Onderzoek naar de morse parameters van de HCl -binding in water
description
Transcript of Onderzoek naar de morse parameters van de HCl -binding in water
A. van LieshoutF. Stolwijk
begeleider Dr. M. Somers 10-06-2008
Leren Onderzoeken 1◦ Beeldvorming wetenschap◦ Ervaring onderzoeken◦ Andere leermethode
1. Inhoudsopgave2. Algemene informatie3. Intramoleculaire krachten4. Intermoleculaire krachten
I. CoulombII. Lennard-JonesIII. Morse
5. Ons onderzoekI. Vorig onderzoekII. SpartanIII. ExcelIV. Classical
6. Resultaten 7. Discussie
Binnen het watermolecuul◦ Harmonische strek (l1)
◦ Harmonische buig (θ)◦ Lennard-Jones veld (σ)
In rood de Lennard-Jones InteractieIn blauw de Morse Interactie
In groen de Coulomb Interacties
Coulomb◦ Interactie afhankelijk van de
lading van de deeltjes en de afstand tussen de deeltjes.
Lennard-Jones-interactieInteractie afhankelijk van de afstand tussen de deeltjes.
Morse-interactie◦ De dissociatie-energie is
afhankelijk van de afstand tussen de moleculen.
◦ α, re, De parameters bepalen de curve
Klassieke Dynamica
Voor elk molecuul kan via klassieke dynamica op tijdstip t worden berekend:
=Snelheid =Acceleratie =Moment =Kinetische Energie =Positie (x,y,z)Hierbij worden de volgende formules gebruikt:
Doel vorig onderzoek◦ Onderzoek waarom het HCl-molecuul niet dissocieerde en een
verandering (verbetering) aanbrengen in de De parameter.
Ref1
Spartan◦ 3 H2O + HCl
◦ Afstand meten (Å)◦ Hoeken meten◦ MP2, 631+G* Ref2
L.S.Diff, Fitten Least square diff.
◦ Σ=<(Bi(p)-Mi)²>◦ Newton root solver◦ Zoekt minimale Σ
Fitten◦ Via verschillende route ◦ Gebruikt l.s.diff◦ Data, spreiding ◦ Constrains
Excel ◦ Excel-sheet macro’s
invoeren en formules invoeren voor de molecuul interacties
◦ Grafiek morse invoeren
◦ Afstanden invoeren◦ Potentiaal fitten
▸ Classicalº 20 H2O+HCl visualisatie
º Script voor het modelRef3
Oude parameters:α=3.424Re=2.43
De=0.163
Nieuwe parameters:α=0.5Re=2.4887
De=0.10946771
Calculated Σ:0.105898
Oude parameters Nieuwe parameters
Conclusie Nieuwe parameters zorgen dat HCl in water
wel dissocieert; De en α veranderden
Het werken in Excel, niet geavanceerd De “box” waarin de moleculen zaten was te
klein waardoor (7%) energie afgekapt werd.
Groter box, meer moleculen Meer geavanceerd programma voor fitten
Ref1: Gelauff, L., Götz, R., v. Meer, R., v. Paridon, J., Rooimans, K., Stoffelsma, C. Dissociatie van HCl in water (2006), blz 17 geraadpleegd op 6mei2008
Ref2: Chemical Physics letters Volume 325, issues 5-6, 4aug2000, blz698-700 geraadpleegd op 6mei2008
Ref3: Ferguson: D. Ferguson, J. Comput. Chem., 16 (1995) 501.
SPC & SPC/E: H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. von Gunsteren, J. Hermans, Intermolecular Forces, B. Pullman ed., Reidel: Dordrecht, Holland, 1981, 331-342 geraadpleegd op 14mei2008
Bedankt voor de aandacht
Zijn er nog vragen over dit onderzoek?