Kenneth Devloo

Promotors:

Philip Dutré

Abram Aertsen

Detecteren en tracken van bacteriële

cellen in time-lapse opnames:

statusupdate

Detectie

Tracking/Correctie

Gui

Tekst

Detectie

Af

Parameters: breedte,mask, aantal iteraties,…

Finetuning

>Erosie om beter onderscheid tussen cellen te

maken

>Splitsen op basis van breedte

Tracking/correctie Af

Algoritme om te splitsen cellen te vinden vernieuwd

Algoritme om cellen te splitsen vernieuwd

Parameters: Percentages voor maximaal grootteverschil,..

Tracking

Te splitsen cellen zoeken: geen, samengesmolten cellen, foutetoekenning, beide,..

Te splitsen cellen splitsen: geen, split, threshold, beide

Scorecorrectie: geen, overlap

Finetuning

>Exacter splitsen in 2e geval

Globaal tracking

GUI

Qt voor gui zelf ->nog geen koppeling

Graphviz om resultaten te maken->werkt

Extra:

>Optie voor low memory

grafiek zelf klikbaar maken

Tekst Abstract, …

Inleiding: situering, uitleg, bijdragen

Theorie: fast bilateral filter, Grayscale –morphology, threshold, (flexible) hough, edge detection, rolling ball algoritme, distance, skeletons, descriptors, tracking -> volgende week zondag

Algoritme: bestaande applicaties, detectie(flow chart), beschrijving, tracking

Implementatie: technologie, structuur, beperkingen, gui

Resultaat: is implementatie zelf een resultaat?, lineages, detectie-resultaten

Toekomstig werk en kritische analyse:detectie, tracking, appl.

Besluit

Planning

17j: theorie, gui, finetuning

24j: algoritme, eerste resultaten voor

31j: implementatie, resultaten

7a: besluit, abstract, paper, poster…