Dimitri Brosens & Bart GoossensInformatie & Datacentrum INBO

OMGAAN MET ONDERZOEKSDATA: INBO

2

Beheer van onderzoeksinformatie: PURE

PURE is een CRIS systeemPersoonlijk overzichtOnderzoeksoutput (publicaties, presentaties, ….)DienstverleningProjectenActiviteitenAdviseringsdocumentenPersoneel en expertiseDatasets

3

Beheer van onderzoeksinformatie: PURE

4

Beheer van onderzoeksinformatie: PURE

Grafiek van relaties

5

Beheer van ruwe data: Welke data

INBO onderzoeksdata

Observaties Human observation & Machine observationRemote sensing

VegetatieopnamesINBOveg

6

Beheer van ruwe data: Welke data

INBO onderzoeksdata

Verzameld materiaal Roadkill & Afvangsten & Bevissing

Analyse data (DNA sequenties…)

–e-DNA–Haarstalen–Swabstalen– Faeces–Bodemstalen- Waterstalen

7

INBO Referentiedata

ChecklistsReferentielijsten naar voorkomen species in een bepaald geografisch gebied

Rode lijstenRode lijst van de ZoogdierenReferentielijsten naar status en voorkomen in een bepaald geografisch gebied

Geografische GIS dataGIS (Kaartlagen)

“Taxonomische lijsten” Catalogue of LIFE…

Beheer van ruwe data: Welke data

8

Beheer onderzoeksdataObservaties

Human observation NBN datamodel (Recorder6)SQL databank (Microsoft SQL server)Werkblad & Access ( )

Machine observation Lifewatch applicaties SQL databank

DATA warehouse

Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer

9

VegetatieopnamesINBOveg

Webapplicatie met achterliggende databank

https://data.inbo.be/inboveg/ViewHome.form

Verzameld materiaal Roadkill & Afvangsten & Bevissing

-> SQL databank (Microsoft server)Werkblad & Access ()

Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer

10

Labo data (Analyse, laboresultaten…)–e-DNA–Haarstalen–Swabstalen– Faeces–Bodemstalen- Waterstalen

Laboratory information management system (LIMS)

Beheer van ruwe data: Centraal data beheer

11

Beheer referentiedataChecklists Rode lijstenTaxonomische lijsten

INBO NAMESERVER (SQL server)Geografische GIS data

GIS data server (GIS team)

Beheer van ruwe data: Centraal data beheer

12

SD 5: Het INBO beheert gegevens en maakt ze toegankelijk. Het INBO fungeert als draaischijf voor het gegevensbeheer. Daarbij zoekt het INBO naar geschikte manieren om aan gegevensverzameling te doen en om gegevens te ontsluiten en toegankelijk te maken.

Beheer van ruwe data: Data Publiceren

13

Data Publiceren

Onderzoeksinformatie Pure Portal (webservices)

Biodiversiteitsdata• Primary Occurrence data & Checklists

• Standaardiseren• Darwin Core

• Metadata optimaliseren• EML

• Publiceren• IPT (integrated publishing toolkit)• Darwin Core Archives

14

Data PublicerenAndere manieren

• Dryad Data Digital Repository• Flexibel ivm het data formaat • Past in de “manuscript indienen“workflow • Gegevens particulier beschikbaar tijdens de peer review • Toestaan van beperkte embargo tijd• Gegevens zijn gekoppeld van en naar gespecialiseerde data

repositories (vb. GBIF of GenBank ) .• Wijst Digital Object Identifiers ( DOI ) aan gegevens• Bevordert de zichtbaarheid van gegevens• Data gepubliceerd onder CC0, geen wettelijke belemmering om data

te hergebruiken• Inhoud wordt actief beheerd .• Datafiles kunnen bijgewerkt worden indien nodig• Bewaring van de data op lange termijn ...

• Webservices• Pure webservices• GBIF webservices • In volle ontwikkeling

15

Data Publiceren

Data policy

Voorgestelde richtlijnen 1 Alle data verzameld in opdracht van het (EV) INBO kunnen in principe ontsloten worden, met toepassing van de uitzonderingsgronden zoals bepaald in het decreet betreffende openbaarheid van bestuur (2004-03-26, Artikel 15). 2 Data die geassocieerd zijn met een wetenschappelijk artikel worden ontsloten bij publicatie. 3 Ruwe data worden ontsloten indien technisch haalbaar. Onderzoekers kunnen gebruik maken van een embargo tot 18 maanden na het verzamelen. Sommige projecten kunnen een versnelde (= geen embargo) of verplichte data-ontsluiting vereisen. 4 Data worden steeds ontsloten als open data, zoals gedefinieerd door de Open Knowledge Foundation.

16

INBO als data Publisher

INBO is data publisher in het GBIF netwerkPubliceren via ITP van Darwin Core ArchivesOndersteuning door het Belgisch Biodiversiteitsplatform (GBIF node)

• Belgische GBIF Data Publishers

?