Klassificatie agglomeratief Divisief Opsplitsen van totale groep stalen in kleinere groepen => grote...
-
Upload
sonja-molenaar -
Category
Documents
-
view
214 -
download
0
Transcript of Klassificatie agglomeratief Divisief Opsplitsen van totale groep stalen in kleinere groepen => grote...
Klassificatie
agglomeratief
Divisief
Opsplitsen van totale groep stalen inkleinere groepen=> grote verschillen domineren kleinere verschillen
Samenbrengen van individuele objecten ingrotere groepen=> lokale gelijkenissen belangrijker dan grotere verschillen
= KLUSTERANALYSE
= TWINSPAN
Braun Blanquet : subjectieve opdeling in groepen van soorten en stalen
site1 site2 site 3 site 4 site 5
soort a 1 2 0 0 0soort b 3 1 1 0 0soort c 5 5 2 2 3soort d 0 0 3 4 6soort e 0 0 0 5 2
12
3 4 5
Two Way Indicator Species ANalysis Hill, 1979
* ontwikkeld voor soorten - stalen data matrix
naast klassificatie van stalen , ook klassificatie van soorten op basis van hun ecologische preferentie
=> twee-wegs tabel of “two-way table”
=> karakterisatie van gemeenschappen=> weergave van synecologische relaties van soorten
Two Way Indicator Species ANalysis Hill, 1979
=> twee-wegs tabel of “two-way table”
12 stalen
12 soorten
= zo duidelijk mogelijke weergave van relaties tussen soorten en stalen (stations)
Two Way Indicator Species ANalysis Hill, 1979
=> twee-wegs tabel of “two-way table”
= zo duidelijk mogelijke weergave van relaties tussen soorten en stalen (stations)
Two Way Indicator Species ANalysis Hill, 1979
=> twee-wegs tabel of “two-way table”
Ordening van stalen en soorten => bovenste soorten meer frequent aanwezig in linkse helft van stalen=> onderste soorten vookeur voor rechts geplaatste stalen=> middelste soorten geen voorkeur voor links of rechts
Two Way Indicator Species ANalysis Hill, 1979
=> twee-wegs tabel of “two-way table”
Soort met uitgesproken preferentie = differentiële soort (indicator soort)
Het voorkomen van deze soort is karakteristiek binnen linkse groep stations
Daarnaast komen in deze groep nog 3 andere soorten preferentieel voor
Two Way Indicator Species ANalysis
Basis princiepe : herhaalde dichotomisatie voor stalen en soorten klassificatie van stalen, gevolgd door klassificatie van soorten
• (1) klasseer stalen in een divisieve hiërarchie
• (2) zet klassificatie om in een volgorde
• (3) groepen (van stalen) gebruikt om soorten te omschrijven als al of niet preferentiëel
• (4) klasseer soorten op zelfde manier als stalen, maar op basis van hun preferentie
• (5) zet soorten klassificatie om in een volgorde
# groepen : 2 -> 4 -> 8 -> 16….enz
Geordende twee-wegs tabel
kritiek: indifferentiële soorten ook geklasseerd in één van beide groepen
site 1 site 2 site 3 site 4 site 5soort a 1 2soort b 3 1 1soort c 5 5 2 2 3soort d 3 4 6soort e 5 2
Score+1+1
Som scores +2 +2 0 0 0
Hoe worden de dichotomieën gemaakt ?
Methode van Mueller-Dombois & Ellenberg (vereenvoudigd) :
• (1) zoek een groep van soorten die een trend vertonen om samen voor te komen• (2) maak een ordinatie door elk van deze soorten een maximale score van +1 te geven• (3) sommeer per staal scores van de aanwezige soorten • (4) Verdeel ordinatie in het midden (t.h.v. centroid) in twee groepen van stalen• (5) Verdeel soorten in categorieën op basis van hun al of niet preferentieel zijn voor een groep
=> twee-wegs tabel of “two-way table”
( 1) Stel we nemen waar dat soort 5, 9 en 11een trend vertonen om samen voor te komen
(2) erkend als differentiële soorten (score +1)
(3) staal 9, 11 en 12 score +3 staal 8 en 10 score +2 staal 7 score +1 rest score 0
(4) ordening van stalen => vaststelling dat soort 3 tevens differentieel is (score +1)
staal 9, 11 en 12 score +4 staal 8 en 10 score +3 staal 7 score +2 rest score 0
Dichotomisatie van stalen in 2 groepen
Stalen 9, 11, 12,8, 10 en 7
Stalen 6, 3, 1, 2,4, 3
Two Way Indicator Species ANalysis
Hoe worden de dichotomieën gemaakt in TWINSPAN ?
Gebaseerd op methode van Mueller-Dombois & Ellenberg :
• (1) Identificatie van richting van variatie d.m.v. ordinatie (CA)
• (2) Verdeel ordinatie in midden van eerste as => ruwe dichotomie
• (3) Identificaar soorten die preferentieel zijn voor één van beide zijden van de dichotomie
• (4) Maak een nieuwe ordinatie met de differentiële soorten als basis
• (5) Verdeel verbeterde ordinatie opnieuw in twee => Verfijnde dichotomie
• (6) Maak een laatste, vereenvoudigde ordinatie op basis van de meest differentiele soorten
• (7) Ga na of deze Indicator ordinatie de verfijnde ordinatie bevestigd
Two Way Indicator Species ANalysis
(1) primaire ordinatie(2) verfijnde ordinatie => afgeleid van 1e ordinatie door identificatie van differentiële soorten(3) indicator ordinatie (bijkomstig)
TWINSPAN = opdeling van ordinaties (en geen selectie van indicator soorten)
Two Way Indicator Species ANalysis
Pseudosoorten
Het idee van preferentiële soorten is puur kwalitatief (aan-of afwezig)
=> daarom vervangen door kwantitatief equivalent = pseudosoort
Eén soort kan vervangen worden door verschillende pseudosoorten
Hoe hoger abundantie van de soort => hoe meer pseudosoorten
Kwantitatieve informatie wordt weerhouden op basis van klassen
De abundanties die worden gebruikt om de klassegrenzen te bepalennoemen we de “pseudospecies cut levels”
Two Way Indicator Species ANalysis
Pseudosoorten
Stel we gebruiken de volgende cutlevels :1 = 0 - 4 %2 = 5 - 25 %3 = 26 - 50 %4 = 51 - 75 %5 = 76 - 100 %
Stel nu soort A met een abundantie van 18 % in staal 1 => 2 pseudosoorten: 1 en 236 % in staal 2 => 3 pseudosoorten : 1, 2 en 3
2 pseudosoortengemeen , 1 niet
Op deze manier worden kwantitatieve waarden gebruikt als differentiële soorten
Two Way Indicator Species ANalysis => twee-wegs tabel of “two-way table”
Stel differentiële soort met cut level 3 => hogere abundanties van deze soort karakteristiek voor stalengroep.
Two Way Indicator Species ANalysis
Output
6 st. 6 st.
12 st.
5 st. 1 st. 2 st. 4st.
1211 9
810
7 6 3 12
4 5
Twee-wegs tabel omzetten in dendrogram
Two Way Indicator Species ANalysis
Output
6 st. 6 st.
12 st.
5 st. 1 st. 2 st. 4st.
1211 9
810
7 6 3 12
4 5
Voor elke dichotomie aanduiding van indicator soorten differentiële soorten en niet-preferentiële soorten
Two Way Indicator Species ANalysis
Aanduiding van positieve en negatieve groep
Borderline negatives / positives : stalen die bij negatieve of positieve groep worden geklasseerd maar die eerder
indifferentieel zijn
Misclassified negatives/positives : wanneer stalen door de verfijnde dichtomie links of rechts worden geklasseerd
maar de indicator dichotomie op basis van meest differentiële soorten plaatst hen inde andere groep.
Two Way Indicator Species ANalysis
Negative/positive preferentials : soorten en pseudosoorten die tenminste 2 maal meer aan ene kant van de dichotomie dan aan andere kant.Hierbij worden wel alleen soorten in rekening die in tenminste 20 % van stalen van één of andere zijde voorkomen.
(meestal wordt tussen haakjes weergegeven in hoeveel stalen van linkse enrechtse groep deze soorten voorkomen)
Bepalen van cut levels
Maximale data distributie over verschillende klassen(data distribution in Excel)