1

MICROBIOLOGIE

- DEEL I -

Prof. Dr. ir. J. Swings

« Biology of Microorganisms », 9de ed. (2000)

LES 1

LES 1

1. INLEIDING

2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie

1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)

1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)

1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)

1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)

1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)

1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)

1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)

2

http://lmg.ugent.be

Volg links: research, education

log in om de dias te bekomen

LES 1

1. INLEIDING

2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie

1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)

1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)

1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)

1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)

1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)

1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)

1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)

3

Faculty of SciencesLaboratory of Microbiology

Prof. Dr. ir. J. Swings Prof. Dr. M. Gillis Prof. Dr. P. De Vos Prof. Dr. P. Vandamme

Wetenschappelijk personeel: 24Administratief en technisch personeel: 25

GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCESLABORATORY OF MICROBIOLOGY

TEACHING

TEACHINGUNIVERSITY STUDENTS IN BIOLOGY, BIOTECHNOLOGY, BIOCHEMISTRYMaster of Science in Applied Microbial Systematics

4

GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCESLABORATORY OF MICROBIOLOGY

RESEARCH GROUPS

RESEARCH on CLASSIFICATION, PHYLOGENY, IDENTIFICATION AND TYPING OF BACTERIA, related to ECOLOGY, BIODIVERSITY, BIOTECHNOLOGY

Rhizosphere bacteria (N2-fixers), plant pathogenic bacteria Bacillus and allied groups Lactic acid bacteria (probiotics) Drinking waters Antarctic mats, fresh waters, tropical soils Biodegradation of bioplastics, xenobiotics Antibiotic resistance genes in the environment and the food chain Bacteria from clinical, veterinary and industrial environments

GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCESLABORATORY OF MICROBIOLOGY

BCCM™/LMG BACTERIA COLLECTION

PRESERVATION and DISTRIBUTION of BACTERIAL CULTURES

SERVICES

RESEARCH

Phylogeny, classification, identification and typing of acetic acid bacteria,

Vibrio, lactic acid bacteria, streptomycetes Taxonomy of bacteria from clinical, veterinary and industrial environments

Optimising fine strain typing

Automation/robotisation

5

GHENT UNIVERSITY - FACULTY OF SCIENCESLABORATORY OF MICROBIOLOGY

TECHNIQUESGENOMIC TECHNIQUES

DNA sequencing % GC determination DNA:DNA hybridisations DNA fingerprinting (DGGE, ARDRA, t-RNA, REP, RAPD, PFGE, AFLP)

PHENOTYPIC TECHNIQUES

gaschromatographic analysis of cellular fatty acids (FAMEs) gelelectrophoresis of cellular proteins (SDS-PAGE) metabolic fingerprinting (breathprints, conventional characterization)

BIOINFORMATICS and BIONUMERICAL techniques for

database construction data mining data analysis

INTRODUCE NEW MOLECULAR TECHNIQUES

American Society for Microbiology (ASM)

6

LES 1

1. INLEIDING

2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie

1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)

1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)

1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)

1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)

1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)

1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)

1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)

Algen 1µm – 10cm

Protozoa 2 – 200µm EUKARYOTEN

Fungi (gisten en schimmels) 2 – 10µm

Bacteriën 0.3 – 2µm PROKARYOTEN

soms tot 100µm

Virussen 0.015 – 0.2µm

MICRO-ORGANISMEN

Afmetingen:

7

Life is first and foremost a microbiological phenomenon

Oudste fossielen

Zijn aanwezig in de biosfeer sinds

3/4 van het ontstaan van het leven

Leeuwenaandeel van het globaal

metabolisme, biomassa en diversiteit

A definition of life

Living organisms are autopoietic

systems capable of evolution by

natural selection

8

The mystery of life

Fig. 1.3

De kenmerken van het cellulair leven

9

Fig. 1.3

Fig. 1.4

Metaforen over de cel Chemische fabriekInformatie opslagplaats

Groei

10

LES 1

1. INLEIDING

2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie

1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)

1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)

1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)

1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)

1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)

1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)

1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)

Fig. 1.5

11

Virussen

Virussen

12

Bacteriofagen zijn virussen van bacteriën

LES 1

1. INLEIDING

2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie

1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)

1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)

1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)

1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)

1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)

1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)

1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)

13

Fig. 1.8

Fig. 1.9

Bacterie Archaea Eukaryoot

14

LES 1

1. INLEIDING

2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie

1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)

1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)

1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)

1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)

1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)

1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)

1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)

Fig. 1.13

Uitzuiveringsent = uitstrijk

15

Fig. 1.12

Steriele overenting

LES 1

1. INLEIDING

2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie

1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)

1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)

1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)

1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)

1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)

1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)

1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)

16

Micro-organisms are part of your life

They are your ancestors

You carry them with you

Fig. 1.14

De impact van micro-organismen op de mens

17

Fig. 1.15

LES 1

1. INLEIDING

2. HOOFDSTUK 1 : Micro-organismen en Microbiologie

1.2 Micro-organismen als cellen (Editie 10 = 1.2)

1.3 Elementen van cellen en virale structuur (2.1)

1.4 Evolutionaire verwantschappen bij levende organismen (2.3)

1.5 Microbiele populaties, gemeenschappen en ecosystemen (1.3)

1.6 Laboratorium kweek van micro-organismen (5.2 & 5.3)

1.7 De impact van micro-organismen op de mens (1.4)

1.8 De historiek van Microbiologie (1.5)

18

Antonie van Leeuwenhoek (1632 – 1723)

De microscoop van A. van Leeuwenhoek

19

Louis Pasteur (1822 – 1895)

Fig. 1.18a

Pasteur’s experiment

20

Fig. 1.18b

Fig. 1.18c

21

Robert Koch (1843 – 1910)

Koch de ontdekker

Anthrax Bacillus anthracis (1877)

Reinculturen (1881)

Tuberculose Mycobacterium tuberculosis (1882)

Cholera Vibrio cholera (1883)

Kochse postulaten (1884)

22

Koch’s tekeningen van Mycobacterium tuberculosis

Fig. 1.20

Fig. 1.19a

Postulaten van Koch

23

Fig. 1.19b

Fig. 1.19c

24

Fig. 1.19d

Fig. 1.21

Martinus Beijerinck

25

Fig. 1.22

Sergei Winogradsky

1600 1700 1800 1900 2000

1684 Van Leeuwenhoek

1860 Pasteur

1881 Koch’s reinculturen

1929 Penicilline

1983 HIV

Tabel 1.1

300 jaar Microbiologie

1995 Eerste complete bacteriële genoomsequentie