WWWIRIS

Publicatie van een ISIS databank op het web

Els Mertens - juni 2003

Wat heb je nodig ?

• Een databank gemaakt in winisis

• Webserver : bv APACHE

• WWWiris (de websoftware voor ISIS)

…en heel veel tijd…

Winisis : twee databanken

• Biomed - bevat referenties van tijdschriftartikelen- geconverteerd vanuit Current Contents

• Bib- bevat bibliotheekbezit (tijdschriften)- geconverteerd vanuit bibliotheeksysteem

Link/relatie tussen Biomed en Bib ( ISSN)

Biomed : veldenEen zo ver mogelijk doorgedreven opsplitsing :

10 : Auteurs20 : Titel artikel30 : Titel Tijdschrift40 : Volume50 : Nummer60 : Pagina’s70 : Jaar80 : ISSN90 : Trefwoorden100 : Samenvatting

Bib : velden

1 : ISSN

2 : Tijdschrifttitel

3 : Holdings - welke jaren/volumes aanwezig zijn - fysieke locatie in de bibliotheek

4 : URL van het tijdschrift op internet - bedoeld voor linking naar full text

Hoe ziet het er uit ?

in Winisisin WWWiris

Hoe doe je dat ?

Webserver : Apache

• Gratis webserver • Halen bij Apache zelf : ingewikkelde procedure

met verificatiecodes• Eén essentiele file : httpd.conf

- configuratiefile- werkt zonder wizzard (dus notepad)- bevat heel veel uitleg (regels met # ervoor)- hierin : alias en scriptalias aanmaken

Alias en scriptalias Alias /wwwiris/ "c:/wwwiris/" <Directory "c:/wwwiris/"> Options Indexes FollowSymLinks MultiViews AllowOverride None Order allow,deny Allow from localhost 127.0.0.1 DirectoryIndex index.php </Directory>

ScriptAlias /wwwiris-cgi/ "c:/wwwiris/"<Directory "c:/wwwiris/"> Options Indexes FollowSymLinks MultiViews ExecCGI AllowOverride None Order allow,deny Allow from localhost 127.0.0.1 DirectoryIndex index.php</Directory>

Functie van (script)alias

• Vertelt webserver wat waar staat

- Alias : verwijst naar folder waarin de html bestanden staan- Scriptalias : verwijst naar folder waar de scripts en executable staan

• Zet juiste rechten op die folders• Geeft zo de mogelijkheid beveiliging in te bouwen

WWWIRIS - Aan te passen files

• Wirmenu.htm = linkerframe van de webpagina- bevat verwijzing naar plaats waar .exe staat (hier benaming scriptalias gebruiken !)- bevat links naar help en info etc.- voor elke taal is een wirmenu file nodig

• Cipar file (dbs.cpr)- vertelt wwwiris waar de databank, toon en highlighting files staan - is hoofd- en kleinletter gevoelig

WWWIRIS (vervolg essentiële files)

• CSS file (dbs.css) - style sheet (te kopiëren van voorbeeld)

• Wirvars.jsin Arrays (per taal) aangeven : - op welke velden (+ prefixen) gezocht kan worden- hoe de toonformaten (pft’s) heten- highlighting files benoemen

Voorbeeld array (Nederlands)• dbs = new Array();• dbs[0] = new Array();• dbs[0][0]=new Array();• dbs[0][0][0]="BIOMED";• dbs[0][0][1]=new Array();• dbs[0][0][2]=new Array();• dbs[0][0][1][0]="AU=";dbs[0][0][2][0]="Auteurs";• dbs[0][0][1][1]="TI=";dbs[0][0][2][1]="Titel Artikel";• dbs[0][0][1][2]="JN=";dbs[0][0][2][2]="Titel Tijdschrift";• dbs[0][0][1][3]="YR=";dbs[0][0][2][3]="Jaar";• dbs[0][0][1][4]="IS=";dbs[0][0][2][4]="ISSN";• dbs[0][0][1][5]="KW=";dbs[0][0][2][5]="Trefwoorden";• dbs[0][0][1][6]="AB=";dbs[0][0][2][6]="Samenvatting";• dbs[0][0][3]=new Array();• dbs[0][0][3][0]="BIOMbool.fst";• dbs[0][0][3][1]="BIOMtext.fst";• dbs[0][0][4]=new Array();dbs[0][0][5]=new Array();• dbs[0][0][4][0]="biomesh";dbs[0][0][5][0]="lijst";• dbs[0][0][4][1]="biomefu";dbs[0][0][5][1]="lang";• dbs[0][0][6]="Biomedische databank";

Voegt zelf taalcode toe aan toonformaten

WWWIRIS (vervolg aan te passen files)

• Highlighting files - moeten er staan (werkend of niet)- met bepaalde naam

DBNBOOL.FST en waarbij DBN = databanknaam DBNTEXT.FST dus BIOMBOOL en BIOMTEXT

• Display files (pft’s ofte toonformaten)- met bepaalde naam en voor elke taal : ldbnsh.pft en waarbij l = language (d = dutch)

ldbnfu.pft dus dbiomesh en dbiomefu

Valkuilen • In Winisis databank : alles met prefixen indexeren• Wwwiris : veel files meegeleverd

- overbodige- dubbele- voorbeeldfiles (handig hulpmiddel !)- essentiële files

- zijn moeilijk van elkaar te onderscheiden- welke doet wat ?- sommige zijn vermeld in documentatie - andere niet

• Files in de juiste folders (met juiste namen) zien te plaatsen

• Sommige dingen kan je gewoon niet wetenbv : highlighting : in pft’s ‘proof modus’ kiezen

• Voor iconen : .ico-files wordt door Apache niet herkent, wel .jpg-files

• Link naar andere databank :in cipar file verwijzing naar die databank opnemen !

• Debugging kan je opzetten, maar is beperktOorzaken errors : hoofd- vs kleine letters; komma’s, spaties….

• Relatie tussen databanken - In Winisis :

{cl1,fs24,'Journal website:'},tab(2667), LINK(('click here'), IF S(REF->bib(L->bib(v80),v4))='' THEN 'URL not available….. ' ELSE 'OPENFILE ', REF->bib(L->bib(v80), v4)/FI/)/

- Wordt in WWWiris :'<TR><TD WIDTH="30%" BGCOLOR="#CCCCCC" ><I>URL Tijdschrift </I></TD><TD BGCOLOR="LIGHTYELLOW" >', IF S(REF(['bib']L(['bib']v80),v4))='' THEN 'URL niet beschikbaar.' ELSE '<a href="', REF(['bib']L(['bib']v80),v4)'">klik hier</A></TD></TR>'/FI,/

Verschillen : - gebruik html codes (ook voor spaties, comma’s en dergelijke)- wwwiris : braziliaanse logica REF->bib(L->bib(v80),v4) wordt REF(['bib']L(['bib']v80),v4)- html formaat voor ‘LINK’ functie en ‘OPENFILE’ uit winisis LINK(('click here') en 'OPENFILE ' worden '<a href="', REF..'">klik hier</A>

Nog op te lossen problemen• Highlighting : auteur wordt alleen gehighlight als

het de eerste auteur van het artikel betreft• Highlighting tijdschrifttitels : titels worden in

keuzelijstje afgebroken op 27 karakters. Alles wat langer is wordt niet gehighlight. Bug ?

• Doorklikken op trefwoorden : werkt nog niet• ‘Terug naar zoekscherm’- knop : achtergrondkleur

verdwijnt. • Andere taalkeuze : N->E kan, E->N taal statische

info in linkerframe verandert niet mee. Bug ?• Nog afwijkingen Engelse tov Nederlandse kant

Conclusie

• Winisis is krachtige software• WWWIRIS een mooie aanvulling daarop• Bovendien gratis

maar er zijn een paar nadelen :

• Niet gebruiksvriendelijk• Niet voor leken• Te weinig gedocumenteerd