DE conferentie 2012 - Koos Biesmeijer

Post on 18-Jun-2015

289 views 0 download

Transcript of DE conferentie 2012 - Koos Biesmeijer

Nieuw leven voor dode hommels Koos Biesmeijer

Of: Hoe digitalisering van natuurhistorische collecties de wetenschap vooruit helpt

Vreemde hobby? Nuttig voor maatschappij en

wetenschap?

Doelstellingen

FES Collectie Digitalisering

Medio 2015 zijn ongeveer 7 miljoen objecten van de 37 miljoen gedigitaliseerd:

• 2 miljoen binnen Naturalis in de digistraten;

• 5 miljoen objecten worden uitbesteed;

• de overige 30 miljoen objecten digitaal worden geregistreerd op een minder gedetailleerd niveau.

Medio 2015: een permanente infrastructuur gerealiseerd om de digitalisering in de dagelijkse praktijk voort te zetten

Digistraten • Wageningen digistraat • Leiden digistraat herbariumbladen • Digistraat mollusken • Alcoholstraat • Entomologiestraat • Houtstraat • (E)vertebraten digistraat • Glasstraat • Papierstraat • Geologiestraat

Proces entomologiestraat

Voor

IN 1

Per insect digitaliseren

2 3

Na

Resultaat: 139 records

4

UIT

Proces entomologiestraat

Resultaat: 139 records

Eind resultaat: >300,000 records

Digitalisering van de collectie helpt bij: 1 Bepaling van verandering in biodiversiteit 2 Ontwikkelen automatisch identificatie systeem 3 [ Dieet vergelijken vroeger en nu] 4 [ Populatie gezondheid DNA ]

Nieuw leven voor dode bijen

Bepaling veranderingen

Collectiegegevens vullen gaten in ruimte en tijd Input voor Rode Lijst, biodiversiteit-targets

TOENAME

GELIJK

AFNAME

Bepaling veranderingen

Nederland loopt voorop in Biodiversiteit-informatie

Bepaling veranderingen

Nederland loopt voorop in Biodiversiteit-informatie

Thibaut De Meulemeester Koos Biesmeijer

Ontwikkelen automatisch identificatie systeem

Eerste stap: hommels

• Hommels worden veel waargenomen • Veel soorten gaan achteruitgaan • Hommels zijn belangrijke gewasbestuivers

Maar ….. identificatie is moeilijk! Bombus lucorum of magnus of cryptarum of terrestris ?

Huidige oplossing: de taxonoom

© Edwin Brosens

Cees van Achterberg Met pensioen in 2013

102321223310020012203112342121112000000100231001

Data analyse

beeldanalyse

Geometric morphology

Smart phone

app

Onze ‘high-tech’oplossing:

Digitalizatie van ‘ader-kruispunten’

Direct van ‘lade scan’ uit collectie !

Kwaliteit ladescan is voldoende

Image analyse ‘corrigeert’ voor positie-effect

Hoe goed is onze methode ?

Hommels: moeilijke groep als testcase

>87% van individuen op goede naam >95% van individuen in goede ‘subgenus’

Eerste analyses :

Nu: alle bijen-geslachten van NL (36)

Terugkoppeling naar collectie

Foute determinaties opgespoord

[ ± controle kwaliteit van identificaties]

Vleugel ID: naam

Collectie: naam

Taxonoom overbodig in toekomst ?

© Edwin Brosens

DIY

Upload vleugel image

Upload DNA

barcode

Stuur naar

expert

online keys, boeken

NEE Beter ingezet voor moeilijke Identificaties !!

Identificatie m.b.v. vleugelbeadering

DNA barcoding

Collecties FES

Digitalisatie project

Wetenschappelijke expertise

WEB-based TOOL

Informatiediensten

BIODIVERSITEITMONITORING

TOEPASSINGEN

CITIZEN SCIENCE PROJECTEN

PUBLIEKE INTERESSE

Bedankt voor uw aandacht

Koos Biesmeijer.naturalis.nl