Формализация и кодирование медицинской...

6.12.6.ОФМ-А

Формализация и

кодирование медицинской

информации

проф., д.т.н. Столбов А.П.ноябрь-декабрь 2016 г.

www.hsha.ru

[Национальная технологическая инициатива, Репик А.Е, 2016, АСИ]2

https://cloud.mail.ru/public/4xoQ/G47mS5rh2

3

[А. Сошнин, 2015]

Онтологическая сложность медицинской деятельности и научных исследований в области биомедицины !!!

Генассамблея ВОЗ ‒ доклад EB118/8 от 25.05.2006 г. "Стандартизованная терминология eHealth" (SNOMED CT)Более 2 млн. медицинских понятий, > 1.5 млн. новых статей ежегодно в NLM US

EN ~ 615 тыс. (Oxford), RU ~ 135 тыс. слов (РАН)

Систематизация медицинских терминовICD-10 International Classification of Diseases, 1893 г. (МКБ-10)

> 33 тыс. нозологических форм, синдромов etcICF – International Classification of Functioning, Disability and Health

> 1400 классификационных единиц SNOMED CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms)

> 427 тыс. концептов, из них ~ 50 тыс. ‒ микроорганизмы> 1280 тыс. синонимов, > 2500 тыс. связей www.ihtsdo.org + www.snomed.ru

Ссылки на коды SNOMED CT в классификаторах ЦНИИОИЗ !!

4

Информация – сведения о лицах, предметах, фактах, событиях, явлениях и процессах независимо от формы их представления, которые содержат элементы новизны для их получателя и используются в процессе принятия решения ->

информированность ЛПР !!Данные – сведения, факты, выраженные в формализованном

виде, обеспечивающем возможность их хранения, обработки и передачи на материальном носителе в пространстве и во времени -> содержательная интерпретация данных ЛПР ->извлечение информации из данных -> понимание ->однозначность ... ‒ зависит от контекста и пресуппозиции !!- структурированные -> базы данных - неструктурированные -> текст + гипертекст + гипермедиа

Метаданные – описание данных ("данные о данных")-> поиск информации !!

Информационные (и телекоммуникационные) технологии (ИТ, ИКТ)– процессы, методы поиска, сбора, хранения, обработки, предоставления, распространения информации и способы осуществления таких процессов и методов

5

Характеристики (свойства) информации (данных)Информационная потребность пользователя – отсутствующая у

пользователя информация, необходимая ему для решения определенной задачи -> осознание / определение потребности

Полезность, ценность, значимость -> прагматическая оценка пользователем

Достоверность, точность: а) содержательная, смысловая б) количественная

Полнота -> достаточность для принятия (выбора) решенияАктуальность -> устаревание информации Своевременность полученияДоступность -> возможность получения нужных данных

в нужное время в нужном виде в любом месте на любое устройство (терминал)

Объем информации (данных) -> количественная оценка [бит, байт]

Конфиденциальность информацииЦелостность -> защита от искажений и удаления данныхРелевантность и пертинентность (при поиске информации)

6

Знание(я) ‒ форма существования и систематизации результатов познавательной деятельности и обучения человека, позволяющая рационально организовывать свою деятельность и решать различные задачи и проблемы =субъективный (ментальный) образ реальности в форме понятий и представлений = обладание провереннымисведениями (ответами на вопросы), позволяющее решать поставленную задачу

Медицина, основанная на доказательствах (Evidence-based medicine)Знания (систематизированные, структурированные)

декларативные ‒ сведения о конкретых понятиях, фактах, объектах, их свойствах и т.д.

процедурные ‒ сведения о методах, способах, правилах, алгоритмах рещения задач(и)

формализованные (явные), содержащиеся в документах, базах данных и базах знаний ‒ отчужденные знания

неформализованные, неявные, неотчужденные, недокументированные, носителем которых являются только люди (невербализованные ‒ опыт, умения, интуиция etc)

7

Номенклатура (лат. nomenclaturа -- перечень имён) -- система терминов, разработанная согласно предварительно установленным правилам наименования [ISO 1087]

Реестр (польск. rejestr, лат. regestrum, registrum -- список, перечень) -- утвержденный в установленном порядке перечень понятий, категорий, терминов и иных объектов в определенной предметной области

Классификатор -- перечень кодов и названий объектов классификации, отражающий соподчиненность и взаимосвязи между ними

Кодификатор -- перечень кодов и названий объектов кодирования (без учета их взаимосвязей)

Справочник -- перечень конкретных объектов, имеющих уникальные идентификаторы (имена, номера, коды), в котором для формализованного представления их характеристик могут использоваться коды из других классификаторов и(или) справочников

Словарь, тезаурус, указатель, рубрикатор, индекс ...

8

Формализация (от лат. forma = вид, образ) ‒ представление результатов наблюдения, познания (анализа, синтеза) в точных понятиях и определениях, выраженных в знаковой форме:а) вербальной (ЕЯ + термины*, ...)б) символьной (формулы, схемы, коды* ...) в целях их однозначной интерпретации всеми субъектами !!результат наблюдения \ познания -> формализация -> данные

Модель (от лат. modulus = мера, образец) ‒ материальный, ментальный или информационный объект, который замещает определенный объект (оригинал), сохраняя при этом только некоторые важные его свойства

Модель – результат формализации !!

Аналогия = подобие -> изоморфизм - гомоморфизм

Назначение модели (прогностическая модель = теория)

экспликация – коммуникация – прогнозирование !!

9

Только человек !!

Модель = форма представления знанийФормализмы и нотации для представления моделей

Онтология (онтологическая модель) – структурированная система понятий (концептов) в определенной предметной области (понятийная модель) -> формализация ‒ кодирование: множество терминов, обозначающих понятия -> объекты

множество отношений (связей) между понятиями синонимия, антонимия, полисемия ?, омонимия ? иерархия -> классификация (род ‒ вид)

дифференциация ‒ обобщение

часть ‒ целое -> декомпозиция ‒ агрегация

ассоциация (... цитология ‒ клетка) симметричная взаимосвязь, сопутствие причина ‒ следствие функциональное сходство сырье ‒ продукт свойство ‒ носитель свойства (объект -> атрибуты)

процесс (действие) -> объект ‒ субъект интерпретация понятий и отношений между ними ‒

определение \ описание одних понятий через другие 10

Онтология (семантика) ->поисковый тезаурус (лексика)-> дескрипторы

Когнитивная графика -> Mind Map – ассоциативная карта

[Not ©]11

[Not ©]12

[Грибова В.В., Окунь Д.Б.,

Черняховская М.Ю., 2015]

Онтология

фармакологического

справочника

13

[Назаренко Г.И., Клейменова Е.Б. и др., 2014]

Г.И. Назаренко, Е.Б. Клейменова,

Л.П. Яшина, А.И. Молодченков,

С.А. Пающик, М.А. Константинова,

М.В. Мокин, В.А. Отделенов,

Д.А. Сычев. Разработка онтологии

технологических карт ведения

пациентов многопрофильного

стационара при моделировании

медицинских технологических

процессов // Искусственный

интеллект и принятие решений,

2014(2)

Сочетание онтологической

(понятия, объекты, субъекты)и алгоритмической (действия,

условия, логика) моделей

14

15

ДРАКОН – визуальный алгоритмический язык

(см. ru.Wikipedia.org)

[Бледжянц Г.А., Белов С.В. и др., 2013]

СимптомЗаболевание

Объединенная база медицинских знаний –United Medical Knowledge Base (UMKB) – http://socmedica.com

16

Задача -> Субъект + Объект моделирования ->

-> Построение модели (Modeling) -> Модель ->

-> Применение модели (Simulation) ->

-> Интерпретация результатов применения модели ->

-> Информация об объекте, полученная на основе модели

Анализ -- декомпозиция -- иерархия -- абстрагирование ---- генерализация (обобщение, агрегация, элиминация) ---- ассоциация -- синтез -- именование etc

Адекватность модели объекту и задаче !? достоверность -> возможность верификации

информативность

полезность

Предметная область =

Онтология = Понятия -> Термины -> Классы & Взаимосвязи

Идентификация объектов, субъектов, сущностей etc

Классификация -> семантическое кодирование -> коды

Информационные модели -> архетипы – www.openehr.org17

Экспериментальная проверка модели -> анализ и оценка на основе стандартных методик -> сопоставимость

"Сферический конь в вакууме" :)

Задача Проблема(В.М. Глушков)

18

Модели объекта – системы – процесса (поведения системы):

натурные \ физические \ биологические \ наглядные ("фото")in situ, in vivo, ex vivo, in vitro

математические -> компьютерные -> in silico !!аналитические & имитационные (Epi-Info + GPSS) !!

"черный ящик", система массового обслуживания, ... информационные:

вербальные & формальные статические динамические

детерминированные & стохастические

Модели:

онтологические (тезаурусы, классификации, номенклатуры)

описательные (феноменологические) & каузальные

структурные (схемы, состав и взаимосвязи, "архитектура")

функциональные ("как работает", события * ...)

потоковые (WorkFlow, DataFlow, DocFlow, логистика ...) *

Модели событийно -- информационные

- коммуникационные

- потоковые (сети Петри)

дискретное время

Информационная модель – модель объекта, представленная в виде информации [данных], описывающей существенные для данного рассмотрения параметры и переменные величины объекта, связи между ними, входы и выходы объекта и позволяющая путем подачи на модель информации об изменениях входных величин моделировать возможные состояния объекта [ГОСТ 34.003-90]

Информационная модель – формальная модель ограниченногонабора фактов, понятий или инструкций, предназначенная для удовлетворения конкретному требованию [ГОСТ Р ИСО 10303-1-99]

Кодирование (визуальное, символьное, числовое, RFID etc) объектов – регистрационное -> код (ID) объекта

• порядковое• серийно-порядковое

информации – семантическое -> классификационное -> код класса• иерархическое кодирование (а)

• фасетное (параллельное) кодирование – по нескольким основаниям (б)

• смешанное кодирование – сочетание (а) и (б)

19

[Кухтичев, Кленов, ВИТ, 2015, № 3]20

Схема базы данных (пример)

НУМ – носимые устройства микроэлектроники

21

Модели в медицине и здравоохранении

физиологических и патологических состояний и процессов

медико-демографических систем и процессов

организационно-технических систем*

административных процессов:

ведения пациента* ("маршрут")

производственной деятельности

административно-хозяйственной деятельности

Моделирование -> проектирование -> регламентация ->

организация -> мониторинг - контроль - оценка ->

-> клинические и управленческие решения

Систематизация, накопление и распространение медицинских и

управленческих знаний -> формализация и представление в

виде системы моделей ->

клинические рекомендации (протоколы), стандарты

порядки оказания мед.помощи, административные регламенты

- объекты- субъекты- действия- события

- сообщения- ресурсы- результаты- цели *

Формализованное представление медицинских знаний =

GEM, GELLO, GLIF, CARE, GALEN, FMA etc

Алгоритмы, правила принятия решений – правила вывода:

Если X (антецедент), то Y (косеквента)

Правило h: "Если X, то Y и наоборот" (h: X <=> Y )

Дедукция "от общего к частному" -> дано: X, h; найти: Y;

Индукция "от частного к общему" -> дано: X, Y; найти: h;

Абдукция (обратная дедукция) -> дано: Y, h; найти: X;

h: Если 'воспаление' (X=В), то 'лейкоцитоз' (Y=Л) и наоборот

индукция: (В & Л => h) => (В <=> Л);

дедукция: Л => В; абдукция: В => Л;

HL7 Arden Syntax ‒ описание клинических правил "Если X, то Y"

Medical Logic Modules (MLM): вход -> MLM -> выход (вывод)

Интерпретация клинических данных -> вычисление результата:

клинические данные -> цепочка MLM -> заключение (вывод)www.HL7.org + www.HL7-russia.org

22

Эвристика !?

Сбор, поиск, накопление, обработка данных \ информации

Наблюдение -> формализация, кодирование -> запись -> данные

Качество (массива) данных: достоверность, точность, полнота etc

Измерение количественного показателя -> число

Признаки: Информативность ?!

бинарные (пол, наличие головной боли etc)

порядковые (тяжесть состояния etc) -> Fuzzy-множества

-> лингвистическая шкала (F-шкала) [Lotfi Zadeh, 1965]

номинальные (место жительства, работы etc)

Признаки, показатели -> метрики и шкалы -> Норма:Патология

Логистическая функция Харрингтона:

Мера по F-шкале -> Число (балл, вес) -> F-вычисления

Кодирование результатов анализа данных "Норма ‒ отклонение"

(пример: анализ ЭКГ -> Миннесотские коды -> интерпретация)

Многомерное шкалирование -> скоринг-карты -> прогноз

23

Организационное моделирование -> анализ, исследование и проектирование организационно-технических систем -> моделирование функциональной и организационной структуры, рабочих (бизнес) процессов =

потоков работ, материалов, документов, данных, ... информационной системы

-> архитектура организации (предприятия)

UML (Unified Modeling Language) -- унифицированный язык графического описания для объектного моделирования, используемый при проектировании (разработке) информационных систем -> построение UML-моделей = совокупность диаграмм + описание (комментарии)

SADT (Structured Analysis and Design Technique) --методология структурного анализа -> стандарт моделирования бизнес-процессов IDEF0 = функциональное моделирование

24

Стандартные операционные (рабочие) процедуры (СОП)(Standard Operation Procedures) =

1) документально оформленный набор инструкций или пошаговых действий, которые надо осуществить, чтобы выполнить ту или иную работу.

2) подробные письменные инструкции, содержащие описание процессов проведения испытаний или другой деятельности

Что? Кто? Где? Когда? Как?

С помощью чего? Какие нужны ресурсы?

Каковы риски (модели рисков)?

Организационно-техническая система -> мультимодельностьРазличные взгляды \ аспекты \ views"Как есть" -> "Как должно быть" (ре-инжениринг)

25

Рекомендации Госстандарта России Р 50.1.028-2001 "Методология функционального моделирования"

Используется при ФСА (Activity Based Costing)

26

Иерархическая пошаговая

декомпозиция ->детализация действий, операций

Базовый элемент

IDEF0-диаграммы

ГОСТ Р ИСО/ТО 10013-2007 Менеджмент организации. Руководство по документированию системы менеджмента качества

Пример IDEF0-схемы (Р 50.1.028-2001)

27

Пример IDEF0-схемы -- Оформление медицинского свидетельства

28

ГОСТ Р 52294-2004 Управление организацией. Электронный регламент административной и служебной деятельности. Основные положения

Регламент -- обязательные правила, устанавливающие порядок деятельности администрации, менеджеров и исполнителей организации в рамках согласованных рабочих процессов, обеспечивающих достижение заявленных целей

29

регистратор

врач-терапевт

Процесс ведения пациента

сестра

R-кабинет врач

действие

событие

законченный случай

Алгоритм ...блок-схема

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

Событие -- соотнесенная с определенным моментом времени, местом и участниками совокупность действий, их результатов и иных фактов, регистрируемых в медицинских документах

Пример схемы модели [Александров С.Е., Кораблева Г.В., 2012, ВИТ № 5]

30

Диаграмма причинно-следственных связей (K. Ishikawa, 1952)

31

[ Кицул И.С. и др., 2012, ВИТ № 2 ]

(+) и (–) факторы ?

- сырье, ресурсы- оборудование- технологии- кадры- управление

12

3

- внешниефакторы

[Макалкина Л.Г., 2014 Рациональное использование лекарственных средств]

32

Единая государственная информационная система в сфере

здравоохранения (ЕГИСЗ)Справочник взаимодействия лекарственных средств –

http://vls.rosminzdrav.ruФедеральная электронная медицинская библиотека –

www.femb.ru -> 1200 клинических протоколов, 2000 моделей пациентов = 90% случаев

Образовательный портал для врачей – www.sovetnmo.ruwww.edu.rosminzdrav.ru (регистрация, курсы etc)Виртуальный образовательный сертификат

Реестр нормативно-справочной информации (НСИ)http://nsi.rosminzdrav.ru – всего 496 справочников 390 медицинских, 30 – "дубли", 45% надо заменить25% – надо исправить ошибки, всего 30% "ОК"

Регламентная служба (ЦНИИОИЗ, с 01.01.2015) -> ведение единых классификаторов и справочников !!

www.mednet.ru/ru/informatizacziya-zdravooxraneniya/klassifikatory

33

Классификация медицинских услугНоменклатура медицинских услуг (НМУ), приказ

Минздрава РФ от 27.12.2011 г. № 1664н (в ред. приказа № 751н от 29.09.2016 !!)

класс А – "простые", класс В – "составные"> 5 тыс. номенлатурных единиц (более 20 тыс. ‒ проект !?)

ГОСТ Р ИСО 1828-2015 (2012) Структура категорий для терминологических систем хирургических процедур (с 01.11.2016)

LOINC – Laboratory Observation Identifier Names and Codes –система кодирования назначений и результатов лабораторных исследований – www.regenstrief.org/loinc !!> 52 тыс. лабораторных тестов и профилей

> 28 тыс. медицинских понятий

Федеральный справочник лабораторных исследований (ФСЛИ) ->маппирование с кодами LOINC (декабрь 2016, ФЛМ + ЦНИИОИЗ)

34

[Орлов Г.М, Коган И.И., 2016]34

Номенклатура работ и услуг в здравоохранении (НРУЗ)Утверждена 12.07.2004 г. (ред. 2007 г.)

А. Простые медицинские услугиВ. Сложные и комплексные медицинские услугиС. Сложные и комплексные услуги. СоставD. Манипуляции, исследования, процедуры и работы в

здравоохраненииF. Услуги медицинского сервисаМетодика расчета стоимости + Реестр услуг с указанием УЕТ

Услуга – элемент медпомощи пациентуРабота – не имеет непосредственного отношения к пациенту

ICD-10-PCS – Procedure Coding System, ВОЗ ICPC-2 – International Classification of Primary Care, ВОЗICECI – International Classification of External Causes of Injury, ВОЗICHI – International Classification of Health Interventions, ВОЗ ICNP – International Classification for Nursing Practice www.icn.chU.S. ICD-9-CM volume 3 Procedure Classification, СШАCPT-5 – Current Procedural Terminology (American Medical Association)

36

Классификация лекарственных средствATC – The Anatomic Therapeutic Chemical Classification, ВОЗ

WHO Model List of Essential Drugs

5 уровней, нижний: МНН + ОДД + лекарственная форма

ОСТ 91500.05.0002-2001 Государственный информационный стандарт лекарственного средства. Основные положения

ГОСТ Р ИСО 11238, 11239, 11240, 11615, 11616-2014 Идентификация лекарственных средств (с 01.10.2015)

UNISCAN / GS1 Russia – идентификация товаров – www.gs1ru.org !!Концепция создания федеральной государственной

информационной системы мониторинга движения лекарственных препаратов от производителя до конечного потребителя с использованием маркировки (ФГИС МДЛП), приказ Минздрава России № 866 от 30.11.2015 г. !!

Соглашение о единых принципах и правилах обращения лекарственных средств в рамках Евразийского экономического союза от 23.12.2014 г., ратифицировано РФ 31.01.2016 г. № 5-ФЗ

37

Классификация медицинских изделийUNMDS – Unified Nomenclature of Medical Devices and Systems, ВОЗНоменклатурная классификация медицинских изделий (приказ

Миздрава РФ № 4н от 06.06.2012 г. в ред. от 25.09.2014 г. № 557н)www.roszdravnadzor.ru/services/mi_reesetr

Соглашение о единых принципах и правилах обращения медицинских изделий в рамках Евразийского экономического союза от 23.12.2014 г., ратифицировано РФ 31.01.2016 г. № 4-ФЗ гармонизации номенклатуры медицинских изделий (МИ) с

Global Medical Device Nomenclature (GMDN, www.gmdnagency.org) единый реестр медицинских изделий единая база данных мониторинга безопасности, качества и

эффективности медицинских изделийРешения Коллегии ЕАЭС от 22.12.2015 г. № 173 (Классификация в

зависимости от риска применения), № 174 (Мониторинг безопасности), от 29.12.2015 г. № 177 (Номенклатура)

ГОСТ Р ИСО 15225-2014 Структура данных номенклатуры медицинских изделий (с 01.09.2015) – GMDN

38

Проблемы найти, идентифицировать и собратьразнородные данные из множества источников -> компиляция данных

согласовать (унифицировать)модели данных -> единая (эталонная)онтологическая модель предметной области

обработать данные -> Big Data39

40[С. Добриднюк, 2015]

41

Управление -> наличие

контура "обратной связи"

Человеко-машинные модели ->моделирование в интерактивном режиме -> подбор параметров "что ... , если ..."? -> обучение модели человеком -> самообучение

Интерактивные учебные динамические модели (физиология и патофизиология)

http://physiome.cz – Laboratory of Biocybernetics and Computer Aided Teaching (prof. Jiří Kofránek, Карлов университет, Прага)

http://physiome.cz/atlas – атлас

http://physiome.lfl.cuni.cz/SimpleCirculationEN – модель кровобращения

http://physiolibrary.org, http://physiomodel.org – библиотека моделей физиологических систем

http://circadapt.org – симулятор функций сердца

http://ecgsim.org – симулятор электрофизиологии сердца (ЭКГ)

Modelica – язык (графического) моделирования физиологических процессов (построение динамических моделей систем организма)

50

Государственная система

научно-технической

информации

О библиотечном деле, № 78-ФЗ от 29.12.1994 г.

Об архивном деле в Российской Федерации, № 125-ФЗ от 10.01.2002 г.

Об обязательном экземпляре документов, № 77-ФЗ от 29.12.1994 г.

О науке и государственной научно-технической политике, № 127-ФЗ от 23.08.1996 г.

О Стратегии научно-технологического развития Российской Федерации,указ Президента РФ от 01.12.2016 г. № 642 !!!

Положение о государственной системе научно-технической информации, постановление Правительства РФ № 950 от 24.07.1997 (ред. от 16.07.2014 г.) -> ЦНМБ

О единой государственной информационной системе учета научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ гражданского назначения, постановление Правительства РФ от 12.04.2013 г. № 327

Перечень операторов документальных, документографических, реферативных, полнотекстовых зарубежных баз данных и специализированных баз данных международных индексов научного цитирования, распоряжение Правительства РФ от 02.08.2016 г. № 1637-р

52

Регистрация и учет информационных ресурсов

Постановление Правительства РФ от 10.09.2009 г. № 723 (ред. от 10.07.2013 г.) -> обязательная регистрация федеральных государственных ИС и баз данных (иные –добровольно) в Роскомнадзоре www.rkn.gov.ru (оператор)

Регистрация баз данных (как объектов интеллектуальной собственности) в Федеральном институте промышленной собственности (ФИПС) – www1.fips.ru, www.rupto.ru

www.viniti.ru -- Всероссийский институт научной и технической информации РАН (ВИНИТИ)

www.inion.ru -- Институт научной информации по общественным наукам РАН (ИНИОН)

www.vimi.ru -- Всероссийский научно-исследовательский институт межотраслевой информации (ВИМИ)

www.vntic.org.ru -- Всероссийский научно-технический информационный центр (ВНТИЦ)

53

www.icsti.su -- Международный центр научной и технической информации (МЦНТИ)

www.gpntb.ru -- Государственная публичная научно-техническая библиотека России (ГПНТБ)

www.rsl.ru, orel.rsl.ru -- Российская государственная библиотека (РГБ) + Антиплагиат.РГБ

www.bookchamber.ru -- Российская книжная палата (РКП)www.stn-international.ru -- Международная сеть

научно-технической информацииwww.cisstat.com -- Межгосударственный статистический

комитет СНГ www.standards.ru -- ФГУП "Стандартинформ" +

Всероссийский научно-исследовательский институт классификации, терминологии (ВНИИКИ) и информации по стандартизации и качеству Росстандарта России

Журнал "Информационные ресурсы России" -- www.rosinf.ru

54

Информационный поиск (60% времени - поиск и чтение ...)

Словари, Тезаурусы, Рубрикаторы -> ИПЯ -> поиск в ИПСКлючевое слово -- из текста документа Дескриптор -- из словаря \ тезауруса (набор слов фиксирован)Рубрикатор содержит коды рубрик -- УДК, ГРНТИ, МПК и др.документ -> индексирование -> ПОД (поисковый образ документа)

Аннотирование, реферирование -> аналитико-синтетическая переработка документа -> семантическое "сжатие" (объема)

Информационная потребность пользователя (ИПП) = отсутствующая у пользователя информация, необходимая ему для решения определенной задачи -> поисковый образ запроса на поиск (ПОЗ) (может включать логические И, ИЛИ, НЕ ...)

ИПП -> запрос (ПОЗ) -> ИПС : поиск -> отбор и выдача документовРелевантность -- смысловое соответствие содержания (ПОД)

документа информационному запросу (ПОД = ПОЗ)Пертинентность -- соответствие содержания документа (ПОД)

информационным потребностям пользователя -> полнота, точность, шум, время поиска, коэф. потерь ...

55

Поиск медицинской информации MEDical Literature Analysis and Retrieval System -> MEDLARSMEDLARS = ссылки на медицинские библиографические

справочники Index Medicus, Indeх tо Dental Litherature, International Nursing Indeх

MedLine -> MEDLARS OnLine -> web-доступ -> www.PubMed.comUMLS -- Unified Medical Language System + MeSH (NML US, 1987)Словарь MeSH = Medical Subject Headings, более 25 тыс. рубрик

www.umlsinfo.nlm.nih.govЦентральная научная медицинская библиотека -- международный

российский МЕДЛАРС-центр -- www.scsml.rssi.ru Электронные каталоги в формате RUSMARC: "Российская

медицина", журналов "ProQuest" и др.РИНЦ (индекс научного цитирования) -- www.eLibrary.ruWeb of Science (Thomson Reuters), ScienceDirect & Scopus

(Elsevier), Springer, Embase, ProQuest, ...Патентный поиск -> www.fips.ru (Роспатент),

www.uspto.gov (США), www.espacenet.com (Европа)56

57

Федеральная электронная медицинская библиотекана базе ГЦНМБ

Web-доступ

www.femb.ruЛИБНЕТ

[Логинов Б.Р., 2011]

Система поддержки принятия врачебных решений и непрерывного медицинского образования

Wolters Kluwer - www.element-lab.ru56

ГОСТ Р ИСО 704-2010 Терминологическая работа. Принципы и методы

ГОСТ Р ИСО 15188-2012 Принципы управления проектами стандартизации терминологии.

ГОСТ Р ИСО 29383-2012 Терминологическая политика. Разработка и внедрение.

ГОСТ Р ИСО 24615-2013 Менеджмент языковых ресурсов. Система синтаксического аннотирования (SynAF)

РМГ 19-96 Рекомендации по межгосударственной стандартизации. Рекомендации по основным принципам и методам стандартизации терминологии.

ГОСТ Р 54624-2011 Информатизация здоровья. Контролируемая медицинская терминология. Структура и высокоуровневые индикаторы

ГОСТ Р ИСО 17115-2009 Информатизация здоровья. Словарь для терминологических систем

ГОСТ Р ИСО 18104-2011 Информатизация здоровья. Интеграция базовой модели терминологии для среднего медицинского персонала

59

ГОСТ Р 53092-2008 Системы менеджмента качества. Рекомендации по улучшению процессов в учреждениях здравоохранения

ГОСТ Р 52623.х ‒ Технологии выполнения простых медицинских услуг ‒ серия стандартов (ТК 466 Медицинские технологии)

ГОСТ Р 56044-2014 Оценка медицинских технологий. Общие положения

ГОСТ Р ИСО 14155-2014 Клинические исследования. Надлежащая клиническая практика

ГОСТ Р 56034-2014 Клинические рекомендации (протоколы лечения). Общие положения

Методические рекомендации по разработке клинических рекомендаций (протоколов лечения) по вопросам оказания медицинской помощи, Минздрав России, 08.04.2016 !!!

ГОСТ ISO/TS 80004-7-2014 Нанотехнологии. Часть 7. Нанотехнологии в медицине. Термины и определения

ГОСТ ISO/TS 80004-5-2014 Нанотехнологии. Часть 5. Нано-/био-интерфейс. Термины и определения

ГОСТ Р ИСО 29701-2015 Наноматериалы для испытаний в тест-системах in vitro

60

ГОСТ 7.73-96 Поиск и распространение информации. Термины и определения

ГОСТ Р 15.011-96 Патентные исследования. Содержание и порядок проведения

ГОСТ 7.32-2001 Отчет о научно-исследовательской работе. Структура и правила оформления.

ГОСТ Р 54521-2011 Статистические методы. Математические символы и знаки для применения в стандартах

ГОСТ Р ИСО 19439-2008 Основы моделирования предприятия.

ГОСТ Р ИСО 20252-2014 Исследование рынка, общественного мнения и социальных проблем. Словарь и сервисные требования

http://sntr-rf.ru ‒ портал "Стратегия научно-технического развития Российской Федерации"

Научные платформы медицинской науки, приказ Минздрава России от 30.04.2013 г. № 281 (в ред. пр. от 23.09.2015 г. № 674)

61

ГОСТ Р 7.0.49-2007 Государственный рубрикатор научно-технической информации. Структура, правила использования и ведения (ред. 23.06.2014)

ГОСТ Р ИСО 8000-102-2011 (2009) Качество данных. Часть 102. Основные данные. Обмен данными характеристик. Словарь

ГОСТ Р ИСО 8000-110-2011 (2009) Качество данных. Часть 110. Основные данные. Обмен данными характеристик. Синтаксис, семантическое кодирование и соответствие спецификации данных

ГОСТ Р 53894, 54146-2010, 54874, 54875, 54876, 54877-2011 Менеджмент знаний (терминология, руководства, внедрение, измерение, организационные процессы)

Федеральный информационный фонд технических регламентов и стандартов -> СТАНДАРТИНФОРМ – www.gostinfo.ru (Постановление Правительства РФ от 07.10.2016 г. № 1012)

www.meganorm.ru, www.complexdoc.ru – ГОСТы

62

Славин М.Б. Практика системного моделирования в медицине.

- М.: Медицина, 2002. - 168 с.

Максимов И.Б., Столяр В.П., Богомолов А.В. Прикладная теория информационного обеспечения медико-биологических исследований. - М.: Изд-во "БИНОМ", 2013. - 312 с. !!

Карась С.И. Информационные основы принятия решений в медицине. - Томск, 2003 - www.medlib.tomsk.ru/fulltext/108803.pdf

Иванов А.В., Мишустин В.Н., Лазурина Л.П., Серебровский В.И. Нечеткие математические модели системы поддержки принятия решений для решения задачи прогнозирования острого панкреатита // Врач и информационные технологии, 2013(6)

Каркач А.С., Романюха А.А. Современные подходы к анализу ипрогнозированию здоровья населения с помощью математических моделей // Врач и информационные технологии, 2014(1)

Лукашевич И.П., Степанян К.В., Попов А.К., Балугян Р.Ш. Автоматизированное формирование заключений по данным общего клинического анализа крови // Врач и информационные технологии, 2015(2)

63

Гаспарян С.А., Довгань Е.Г., Пашкина Е.С., Чеснокова С.И. Структурированный справочник симптомов для формирования формализованных историй болезни. – М.: "Форсикон", 2008.

Малышева Е.Н., Гольдштейн С.Л. Обзор инструментария имитационного моделирования системы организации медицинской помощи как сложной динамической системы // Врач и информационные технологии, 2010(3)

Грибова В.В., Окунь Д.Б., Черняховская М.Ю. Онтология и модель онтологии предметной области "Медикаментозное лечение" // Информатика и системы управления, 2015(2)

Румянцева П.О., Бледжянц Г.А., Туманова Н.А. и др. UMKB-технологии для создания "интеллектуальных" систем в области медицины // Здравоохранение, 2015(11)

www.lischouk.ru -- проф. Лищук Владимир Александрович (математическая кардиология и др.) !!!

64

Гельфанд И.М., Розенфельд Б.И., Шифрин М.А. Очерки о совместной работе математиков и врачей (1989, 2-ое доп. изд. 2005, 3-е стереотип. изд. 2011)

Эрвин Шредингер. Что такое жизнь? Физический аспект живой клетки (1944)

Карл Поппер. Логика научного исследования (1959)

Предположения и опровержения. Рост научного знания (1963)

Объективное знание (1972)

Томас Кун. Структура научных революций (1962)

Имре Лакатос. Методология научно-исследовательских программ (1978, и др.)

Броуно Латур. Дайте мне лабораторию, и я переверну мир

(2002, и др.)

Деар, Шейпин. Научная революция как событие (2015)

65

Герасевич В.А. Компьютер для врача. Самоучитель. - 2-е изд., перераб. и доп. - СПб.: БХВ-Петербург, 2008.

www.bmn.medstalker.comТавровский В.М. Автоматизация лечебно-диагностического

процесса / Монография. - Тюмень: ВекторБук, 2009. - 464 с. http://vmtavr2.narod.ru !!!

Врач и информационные технологии www.idmz.ru (WoS)Клиническая информатика и телемедицина www.uacm.kharcov.ua

www.biometrica.tomsk.ru – статистический анализ для аспирантов

Инструментальные средства моделирования и проектирования

MS Visio, BPWin -> DIA – www.gnome.org/projects/dia

Mindmap – построение Mind-карт, www.nodemind.com/rus/

Jose M. Guerrero, Pilar Ramos. Introduction to the of Mind Mapping in Medicine -> Internet Medical Publishing – www.imedpub.com

http://portalramn.ru/news/2304/ -- Станцуй свою диссертацию :)

66

СПАСИБО !ВОПРОСЫ ?

Столбов Андрей Павлович

[email protected]

www.hsha.ru

Формализация и кодирование медицинской...

Documents

Transcript of Формализация и кодирование медицинской...