Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

12

Click here to load reader

Transcript of Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Page 1: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Kenneth Devloo, 2e Ma CW: MMC

Promotors:

Philip Dutré

Abram Aertsen

Distributie en segregatie van cellulaire

schade in bacteriële populaties

Page 2: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Inhoud

Doel

Bestaande toepassingen

Algoritme

Planning/ Besluit

Page 3: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Doel

Cellen tracken uit video

Stamboom bijhouden van deling

Page 4: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Bestaande toepassingen

Cell Profiler

DCILabs

Page 5: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Bestaande toepassingen:Cell

profiler

Metingen cellen uit afbeeldingen

Pipeline

Detectie /Tracking

Vb: onderscheid in objecten puur op vorm

Page 6: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Bestaande toepassingen:DCILabs

Bedrijf

High content screening assay

Verschillende paketten

Vb: MORFO

Page 7: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Algoritme

Preprocessing

Detectie

Beschrijving

Tracking - corigeren

Page 8: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Algoritme: Detectie

Threshold

Skeletonisation

Snakes

Page 9: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Algoritme: Beschrijving

Data nodig om te vergelijken

Positie

Grootte

SIFT

Page 10: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Algoritme: Tracking

Verwachtte positie

Vergelijking met cellen in de buurt

Correctie van detectie

Page 11: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Planning/Besluit

Toepassingen

Algoritme

Achterstand

December-Januari

Eind december-> goeie detectie

Page 12: Distributie en segregatie van cellulaire schade in bacteriële

Vragen?