Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en...

20
Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Verschuere Annelies Stagementor: Sofie D’hondt Stagementor: Ineke van Gremberghe Promotor: Mieke Demeyere

Transcript of Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en...

Page 1: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE.

Verschuere AnneliesVerschuere Annelies

Stagementor: Sofie D’hondtStagementor: Ineke van GremberghePromotor: Mieke Demeyere

Page 2: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Project B-Blooms2

Project B-Blooms

Project B-Blooms2

Doelstellingen stage- Cyanobacteriën in Donkmeer- Planktothrix populatie in Donkmeer- Microcystis populatie in Westveldpark

Page 3: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Overzicht

CyanobacteriënMicrocystis & PlanktotrixDGGEResultaten

Page 4: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Cyanobacteriën

Naam kleur cyaan

Voorkomen:– Vooral in mariene omgevingen– Bloeien

Page 5: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Cyanobacteriën

Bloeien– Licht– Gasvacuolen– Fosfor en stikstof– Populatiestabiliteit– Temperatuur

Page 6: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:
Page 7: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Microcystis & Planktothrix

Microcystis– 1/3: toxines

Contact: huidirritatie Inname: gastro-intestinaal ongemak

Planktothrix

Page 8: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Microcystis & Planktothrix

ITS (‘Intergenic Transcribed spacer’)

Page 9: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

DGGE

DGGE = Denaturatie gradiënt gel electroforese

Prof Leonard Lerman

Gewone agarose:

Page 10: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

DGGE

Principe:

Page 11: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

Westveldpark Microcystis (ITS)

- Diversiteit:

8 bandjes/staal

14 ≠ bandjes 14 ≠ genotypes

Culturen (Van Wichelen J.): 2 morfotypes M. viridis & M. aeruginosa

- Temporele dynamiek:

# bandjes: voorjaar > zomer > najaar

Page 12: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

M. aeruginosa M. viridis

Page 13: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:
Page 14: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

Donkmeer – cyanobacteriën

- Diversiteit:

Gels: Planktothrix Anabaena of Aphanizomenon

- Temporele dynamiek:

#: najaar < zomer & voorjaar

zomer ~ voorjaar

Page 15: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:
Page 16: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

Donkmeer – Planktothrix

- Agarosegel:

Page 17: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

- DGGE-gel:

Page 18: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

- Diversiteit:

7 genotypes per staal

8 ≠ genotypes

- Temporele dynamiek:

#: najaar > zomer

Page 19: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Conclusie

Diversiteit:

- 14 verschillende genotypes Microcystis

- 8 verschillende genotypes Planktothrix

Temporele dynamiek:

- voorjaar: Microcystis

- najaar: Planktothrix

Page 20: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Ik dank u voor uw aandacht.

Enkele vragen?

Annelies Verschuere