GHENT UNIVERSITY 11 faculteiten meer dan 130 vakgroepen · 2018-11-22 · and tropical Asia....
64
11 faculteiten meer dan 130 vakgroepen Faculty of Science Dpt. Biology Research group Mycology GHENT UNIVERSITY
Transcript of GHENT UNIVERSITY 11 faculteiten meer dan 130 vakgroepen · 2018-11-22 · and tropical Asia....
11 faculteiten
meer dan
130 vakgroepen
Faculty of Science
Dpt. Biology
Research group
Mycology
GHENT UNIVERSITY
Wie zijn we?
miljoenen soorten, één van de succesrijkste groepen
organismen op aarde! exclusieve lichaamsbouw en voedingswijze
ingenieuze voortplantingswijze -vervullen sleutelrollen in alle ecosystemen
indrukwekkende vormenrijkdom aan vruchtlichamen
Waarom fungi?
“The universal joy of finding and collecting mushrooms…”
FOCUS OP MELKZWAMMEN:
1500 soorten wereldwijd, nu in Lactarius,
Lactifluus en Multifurca)
RESEARCH GROUP MYCOLOGY
167
42 42
87
123
10
Aantal soorten melkzwammen per continent:
Zwart: Lactifluus, Groen: Lactarius
• identificeren van soorten, biodiversiteit
• afbakenen van soorten
• systematiek: ontwerpen van een hiërarchisch
classificatie systeem
• evolutionaire geschiedenis van een taxon begrijpen
• ecologische rol
RESEARCH GROUP MYCOLOGY
taxonomie, systematiek,
fylogenie, fylogeografie
Belangrijke bijdrage tot de kennis van de biodiversiteit:
meer dan 130 nieuwe melkzwam soorten werden door
onze groep beschreven, vooral van tropisch Afrika en
tropisch Azië.
RESEARCH GROUP MYCOLOGY
Lactifluus limbatus (Stubbe & Verbeken) Stubbe
Malaysia (foto Dirk Stubbe)
Lactarius cyanescens Stubbe, Verbeken & Watling
Malaysia (foto Dirk Stubbe)
Lactifluus velutissimus (Verbeken) Verbeken – tropical Africa
Lactifluus nonpiscis (Verbeken) Verbeken – tropical Africa
Lactifluus subvolemus Van de Putte & Verbeken – Europa
Lactarius fennoscandicus Verbeken & Vesterholt – Europa
Important contribution to the knowledge of the
biodiversity: more than 130 new milkcap species have
been described by our group, mainly from tropical Africa
and tropical Asia.
RESEARCH GROUP MYCOLOGY
Lactifluus raspei nov. sp. – Thailand
soorten identificeren ≠ soorten afbakenen
• Identificatie:
– moet snel gaan
– gebaseerd op klein aantal kenmerken (morfologisch of moleculair), en op overeenkomsten met eerder beschreven soorten
– nood aan zeer accurate kenmerken
• Soorten afbakenen (delimitation) = taxonomie:
– veel verschillende kenmerken worden onderzocht:
onafhankelijke moleculaire merkers, ecologie, morfologie
– maximaliseren van aantal kenmerken om soortgrenzen af te bakenen en evolutionaire geschiedenis te achterhalen
soorten identificeren
versus
soorten afbakenen
WELK SOORTCONCEPT?
2 soorten
1 soort
reproductieve isolatie
tijd
ecologisch verschil
monofylie
morfologisch verschil
+ bayesian species delimitation
1. Inzamelen materiaal
Phylogeny would
be nothing
without the
tropics
E.J.H. Corner
METHODES
Nadruk op weinig geëxploreerde gebieden…
METHODES
… en intensieve samenwerking met
lokale contacten
Uitdagingen van tropische en primitieve omstandigheden bij het
drogen en verwerken van het materiaal
2. Macromorfologie
METHODES
3. Micromorfologie
METHODES
Sporen: amyloïde ornamentatie
Basidia
100
75
1
det005PAM5999
detV7217detV6333detV6332detC7176detA7561detA61004det1073
det1014det1076det1008fenV5330det1099
det1053det010det1018fenC7183
fen1039fen1031
fen1027fenA7530
fen1030fenW1577
fenC7119det002
por1082qui009quiW1503
qui1004bqui1004a
qui011K112
K65del1005delV6457delV6312delA0104del1046
sem1049semL6081
semA61032sem1093
PAM30901san006
sanA9246san1096san1050
san008Tur130vin1110
vin1104avin1104c
Tur129K113
K36K35
sal1087sal1123
salA8056scr1024
K114Aborz
Rbrevipe
L. deterrimus
(Peenrode
melkzwam) +
L. fennoscandicus
L. quieticolor (Vaaloranje
melkzwam)
L. deliciosus (Smakelijke
melkzwam)L. semisanguifluus (Vaalrode
melkzwam)
L. sanguifluus (Wijnrode
melkzwam)
L. vinosus
L. porninsis (Lorkenmelkzwam)
L. salmonicolor
(Zilversparmelkzwam)
100
100
83
75
84
100
75
75
59
64
100
100
58
100
76 75
83
96
10075
OUTGROUP
100
75
1
det005PAM5999
detV7217detV6333detV6332detC7176detA7561detA61004det1073
det1014det1076det1008fenV5330det1099
det1053det010det1018fenC7183
fen1039fen1031
fen1027fenA7530
fen1030fenW1577
fenC7119det002
por1082qui009quiW1503
qui1004bqui1004a
qui011K112
K65del1005delV6457delV6312delA0104del1046
sem1049semL6081
semA61032sem1093
PAM30901san006
sanA9246san1096san1050
san008Tur130vin1110
vin1104avin1104c
Tur129K113
K36K35
sal1087sal1123
salA8056scr1024
K114Aborz
Rbrevipe
L. deterrimus
(Peenrode
melkzwam) +
L. fennoscandicus
L. quieticolor (Vaaloranje
melkzwam)
L. deliciosus (Smakelijke
melkzwam)L. semisanguifluus (Vaalrode
melkzwam)
L. sanguifluus (Wijnrode
melkzwam)
L. vinosus
L. porninsis (Lorkenmelkzwam)
L. salmonicolor
(Zilversparmelkzwam)
100
100
83
75
84
100
75
75
59
64
100
100
58
100
76 75
83
96
10075
OUTGROUP
4. Moleculaire data
METHODES
Fylogenie: =
verwantschaps-
boom
Alignment + fylogenetische technieken
DNA
Extractie + PCR
agatggtaca
Russula
Multifurca Piperites
+
Russularia
Plinthogalus
ML fylogenie gebaseerd op ITS, LSU and rpb2
Russulaceae
Lactarius
Lactifluus
Mogelijke gastheren:
Fagaceae: e.g. Quercus
Myrtaceae: e.g. Eucalyptus
Fabaceae: e.g. Brachystegia
Phyllantaceae: e.g. Uapaca
Dipterocarpaceae: e.g. Dipterocarpus
Pinaceae
Brachystegia sp.
Uapaca guineensis
Eucalyptus sp.
Dipterocarpus baudii
Quercus frainetto
5. Ecologie
METHODES
Ecologie en gastheerspecificiteit van
Lactarius / Lactifluus en de studie van
hun ectomycorrhiza: morfologisch,
anatomisch en moleculair
METHODES
6. Ethnomycologische data
METHODES
Ethnomycologie in tropisch Afrika: eetbare fungi
en hun vernaculaire namen in verschillende regio’s
Lactifluus gymnocarpus (R. Heim ex Singer) Verbeken
Lactifluus Lactifluus subg. Gymnocarpi
Rainforest & riparian forest
Uapaca sp.
X
Referring to the gymnocarpic development of the fruiting body
OUTPUT
1. Taxonomie
→ fylogenetisch onderbouwde classificaties
→ identificatie-tools (sleutels, identification
programs, flora’s, revisies)
2. Identificatie-tools
OUTPUT
Lf. subg.
Pseudogymnocarpi
Lf. subg.
Lactariopsis
Lf. subg.
Gymnocarpi
Lf. subg. Lactifluus
Agaricoid -
Pleurotoid
3. Fylogenie en ancestral state
reconstruction: reconstrueren van de
evolutionaire geschiedenis
Fruitbody type:
Agaricoid/pleurotoid
OUTPUT
Connection between Asia and
Europe via land bridges
on-land migration
Connection between Asia and
North America via land bridges:
Beringia
on-land migration
4. Evolutionaire geschiedenis:
gedateerde fylogenie
OUTPUT
5. Biodiversiteit van andere
ectomycorrhizavormende groepen in
tropische regio’s
OUTPUT
Russula heinemannii
Cantharellus cibarius var.
cantharellus sensu Heinemann
Multifurca zonaria (Thailande) Bas.: Russula zonaria
New genus:
MULTIFURCA Buyck & V. Hofstetter
Multifurca furcata Bas.: Lactarius furcatus
Truffelachtigen in Afrika
Mackintoshia persica
Aroramyces radiatus
6. Macrofungi in Vlaanderen: Rode Lijst, check-lists,
inventarisatie, samenwerking met amateur
mycologen (KVMV)
Coprinus micaceus
Hygrocybe aurantiosplendens
OUTPUT
Eske De Crop
CURRENT PROJECTS
Ectomycorrhizal networks in African
miombo woodlands: composition and
influence of different land use practices
- Increasing human population growth
- Increasing pressure on the woodlands
- What is the impact on woodland dynamics, and more
specifically on ectomycorrhizal (ECM) fungi?
Problem:
Question:
Aim:
- Explore the ECM diversity and species composition in the miombo
woodlands under different land use practices, using soil samples and
metagenomics
Lynn Delgat
CURRENT PROJECTS
Filling the gaps: completing the Lactifluus phylogeny
by assessment of its Neotropical biodiversity
?
Currently described:
30 species
Preliminary molecular study reveals:
+/- 70 species
Large unknown diversity
Ruben De Lange
CURRENT PROJECTS
Russula subg. Compactae Russula subg. Brevipes Russula subg. Archae
Diversity and phylogeny of Russula subgenus Compactae
Stefanie De Schrijver
L. glyciosmus L. glyciosmus
=
?
CURRENT MASTERS TOPICS
Milkcaps (Lactarius) in North-America and Europe:
testing species concepts
Zelfs in Europa valt er nog wat te ontdekken: zijn er echt 2
cryptische soorten onder de kokosmelkzwammen?
Hebben we een look-alike van de Vaaggegordelde melkzwam
over het hoofd gezien?
Lactarius evosmus
Vaaggegordelde melkzwam
- with Quercus, Populus or Salix
repens
- on calcareous soil
- agreable fruity smell.
Stefanie De Schrijver
Milkcaps (Lactarius) in North-America and Europe:
testing species concepts
CURRENT MASTERS TOPICS
Bevat L. stephensii in werkelijkheid 2 verschillende soorten
truffelvormige melkzwammen?
Lactarius stephensii
PLAN: - Multigene phylogeny - search for supporting morphological or ecological characters
Stefanie De Schrijver
Milkcaps (Lactarius) in North-America and Europe:
testing species concepts
CURRENT MASTERS TOPICS
Nathan Schoutteten
& Jana Goes Changes in fungal species composition on
dead Fagus wood (Zoniënwoud): effects of
changing nitrogen deposition and continuous
wood decay
CURRENT MASTERS TOPICS
Parthenope pilatii
Mycena purpureofusca
Mycena crocata
Marie Froyen
Africa revised: an updated flora for Lactarius
and Lactifluus in tropical Africa
CURRENT MASTERS TOPICS
BACHELORS TOPICS
Monitoren van
houtafbrekende
voorjaarszwammen in het
Zoniënwoud: wat leert de
lente ons?
Parthenope pilatii
Mycena purpureofusca
Phleogena faginea Pholiota aurivella
Ceriporia excelsa
BACHELORS TOPICS
Beschrijf een nieuwe melkzwam uit Afrika !!
Microscopische en moleculaire studie van
Lactifluus sp. uit het regenwoud van
Kameroen en uit de miombo bossen van
Tanzania.
BACHELORS TOPICS
Zwammendiversiteit in een hyperparasitair systeem van
vleermuizen, vleermuisvliegen en Laboulbeniales
(Ascomycota)
Nycteribiidae, parasiet op vleermuizen
BACHELORS TOPICS
Ectomycorrhiza voor de lens:
morfologische studie van basidiocarpen en EM-worteltjes.
BACHELORS TOPICS
Under the spell of a ring - species delimitation in two
morphologically similar lineages from different continents
within the genus Lactifluus.
NEW MASTER SUBJECTS
NEW MASTER SUBJECTS
Revealing the African origin of Lactarius.
Early diverging clades in Lactarius contain
only African species. They represent 3
subgenera that are new to science. This
study wants to reveal their unique
morphological features and describe the
new species they contain.
R. chloroides var. trachyspora ©Jesko Kleine
R. chloroides var. parvispora ©Felix Hampe
R. cf. delica ©Marco Floriani
Vb. Nu op zoek naar
morfologische kenmerken
om de witte Russula’s van
elkaar te onderscheiden
NEW MASTER SUBJECTS
Testing morphology to recognize
species among large white russula’s
Zwammendiversiteit in een hyperparasitair systeem van
vleermuizen, vleermuisvliegen en Laboulbeniales
(Ascomycota)
NEW MASTER SUBJECTS
Nycteribiidae, parasiet op vleermuizen
Trees matter: Comparison of the
ectomycorrhizal community of Fagus and
Quercus lanes on sandy soils.
NEW MASTER SUBJECTS
Hydnellum concrescens
Natural regeneration of beech (Fagus
sylvatica) in Sonian Forest : are
ectomycorrhizal fungi essential for the
survival of seedlings ?
NEW MASTER SUBJECTS
Russula mairei
Lactarius blennius
African fungal communities,
diversity of three vegetation
types compared
NEW MASTER SUBJECTS
Results of ECM genera are known,
but what about the other fungal
groups (e.g. endomycorrhizal fungi,
endophytes)?
DOMINANT ECM GENERA
