Literatuurzoeken tijdens de Biologiestudie

Pascal Braak, Peter Roessingh, George Meerburg

UBA / FNWI

http://www.uba.uva.nl

2

Programma

• Zoeken in de Digitale Bibliotheek + bibliotheekgebruik

• Pauze• Web of Science• Wetenschappelijk publiceren• Paaseieren zoeken• EndNote• Plagiaat

3

Vissen in de IJszee

… en dan moet u ook het artikel van Vermei in Science?!

…over de te verwachten invasie van pacifische organismen in de

Atlantische Oceaan lezen…en zoekt u aanvullende literatuur

bij dit onderwerpDoor wie?

Waar?Wanneer?

Pfff…. Overgenomen uit:Literaturrecherche im Biologiestudium

Technische Universtität Darmstadt

4

Vissen in de IJszee

… en nu…?

phhf…

Overgenomen uit:Literaturrecherche im Biologiestudium

Technische Universtität Darmstadt

5

Vissen in de IJszee

Visible web

Invisible WebDeep Web

Publicaties die via Internet zoekmachinestoegankelijk zijn

Publicaties die via Literatuurbestandentoegankelijk zijn

Overgenomen uit:Literaturrecherche im Biologiestudium

Technische Universtität Darmstadt

6

Twee wegenDe weg …… naar de digitale bibliotheek en daar zoeken in databases

Of direct naar de elektronische tijdschriften en daar zoeken naar het tijdschrift

7

Zoeken in de DB

8

Zoeken naar tijdschriftenVermeij, GJ; Roopnarine, PD (2008): The coming arctic invasion.Science 321 (5890), 780-781

VolumeJaargang

Issue Aflevering

Bladzijden

Jaar

9

Natuurwetenschappelijke databases

OVID

Biological Abstracts 1993 - heden

Medline 1950 - 2010

INSPEC 1969 - heden

SciFinder Scholar

Wereldwijd de grootste verzameling chemische informatieArtikelen uit tijdschriften, boeken, comgresverslagen, patenten (1878 -), chemische stoffen (1957-) en reakties (1840-)

Zoeken met chemische formules

Registratie vereist

11

Web of Knowledge

Web of Science: 1975 – heden

Zoeken naar artikelen

Citaties

Journal Citation Reports (JCR):

Statistische berekening van hoe vaak tijdschrift wordt geciteerd.

Bepaalt “impactfactor” van een tijdschrift

12

OVERLAP BETWEEN WEB OF SCIENCE AND BIOSIS PREVIEWS

Overlap2.980 journals

ISI Web of Knowledge journal counts as of March 2009

13

BioOneNon-profit samenwerking tussen een aantal uitgevers en organisaties.Bioscience tijdschriften vaak vanaf 2000 tot heden.Ook Open Access tijdschriften.

14

TijdschriftenprijzenCrisis in de wetenschappelijke informatievoorziening

“Temidden van de overvloed aan informatie heerst een informatietekort”

Oplossing: door elektronisch publiceren geheel of gedeeltelijk afzien van intermediairen (uitgevers, bibliotheken).

Self-Archiving: secundaire publicatiePublicatie in een Open Access tijdschrift

15

Voorbeelden van Open Access TijdschriftenBioMed Central

1997 – Full text van artikelen en Abstracts uit biologische tijdschriften

Public Library of Science

PLoS Biology 2003 -PLoS Medicine 2004 -PLoS computational Biology 2005 -PLoS Genetics 2005 -

16

Google Wetenschap / Google Scholar

Makkelijk om snel te zien of of publicatie online beschikbaar is Open Access publicaties en repositoriesFulltext van uitgevers via de UvA-LINKERVaak iets meer treffersDekking/lacunes niet bekend

17

Informatie explosie• Elke minuut 2000

nieuwe bladzijden wetenschappelijke literatuur)

• Zoek secundaire literatuur met in titel: Reviews of …, Trends in …, Current opinion in … etc.

18

Literatuur zoeken• Literatuur zoeken is het systematisch

verzamelen van gepubliceerde informatie over een onderwerp

Fasen:

1. Vraaganalyse en oriëntatie

2. Kiezen van bestanden en zoektermen

3. Zoekstrategie ontwikkelen en verzamelen van de resultaten

4. Evalueren en bijstellen

19

Onderwerp > Zoekvraag

• Find studies on the reintroduction of the European beaver back into Europe.

20

Onderwerp > Zoekvraag

• Find studies on the reintroduction of the European beaver back into Europe.

21

Encyclopedieën• Startpunt

• Encyclopedia of life sciences

• Grzimek's animal life encyclopedia

• Wikipedia

22

Denken als een document• Ga niet uit van wat je zoekt, maar van

wat je wilt vinden.

• Probeer te bedenken hoe iemand iets heeft opgeschreven

• Neem voldoende tijd

• Maak verslag van wat je vindt

• Begin ruim en perk je zoekresultaten in

23

Recall en precision

Bniet

relevantgevonden

Arelevant

gevonden

Drelevant

niet gevonden

Cniet

relevantniet

gevonden

Precisie = A/(A+B) Proportie van gevonden documenten die relevant zijn.

Vangst = A/(A+D) Proportie van relevante documenten die zijn gevonden.

24

Negatief verband

25

Booleaanse operatoren Operator Voorbeeld Resultaat

AND prey

AND

predators

Je zoekt preciezer

OR pteropodsOR

cuvierinidae

Je zoekt breder

NOT pH

NOT

CO2

Je sluit bepaalde treffers uit

26

Trunceren?, * = willekeurig aantal tekens

Rechtszijdig Intern (wildcards)

gene* gene

general

generation

bio*ical biochemical

biological

biomedical

# = nul of één teken

! = één teken

27

And now something completely different…

http://cf.uba.uva.nl/mobiel http://cf.uba.uva.nl/nl/

28

Toegang vanuit huis• UvA-dsl• UvA-vpn – virtual private network• Studentsite of http://www.ic.uva.nl

29

Bibliotheek Bètawetenschappen

30

Openingstijden

Ma t/m vrij van 7.30 - 22.00 uur (m.i.v. 15 april tot 20.00 uur)Zat van 10.00 - 18.00 uur

31

Bibliotheek Zoölogie Mauritskade

32

Openingstijden

Leeszalen hele week toegankelijkBalie Do van 9.00-17.00 uur

33

Studie- en Informatiecentrum FNWI

34

Openingstijden

Ma t/m do van 9.00 - 18.45 uurVrij van 9.00 - 17.00 uurVerhuist per 7 juni naar Science park

35

Nederlandse Entomologische Vereniging

36

Openingstijden

Di t/m vrij van 9.00 – 12.30 uur en van 13.30 – 16.30 uur

37

Oefeningen• Oefeningen:

http://www.science.uva.nl/library/cursus/Biologie/2010/index_nl. html

Werken in duo’s

38

Wat is plagiaat?Het gebruiken van een werk zonder toestemming en zonder vermelding van de oorspronkelijke auteur, waarbij de pleger van het plagiaat het doet voorkomen alsof dit zijn eigen oorspronkelijke werk is. (wikipedia)

39

Copy/Paste en plagiaat, wat mag wel en wat mag niet?

• Overnemen van een stukje tekst waarin je oppervlakkige veranderingen aanbrengt, z.b.

• Overnemen van een stukje tekst waarin je alle zinnen wat verandert, z.b.

• Overnemen van een idee dat je geheel in eigen woorden weergeeft, z.b.

• Overnemen van een plaatje van een site van een groot bedrijf, m.b./z.t.

• Overnemen van een compleet gedicht van Vondel, m.b./z.t.

X

X

X

X

√

40

Copy/Paste en plagiaat, wat mag wel en wat mag niet??

• Overnemen van een foto van een schilderij van Rembrandt uit een museumsite, m.b./z.t.

• 5 regels tekst uit een boek letterlijk overnemen, m.b./z.t.

• De helft van een websitetekst letterlijk overnemen, m.b./z.t.

• Een oud verslag van een vriend (met diens toestemming) inleveren onder je eigen naam, zb.

• Achter in een verslag staat als enige bron-vermelding: “Bij dit verslag werd gebruik gemaakt van de leerboeken van het tweede en derde

studiejaar”

X

X

X

X

√

41

Regeling " Fraude en Plagiaat" van de UvA

3. Onder plagiaat wordt in ieder geval verstaan:

a. het gebruik maken dan wel overnemen van andermans teksten, gegevens of ideeën zonder volledige en correcte bronvermelding;

b. het presenteren als eigen werk of eigen gedachten van de structuur dan wel het centrale gedachtegoed uit bronnen van derden, zelfs indien een verwijzing naar andere auteurs is opgenomen;

c. het niet duidelijk aangeven in de tekst, bijvoorbeeld via aanhalingstekens of een bepaalde vormgeving, dat letterlijke of bijna letterlijke citaten in het werk werden overgenomen, zelfs indien met een correcte bronvermelding;

d. het parafraseren van de inhoud van andermans teksten zonder voldoende bronverwijzingen;

e. het overnemen van beeld-, geluids- of testmateriaal, software en programmacodes van anderen zonder verwijzing en zodoende laten doorgaan voor eigen werk;

f. het indienen van een eerder ingediende of daarmee vergelijkbare tekst voor opdrachten van andere opleidingsonderdelen;

g. het overnemen van werk van medestudenten en dit laten doorgaan voor eigen werk;

h. het indienen van werkstukken die verworven zijn van een commerciële instelling of die (al dan niet tegen betaling) door iemand anders zijn geschreven.