gewassen. Merkerge-stuurde selectie heeft het gevaar in zich dat men zich te eenzijdig gaat richten op het Dna van de plant. Dit doet geen recht aan de integriteit van de plant, vinden biologische veredelaars. De kwaliteit van een plant ligt verborgen in het samenspel van erfelijke en actuele omgevingsfactoren. Bij veelvuldig gebruik van Dna-merkers wordt een plant volgens die zienswijze gereduceerd tot slechts een klontje Dna.

DuuRzAAm

naast bovenstaande overwegingen spelen ook de kos-ten een rol. Het ontwikkelen van moleculaire merkers slokt een groot deel van het gangbare onderzoeksbud-get op. Is dit een techniek waar de biologische sector haar beperkte biologisch onderzoeksbudget aan moet besteden? Dat ligt niet voor de hand. De nadruk ligt in biologische landbouw immers op de ontwikkeling van duurzame resistenties voor een plant in een bredere context. De ontwikkeling van moleculaire merkers voor bijvoorbeeld een goed wortelstelsel zal vele jaren duren. Dan nog zullen dergelijke merkers slechts een deel, bijvoorbeeld 30-40%, van de variatie op het veld kunnen voorspellen. De vraag is hoeveel winst dat voor de praktijk oplevert. Bovendien staan de kosten daarvoor niet in verhouding tot andere noodzakelijke onderzoekswensen in de biologische sector.

GelelectroforeseGelelectroferese is een techniek om Dna-fragmen-ten van verschillende lengtes van elkaar te scheiden. negatief geladen Dna-fragmenten bewegen zich als gevolg van een elektrisch veld door een gel heen, waarbij kleine fragmenten sneller migreren dan grote. Die fragmenten groeperen zich in bandjes op de gel. Doordat het Dna zichtbaar is gemaakt met een kleur-stof, zijn de bandjes in de gel te zien. na de electrofo-rese wordt het patroon van korte en lange fragmenten geanalyseerd.

Ha

P s

LIK

We

G

108

aL

Le

so

Ve

rD

na

In West-Afrika telen boeren rijst op droge grond.Onderzoek richtte zich vooral op natte rijst in Azië, niet in Afrika.Alleen door samenwerking kan de Afrikaanse boer betere rijst krijgen.

Rijst voor droog AfrikaDe rijstopbrengsten in West-Afrika in de rijstteelt lopen sterk achter bij de oogsten in Azië. Bij de veredeling van nieuwe rijstrassen heb-ben onderzoekers nog maar weinig oog gehad voor Afrika. Geleidelijk aan komt daar nu verandering in.

Dat de rijst die we in nederland eten oorspronkelijk uit Zuidoost-azië komt, weten de meeste mensen wel. Iedereen heeft wel eens beelden gezien van uitgestrekte rijstvelden (sawa’s) in landen als Indonesië, India of China. In deze regio’s zijn mensen ongeveer 10.000 jaar geleden met het telen van rijst begonnen. Deze landen hebben dan ook een rijke traditie in het telen van rijst. Dat er ook een traditie van duizenden jaren van droge rijstteelt bestaat in West-afrika is minder bekend.

GEEN ‘GROENE REVOLutIE’

In veel aziatische landen heeft de komst van verbe-terde rassen, irrigatie, kunstmest en pesticiden, in de jaren ‘60-‘70 geleid tot een flinke verbetering in de

voedselproductie (de ‘Groene revolutie’). sommige lan-den zijn veranderd van importeur van rijst in exporteur. In West-afrika wordt slechts 10-15% van het totale rijstareaal bebouwd met verbeterde rassen. Boeren ver-bouwen nog steeds de rassen die zij en hun voorouders geselecteerd hebben. De Groene revolutie heeft niet gewerkt in afrika. een van de redenen daarvoor is dat er maar weinig gebieden in afrika geschikt zijn voor irrigatie, belangrijk voor het verkrijgen van hoge op-brengsten. Bovendien is in veel West-afrikaanse landen de regenval minder en onregelmatiger. Het is moeilijker om met verbeterde rassen in West-afrika een hogere opbrengst te verkrijgen dan in Zuidoost-azië.

RIjStGENOOm

West-afrikaanse rijst moet bestand zijn tegen droogte en tegen hoge gehaltes aluminium, ijzer en zout in de grond. Voor een rijstras met dat soort eigenschappen is een slimmere manier van veredelen nodig dan traditio-nele kruising en selectie.

Ha

P s

LIK

We

G

109

aL

Le

so

Ve

rD

na

In 2000 werd het hele rijstgenoom in kaart gebracht. De komende jaren kunnen rijstonderzoekers dus deze informatie gebruiken om de genen te vinden die met deze eigenschappen verband houden. tijdens het proces van veredeling, waarbij honderden kruisingen worden gemaakt, kunnen de veredelaars de rijstplant-jes makkelijker op deze genen selecteren. Daardoor zou het veredelingsproces efficiënter en sneller kunnen verlopen.

cuLtuuRVERScHILLEN

Dit klinkt heel mooi, maar zo simpel is het in werkelijk-heid niet. op de eerste plaats is er in West-afrika nog nauwelijks kennis over genomics. Bovendien is geble-ken dat bovengenoemde eigenschappen complexer zijn dan gedacht. Zo werken de genen die planten bestand maken tegen droogte- en aluminium op een ingewik-kelde manier met elkaar samen. een derde reden is dat de ideeën van genomics-onderzoekers over veredeling sterk verschillen van die van plantenveredelaars. De vraag is nu hoe de cultuurverschillen tussen deze groe-pen onderzoekers overbrugd kunnen worden.

SAmEN mEt BOEREN

ondanks alle wetenschappelijke kennis die verede-laars tot hun beschikking hebben, gebruiken boeren in West-afrika nog steeds vooral hun eigen rassen, omdat die een constantere opbrengst geven dan de verbeterde rassen. Blijkbaar is er iets wat wetenschap-pers van deze boeren kunnen leren. Het is dus zaak dat genomics-onderzoekers, veredelaars en boeren meer met elkaar gaan samenwerken. Dat zou de rijstproduc-tie in West-afrika werkelijk kunnen verbeteren.Vooralsnog is er dus nauwelijks genomics-onderzoek gericht op West-afrikaanse rijst. Veel onderzoekspro-jecten zijn kort van duur en initiatieven voor samen-werking stranden. Veredelen is een kwestie van lange adem; het ontwikkelen, testen en uitbrengen van een nieuw ras duurt al gauw 5 tot 6 jaar, soms kan het 10 jaar duren.

We

re

LD

WIJ

D

110

aL

Le

so

Ve

rD

na GTA

We

re

LD

WIJ

D

111

aL

Le

so

Ve

rD

naGCWereldwijd

Moderne technologie zoals genomics is een product van de rijke westerse maatschappij. toch levert het ook mogelijkheden om de levensstandaard te verbeteren in minder welvarende gebieden. Door de landbouwproductie op te schroeven bijvoorbeeld of door bacteriën om te scholen tot landmijnvreters. toch zijn er ook negatieve kanten aan de ontwikkelingen voor armere landen. Ze dreigen het eigendom van hun eigen grondstoffen kwijt te raken, omdat slimme technologen er met de patenten vandoor gaan. De vraag is of de huidige regels hen voldoende beschermen tegen de kapers op de kust. A

We

re

LD

WIJ

D

112

aL

Le

so

Ve

rD

na

Aangepaste bacteriën blijken landmijnen te kunnen opsporen.Ze herkennen een specifiek stofje in de explosieven en zenden dan licht uit.In de toekomst kunnen ze mogelijk explosieve stoffen opruimen.

microsoldaten sporen landmijnen opBacteriën kunnen heel nuttig zijn. In de darmwand beschermen ze ons tegen ziekmakende indringers. En het groenafval in de GFt-bak breken ze netjes af tot milieuvriendelijk compost. Wanneer je bacte-riën genetisch iets aanpast, kun je ze voor nog veel meer doeleinden inzetten. Het principe is heel simpel. je laat deze micro-organismen het werk doen waar ze goed in zijn. Vervolgens pas je het genetische programma zo aan dat ze gaan werken in de richting die jij wilt en onder de omstandigheden waarin jij ze nodig hebt. Soms is dat lastig, maar wetenschappers worden steeds beter in het vinden van oplos-singen.

SOLDAAt

Verrassend is dat bacteriën ook nuttig werk leveren bij de opsporing en opruiming van landmijnen en andere explosieve stoffen. Dat blijkt uit onderzoek van professor Victor de Lorenzo van het nationaal Centrum voor Biotechnologie in Madrid, spanje. Zijn onderzoek verkeert nog in de experimentele fase, maar het is goed denkbaar dat binnen een paar jaar bacteriën als micro-

soldaten ingezet gaan worden.De gemeenste landmijnen zijn antipersoneelmijnen. Die worden vlak onder de grond begraven en ontploffen als er een persoon overheen loopt. Deze explosieven maken tijdens en na oorlogen de meeste burgerslacht-offers. Het probleem is ook nog eens dat ze met een metaaldetector niet op te sporen zijn. Ze zijn namelijk niet altijd verpakt in een metalen omhulsel.

BODEmBActERIE

De bodembacterie Pseudomonas putida biedt uitkomst. Deze slimme bacterie kan landmijnen wél herkennen. Hoe doet hij dat? Volgens Victor de Lorenzo is de truc om de bacterie genetisch te modificeren zodat hij speci-fiek het stofje 2,4-dinitrotolueen herkent dat voorkomt in explosieven. Wanneer de gemodificeerde bacterie met het stofje in aanraking komt, zendt de bacterie een fluorescerend licht uit. Daar zijn ze in het laboratorium voor getraind. Met een speciale lamp zijn de lichtge-vende bacteriën en dus de plekken waar landmijnen

We

re

LD

WIJ

D

113

aL

Le

so

Ve

rD

na

liggen gemakkelijk te herkennen.Pseudomonas putida is een handige bondgenoot. Deze onschadelijke bacteriën komen van nature voor in bodems waar ook militairen hun landmijnen in verstop-pen. Ze gedijen dus prima in een mijnenveld. Ze laten zich ook gemakkelijk samenballen tot kleine zaadjes, zodat ze vanuit een vliegtuig over een verdacht gebied uitgestrooid kunnen worden waarvan wordt vermoed dat er mijnen liggen. Bovendien worden deze bacteriën nooit moe en vragen niet om een salarisverhoging.

tNt

Het landmijnenprobleem is enorm en de vraag naar een veilige opsporingsmethode is dan ook groot. alleen al in Bosnië-Herzegovina liggen nog miljoenen landmij-nen die nog vaak voor nieuwe slachtoffers zorgen. als we 1% van het land mijnenvrij kunnen maken, levert dat de regio 150 miljoen euro op door herstel van de locale economie, landbouw en de toeristische sector.Uit onderzoek is bekend dat sommige bodembacte-riën de explosieve stof trinitrotolueen (tnt) volledig kunnen afbreken tot onschadelijke stoffen als water, kooldioxide en ammonia. Het is een enorme uitdaging om bacteriën in de toekomst zo te modificeren dat ze eerst landmijnen opsporen en ze vervolgens afbreken. Volgens hetzelfde principe als de mijnopsporing kunnen bacteriën in het laboratorium worden getraind om in feite ieder gewenst stofje te herkennen. Wetenschap-pers denken in de toekomst gemodificeerde bacteriën te kunnen maken die een scala aan totnogtoe onbe-kende moleculen herkennen. Moleculen die misschien de basis vormen voor nieuwe geurstoffen voor parfums of shampoos.

We

re

LD

WIJ

D

114

aL

Le

so

Ve

rD

na

Op genetisch aangepaste planten kun je een patent aanvragen.Rijke landen claimden zo het erfgoed van de derde wereld.Nu is ieder land eigenaar van haar eigen plantbronnen, maar de regels zijn vaag.

Van wie is dat gen nou eigenlijkHet genetisch materiaal van planten is een waardevolle grondstof voor allerlei onderzoekers en bedrijven. De grote vraag is alleen: van wie is deze waardevolle grondstof? Van wie is het genetische materi-aal van bijvoorbeeld een brandnetel, of van dat zeldzame plantje diep in het regenwoud?

GEmEENScHAPPELIjK ERFGOED

De eigendomsvraag houdt velen bezig, en er wordt tot op hoog politiek niveau druk over gediscussieerd. nog niet zo heel lang geleden beschouwde men de plant-genetische bronnen van deze wereld als een gemeen-schappelijk erfgoed. Hiermee bedoelde men dat het genetische materiaal van planten van iedereen is en dat niemand kan zeggen dat het zijn eigendom is. een boer is natuurlijk wel eigenaar van de tarweplantjes die hij verbouwt, maar hij kan zich niet de eigenaar noemen van dé tarweplant, want die wordt door nog miljoenen andere boeren verbouwd.Inmiddels is de situatie een stuk complexer gewor-

den. Door de opkomst van de biotechnologie is het mogelijk geworden om planten genetisch te modifice-ren. Dergelijke planten worden in steeds meer landen als uitvindingen gezien die je net als iedere andere technische uitvinding kan patenteren. Dit betekent dat degene die het patent krijgt over een bepaalde gene-tisch gemodificeerde plant, daar voor een bepaalde tijd (meestal 20 jaar) de eigenaar van is en deze als enige mag produceren en verkopen.

Planten die groeien in de natuur zijn uiteraard geen menselijke uitvindingen en kunnen dus niet worden gepatenteerd. toch is het in steeds meer landen in de wereld ook mogelijk om het genetisch materiaal van een bestaande plant te patenteren. De reden hiervoor is dat dit genetisch materiaal met behulp van geno-micstechnieken kan worden geïsoleerd en gekopieerd. onderzoekers proberen daarbij de specifieke eigen-schappen van het geïsoleerde stukje Dna te bepalen. Het gekopieerde stukje Dna komt in geïsoleerde vorm

We

re

LD

WIJ

D

115

aL

Le

so

Ve

rD

na

niet voor in de natuur en kan als menselijke uitvinding worden gepatenteerd.Met het gepatenteerde genetische materiaal kan veel geld verdiend worden. Zeker ook omdat het plant-ge-netisch materiaal steeds meer toegepast kan worden in verschillende industrieën. Planten spelen bijvoorbeeld een grote rol in de ontwikkeling van nieuwe medicijnen of cosmetische producten. Dergelijke producten kun-nen zeer winstgevend zijn.

ONEERLIjK

De grootste plant-genetische bronnen van de wereld bevinden zich in ontwikkelingslanden. De natuurlijke biodiversiteit is in veel van deze landen enorm groot en ook is er meer variatie in culturele tradities van het boe-renleven. toch vindt het onderzoek naar deze geneti-sche bronnen voornamelijk plaats in de bio-industrieën van de ontwikkelde landen. en daar worden de uitein-delijke producten ontwikkeld die gepatenteerd kunnen worden en waarmee geld kan worden verdiend. en dan te bedenken dat de plant-genetische bronnen in de ontwikkelingslanden zelf tot voor kort nog als gemeen-schappelijk erfgoed werden beschouwd, waar iedereen gratis toegang toe had.

om aan deze ongelijke situatie een einde te maken en ontwikkelingslanden mee te laten profiteren van de groeiende bio-industrieën, besloot de international ge-meenschap in 1992 om het principe van gemeenschap-pelijk erfgoed los te laten. In plaats daarvan bevestigde

Oerbossen bevatten een

groot deel van de plant-

genetische bronnen.

Patenteen octrooi of patent is een alleenrecht om een product te maken, verkopen of anderszins te ex-ploiteren. een octrooihouder kan zijn octrooi ge-bruiken als monopolie op een bepaalde techniek. anderen mogen deze techniek dan niet gebrui-ken. een octrooihouder heeft niet automatisch op basis van het verleende octrooi het recht om de uitvinding toe te passen. In veel gevallen zijn daarvoor nadere vergunningen nodig, bijvoor-beeld op grond van de warenwet of op grond van de milieuwetgeving. soms staan octrooirechten van anderen toepassing van de uitvinding in de weg.

We

re

LD

WIJ

D

116

aL

Le

so

Ve

rD

na

men in de Convention on Biological Diversity (CBD) dat ieder land de baas is over zijn eigen plant-geneti-sche bronnen. Dit betekent dat een land nu eisen kan stellen aan iedere partij die toegang wil hebben tot de genetische bronnen op zijn grondgebied. In ruil voor toegang kan zo een aandeel worden gevraagd in de winst die voortvloeit uit het gebruik van het ontvan-gen plant-genetisch materiaal. ook kan onderhandeld worden over de verdeling van kennis en technologieën die ontwikkeld worden met behulp van het uitgewis-selde materiaal.

Helaas bleek dit systeem niet goed te werken voor die genetische bronnen die gebruikt worden voor voedsel en landbouw. De voornaamste reden hiervoor is dat de planten die men gebruikt voor voedselproductie al

eeuwen lang worden uitgewisseld en meestal wijdver-breid worden verbouwd. Hierdoor is het nauwelijks mogelijk om één land aan te wijzen dat eigenaar is van het genetische materiaal van een bepaald gewas. Daarnaast is de landbouwsector zelfs afhankelijk van de historische uitwisseling van plant-genetische bron-nen. alleen op die manier kan men steeds weer betere gewassen kweken die tegen nieuwe ziektes opgewas-sen zijn en meer voedsel produceren voor de groeiende wereldbevolking. een systeem dat de vrije uitwisseling van deze plant-genetische bronnen in de weg staat, zou uiteindelijk de wereldvoedselvoorziening in de weg kunnen staan, zo menen critici van de CBD en diens systeem van eigendomsrechten op plant-genetisch materiaal.

LIjSt

Daarom heeft de internationale gemeenschap in 2001 een internationale lijst voor voedsel- en landbouw-gewassen opgesteld. Die lijst bevat de namen van de gewassen die vanuit het oogpunt van voedselzekerheid belangrijk zijn. Ieder land dat het verdrag ondertekent heeft vrije toegang tot die gewassen en mag zelf geen eigendomsrechten op die gewassen claimen. Bedrijven die de gewassen gebruiken bij het kweken van nieuwe rassen mogen deze alleen patenteren, als ze een ge-deelte van hun winst op deze nieuwe gewassen storten in een internationaal fonds dat projecten voor boeren in ontwikkelingslanden ondersteunt.Sorghum, een typisch landbouwgewas dat in Afrika groeit.

We

re

LD

WIJ

D

117

aL

Le

so

Ve

rD

na

Deze internationale lijst vergemakkelijkt dus de toegang tot die gewassen die essentieel zijn voor de wereldvoedselvoorziening. Daarmee komt het oor-spronkelijke principe van gemeenschappelijk erfgoed weer een beetje terug en hopen de opstellers dat de historisch vrije uitwisseling van plant-genetische bron-nen voor voedsel en landbouw in stand blijft. Deze lijst is opgenomen in een internationale verdrag voor plant-genetische bronnen. tot op de dag van van-daag onderhandelen landen over de precieze invulling en toepassing van de huidige regels die bepalen wie welke plant- genetische bronnen bezit. Het zou dus goed kunnen dat er over tien of twintig jaar weer heel andere regels gelden.

Leesopdracht voor in de klas

Instructiea. Kies twee artikelen uit.b. Zoek voor beide artikelen de informatie die in de tabel wordt gevraagd en vul deze in. Antwoord met één of

enkele steekwoorden.c. Als je de informatie niet uit het artikel kunt halen, probeer dan andere bronnen te raadplegen.d. Ga na welke vragen bij jou worden opgeroepen door het vergelijken van deze twee artikelen. In welk opzicht zijn

de situaties vergelijkbaar, in welk opzicht niet?

Artikel 1 Artikel 2

Titel

Om welk probleem gaat het?

Om welk organisme gaat het?

Welke eigenschap is van belang op organismeniveau?

Welke eigenschap is van belang op moleculair/celniveau?

Welke delen van het genoom zijn van belang?

Welke technieken worden gebruikt?

In hoeverre is het probleem hiermee opgelost?

Welke problemen zijn nog niet opgelost of juist opgeroepen door de techniek?

Zijn er toekomstverwachtingen?

Welke begrippen staan centraal?

Welke vragen roept de vergelijking van deze artikelen bij jou op?

Hieronder staat een voorbeeld van wat twee willekeurig gekozen artikelen zouden opleveren. De onderdelen die niet in het artikel voorkomen zouden kunnen leiden tot een opdracht om daar nader literatuuronderzoek naar te doen.

Artikel 1 Artikel 2

Titel Boeven vangen met DNA Een pleister voor RNA

Om welk probleem gaat het? Opsporing misdadigers Ziekte van Duchenne

Om welk organisme gaat het? Mens Mens, proefdier muis

Welke eigenschap is van belang op organismeniveau? Identiteit van de dader Afbraak spierweefsel

Welke eigenschap is van belang op moleculair/celniveau? Individueel DNA-profiel Ontbreken spiereiwit

Welke delen van het genoom zijn van belang? (Komt niet voor in artikel) Gen voor spiereiwit

Welke technieken worden gebruikt? PCR Antisense-RNA in spier inbrengen

In hoeverre is het probleem hiermee opgelost?DNA-profielen kunnen van kleine sporen met grote waarschijnlijkheid vaststellen of er een match is met een verdachte

Werkend (maar korter) eiwit

Welke problemen zijn nog niet opgelost of juist opgeroepen door de techniek?

(komt niet voor in artikel: opslag van materiaal en privacy)

Medicijn blijvend gebruikenVeel varianten van fout gen

Zijn er toekomstverwachtingen? Vaker gebruik, ook voor oude zaken Toepassingen in de mens

Welke begrippen staan centraal? DNA-profiel Antisense RNA (‘pleister’)

Welke vragen roept de vergelijking van deze artikelen bij jou op?

Debatteer in de klas

VoorbereidingKies een onderwerp uit het boekje, dat aanleiding kan zijn voor debat. Stel vast wat het dilemma is en verwoord die als stelling.

Voorbeelden:- voor forensische doeleinden mogen DNA-sporen worden

geanalyseerd op ‘raskenmerken’ (p 36)- het ‘criminaliteitsgen’ ontslaat een verdachte van vervolging

(p 69)- aanbod van DNA-tests via internet moet verboden worden

(p 80)- bij veredeling van biologische gewassen mogen geen

genetische technieken worden gebruikt (p 103)- patenten op genen zijn nodig om de wetenschap vooruit te

helpen (p 112)

Maak twee teams – een is voor, de ander tegen. Ieder team gaat in het eerste deel van de les of thuis op zoek naar argumenten. Beide partijen spreken af wie van hen als eerste het woord neemt.

DebatMaak van de klas een ‘Lagerhuis’: stel de ene partij in een of twee rijen aan de ene kant op en de andere partij aan de andere kant. De docent is de voorzitter. De partij die voorstander is begint met een beargumentering en heeft daarvoor twee minuten de tijd. Dan volgt de woordvoerder van de tegenpartij, eveneens twee minuten. Daarna mag iedereen meedoen. Net als bij het Britse Lagerhuis geeft een leerling die het woord wil dit aan door op te staan. Hij krijgt het woord van de voorzitter. Na tien minuten debatteren, of wanneer het debat ophoudt, bepaalt de voorzitter welke partij gewonnen heeft.

VariatieLaat de leerlingen ter plekke beslissen of ze voor of tegen een stelling zijn. De voorstanders nemen aan de ene kant plaats, de tegenstanders aan de andere kant. Het debat barst daarna direct los. Het wordt nu zaak dat de deelnemers zo scherp debatteren dat ze mensen uit het andere kamp overhalen om van mening te veranderen en over te steken. De jury bepaalt welke individuele debater gewonnen heeft.

Laat de winnaar of winnende partij aanwijzen door de voorzitter of een driekoppige jury van leerlingen.

Woordenlijst

ChromosoomGroot stuk DNA, bevat meestal honderden genen. Chromosomen zijn bij de celdeling zichtbaar onder microscoop. Bij de mens heeft elke cel 46 (23 paar) chromosomen.

DNALangwerpig molecuul, opgebouwd uit de bouwstenen G, A, T, C.

EiwitLangwerpig, gevouwen molecuul opgebouwd uit verschillende aminozuren. Eiwitten zorgen voor chemische reacties, structuur, transport, communicatie in de cel en het organisme.

GenEen bepaalde DNA-volgorde die codeert voor een of meerdere specifieke eiwitten. De mens heeft 22.500 verschillende genen.

GenoomDe totale genetische informatie die aanwezig is in een cel of een individu.

GenomicsGrootschalig onderzoek naar erfelijkheid en de genen van organismen, inclusief de mens.

Mutatie Verandering in de DNA-code. Een mutatie in een gen kan de werking van een eiwit beïnvloeden.

RNASterk op DNA lijkend molecuul dat zorgt voor de vertaling van de DNA-code van een gen naar een eiwit.

Leesopdracht voor in de klas

Instructiea. Kies twee artikelen uit.b. Zoek voor beide artikelen de informatie die in de tabel wordt gevraagd en vul deze in. Antwoord met één of

enkele steekwoorden.c. Als je de informatie niet uit het artikel kunt halen, probeer dan andere bronnen te raadplegen.d. Ga na welke vragen bij jou worden opgeroepen door het vergelijken van deze twee artikelen. In welk opzicht zijn

de situaties vergelijkbaar, in welk opzicht niet?

Artikel 1 Artikel 2

Titel

Om welk probleem gaat het?

Om welk organisme gaat het?

Welke eigenschap is van belang op organismeniveau?

Welke eigenschap is van belang op moleculair/celniveau?

Welke delen van het genoom zijn van belang?

Welke technieken worden gebruikt?

In hoeverre is het probleem hiermee opgelost?

Welke problemen zijn nog niet opgelost of juist opgeroepen door de techniek?

Zijn er toekomstverwachtingen?

Welke begrippen staan centraal?

Welke vragen roept de vergelijking van deze artikelen bij jou op?

Hieronder staat een voorbeeld van wat twee willekeurig gekozen artikelen zouden opleveren. De onderdelen die niet in het artikel voorkomen zouden kunnen leiden tot een opdracht om daar nader literatuuronderzoek naar te doen.

Artikel 1 Artikel 2

Titel Boeven vangen met DNA Een pleister voor RNA

Om welk probleem gaat het? Opsporing misdadigers Ziekte van Duchenne

Om welk organisme gaat het? Mens Mens, proefdier muis

Welke eigenschap is van belang op organismeniveau? Identiteit van de dader Afbraak spierweefsel

Welke eigenschap is van belang op moleculair/celniveau? Individueel DNA-profiel Ontbreken spiereiwit

Welke delen van het genoom zijn van belang? (Komt niet voor in artikel) Gen voor spiereiwit

Welke technieken worden gebruikt? PCR Antisense-RNA in spier inbrengen

In hoeverre is het probleem hiermee opgelost?DNA-profielen kunnen van kleine sporen met grote waarschijnlijkheid vaststellen of er een match is met een verdachte

Werkend (maar korter) eiwit

Welke problemen zijn nog niet opgelost of juist opgeroepen door de techniek?

(komt niet voor in artikel: opslag van materiaal en privacy)

Medicijn blijvend gebruikenVeel varianten van fout gen

Zijn er toekomstverwachtingen? Vaker gebruik, ook voor oude zaken Toepassingen in de mens

Welke begrippen staan centraal? DNA-profiel Antisense RNA (‘pleister’)

Welke vragen roept de vergelijking van deze artikelen bij jou op?

Debatteer in de klas

VoorbereidingKies een onderwerp uit het boekje, dat aanleiding kan zijn voor debat. Stel vast wat het dilemma is en verwoord die als stelling.

Voorbeelden:- voor forensische doeleinden mogen DNA-sporen worden

geanalyseerd op ‘raskenmerken’ (p 36)- het ‘criminaliteitsgen’ ontslaat een verdachte van vervolging

(p 69)- aanbod van DNA-tests via internet moet verboden worden

(p 80)- bij veredeling van biologische gewassen mogen geen

genetische technieken worden gebruikt (p 103)- patenten op genen zijn nodig om de wetenschap vooruit te

helpen (p 112)

Maak twee teams – een is voor, de ander tegen. Ieder team gaat in het eerste deel van de les of thuis op zoek naar argumenten. Beide partijen spreken af wie van hen als eerste het woord neemt.

DebatMaak van de klas een ‘Lagerhuis’: stel de ene partij in een of twee rijen aan de ene kant op en de andere partij aan de andere kant. De docent is de voorzitter. De partij die voorstander is begint met een beargumentering en heeft daarvoor twee minuten de tijd. Dan volgt de woordvoerder van de tegenpartij, eveneens twee minuten. Daarna mag iedereen meedoen. Net als bij het Britse Lagerhuis geeft een leerling die het woord wil dit aan door op te staan. Hij krijgt het woord van de voorzitter. Na tien minuten debatteren, of wanneer het debat ophoudt, bepaalt de voorzitter welke partij gewonnen heeft.

VariatieLaat de leerlingen ter plekke beslissen of ze voor of tegen een stelling zijn. De voorstanders nemen aan de ene kant plaats, de tegenstanders aan de andere kant. Het debat barst daarna direct los. Het wordt nu zaak dat de deelnemers zo scherp debatteren dat ze mensen uit het andere kamp overhalen om van mening te veranderen en over te steken. De jury bepaalt welke individuele debater gewonnen heeft.

Laat de winnaar of winnende partij aanwijzen door de voorzitter of een driekoppige jury van leerlingen.

Woordenlijst

ChromosoomGroot stuk DNA, bevat meestal honderden genen. Chromosomen zijn bij de celdeling zichtbaar onder microscoop. Bij de mens heeft elke cel 46 (23 paar) chromosomen.

DNALangwerpig molecuul, opgebouwd uit de bouwstenen G, A, T, C.

EiwitLangwerpig, gevouwen molecuul opgebouwd uit verschillende aminozuren. Eiwitten zorgen voor chemische reacties, structuur, transport, communicatie in de cel en het organisme.

GenEen bepaalde DNA-volgorde die codeert voor een of meerdere specifieke eiwitten. De mens heeft 22.500 verschillende genen.

GenoomDe totale genetische informatie die aanwezig is in een cel of een individu.

GenomicsGrootschalig onderzoek naar erfelijkheid en de genen van organismen, inclusief de mens.

Mutatie Verandering in de DNA-code. Een mutatie in een gen kan de werking van een eiwit beïnvloeden.

RNASterk op DNA lijkend molecuul dat zorgt voor de vertaling van de DNA-code van een gen naar een eiwit.

Leesopdracht voor in de klas

Instructiea. Kies twee artikelen uit.b. Zoek voor beide artikelen de informatie die in de tabel wordt gevraagd en vul deze in. Antwoord met één of

enkele steekwoorden.c. Als je de informatie niet uit het artikel kunt halen, probeer dan andere bronnen te raadplegen.d. Ga na welke vragen bij jou worden opgeroepen door het vergelijken van deze twee artikelen. In welk opzicht zijn

de situaties vergelijkbaar, in welk opzicht niet?

Artikel 1 Artikel 2

Titel

Om welk probleem gaat het?

Om welk organisme gaat het?

Welke eigenschap is van belang op organismeniveau?

Welke eigenschap is van belang op moleculair/celniveau?

Welke delen van het genoom zijn van belang?

Welke technieken worden gebruikt?

In hoeverre is het probleem hiermee opgelost?

Welke problemen zijn nog niet opgelost of juist opgeroepen door de techniek?

Zijn er toekomstverwachtingen?

Welke begrippen staan centraal?

Welke vragen roept de vergelijking van deze artikelen bij jou op?

Hieronder staat een voorbeeld van wat twee willekeurig gekozen artikelen zouden opleveren. De onderdelen die niet in het artikel voorkomen zouden kunnen leiden tot een opdracht om daar nader literatuuronderzoek naar te doen.

Artikel 1 Artikel 2

Titel Boeven vangen met DNA Een pleister voor RNA

Om welk probleem gaat het? Opsporing misdadigers Ziekte van Duchenne

Om welk organisme gaat het? Mens Mens, proefdier muis

Welke eigenschap is van belang op organismeniveau? Identiteit van de dader Afbraak spierweefsel

Welke eigenschap is van belang op moleculair/celniveau? Individueel DNA-profiel Ontbreken spiereiwit

Welke delen van het genoom zijn van belang? (Komt niet voor in artikel) Gen voor spiereiwit

Welke technieken worden gebruikt? PCR Antisense-RNA in spier inbrengen

In hoeverre is het probleem hiermee opgelost?DNA-profielen kunnen van kleine sporen met grote waarschijnlijkheid vaststellen of er een match is met een verdachte

Werkend (maar korter) eiwit

Welke problemen zijn nog niet opgelost of juist opgeroepen door de techniek?

(komt niet voor in artikel: opslag van materiaal en privacy)

Medicijn blijvend gebruikenVeel varianten van fout gen

Zijn er toekomstverwachtingen? Vaker gebruik, ook voor oude zaken Toepassingen in de mens

Welke begrippen staan centraal? DNA-profiel Antisense RNA (‘pleister’)

Welke vragen roept de vergelijking van deze artikelen bij jou op?

Debatteer in de klas

VoorbereidingKies een onderwerp uit het boekje, dat aanleiding kan zijn voor debat. Stel vast wat het dilemma is en verwoord die als stelling.

Voorbeelden:- voor forensische doeleinden mogen DNA-sporen worden

geanalyseerd op ‘raskenmerken’ (p 36)- het ‘criminaliteitsgen’ ontslaat een verdachte van vervolging

(p 69)- aanbod van DNA-tests via internet moet verboden worden

(p 80)- bij veredeling van biologische gewassen mogen geen

genetische technieken worden gebruikt (p 103)- patenten op genen zijn nodig om de wetenschap vooruit te

helpen (p 112)

Maak twee teams – een is voor, de ander tegen. Ieder team gaat in het eerste deel van de les of thuis op zoek naar argumenten. Beide partijen spreken af wie van hen als eerste het woord neemt.

DebatMaak van de klas een ‘Lagerhuis’: stel de ene partij in een of twee rijen aan de ene kant op en de andere partij aan de andere kant. De docent is de voorzitter. De partij die voorstander is begint met een beargumentering en heeft daarvoor twee minuten de tijd. Dan volgt de woordvoerder van de tegenpartij, eveneens twee minuten. Daarna mag iedereen meedoen. Net als bij het Britse Lagerhuis geeft een leerling die het woord wil dit aan door op te staan. Hij krijgt het woord van de voorzitter. Na tien minuten debatteren, of wanneer het debat ophoudt, bepaalt de voorzitter welke partij gewonnen heeft.

VariatieLaat de leerlingen ter plekke beslissen of ze voor of tegen een stelling zijn. De voorstanders nemen aan de ene kant plaats, de tegenstanders aan de andere kant. Het debat barst daarna direct los. Het wordt nu zaak dat de deelnemers zo scherp debatteren dat ze mensen uit het andere kamp overhalen om van mening te veranderen en over te steken. De jury bepaalt welke individuele debater gewonnen heeft.

Laat de winnaar of winnende partij aanwijzen door de voorzitter of een driekoppige jury van leerlingen.

Woordenlijst

ChromosoomGroot stuk DNA, bevat meestal honderden genen. Chromosomen zijn bij de celdeling zichtbaar onder microscoop. Bij de mens heeft elke cel 46 (23 paar) chromosomen.

DNALangwerpig molecuul, opgebouwd uit de bouwstenen G, A, T, C.

EiwitLangwerpig, gevouwen molecuul opgebouwd uit verschillende aminozuren. Eiwitten zorgen voor chemische reacties, structuur, transport, communicatie in de cel en het organisme.

GenEen bepaalde DNA-volgorde die codeert voor een of meerdere specifieke eiwitten. De mens heeft 22.500 verschillende genen.

GenoomDe totale genetische informatie die aanwezig is in een cel of een individu.

GenomicsGrootschalig onderzoek naar erfelijkheid en de genen van organismen, inclusief de mens.

Mutatie Verandering in de DNA-code. Een mutatie in een gen kan de werking van een eiwit beïnvloeden.

RNASterk op DNA lijkend molecuul dat zorgt voor de vertaling van de DNA-code van een gen naar een eiwit.

Leesopdracht voor in de klas

Instructiea. Kies twee artikelen uit.b. Zoek voor beide artikelen de informatie die in de tabel wordt gevraagd en vul deze in. Antwoord met één of

enkele steekwoorden.c. Als je de informatie niet uit het artikel kunt halen, probeer dan andere bronnen te raadplegen.d. Ga na welke vragen bij jou worden opgeroepen door het vergelijken van deze twee artikelen. In welk opzicht zijn

de situaties vergelijkbaar, in welk opzicht niet?

Artikel 1 Artikel 2

Titel

Om welk probleem gaat het?

Om welk organisme gaat het?

Welke eigenschap is van belang op organismeniveau?

Welke eigenschap is van belang op moleculair/celniveau?

Welke delen van het genoom zijn van belang?

Welke technieken worden gebruikt?

In hoeverre is het probleem hiermee opgelost?

Welke problemen zijn nog niet opgelost of juist opgeroepen door de techniek?

Zijn er toekomstverwachtingen?

Welke begrippen staan centraal?

Welke vragen roept de vergelijking van deze artikelen bij jou op?

Hieronder staat een voorbeeld van wat twee willekeurig gekozen artikelen zouden opleveren. De onderdelen die niet in het artikel voorkomen zouden kunnen leiden tot een opdracht om daar nader literatuuronderzoek naar te doen.

Artikel 1 Artikel 2

Titel Boeven vangen met DNA Een pleister voor RNA

Om welk probleem gaat het? Opsporing misdadigers Ziekte van Duchenne

Om welk organisme gaat het? Mens Mens, proefdier muis

Welke eigenschap is van belang op organismeniveau? Identiteit van de dader Afbraak spierweefsel

Welke eigenschap is van belang op moleculair/celniveau? Individueel DNA-profiel Ontbreken spiereiwit

Welke delen van het genoom zijn van belang? (Komt niet voor in artikel) Gen voor spiereiwit

Welke technieken worden gebruikt? PCR Antisense-RNA in spier inbrengen

In hoeverre is het probleem hiermee opgelost?DNA-profielen kunnen van kleine sporen met grote waarschijnlijkheid vaststellen of er een match is met een verdachte

Werkend (maar korter) eiwit

Welke problemen zijn nog niet opgelost of juist opgeroepen door de techniek?

(komt niet voor in artikel: opslag van materiaal en privacy)

Medicijn blijvend gebruikenVeel varianten van fout gen

Zijn er toekomstverwachtingen? Vaker gebruik, ook voor oude zaken Toepassingen in de mens

Welke begrippen staan centraal? DNA-profiel Antisense RNA (‘pleister’)

Welke vragen roept de vergelijking van deze artikelen bij jou op?

Debatteer in de klas

VoorbereidingKies een onderwerp uit het boekje, dat aanleiding kan zijn voor debat. Stel vast wat het dilemma is en verwoord die als stelling.

Voorbeelden:- voor forensische doeleinden mogen DNA-sporen worden

geanalyseerd op ‘raskenmerken’ (p 36)- het ‘criminaliteitsgen’ ontslaat een verdachte van vervolging

(p 69)- aanbod van DNA-tests via internet moet verboden worden

(p 80)- bij veredeling van biologische gewassen mogen geen

genetische technieken worden gebruikt (p 103)- patenten op genen zijn nodig om de wetenschap vooruit te

helpen (p 112)

Maak twee teams – een is voor, de ander tegen. Ieder team gaat in het eerste deel van de les of thuis op zoek naar argumenten. Beide partijen spreken af wie van hen als eerste het woord neemt.

DebatMaak van de klas een ‘Lagerhuis’: stel de ene partij in een of twee rijen aan de ene kant op en de andere partij aan de andere kant. De docent is de voorzitter. De partij die voorstander is begint met een beargumentering en heeft daarvoor twee minuten de tijd. Dan volgt de woordvoerder van de tegenpartij, eveneens twee minuten. Daarna mag iedereen meedoen. Net als bij het Britse Lagerhuis geeft een leerling die het woord wil dit aan door op te staan. Hij krijgt het woord van de voorzitter. Na tien minuten debatteren, of wanneer het debat ophoudt, bepaalt de voorzitter welke partij gewonnen heeft.

VariatieLaat de leerlingen ter plekke beslissen of ze voor of tegen een stelling zijn. De voorstanders nemen aan de ene kant plaats, de tegenstanders aan de andere kant. Het debat barst daarna direct los. Het wordt nu zaak dat de deelnemers zo scherp debatteren dat ze mensen uit het andere kamp overhalen om van mening te veranderen en over te steken. De jury bepaalt welke individuele debater gewonnen heeft.

Laat de winnaar of winnende partij aanwijzen door de voorzitter of een driekoppige jury van leerlingen.

Woordenlijst

ChromosoomGroot stuk DNA, bevat meestal honderden genen. Chromosomen zijn bij de celdeling zichtbaar onder microscoop. Bij de mens heeft elke cel 46 (23 paar) chromosomen.

DNALangwerpig molecuul, opgebouwd uit de bouwstenen G, A, T, C.

EiwitLangwerpig, gevouwen molecuul opgebouwd uit verschillende aminozuren. Eiwitten zorgen voor chemische reacties, structuur, transport, communicatie in de cel en het organisme.

GenEen bepaalde DNA-volgorde die codeert voor een of meerdere specifieke eiwitten. De mens heeft 22.500 verschillende genen.

GenoomDe totale genetische informatie die aanwezig is in een cel of een individu.

GenomicsGrootschalig onderzoek naar erfelijkheid en de genen van organismen, inclusief de mens.

Mutatie Verandering in de DNA-code. Een mutatie in een gen kan de werking van een eiwit beïnvloeden.

RNASterk op DNA lijkend molecuul dat zorgt voor de vertaling van de DNA-code van een gen naar een eiwit.

GG ACGCCGGG TTATTAACTTCCAomslag publieksboek-2.indd 1 12/15/08 7:18:24 PM

GG ACGCCGGG TTATTAACTTCCAomslag publieksboek-2.indd 1 12/15/08 7:18:24 PM

GG ACGCCGGG TTATTAACTTCCAomslag publieksboek-2.indd 1 12/15/08 7:18:24 PM