MeSH DatabaseArtikelen zijn geïndexeerd met een woordenlijst, de Medical Subject Headings (MeSH). In de MeSH Database kun je zoeken naar geschikte MeSH-termen voor een zoekactie. Klik op MeSH onder Advanced Search Queries of MeSH Database op de startpagina van PubMed om te zoeken naar een term. De gevonden term kun je verfijnen met subheadings en aspecten. Vink de gewenste termen aan en kies dan onder Send To voor Search Box. Als je klaar bent met toevoegen van termen klik dan op Search PubMed om de zoekactie uit te voeren.

Clinical QueriesPubMed’s Clinical Queries, toegankelijk via de startpagina onder Advanced Search, maakt het gemakkelijker om artikelen te vinden die verslag doen van klinisch onderzoek. Kies één van de drie opties. Om te zoeken op een categorie van klinische studies voer je zoektermen in. Selecteer dan één van de filtercategorieën: etiology, diagnosis, therapy, prognosis of clinical prediction guides en dan of “narrow, specific search” of “broad, sensitive search”.

Selecteer Find Systematic Reviews om te zoeken naar systematische reviews, meta-analyses, reviews van clinical trials, evidence-based medicine, consensus development conferenties en richtlijnen.

Selecteer Medical Genetics Searches om referenties te vinden die zijn gerelateerd aan diverse onderwerpen in de medische genetica. Kies één of meer van de filtercategorieën.

Resultaten Printen, E-mailen, Downloaden De geselecteerde referenties (bijvoorbeeld op het Clipboard) kun je direct vanuit de browser printen of eerst in een ander formaat zetten met Display Settings. Je kunt ook kiezen voor File of E-mail in het menu Send To. File biedt de mogelijkheid om formaat en sorteervolgorde te wijzigen voordat je de resultaten als bestand opslaat. E-mail vraagt te kiezen voor een formaat en een e-mailadres. Kies MEDLINE Display voor het downloaden naar programma’s zoals Reference Manager.

My NCBIMet My NCBI kun je referenties en zoekstrategieën opslaan en zorgen voor updates per e-mail van opgeslagen zoekacties. Registreer je bij My NCBI met een username en password. Klik op Manage Filters om maximaal vijf filters te kiezen of aan te maken.

Toegang tot Full-TextVeel referenties in PubMed hebben een link naar de volledige tekst van een artikel via PubMed Central (een gratis digitaal archief van biomedische tijdschriften) of de Leerhuis bibliotheek. Ze zijn te herkennen aan deze ikonen:

Artikelen die niet toegankelijk zijn kun je aanvragen bij:

Leerhuis BibliotheekMartini ziekenhuis

Postbus 9700 RM Groningentelefoon 050 – 524 6078

e-mail leerhuis.bibliotheek@mzh.nl

Deze folder is een vertaling en bewerking van: PubMed BASICS / The National Network of Libraries of Medicine (NN/LM), October 2009http://nnlm.gov/training/resources/pmtri.pdf

PubMed van de National Library of Medicine (VS) is een zoeksysteem voor biomedische literatuur. Het is gratis beschikbaar op http://pubmed.gov.De link PubMed MZH op de intranetpagina’s van de Medische Bibliotheek geeft direct toegang tot de tijdschriften waarop het MZH een abonnement heeft.

PubMed InhoudPubMed geeft toegang tot gegevens en abstracts van miljoenen artikelen uit tijdschriften op het gebied van geneeskunde, verpleegkunde, tandheelkunde, diergeneeskunde, het zorgstelsel en de preklinische wetenschappen.

PubMed Eigenschappen►Verfijnde zoekmogelijkheden, zoals spellingscontrole, uitgebreid zoeken en speciale tools om te zoeken naar klinische onderwerpen. ►Assistentie bij het vinden van zoektermen met de MeSH (Medical Subject Heading Database), een gids naar MEDLINE’s gecontroleerde trefwoordenlijst. ►De mogelijkheid om referenties op te slaan en automatisch updates te ontvangen via e-mail met My NCBI ►Links naar full-text artikelen, naar informatie over de beschikbaarheid in de bibliotheek, en naar andere NLM databases ►Links naar andere NLM zoeksystemen zoals ClinicalTrials.gov®, MedlinePlus®, NIH Clinical Alerts and Advisories, en PubMed Central

Assistentie en TrainingKlik op Help boven de zoekbalk of op PubMed Tutorials onder More Resources op de startpagina.

PubMed SearchOm in PubMed te zoeken voer je in de zoekbalk een woord of frase in, bijvoorbeeld onderwerp, auteur en/of tijdschrifttitel. Klik op de knop Search of druk op de Enter toets. Combineer zoektermen met de koppelwoorden “AND”, “OR” of “NOT” in hoofdletters.

PubMed biedt alternatieve zoekmogelijkheden zoals het menu met suggesties dat automatisch verschijnt als je termen invoert, en de opties in het kader Also Try dat verschijnt bij de resultaten van een zoekopdracht.

PubMed Advanced SearchDe link Advanced Search biedt mogelijkheden om een zoekactie te verfijnen.

boven de zoekbalk laat zien hoe PubMed heeft gezocht. PubMed zoekt eerst naar woorden zoals MeSH-termen, dan tijdschrifttitels, dan auteurs en zoekt ook in alle velden naar de woorden. In het veld Query Translation kunnen wijzigingen worden aangebracht.

houdt bij welke zoekopdrachten zijn gegeven en nummert ze als links. Bij het aanklikken van een nummer verschijnt een menu waarmee je zoekopdrachten kunt combineren met “AND”, “OR” of “NOT”, uitvoeren, verwijderen, onderzoeken met Details, of opslaan in My NCBI.

Gebruik deze optie om gericht te zoeken naar een artikel op basis van bekende gegevens. Klik op één van de Search-knoppen om een zoekopdracht uit te voeren.

Begrens het zoeken door het aanvinken van de vakjes bijTypes of Article, Languages, Subsets zoals groepen tijdschriften of onderwerpen, Ages, Humans of Animals, Gender. Beperk een zoekactie tot referenties met abstracts of links naar de full text, en maak meerdere keuzes binnen een categorie. Klik na het selecteren op één van de Search-knoppen om de zoekopdracht uit te voeren.

Achter het ikoon in de rechter kolom staan de toegepaste beperkingen vermeld. Ze blijven actief totdat ze zijn verwijderd.

maakt het mogelijk om zoekbare velden en onderwerpstermen te bekijken en te selecteren. Gebruik het uitklapmenu, het zoekveld en de Index-knop om zoekopdrachten te formuleren en te combineren met de koppelwoorden AND, OR of NOT. Raadpleeg Help voor meer informatie.

biedt aanvullende snelle links naar: PubMed Clinical Queries zoekopdrachten, Topic-Specific Queries met links naar aanvullende vooropgezette zoekvragen en interfaces, naar de MeSH en Journals databases, en naar de Single Citation Matcher.

Met het Clipboard kunnen geselecteerde referenties uit één of meer zoekresultaten worden verzameld om ze op te slaan, te printen, te e-mailen, of toe te voegen aan My NCBI Collections. De link is alleen zichtbaar als er referenties op het Clipboard zijn opgeslagen. Klik op het aanvinkvakje voor de referenties om ze te selecteren. Ga dan naar het uitklapmenu Send to en kies Clipboard. Klik op de Clipboard link in de rechterkolom om de geselecteerde referenties te bekijken.

PubMed Search ResultsNa klikken op de Go knop laat PubMed een lijst met resultaten zien in het Summary formaat. Meer informatie over de zoekresultaten kun je oproepen door in het uitklapmenu Display Settings te kiezen voor de formaten Abstract of MEDLINE.

Related ArticlesEen handige functie van PubMed is de mogelijkheid om soortgelijke referenties te vinden die ook interessant kunnen zijn. Klik op Related Articles onder het PMID-nummer van elke referentie in het Summary-formaat of selecteer referenties uit de lijst in het Abstract-formaat.

SensorsPubMed onderzoekt elke zoekterm op bepaalde elementen en toont links naar één of meer referenties of databases. Deze staan vermeld in de kaders rechts naast de zoekresultaten.

laat referenties zien die dezelfde elementen bevatten (bijvoorbeeld blood choi 2009).

biedt de mogelijkheid om met de gevonden elementen in andere databases te zoeken, bijvoorbeeld op gensymbool CFTR in de Gene database, of op proteïne 1R10 in de Structure database. Selecteer een database uit het uitklapmenu en klik op Find items.