Welkom bij het CMBI Bioinformatica. Voorlichting BIOINFORMATICA •Wat is bioinformatica?...
-
Upload
lotte-coppens -
Category
Documents
-
view
218 -
download
0
Transcript of Welkom bij het CMBI Bioinformatica. Voorlichting BIOINFORMATICA •Wat is bioinformatica?...
Welkombij het CMBI
Bioinformatica
Voorlichting BIOINFORMATICA
• Wat is bioinformatica?• Studeren aan deze faculteit (FNWI, KUN)• Bioinformatica vakken• Stagemogelijkheden• Masteropleiding• Beroepsperspectief
Wat is Bioinformatica?
Bio Informatica
+
Bioinformatica probeert met hulp van computers biologische, chemische en medische vragen te beantwoorden.
Wat is Bioinformatica?
Studeren aan deze faculteit
Jaar 1
Jaar 2
Jaar 3
Jaar 4
Jaar 5
VWO
Toekomstig beroep
Bachelortitel: Bachelor of Science
Mastertitel: Master of Science
Opleidingen- scheikunde- biologie & medische biologie- natuurwetenschappen- informatica- moleculaire levens- wetenschappen- life sciences
- wiskunde- natuur- en sterrenkunde- milieu- natuur- wetenschappen
Faculteit der Natuurwetenschappen,
Wiskunde en Informatica (FNWI)
5 subfaculteiten scheikundenatuurkundebiologiewiskundeinformatica
Bioinformatica = Masteropleiding
• Je kunt starten bij Bioinformatica Master als je een vooropleiding (bachelor) hebt in:-scheikunde-biologie-natuurwetenschappen-moleculaire levenswetenschappen-informatica-life sciences-biomedische gezondheidswetenschappen (medische faculteit)
Vakkenpakketten voor toelating tot de vooropleiding (bachelor)
ScheikundeN&T; N&G; M-profiel+WiskB1,Sk1,Nat1;WiskB+Nat
BiologieN&G; N&T
NatuurwetenschappenN&T; N&G+WiskB2; M-profiel+WiskB1,Sk1,Nat1
Moleculaire LevenswetenschappenN&T; N&G; M-profiel+WiskB1,Sk1,Nat1
InformaticaN&T; N&G+WiskB2
Bioinformatica vakken
• Je komt ons tijdens de vooropleiding al tegen!- Verplichte vakken- Keuze vakken- Hands-on
Voorbeeld uit Bioinformatica I
Welke tools en databases zijn er en hoe kun je ze toepassen?
Databases met sequenties en structuren van eiwitten (o.m. via WWW); Zoekprogramma’s om gelijkenissen te vinden; Voorspellen eigenschappen van eiwitten
Welke biowetenschappelijke vragen zijn hiermee te bestuderen?
Hoeveel lijkt de mens op de aap (evolutie en homologie)? Hoe zal dit onbekende eiwit zich gedragen en er uitzien?
Bioinformatica II
• Overzicht en details van eiwitstructuren• Hoe maak je een eiwit stabieler?• Het bouwen van een eiwitmodel (Homology Modelling)• Energieberekeningen• Realworld voorbeelden
Bioinformatica II:- Eiwitstructuur analyse- 4 ECTS- Voorkennis: bioinformatica I
Bioinformatica III
Bioinformatica III:- Genoom Analyse- 3 ECTS- Voorkennis:
bioinformatica I
Bioinformatica IV
Bioinformatica IV:- Computational Drug Discovery- 3 ECTS (optioneel: 4)- Voorkennis: bioinformatica I & II
Bioinformatica V
Bioinformatica V- applied bioinformatics- 6 ECTS- voorkennis bioinformatica 1- projectmatig a.h.v. casus- gericht op biologie; maar ook andere studenten zijn welkom
Stage mogelijkheden
• Invulling is afhankelijk van je eigen belangstelling en achtergrond!– Voorbereiding: Bioinformatica II of III– Bijvak & hoofdvak (6-12 maanden)– Ministages (8 weken, derde jaar)– Sommige stages zijn extern (andere
universiteit of buitenland)
Bioinformatica onderzoek op het CMBI
• Gert Vriend:– Bioinformatics of Protein Structures
• Martijn Huynen:– Computational Genomics
• Roland Siezen:– Bacterial Genomics
• Jacob de Vlieg:– Computational Drug Discovery
Samenwerking
Enkele Stagevoorbeelden
• Voorspellen thermostabiliserende mutaties in eiwitten “hoe verbeter je eigenschappen van enzymen door engineering”
• Plaats en omringing van ionen in eiwitstructuren“zijn er regels af te leiden volgens welke de ionen in de eiwitstructuren zitten”
• Voorspellen van humane ziektegenen“The GeneSeeker”
• Webadres huidige stageplaatsen:
http://www.cmbi.kun.nl/stages
Masteropleiding Bioinformatica
• Gestart in 2001/2002
• 2 jarige master opleiding bestaand uit:* 60 ECTS (1 jaar) tailormade vakkenpakket (bioinformatica,
maar ook breed in chemie, biologie, informatica en/of geneeskunde)* 60 ECTS (1 jaar) bioinformatica research
• Titel: Master of Science in Bioinformatics
• Vooropleiding: Bachelor in chemie, biologie, Moleculaire Levenswetenschappen, Natuurwetenschappen, biomedische gezondheidswetenschappen, geneeskunde, informatica, life sciences, HLO, HIO
• Second Master variant (1 jarige opleiding) voor mensen die al een mastertitel hebben
Beroepsperspectief (1)
• Een bioinformaticus beheerst altijd ten minste twee disciplines.
• Werkt vaak in multidisciplinaire teams
• Is overal nodig waar computers de bioweten-schappen binnendringen: voedselindustrie, medicijnontwikkeling, diagnostische tests (“even een druppeltje bloed meneer, en in twee minuten weten we of u ziek bent”), wasmiddelen (enzymen),plantveredeling, etc.
Beroepsperspectief (2)
VOORBEELDEN:
Chemicus-bioinformaticus zal zijn baan vinden in farmaceutische- of voedingsmiddelenindustrie
Bioloog-bioinformaticus gaat werken aan biologische datasets (o.a. genoom projecten)
Bioinformaticus die de IT ingaat heeft waarschijnlijk een informatica achtergrond
Bioinformaticus in ziekenhuis heeft waarschijnlijk gezondheidswetenschappen gestudeerd
Beroepsperspectief (3)
Grote vraag uit bedrijfsleven
Gunstige loopbaanperspectieven