Kenneth Devloo, 2e Ma CW: MMC

Promotors:

Philip Dutré

Abram Aertsen

Distributie en segregatie van cellulaire

schade in bacteriële populaties

Inhoud

Doel

Bestaande toepassingen

Algoritme

Planning/ Besluit

Doel

Cellen tracken uit video

Stamboom bijhouden van deling

Bestaande toepassingen

Cell Profiler

DCILabs

Bestaande toepassingen:Cell

profiler

Metingen cellen uit afbeeldingen

Pipeline

Detectie /Tracking

Vb: onderscheid in objecten puur op vorm

Bestaande toepassingen:DCILabs

Bedrijf

High content screening assay

Verschillende paketten

Vb: MORFO

Algoritme

Preprocessing

Detectie

Beschrijving

Tracking - corigeren

Algoritme: Detectie

Threshold

Skeletonisation

Snakes

Algoritme: Beschrijving

Data nodig om te vergelijken

Positie

Grootte

SIFT

Algoritme: Tracking

Verwachtte positie

Vergelijking met cellen in de buurt

Correctie van detectie

Planning/Besluit

Toepassingen

Algoritme

Achterstand

December-Januari

Eind december-> goeie detectie

Vragen?