Alexander Scheffer, 5800978Suraja Padarath, 5745039

Eefke van Eerden, 5800919Bas de Vleeschhouwer, 5736420

12 december 2008

De GIRaFH-studieFactors influencing HDL cholesterol

levels

Overzicht

• Inleiding• Methoden• Resultaten• Discussie

Inleiding

• Familiaire hypercholesterolemie (FH)– Erfelijke aandoening– Verhoging cholesterol

• Genafwijking -> FH -> laag HDL-C/hoog LDL-C -> CVD

• Onderzocht: factoren die variatiein het HDL-C niveau in hetbloedplasma kunnen aan-brengen

Methoden

• Retrospectieve, multicenter cohort studie• Patiënten met FH uit 27 lipideklinieken in

Nederland• Verschillende data:

– Fenotype (leeftijd, roken, diabetes)– Genotype (gen1 , gen 2, gen 3)– Cholesterolniveau (HDL-C, LDL-C,

triglyceriden)

Methoden

• Aanpak 1:– Baseline tabel maken– Variabelen normaal verdeeld?– Simpele lineaire regressie– Multiple lineaire regressie

Methoden

• Aanpak 2:– Baseline tabel maken– Variabelen normaal verdeeld?– Statistische test

• Categoriële data (Pearson Chi²-test)• Continue data (independent sample t-test)

– Simpele lineaire regressie– Multiple backward lineaire

regressie

Resultaten aanpak 1

• Baseline tabel Man Vrouw

Aantal patiënten 377 384

Leeftijd (jaren)45,9 ± 11,1

51,2 ± 14,3

Roken (%) 33,5 37,7

Diabetes (%) 1,3 6,6

HDL-C (mmol/L) 1,1 ± 0,3 1,3 ± 0,4

LDL-C (mmol/L) 9,1 ± 2,2 9,4 ± 2,2

Triglyceriden (mmol/L) 3,1 ± 1,7 3,0 ± 1,5

Drager gen 1 (%) 6,2 3,9

Drager gen 2 (%) 30 29,3

Drager gen 3 (%) 37,3 36,1

Resultaten aanpak 1

• Bepaling normale verdeling continue variabelen

2,00 4,00 6,00 8,00 10,00

Triglycerides

0

20

40

60

Count

Resultaten aanpak 1

• Bepaling normale verdeling continue variabelen

HDL-C Mannen Vrouwen

skewness 0,387 1,187

kurtosis 0,456 5,190

normaal verdeeld ja nee

LDL-C Mannen Vrouwen

skewnes 0,657 0,740

kurtosis 0,387 0,694

normaal verdeeld ja ja

Triglyceriden Mannen Vrouwen

skewness 0,653 0,297

kurtosis 0,625 -0,411

normaal verdeeld ja ja

Leeftijd Mannen Vrouwen

skewness -0,413 -0,950

kurtosis -0,433 -0,570

normaal verdeeld ja ja

Resultaten aanpak 1

• Vergelijking simpele versus multiple variabele lineaire regressie

 Simpel linear

regressieMultiple linear

regression

  R²P-

waarde R²P-

waarde

Geslacht 0,112 0,000 0,374 0,000

Leeftijd 0,022 0,000 0,374 0,004

Roken 0,000 0,544 0,374 0,982

Diabetes 0,000 0,789 0,374 0,230

LDL 0,004 0,066 0,374 0,005

Triglyceride 0,001 0,308 0,374 0,270

Gen 1 0,003 0,116 0,374 0,440

Gen 2 0,001 0,379 0,374 0,364

Gen 3 0,004 0,065 0,374 0,016

Resultaten aanpak 2

• Baseline tabel Totaal aantal patiënten 737  

  Man Vrouw

  n = 368 n = 369

Roken? Nu; n(%) 256(69,9) 265(71,8)

Diabetes? Ja; n(%) 14(3,8) 22(6)

Leeftijd; mean(SD)46,1(10,9

)51,8(14,6

)

LDL Cholesterol (mmol/l); mean(SD)

9,15(2,17)

9,42(2,12)

HDL Cholesterol (mmol/l); mean(SD)

1,08(0,29)

1,35(0,42)

Triglyceride (mmol/l); mean(SD)

3,12(1,67)

3,00(1,54)

Gene1, drager; n(%) 37(10,1) 31(8,4)

Gene2, drager; n(%) 213(57,9) 211(57,2)

Gene3, drager; n(%) 277(75,3) 265(72,8)

Resultaten aanpak 2

• Bepaling normale verdeling

  Man   Vrouw  

  Skewness KurtosisSkewness

Kurtosis

HDL-Cholesterol 0,238 0,07 1,095 4,755

LDL-Cholesterol 0,514 -0,174 0,673 0,767

Triglyceride 0,634 0,285 0,455 -0,033

Leeftijd 0,359 0,293 -0,127 0,686

Resultaten aanpak 2

• Statistische test:– Categoriële data

• Pearson Chi²-test

• H0: Proporties tussen twee groepen zijn gelijk verdeeld

– Continue data:

• H0: geen verschil in de mean tussen de twee groepen

• independent sample t-test bij een normale verdeling• Mean difference• 95% CI van de mean difference

– P-waarde < 0.05 wordt als significantbeschouwd

Resultaten aanpak 2

• Statistische testen

Totaal aantal patiënten 737    

 Man

n = 368

Vrouw

n = 369

     

  p-waardemean

difference 95% CI

Roken? Nu; n(%) 256(69,9) 265(71,8) 0,502    

Diabetes? Ja; n(%) 14(3,8) 22(6) 0,174

Leeftijd; mean(SD) 46,1(10,9) 51,8(14,6) 0,000 5,67low: 3,81

upper: 7,55

LDL Cholesterol (mmol/l); mean(SD) 9,15(2,17) 9,42(2,12) 0,950 0,26

low: -0,05upper: 0,58

HDL Cholesterol (mmol/l); mean(SD) 1,08(0,29) 1,35(0,42) 0,000 0,26

low: 0,20upper: 0,31

Triglyceride (mmol/l); mean(SD) 3,12(1,67) 3,00(1,54) 0,290 0,13

low: 0,11upper: 0,36

Gene1, drager; n(%) 37(10,1) 31(8,4) 0,438    

Gene2, drager; n(%) 213(57,9) 211(57,2) 0,848    

Gene3, drager; n(%) 277(75,3) 265(72,8) 0,288    

Resultaten aanpak 2

• Vergelijking simpele versus multiple variabele backward lineaire regressie

 Simpel Lineair Regressie  

Multivariabele Lineair Regressie

  p-waarde R² p-waarde R²

Mannelijk geslacht 0,000 0,111 0,000

0,146

Leeftijd 0,010 0,160 0,022

Roken 0,952 0,000 0,960

Diabetes 0,047 0,050 0,007

LDL-cholesterol 0,006 0,100 0,000

Triglyceride 0,112 0,003 0,204

Gene1 0,174 0,003 0,256

Gene2 0,609 0,000 0,867

Gene3 0,005 0,050 0,011

Alex Eefke Suraja Bas

R²P-

value R²P-

value R²P-

value R²P-

value

Geslacht 0,123 0,000 0,107 0,000 0,111 0,000 0,112 0,000

Leeftijd 0,023 0,000 0,010 0,006 0,160 0,010 0,022 0,000

Roken 0,000 0,599 0,000 0,986 0,000 0,952 0,000 0,544

Diabetes 0,087 0,004 0,000 0,597 0,050 0,047 0,000 0,789

LDL 0,003 0,012 0,004 0,069 0,100 0,006 0,004 0,066

TG 0,080 0,004 0,001 0,322 0,003 0,112 0,001 0,308

Gen 1 0,002 0,230 0,001 0,419 0,003 0,174 0,003 0,116

Gen 2 0,002 0,202 0,001 0,315 0,000 0,609 0,001 0,379

Gen 3 0,007 0,019 0,008 0,015 0,050 0,005 0,004 0,065

Eindresultaat

• Proportie categoriele variabelen statistisch gelijk verdeeld over man en vrouw

• Continue variabelen:– TG en LDL-C gelijk verdeeld– HDL en leeftijd niet gelijk verdeeld

Eindresultaat

• Multivariabele regressie:– Alex: geslacht, leeftijd, diabetes, LDL-C en gen

3 16,3%– Eefke: geslacht, LDL-C, gen 3 12,5%– Suraja: geslacht, leeftijd, diabetes, LDL-C en

gen 3 14,6%– Bas: leeftijd, geslacht, LDL-C en

gen 3 37,4%

Discussie

• HDL-C bij vrouwen niet normaal verdeeld, dus analyse onbetrouwbaar

• Achteraf: – simpele lineaire regressie, vervolgens

multivariabele backward lineaireregressie

– Kurtosis en skewness splitsen opgeslacht was niet nodig

Vragen?Bedankt voor jullie aandacht