Download - Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: [email protected] Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

Transcript
Page 1: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

  

 

 

Clinical Immunology  

     

M O D U L E B O O K

Bachelor Medicine, Third year

Course year 2014-2015

Page 2: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

   

© 2014 Alle rechten voorbehouden

LUMC

Behoudens de in of krachtens de Auteurswet van 1912 gestelde uitzonderingen, mag niets uit deze

uitgave worden verveelvoudigd en/of openbaar gemaakt worden door middel van druk, Photographkopie,

microfilm, web-publishing of op welke andere wijze dan ook en evenmin in een gegevensopzoeksysteem

worden opgeslagen zonder voorafgaande schriftelijke toestemming van de houder van de copyrights.

Voor vragen of informatie kunt u contact opnemen met:

Directoraat Onderwijs en Opleidingen, PB 9600, 2300 RC Leiden

Page 3: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Clinical Immunology

Module coordinators: 

Dr. M. Bax

LUMC, Department of Rheumatology

Email: [email protected]

Dr. R.G.M. Bredius

LUMC, Department of Paediatrics

Email: [email protected]

Dr. A. Lankester

LUMC, Department of Paediatrics

Email: [email protected]

M O D U L E B O O K

Bachelor Medicine, third year

Course year 2014-2015

Page 4: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

  

Contents 

 

Module committee and teachers   1 

Preface  5 

Introduction and general information  7 

Themes  17 

Introduction in immune‐mediated disease  18 

Diagnostics in immunological disorders  32 

Neuro‐immunology  40 

Rheumatology  45 

Pulmonology  49 

Nephrology  52 

Final report patient case  56 

Innovative Therapies  58 

Appendices  70 

Instructions for final report week 8  70 

Assessment criteria grant proposal poster presentation  71 

Assessment form  73 

Guidelines diagnosis report  74 

Oral presentation lab visit  75 

Oral presentation patient casus  76 

Report neuro‐immunology  77 

Oral presentation rheumatic disease  78 

Oral presentation pulmonology  79 

Report nephrology  80 

         

Page 5: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

 

Module committee and teachers 

Module coordinators 

 

Dr. M. Bax 

LUMC, Dept. of Rheumatology 

Email: [email protected] 

 

Dr. K.L.L. Habets 

LUMC, Dept. of Rheumatology 

Email: [email protected] 

 

Dr. R.G.M. Bredius 

LUMC, Dept. of Paediatrics 

Email: [email protected] 

 

Dr. A. Lankester 

LUMC, Dept. of Paediatrics 

Email: [email protected]

Logistical support 

[email protected] 

Module committee 

Dr. H.H. Smits Dept. of Parasitology Email:[email protected] Dr. J.J.C. de Vries Dept. of Medical Microbiology Email: [email protected] Dr. J.A. Bakker Dept. of Clinical chemistry Email: [email protected] Dr. B.E.P.B. Ballieux Dept. of Clinical chemistry Email: [email protected] Prof. dr. J.J.G.M. Verschuuren Dept. of Neurology Email: [email protected] Dr. J.J. Plomp Dept. of Neurology Email: [email protected] Dr. J.K. de Vries‐BouwstraDept. of Rheumatology Email: J.K.de_Vries‐[email protected] 

Prof. dr. R.E.M. ToesDept. of Rheumatology Email: [email protected] Prof. dr. C. TaubeDept. of Pulmonology Email: [email protected] Prof. dr. P.S. HiemstraDept. of Pulmonology Email: [email protected] Dr. A.P.J. de VriesDept. of Nephrology Email: [email protected] Prof. dr. C. van KootenDept. of Nephrology Email: [email protected] Dr. B.G.A. GuigasDept. of Parasitology Email: [email protected] 

Page 6: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

 

Secretariat 

Mw. N.E. Schenk‐Lagendijk 

LUMC, Dept. of Rheumatology 

Phone: 071‐5263423  

Email: N.E.Schenk‐[email protected] 

Teachers 

LT = lecture, PR = practical, PD = patient demonstration, WG = work group 

 Dr. A. Aartsma‐Rus Dept. of human genetics 

LT 

Drs. G.D. Amatngalim Dept. Pulmonology, LUMC 

LT 

Dr. U.A. Badrising Dept. of Neurology, LUMC 

LT, WG, PD

Dr. J.A. Bakker Dept. of Clinical Chemistry, LUMC 

LT, PR

Dr. B.E.P.B. Ballieux Dept. of Clinical Chemistry, LUMC 

LT, PR

Dr. M. Bax Dept. of Rheumatology, LUMC 

PR 

Dr. V. Bekker Dept. of Paediatrics 

LT 

Dr. M. de Boer Dept. of Infectious diseases 

LT 

Dr. E.L.E.M. Bollen Dept. of Neurology, LUMC 

LT, WG, PD

Mw. B.C.M. Bos‐van NoortDept. Pulmonology, LUMC 

LT 

Drs. H. Bouwsma Dept. of Nephrology, LUMC 

PD 

Dr. R.G.M. Bredius Dept. of Paediatrics, LUMC 

LT, WG

Dr. C.M. Cobbaert Dept. of Clinical Chemistry, LUMC 

LT 

Prof. dr. A.F. Cohen Dept. of Nephrology, LUMC 

LT 

Prof dr. D.P. Engberts Dept. Ethics & Law 

LT 

Prof. dr. J.W. de Fijter  Dept. of Nephrology, LUMC 

LT 

Dr. F.A. van Gaalen Dept. of Rheumatology, LUMC 

LT, WG

Prof dr. H.J. Guchelaar Dept. KFT 

LT 

Dr. B.G.A. Guigas Dept. of Parasitology 

LT 

Dr. K.L.L. Habets Dept. of Rheumatology, LUMC 

PR 

Dr. T. van Hall Dept. of Clinical oncology) 

LT 

Dr. L.M. ‘t Hart (MCB)  WG

Dept. Of Molecular cell biology Prof. dr. P.S. HiemstraDept. of Pulmonology, LUMC 

LT, PR, WG

Drs. P.C.E. Hissink MullerDept. of Paediatrics, LUMC 

LT 

Dr. C.H. HokkeDept. of Parasitology 

LT 

Dr. S. KleijnDept. Pulmonology, LUMC 

LT 

Prof. dr. F. KoningDept. of Immunohematology and Blood bank, LUMC 

LT 

Drs. P. KhedoeDept. Pulmonology, LUMC 

LT 

Prof. dr. C. van KootenDept. of Nephrology,LUMC 

LT 

Dr. F. KroonDept. of Infectious diseases 

LT 

Dr. A. LankesterDept. of Paediatrics, LUMC 

LT, WG

Dr. A.F. LipkaDept. of Rheumatology 

LT, WG, PD

Dr. E. LoprioreDept. of Paediatrics, LUMC 

LT 

Prof. dr. R.M. MaizelsEdinburgh, UK 

LT 

Dr. M.L. Mearin Manrique Dept. of Paediatrics, LUMC 

LT 

Drs. D.J.A.R. MoesDept. of Clinical Pharmacy and Toxicology 

LT 

Mr. I. de NooijerLURIS 

LT 

Dr. F.A. OssendorpDept. of Immunohematology and Blood bank, LUMC 

LT 

Dr. J.J. PlompDept. of Neurology, LUMC 

PR, LT

Prof. Dr. T. RabelinkDept. of Nephrology, LUMC 

LT 

Drs. S.R.S. RamaiDept. Pulmonology, LUMC 

LT 

Dr. M.E.J. Reijnders LT 

Page 7: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

 

Dept. of Nephrology, LUMCDr. D.L. Roelen Dept. of Immunohematology and Blood bank, LUMC 

LT 

Dr. J.N. Samsom Dept of Paediatric Gastroenterology, Erasmus MC 

LT 

Mw. A. van Schadewijk Dept. Pulmonology, LUMC 

PD 

Dr. K. Schimmel Dept. KFT 

LT 

Ir. R. Schot Dept. Pulmonology, LUMC 

PR 

Dr. A.M. Slats Dept. Pulmonology, LUMC 

LT 

Dr. J.J. Schweizer Dept. of Paediatrics) 

LT 

Prof dr. F.J. Staal Dept. of Immunohematology and Blood bank, LUMC 

LT 

Dr. B.C. Stoel Dept. Pulmonology, LUMC 

PR 

Dr. Y.K.O. Teng Dept. of Nephrology, LUMC 

LT 

Prof. dr. R.E.M. Toes Dept. of Rheumatology, LUMC 

LT, WG

Prof. dr. C. Taube Dept. Pulmonology, LUMC 

LT, PD

Dr. M.D.J. van Tol Dept. of Paediatrics, LUMC 

LT, PR

Dr. L.A. Trouw Dept. of Rheumatology, LUMC 

LT, PR

Dr. J. Vellinga Crucell 

LT 

Drs. E.P.M. van der Vlugt Dept. Pulmonology, LUMC 

LT 

Dr. E. van de Vosse Dept. of Infectious diseases, LUMC 

LT 

Dr. A.P.J. de Vries Dept. of Nephrology, LUMC 

LT, PR

Dr. J.J.C. de Vries Dept. of Medical Microbiology, LUMC 

LT 

Dr. J.K. de Vries‐BouwstraDept. of Rheumatology, LUMC 

LT, PR, PD, WG 

Dr. M. de Vries Dept. of Paediatrics 

LT 

Prof. dr. J.J.G.M. Verschuuren Dept. of Neurology, LUMC 

LT, WG, PD

Drs. Y. van Wijck Dept. Pulmonology, LUMC 

LT 

Dr. L.N.A. Willems Dept. Pulmonology, LUMC 

LT, PD

Dr. D. van der Woude Dept. of Rheumatology, LUMC 

LT, PR, PD, WG 

Drs. M. Zarcone Dept. Pulmonology, LUMC 

LT 

Dr. M.C. van ZelmDept. of Molecular Immunology, Erasmus MC  

LT 

 

 

Page 8: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,
Page 9: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

 

5

Preface 

 

The human immune system is intended to recognize non‐self, harmful entities in order to eliminate 

them  to  avoid  damage.  Upon  re‐exposure  to  the  same  pathogenic  entity,  a  faster  and  stronger 

immune  response  occurs,  known  as memory.  The memory  response  has  been  used  throughout 

history to confer immunity, even before our understanding of the physiological basis of the immune 

response. Already more than 2000 years ago, Thucydides wrote  in his History of the Peloponnesian 

War that persons who had been exposed to plague previously were protected against disease. Much 

later,  in  the  18th  century,  Edward  Jenner  postulated  that  the  pus  in  the  blisters  from  cowpox 

protected milkmaids  from smallpox. He  tested  this hypothesis by  inoculating an eight‐year‐old boy 

with pus from cowpox blisters in both arms. The boy developed fever and some uneasiness, but not a 

full‐blown  infection. A  few months  later,  Jenner  challenged  this boy with  live  smallpox and  found 

that the boy was protected against this infection. 

 

In  the  next  years,  basic  knowledge  on  the  immune  system  improved,  and  especially  genetically 

inherited  primarily  immunodeficiency’s  has  provided  valuable  insights  into  the  functioning  of  the 

immune  system.  The  study  of  immunology  provides  the  opportunity  in  medicine  to  relate  the 

findings of basic  scientific  investigations  to  clinical problems. Currently we know  that  the  immune 

system has the important task to maintain a delicate balance between the potency to destroy foreign 

cells  and  viruses, while  refraining  from  destruction  of  the  host's  own  tissue. When  the  immune 

system  is  not  able  to mount  a  sufficient  defense  of  the  host,  this  is  considered  as  an  immune 

deficiency  (e.g. HIV  infection and SCID), whereas  if  the  immune system acts  too vigorously, allergy 

might  be  induced  or  the  immune  system might  start  to  attack  the  host,  initiating  autoimmune 

diseases (e.g. Rheumatoid arthritis and Myasthenia gravis). 

 

During  this 10‐weeks course, many different disciplines  involved  in  immune‐mediated diseases are 

offered,  including Parasitology, Medical Microbiology, Neurology, Rheumatology, Pulmonology, and 

Nephrology. In the first two weeks of this half minor, case studies describing real events from records 

of  different  hospitals  are  presented,  illustrating  in  a  clinical  context  essential  points  about  the 

fundamental mechanisms of  immunity. Subsequently,  clinicians, basic  researchers, and patients of 

different departments  involved  in  immune mediated diseases will be  introduced. At the end of this 

module, the student is able to understand immune‐mediated mechanisms leading to disease, and is 

prepared  to  present  a  research  proposal  with  state‐of‐art  laboratory  techniques  to  investigate 

specific components of  the  immune  system  related  to disease, based on  recent  literature  (Scholar 

competence).  By  attending  patient  demonstrations,  taking  a  patient’s  history,  and  investigate 

diagnostic  profiles,  the  student  is  able  to  diagnose  a  patient with  an  immune mediated  disease 

correctly.  The  student  is  also  capable  to  set  up  a  diagnostic  and  therapeutic  plan  for  a  patient 

suspected to suffer from an immune mediated disorder, making the first steps to become a Medical 

expert.  In  collaboration with  other  students,  a  Grant  proposal  for  an  innovative  therapy will  be 

designed. The  last day of the half minor, this Grant proposal poster will be presented clearly to an 

audience showing Communicator and Collaborator competences, and might be selected for the best 

poster award. 

Page 10: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,
Page 11: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

 

7

Introduction and general information 

Description  Immune  mechanisms  underlying  immune  deficient  patients  are  explained  to  understand  the consequences of a defective immune system. Based on specific patients cases, the students will take a patient’s history, attend patient demonstrations, and investigate the diagnostic profile to diagnose the patient correctly. By  independent search of recent  literature,  the students are able  to  find out the pathogenic mechanisms underlying a specific  immune related disorder and  tools  to  investigate these mechanisms with state‐of‐art laboratory techniques. By knowledge tolerance inducing agents, the  students  are  able  to  design  a  therapeutic  plan.  The  last  day  of  the  half minor,  the  students present a Grant proposal poster for an innovative therapy, that might be selected for the best poster award.   

Subjects 

 1. Immune deficiencies 2. Diagnostics in immune mediated disorders 3. Autoimmune diseases 4. Allergy 5. Transplantation 6. Innovative treatments 7. State‐of‐art laboratory techniques 8. Grant proposal  Schematic overview 10 weeks:   

   

Diagnostics in immunological 

disorders 

Neuro‐immunology 

Rheumatology 

Innovative therapies 

Nephrology 

Introduction in immune mediated 

diseases 

Pulmonology 

Assessment case 

Week 1 

Week 2 

Week 3 

Week 4 

Week 5 

Week 6 

Week 7 

Week 8 

Week 9 

Week 10 

Page 12: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

 

Study goals of the module: 

 General learning objectives for Academic and Scientific competences: 

The student is able to: 

• professionally  implement his  knowledge,  insight,  and  competences  to  function well within  the health system and in medical sciences related situations 

• collect  and  interpret  relevant  information  in  the  area  of medical  sciences  to make  a  decision based on relevant social, scientific, and ethical aspects 

• communicate information, ideas, and solutions to an audience with or without medical experts • possess the capacity to perform autonomously a high level follow‐up study  

Specific learning objectives of this half minor: 

The student is able to: 

take a patients’ history in order to examine whether (s)he suffers from an immunological disorder (Medical expert) 

perform  independently  literature  research  based  on  a  specific  patient  casus  and  select  three relevant  papers  to  analyse  and  report  the  immunological  background  of  the  patient  casus  in detail (Academic) 

explain  and  determine  by  knowledge  obtained  from  lectures  and  literature  the  pathogenic mechanism(s) underlying the symptoms of a patient diagnosed with an immunological disorder 

relate  the  mechanism  of  disease  of  a  systemic  auto‐immune  disease  to  organ  specific involvement by understanding the defect immune components related to the disorder 

create  a  diagnostic  plan  by  evaluation  of  immunological  laboratory  techniques  based  on  a differential diagnosis and motivate why these techniques are appropriate to be able to diagnose the patient correctly (Academic) 

interpret  results  from  diagnostic  tests  and  subsequently  translate  these  results  to  potentially underlying immunological diseases 

develop a  therapeutic plan based on  results  from diagnostic  tests and corresponding diagnosis and describe the method to check the effect of the intervention (Medical expert) 

formulate  and  communicate  clearly  in  collaboration with  other  students  following  another ½ minor the disbalance between the ‘good’ and ‘bad’ immune system in a specific patient casus and develop  a  therapeutic  plan with  groups  of  therapeutics  to manipulate  the  immune  system  in order to reach a balance again (Communicator, Collaborator) 

  Under the different Themes, specific learning objectives for each module are described. 

Competency lines  Medical expert and Professional 

    

 Learning objectives: 

take a patients’ history in order to examine whether (s)he suffers from an immunological disorder 

develop a  therapeutic plan based on  results  from diagnostic  tests and corresponding diagnosis and describe the method to check the effect of the intervention 

Page 13: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

 

 Academic 

 

  

 Learning objectives: 

perform  independently  literature  research  based  on  a  specific  patient  casus  and  select  three relevant  papers  to  analyse  and  report  the  immunological  background  of  the  patient  casus  in detail 

create  a  diagnostic  plan  by  evaluation  of  immunological  laboratory  techniques  based  on  a differential diagnosis and motivate why these techniques are appropriate to be able to diagnose the patient correctly 

  Collaborator and Communicator  

    

 Learning objectives: 

formulate  and  communicate  clearly  in  collaboration with  other  students  following  another ½ minor the disbalance between the ‘good’ and ‘bad’ immune system in a specific patient casus and develop  a  therapeutic  plan with  groups  of  therapeutics  to manipulate  the  immune  system  in order to reach a balance again 

 

 

Prerequisites 

 

‐Mechanisms of disease I, theme I, III, IV, and VI (2nd year Medicine) 

‐Knowledge of the English language 

 

 

Place in the curriculum 

 

This module will  follow‐up on  the  immunological basis  the students obtained  in G2MD1, and gives 

students  with  an  interest  in  the  broad  field  of  immunology  the  change  to  intensify  their 

immunological  knowledge  in  a  specific  clinical  setting.  This module prepares  the  students  for  the 

subsequent modules regarding patient interactions and diagnostic potential. 

 

 

 

 

 

 

 

 

Page 14: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

10 

 

Assessment matrix 

 

Assessment:  Knowledge  Final report  Grant proposal poster 

Exam type:  Open question exam  Written report of ~2000 words  Oral presentation 

Area:  Knowledge  Knowledge and ability Knowledge, ability, and communication 

Time:  Week 2  Week 8  Week 10 

Duration:  1,5 hrs  36 hrs  20 hrs preparation 

Weight:  10%  60%  30% 

Collaboration:  Individual  Individual  Couple 

Assessed by:  Minor teacher One minor teacher and one Specialist (evaluation form available) 

Average of one minor teacher and one Specialist 

Number of  questions:  10  1800‐2200 words  N/A 

 

Assessment matrix related to learning objectives 

 

Assessment:  Knowledge  Final report  Grant proposal poster 

General academic and scientific learning objectives  X  X 

1 diagnose a patient with an immunological disorder by 

performing taking a patient’s history (Medical expert)   X   

2 perform literature research on a patient casus and select 

papers to report the immunological background in detail. 

(Academic) 

  X  X 

3 determine the pathogenic mechanism(s) of a patient casus   X  X  X 

4 relate the mechanism of disease of a systemic auto‐immune 

disease to organ specific involvement  X  X  X 

5 create a diagnostic plan by evaluation of state of the art 

laboratory techniques on a differential diagnosis (Academic)   X  X 

6 interpret results from diagnostic tests and subsequently 

translate which immunological defects might underlie the results X  X  X 

7 develop a state of the art therapeutic plan from diagnostic 

tests and the method to check the effect of the intervention    X   

8 formulate and communicate disbalance between ‘good’ and 

‘bad’ immune system in a specific patient casus and develop a 

therapeutic plan with groups of therapeutics (Communicator, 

Collaborator) 

  X  X 

Page 15: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

11 

 

Assessment information 

 Summative assessment plan consists of: 

 

• Knowledge exam • Final written report • Grant proposal poster presentation 

 • Additional requirements (Passed/Failed) 

o Diagnosis report (1x) o Oral presentations (4x) o Written reports (2x)  

 

I) Knowledge exam 

 

The knowledge exam consists of 10 open questions Rating: Mark 1‐10 Assessment form: Mark fixed depending on the number of right answered questions.  Assessed by: Workgroup docent week 1‐2 Assessment criteria: N/A  

II) Final report 

In Week 8, the students should combine all knowledge obtained in Week 3‐7 by writing individually a 

report  (approximately  2000 words)  on  a  specific  immunological  disease  (MG,  SLE,  aHUS,  Allergy; 

received in Week 3). 

Assessment: Mark 1‐10 Assessment form: See Appendix A. Assessed by: Medical specialists of the corresponding casus. Assessment criteria: See Appendix A.  

III) Grant proposal poster presentation 

Students are grouped  in pairs (one from Clinical Immunology (CI) and one from Infections, Vaccines 

and  Immune modulation  (IVIM)) and get a personal  tutor assigned  for 2 weeks. Together  they will 

develop  a  grant  proposal  on  an  innovative  therapeutic  strategy  for  a  specific  immunological  or 

infectious disease. The students will have at least 4 feedback moments on their grant proposal with 

their personal  tutor. At  the  last day,  the  idea  for  the grant proposal  is presented by a poster at a 

symposium. Clear guidelines are provided to the students for both the grant proposal  idea and the 

poster presentation (See Appendix B). 

Rating: mark 1‐10 Assessed by: Tutors Week 9‐10 Assessment: The grant proposal will be evaluated based on a E‐poster presentation  (7 min) during the final symposium and a 15 min discussion. The mark for the poster presentation will be an average of the evaluation of all tutors present plus the mark from the assigned personal tutor (1:1 ratio). The students will also evaluate and rank all the posters using a written anonymous form. The poster with the highest rank will receive a poster award.  Assessment  criteria:  use  of  immunological  knowledge  into  novel  concepts,  innovation,  creativity, collaboration, communication, writing skills, presentation.  The topic should be different from the final report (Week 8). 

Page 16: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

12 

 

Calculation overall mark  

The final report and the final mark has to be >5.5, to pass the half minor. 

 

‐ Open question exam = 10% of the final mark 

‐ Final report = 60% of the final mark 

‐ Grant proposal poster presentation = 30% 

 

See Appendix C. 

 

Additional requirements 

1. Diagnosis report in Week 2 Assessment: Passed/Failed Assessed by: Minor teacher Week 1/2. Assessment  criteria:  Individual  report  to  show  understanding  of  immunology  and  diagnosis  for selected  case  studies according  to  strict guidelines  (Appendix D). This assignment  is a preparative assignment for the report of week 8. 

2. Oral presentation Laboratory Assessment: Passed/Failed Assessed by: Diagnostic test teacher Week 1/2. Assessment criteria: Short oral presentation to show understanding of the application and principle of a dedicated set of clinical tests (Appendix E). 

3. Oral presentation patient casus Week 3 Assessment: Passed/Failed Assessed by: Medical specialist of the casus Assessment criteria: Being able to prepare a clear presentation in a group of max. 5 students about the immunological mechanisms and diagnostic tools at the end of Week 3 (Appendix F). 

4. Written report Neuro‐immunology Assessment: Passed/Failed Assessed by: Neurologist Assessment criteria: Being able to collaborate, prepare in a group of max 5 students a written review report  about  one  neuro‐immunological  disease  (Appendix G).  Students with  the  case MG  for  the written report of Week 8 should choose another disease this week. 

5.  Oral presentation Rheumatology Assessment: Passed/Failed Assessed by: Medical specialist of the corresponding week. Assessment  criteria:  Being  able  to  collaborate,  prepare  a  clear  presentation  with  literature  and knowledge  obtained  previously,  present  clear,  answer  questions  (Appendix H).  Students with  the case SLE case for the written report of Week 8 should choose another disease this week. 

6. Oral presentation Pulmonology Assessment: Passed/Failed Assessed by: Medical specialist of the corresponding week. Assessment  criteria:  Being  able  to  collaborate,  prepare  a  clear  presentation  with  literature  and knowledge obtained previously, present clear, answer questions (Appendix I). Students with the case Allergy case for the written report of Week 8 should choose another disease this week. 

7. Written report Nephrology Assessment: Passed/Failed Assessed by: Medical specialist of the corresponding week. Assessment criteria: Prepare  individually a clear written report about one biological with  literature and knowledge obtained previously (Appendix J). 

Page 17: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

13 

 

 A minimal number 5/7 of  the additional  tasks have  to be passed. A maximal number of  two  failed additional task might be repeated. In case of an oral exam, a written report should be handed in.  

 

Presence 

Presence during the complete program will be recorded and at least 90% of the contact hours should 

be attended. If not, additional tasks should be performed to compensate for the missed hours. 

 

 

Re‐examination  

One  exam;  the multiple  choice  exam,  the  final  report,  or  the  Grant  proposal  (report  instead  of 

poster) can be repeated in case the final report or the final mark is <5.5. 

 A  maximal  number  of  two  failed  additional  task  might  be  repeated  to  pass  5/7  additional requirements. In case of an oral exam, a written report should be handed in.  

 

FORMATIVE examination and FEEDBACK 

Diagnosis report (Week 2) – Exercise for final report (Week 8).  

Short oral presentation (Week 3) – Feedback will be provided directly after the presentation and it will be checked in the final report if the feedback is used 

Oral presentations (Week 2, 5, 6) – After all presentations feedback will be provided, to be used for Grant proposal poster presentation (Week 10) 

Small written report (Week 4, 7) – Exercise for written report (Week 8), Feedback on small reports will be provided within one week. 

 

 

Study books 

 

• The immune system (Peter Parham) 

• Other study material are placed on Blackboard 

Relevant websites 

• Links of relevant websites and other required study material are placed on Blackboard 

Page 18: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

14 

 

Module schedule overview  

 

  

 

Week 1 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

Introduction 1‐sep‐14 2‐sep‐14 3‐sep‐14 4‐sep‐14 5‐sep‐14 hours

1 self study self study self study prepare lab visit 08:30 ‐ 09:30

2 Clinical case adaptive immune disorders Clinical case heamolytic disease *Lab visit  09:30 ‐ 10:30

3 Free:  Clinical case innate immune disorders Role of B cells  in infections DCs in Ag pres. and T cell activation clinical immunology 10:30 ‐ 11:30

4 Opening of the Role of innate immunity and PRR self study self study Instructions Diagnosis  Report 11:30 ‐ 12:30

 Academic Year

5 Self study: Self study: Self study: Free: 13:30 ‐ 14:30

6 parham parham prepare work group Inauguration of  14:30 ‐ 15:30

7 written case studies written case studies work group student societies 15:30‐16:30

8 case reports  & questions 16:30‐17:30

*No room needed

Week 2 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

Introduction 08‐sep‐14 9‐sep‐14 10‐sep‐14 11‐sep‐14 12‐sep‐14 hours

1 self study self study self study Self study: 08:30 ‐ 09:30

2 Clin case: juvenile RA, hyper IgE Clin case:X‐linked lymphoprolif syndr Clin case: Crohn's dis, Celiac Dis prepare 09:30 ‐ 10:30

3 destructive inflammation & T cells Mendellian suscept. for mycobacterial infections Celiac disease: adaptive vs innate immunity written exam 10:30 ‐ 11:30

4 self study self study self study Self‐study 11:30 ‐ 12:30

prepare 

5 oral presentations Self study: Self study: written exam Written exam 13:30 ‐ 14:30

6 on lab visits write prepare work group (summative) 14:30 ‐ 15:30

7 Self study: prepare diagnosis report diagnosis report work group Free 15:30‐16:30

8 (formative) (formative) case reports & questions 16:30‐17:30

Week 3 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

CKCL 15‐sep‐14 16‐sep‐14 17‐sep‐14 18‐sep‐14 19‐sep‐14 hours

1 distribution patient casus Laboratory diagnostics I Laboratory diagnostics II Lymphocyte characterization in diagnostics preparation of presentatio case studies 09:00‐10:00

2 Intro in laboratory diagnostics 10:00‐11:00

3 self study 11:00‐12:00

4

5 Group 1: Group 2: Group 3: Group 4: 13:30‐14:00

6 laboratory visit laboratory visit laboratory visit laboratory visit Student presentations 14:00‐15:00

7 self study self study self study self study case studies 15:00‐16:00

8 work on patient casus work on patient casus work on patient casus work on patient casus 16:00‐17:30

Week 4 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

Neurology 22‐sep‐14 23‐sep‐14 24‐sep‐14 25‐sep‐14 26‐sep‐14 hours

1 Self study: Self study: Self study: Self study: 09:00‐10:00

2 Prepare today's topic Prepare today's topic Voortgangstoets Prepare today's topic Report 10:00‐11:00

3 Lecture MS Lecture MG & LEMS Lecture GBS & CIDP 11:00‐11:45

4 Patient demonstration MS Patient demonstration MG & LEMS Patient demonstration  GBS & CIDP 11:45‐12:15

12:15‐13:15

5 Workgroup MS Workgroup MG & LEMS Lecture IBM Workgroup GBS & CIDP 13:15‐14:30

6 Patient demonstrationIBM 14:30‐15:00

7 *Laboratory visit Group 1 *Laboratory visit Group 2 Workgroup IBM *Laboratory visit Group 4 15:00‐16:30

8 Self study: Report Self study: Report *Laboratory visit Group 3 Self study: Report 16:30‐17:30

*No room needed *No room needed *No room needed *No room needed

Week 5 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

Rheumatology 29‐sep‐14 30‐sep‐14 1‐okt‐14 2‐okt‐14 3‐okt‐14 hours

Lectures Patient demonstrations *Clinical rounds:  Self study: Free day: 09:00‐10:00

 Rheumatic diseases Multidisciplinary day care, Read literature and  Leids  ontzet 10:00‐11:00

Self study: Laboratory visit part I joint puncture, nailfold capillaroscopy  prepare presentation 11:00‐12:00

Immunology 12:00‐13:00

 of Rheumatic diseases Self study: *Laboratory visit part II Student presentations 13:00‐14:00

Read literature and  Self study: 14:00‐15:00

prepare presentation Read literature and  15:00‐16:00

prepare presentation 16:00‐17:00

Introduction of immune system

Lecture

Practical

Patient demonstration

Workgroup

Self study

Page 19: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

15 

 

  

  

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Week 6 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

Pulmonology 06‐okt‐14 7‐okt‐14 8‐okt‐14 9‐okt‐14 10‐okt‐14 hours

Lectures: 9:00‐9:30 questions self study 9:00‐12:00 Lectures: Interactive mini‐symposium Question hour presentation 09:00‐10:00

Anatomy and Physiology of the lung 9:30‐11:00 Patient demonstrations In vivo and cell culture models 10:00‐11:30 Self study 10:00‐11:00

Cell biology and host defense of the lung 11:15‐13:00 Diagnostic procedures Clinical research 11:30‐13:00 Presentations 11:00‐12:00

COPD and asthma   12:00‐13:00

Self study: Self study 12:30‐13:30 *Lunch meeting PulmoScience Self study: 13:00‐13:30 Break 13:00‐14:00

Immunology Literature 13:30‐14:15 **Microscopy Read literature and  13:30‐15:00 Presentations 14:00‐15:00

 of COPD and asthma 14:15‐17:00 Self study prepare presentation 15:00‐16:00

Read literature 16:00‐17:00

*Lecture hall for 50 attendants required

**Lecture room at Pathology Department with microscope and projection

Week 7 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

Nephrology 13‐okt‐14 14‐okt‐14 15‐okt‐14 16‐okt‐14 17‐okt‐14 hours

Lectures: Lectures: Lectures: Self study Self study: write report 09:00‐10:00

Introduction to Clinical Nephrology, SLE Immunogenetics and HLA, Acute rejection, Viral infection immunosuppressive drugs 10:00‐11:00

nephritis, Complement‐rel. renal disease Allo‐immunity, Belatacept Self study 11:00‐12:00

12:00‐13:00

ANCA‐vasculitis Immunosuppressive drugs  13:30‐14:00 *Histopathology rounds Lecture: HIV and renal transplantation 13:00‐14:00

handing out assignment target therapy Therapeutic drug monitoring Self study *Clinical rounds 14:00‐15:00

Self study Self study 15:30‐16:30 Lecture PCP and fungal inf Self study 15:00‐16:00

Self study 16:00‐17:30

hand in written report 16:30‐17:30

*No room needed *No room needed

Week 8 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

Assessment 20‐okt‐14 21‐okt‐14 22‐okt‐14 23‐okt‐14 24‐okt‐14 hours

Self study: write report Self study: write report Self study: write report Self study: write report Self study: write report 09:00‐10:00

10:00‐11:00

11:00‐12:00

12:00‐13:00

13:00‐14:00

14:00‐15:00

15:00‐16:00

16:00‐17:30

16:30‐17:30

Week 9 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

Innovative thera 27‐okt‐14 28‐okt‐14 29‐okt‐14 30‐okt‐14 31‐okt‐14 hours

1 Self study:symposium/grant proposal Self study:symposium/grant proposal Innovative therapies & IT Self study: 08:30

2 Introduction Innovative therapies How to develop a  clinical trial for IT preparing Round table discussion *Site Visit Leiden BiosciencePark

3 Philosophy and ethics of IT Exon Skipping therapy for DMD Stem cell‐based gene therapy for SCID Towards personalized medicine:

4 Meet the mentors Self study:symposium/grant proposal  EU FP7 approach on helminth vaccines Pros and Cons (formative) Meet the mentors 12:30

5 Self study: Symposium Rick Maizels Meet the mentors Self study: Self study: 13:30

6 Preparing Symposium/Grant proposal Self study: preparing Symposium/Grant proposal preparing Symposium/Grant proposal

7 preparing Symposium/Grant proposal

8 17:30

*No room needed

Week 10 Monday Tuesday Wednesday Thursday Friday

Innovative thera 03‐nov‐14 04‐nov‐14 05‐nov‐14 06‐nov‐14 07‐nov‐14 hours

1 Self study: *Site Visit LUMC pharmacy manufacture Self study: preparing JC lecture Self study: 08:30

2 preparing Symposium/Grant proposal Hot topics in innovative therapies: preparing Symposium/Grant proposal Poster Symposium: Study group 1‐10

3 Pre‐ and probiotics for immune diseases Meet the mentors highlights from high‐ranking journals summative

4 IT: new approaches for vaccination Self study: Dealing with minor age for IT 12:30

5 Self study: Self study: Self study: Self study: 13:30

6 preparing Symposium/Grant proposal preparing Symposium/Grant proposal preparing Symposium/Grant proposal PRINTING POSTER Poster Symposium: Study group 11‐20

7 Deadline 1.30am summative

8 17:30

Lecture

Practical

Patient demonstration

Workgroup

Self study

Page 20: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

16 

 

 

Line schedule 

 

  

 

Page 21: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

 

17

Themes 

 

1. Introduction in Immune‐mediated diseases 

2. Diagnostics in immunological disorders 

3. Neuro‐immunology 

4. Rheumatology 

5. Pulmonology 

6. Nephrology 

7. Write report patient case 

8. Innovative therapies 

Page 22: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

18 

 

1. Introduction in Immune‐mediated diseases 

Clinical coordinators:  Dr. R.G.M. Bredius (Paediatrics), Dr. A.C. Lankester (Paediatrics) Scientific coordinators:  Dr. M. Bax (Rheumatology), Dr. H.H. Smits (Parasitology) Other teachers involved:  Dr. V. Bekker  (Paediatrics), Dr.  T.  van Hall  (Clinical  oncology),  Prof Dr. 

P.S. Hiemstra (Pulmonology), Dr. Hissink Muller (Paediatrics), Prof. Dr. F. Koning (IHB), Dr. E. Loprione (Paediatrics), Dr. L. Mearin (Paediatrics), Dr. P. Nibbering  (Infectious diseases), Dr.  J.J. Schweizer  (Paediatrics)  , Prof dr. R. Toes (Rheumatology), Dr. E. van de Vosse (Infectious diseases), Dr. J.J.C. de Vries (Medical microbiology), Dr. M. van Zelm (Erasmus MC) 

 Background 

 The  immune  system  is  a  sophisticated  system designed  to protect us  against  invading pathogens, which try to exploit us for their own survival. The  immune system consists of different  intertwined layers,  such as  innate and adaptive elements.  Innate  immunity  is germline‐encoded and will  react immediately by e.g. circulating complement molecules and/or soluble mediators secreted by various innate cell types  in responds to danger signals. In contrast, adaptive  immunity only slowly develops but results in effective tailor‐made high affinity T and B cells and immunoglobulins. Importantly, the immune  system  is not only  capable of distinguishing between  self  and non‐self but  also between harmful  and  harmless.  As  such,  the  immune  system  has  developed  the  capacity  to  dampen  or prevent  immune  responses  in  the  case  of  non‐self,  but  ubiquitous molecules  to  protect  against unnecessary tissue damage as a result of otherwise exaggerated inflammatory responses.   Clinical presentations 

 The  concepts  of  immunology  are  illustrated  by  medical  problems  in  patients  with  (inheritable) immune deficiencies of either the innate or the adaptive immune system.   Study goals 

 The student can 

Describe  medical  conditions  when  the  innate  immune  system  does  not  properly  recognize pathogens. 

Describe medical consequences when cell subset(s) of the adaptive immune system are lacking  

Explain the dichotomy of the immune system towards ‘self/non‐self’ and ‘harmful/harmless’ and describe medical consequences when these systems fail  

In patients with  (genetic)  immune deficiencies, describe  the medical problems due  to  specific infections and explain the immunological mechanism 

 Contact hours (~14 hr), divided over 8½ days: Lectures/  demonstrations  of  patients  with  genetic  immune  deficiencies  to  explain  the  following aspects of the immune system: 

‐ Broad overview of the different elements of the immune system (2 hours) ‐ The innate immune system (3 hours) ‐ Dendritic cells in antigen presentation and recognition of self vs non‐self (2 hours) ‐ B cells and immunoglobulins (2 hours) ‐ The role of T cells and cytokines in inflammation (3 hours) ‐ Distinction between harmful or harmless  (2 hours) 

Page 23: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

19 

 

Self‐study hours:  

Read indicated book chapters of Parham plus relevant review articles 

Write diagnosis report 

Prepare workgroups 

Prepare oral presentation (laboratory visit)   Study materials  Book: The immune system (Peter Parham) Other materials are posted on Blackboard   Evaluation:  

Oral presentation (laboratory visit) (p/f) 

Workgroups (p/f) 

Diagnosis report (p/f) 

Multiple‐choice exam (summative)   Detailed program and study material: 

 Tuesday 2 September Theme:   Innate immunity  Self‐study  8.30‐9.30 hour 

Prepare case studies and lectures of this morning 

 Lecture   8.30 – 8.45 hour Title    Introduction to the module immune‐mediated diseases Instructor  Dr. R. Bredius MD (Dept of Paediatrics) Goals    Explain the content, the learning objectives and the assignments for this module  Lecture   8.45 – 10.30 hour Title    General overview of the immune system Instructor  Prof dr. P.S. Hiemstra (Dept. of Pulmonology) Goals  The aim of this first lecture is to refresh your memory! If you know it all you may sit 

back and  relax, but also  consider asking questions about  the  immune  system  that were  left  unanswered  from  your  second  year  courses  in  immunology  and mechanisms of disease. More  likely, your memory will welcome some refreshment. The aim of this  lecture  is therefore to  lay a solid foundation for the two minors on immune‐mediated disease: “Infections, Vaccines, Immune Modulation” and “Clinical Immunology”.  We will review the innate and adaptive immune systems with the various cell types, mediators  and  effector  molecules  involved.  We  will  discuss  the  apparently complicated way  that  the  immune  system uses MHC/HLA molecules and dendritic cells  to  present  antigens,  and  how  this  system  offers  intriguing  opportunities  to prevent  infections and  tune  the  immune system. We will also explore  the way  the 

Page 24: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

20 

 

immune  system  controls  its  own  activity  as  an  essential  opportunity  to  prevent hypersensitivity reactions, including autoimmune diseases and allergies.  

Literature  Parham: Hst. 1: 1.4‐1.6, 1.7 Fig. 1.7‐1.12. Hst. 3: Complete, including all figures.  Case study   11.00 – 11.45 hour Title  Deficiencies in innate immunity Instructor  Dr. V. Bekker MD (Dept. of Paediatrics) Goals  Case presentation of patient with defects  in  innate  immunity.  These  patients  lack 

important components of the  innate defence,  i.e. complement, phagocytes. Due to this  immune  defect  these  patients  have  a  specific  susceptibility  spectrum,  some infectious agents will be problematic while others are not. Phagocyte dysfunctions such as seen in Chronic Granulomatous Disease and absolute deficiencies in number of phagocytes (Congenital Neutropenia) will be discussed.  

Literature  Parham Hst. 2: 2.2, 2.4. 2.5, 2.13, 2.14 Fig: 2.5, 2.9, 2.10, 2.27, 2.33  Preparation  See case studies at Blackboard  Lecture    11.45 – 12.30 hour Title    Host pathogen interactions: it takes two to tango Instructor  Dr. P. Nibbering (Dept. of Infectious Diseases) Goals   Using  examples  from  patients  this  presentation  is  dedicated  to  barriers  (both 

chemical  and  microbiological),  the  inflammatory  response,  defences  against  viral infections,  defences  against  bacterial  infections,  and  some  emphasis  on  immune evasion. The focus will be on both cells and molecules involved. 

Literature  Parham Hst. 2: 2.10, 2.11, 2.12 Fig 2.19, 2.24  Self‐study   12.30‐17.00 hour 

See case studies and quizzes on Blackboard.  

   

Page 25: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

21 

 

Wednesday 3 September Theme:   Adaptive Immunity and the role of T and B cells   Self‐study  8.30‐9.30 hour 

Prepare case studies and lectures of this morning  Case study   8.30‐9.30 hour Title  Deficiencies of the adaptive immune system Instructor  Dr. A. Lankester MD/ Dr. R. Bredius MD (Dept. of Paediatrics) Goals  Cases with  severe genetic defects  in  the adaptive  immunity will be demonstrated. 

Both  T  and  B  cellular  defects  are  adaptive  immune  system  disorders.  T  cellular defects such as seen  in SCID (absent or dysfunctional T/B cells) are the most severe defects and usually  these patients need urgent  treatment at young age. B cellular, humoral defects such as seen  in X‐linked Agammaglobulinemia  (no B cells) or class switch defects (Activation‐induced Cytidine Deaminase Deficiencies) lead to infection proneness when maternal trans‐placental transferred antibodies fade away. 

Literature  Parham Hst. 5: 5.2‐5.4, Fig. 5.1, 5.5. Hst. 8: Fig. 8.37 Preparation  Case studies at blackboard  Lecture    9.30‐10.30 hour Title   Critical  steps  in  B‐cell  development  revealed  in  patients  with  primary 

immunodeficiencies  Instructor  Dr. M.C. van Zelm (Dept. of Imunology, ErasmusMC) Goals  In  the  past  2  decades,  many  new  genetic  defects  have  been  found  to  underlie 

immunodeficiencies with  impaired  antibody production.  These  single  gene defects have  revealed critical steps  in B‐cell differentiation and antibody  responses.  In  this lecture, immunobiological processes will be discussed that have been found impaired in antibody‐deficient individuals. Specifically, the importance of V(D)J recombination, antibody  receptor  signaling,  somatic  hypermutation  (SHM)  and  Ig  class  switch recombination will be explained. 

Literature  Parham Hst. 4: 4.8‐4.16 Fig. 4.2, 4.5, 4.17, 4.20, 4.30, 4.32  Self‐study   10.30‐17.00 hour 

See case studies at Blackboard.  

   

Page 26: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

22 

 

Thursday 4 September Theme:   Recognition of self/non‐self  Self‐study  8.30‐9.30 hour 

Prepare case studies and lectures of this morning  Case study   9.30 – 10.30 hour Title  Auto‐ and alloimmune cytopenias  in neonates and other  immunoglobulin mediated 

problems in neonates  Instructor  Dr. E. Loprione MD (Dept. of Neonatology) Goals  Maternal antibodies can severely disturb intrauterine and neonatal life. A case study 

on hemolytic disease of the newborn and allo and auto‐immune thrombocytopenia will be presented.  

Literature  Parham Hst. 5: 5.7‐5.15 5.17 Fig. 5.13‐5.14, 5.20, 5.23, 5.25. Hst. 8: 8.13‐8.18 Fig. 8.1, 8.27, 8.34, 8.37; Hst. 13: 13.24 Fig.13.35 

Preparation  See case studies at Blackboard.  Lecture    10.30‐11.30 hour Title    Recognition between self and non‐self: the start of a T cell response Instructor  Dr. T. van Hall (Dept. of Oncology) Goals  At  the  moment  a  pathogen  enters  our  body,  they  are  detected  by  ‘antigen‐

presenting  cells’  (APC)  that are  spread around  in all our  tissues. These cells of  the innate  immune  system  try  to  eradicate  the  micro‐organisms.  In  addition,  the dendritic cells, as specialized APC, generate fragments of the proteins derived from the intruders en present these partial proteins on HLA class I and II molecules at their cell surface. This is the start of a T cell response 

Literature  Parham Hst. 5: 5.7‐5.15 5.17 Fig. 5.13‐5.14, 5.20, 5.23, 5.25. Hst. 8: 8.13‐8.18 Fig. 8.1, 8.27, 8.34, 8.37; Hst. 13: 13.24 Fig.13.35 

Self‐study  11.30 – 15.30 hour Prepare case studies and questions for the workgroup, posted on Blackboard. 

 Work group   15.30 – 17.30 hour Instructors  Dr. V. Bekker MD; Dr. R. Bredius MD (Dept. of Paediatrics); Dr. H.H. Smits (Dept. of 

Parasitology)  Test element  Formative (pass/fail)                 

Page 27: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

23 

 

Information Workgroup  In the workgroup primary immunodeficiencies (PID) cases will be discussed with clinicians. The case histories and the immunological introduction can be found on blackboard. Preparation of the workgroup is essential. Use sources such as Up to Date and Parham for preparation of the workgroup.   For each case the following questions need to be addressed: 

1. Immunological background Which immunodeficiency is present in this patient?  Explain what part of the immune system is causing this disease?  

 2. Clinical picture 

What kind of problems can be encountered in patients with this deficiency and why is that? What is the typical disease presentation and what complications can be expected? 

 3. Diagnosis 

How is the disease diagnosed and what is the differential diagnosis?  

4. Management How is the disease managed and treated, and what preventive measures are helpful? 

    

Page 28: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

24 

 

Friday 5 September Theme:   Introduction to diagnosis of immune disorders  Self‐study  8.30‐10.00 hour 

Prepare laboratory visit 

 Laboratories visit 10.00 – 11.30 hour Goals   The  students will be  split  into 6 groups of max. 6  students. Each group will get an 

introduction  to  a  dedicated  set  of  laboratory  techniques  which  form  a  central element  to  diagnose  patients  with  various  immune  disorders.  These  include immunoglobulin and complement analysis, blood group typing, immune cell numbers and phenotyping and cytokine production. The technique will be demonstrated and the principle of  the  test  system will be explained. The expected  range of a normal test  result will  be  detailed  and what  deviations  can  be  expected with  respective immune disorders. The  laboratory visit will be ended by an  introduction  lecture on diagnosis reports.  

Preparation  Details on the respective labs, lab protocols and range of normal values can be found on Blackboard. 

 Lecture   11.30 – 12.30 hour Title    Clinical immunology diagnosis reports Instructor  Dr. M. van Tol (Dept. of Paediatrics) Goals   Introduction  to  clinical  immunology  diagnosis  reports.  The  instructions  and 

guidelines  for  the diagnosis  report are explained by  some examples  from  the daily practise. 

 Free  12.30‐17.00 hour 

Inauguration of the student societies.  

   

Page 29: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

25 

 

Monday 8 September Theme:   T cell‐mediated (auto‐immune) inflammation   Self‐study  8.30‐9.30 hour 

Prepare case studies and lectures of this morning 

 Case study   9.30 – 10.30 hour Title  Auto‐immune and auto‐inflammatory diseases Instructor  Dr. P. Hissink Muller MD (Dept. of Paediatrics) Goals  Case  report  on  (juvenile) RA patient  and  anti‐TNF  therapy  and  auto  inflammatory 

diseases will be presented Preparation  See case studies at Blackboard.  Lecture    10.30‐11.30 hour Title    Adaptive immunity and RA: how do they connect? Instructor  Prof dr. R. Toes (Dept. of Rheumatology) Goals  Many  targeted  therapies  employing  biologicals  used  in  the  treatment  of  patients 

with rheumatic disease are directed against molecules that play a dedicated role  in the  induction  or  propagation  of  immune  responses.  In  the  context  of  this presentation,  the  function  of‐  and  place  in  the  immune  system  of  several  of  the molecules targeted by different biologicals will be discussed  in relation to their role in  the  immune  response against  invading pathogens as well as  in  relation  to auto‐immunity.  

 Self‐study  11.30 – 13.30 hour Prepare oral presentation on the lab visits according to the following guidelines: 1. Prepare a presentation of 10‐15 min and include appropriate images 2. Explain the application of the diagnostic test (medical conditions) 3. Explain the principle of the diagnostic test  4. Show a typical test result (including the range of a ‘normal’ response) 5. Explain how these results should be interpreted  Oral presentations on lab visits 13.30 – 15.00 hour Instructor  Dr. R. Bredius MD, Dr. M. van Tol  (Dept. of Paediatrics), Dr. H.H. Smits  (Dept. of 

Parasitology) Goals   Students explain each other on the different techniques they have been  introduced 

to during  the  lab visit  (5 September 2014) and  the application of  this  technique  to diagnose various immune disorders. 

Test element  Formative (pass/fail)  Self‐study  15.00 – 17.00 hour             

Page 30: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

26 

 

Informatio Diagnosis report:  Case information and aim of laboratory test When seeing a patient for the first time in the (outpatient)clinic, a physician will make an  inventory of the clinical history of the patient in particular and his/her family in general, and perform physical examination.  Also  utilizing  information  from  the  refering  centre,  which  may  include  results  of previously performed  laboratory  tests,  the physician will make a differential diagnosis and a work plan  based  on  professional  knowledge,  experience  and  “some  gut  feeling”.  Part  of  this  plan will usually be  to  send patient material  to a general and/or a more  specialized  laboratory  in order  to document  the actual clinical  status and  to explore  the  likelihood of presence of a clinical disorder that is high on the list of differential diagnosis. Delivery of the patient material to the  laboratory will be accompanied by a specified question, e.g., perform test A or B, which are usually tests routinely performed in the  laboratory. In an ideal setting, the physician  is posing an additional question or  is  indicating some key observations  leading to the work plan. For an optimal interpretations of laboratory findings, the laboratory specialist should take notice of the question(s) and indications formulated.  Diagnosis report: Step 1:  Shortly summarize the issues arising from previous clinical and laboratory investigations that  are  considered  most  relevant  to  interprete  the  data  obtained  from  the  laboratory  tests  to  be performed.   Laboratory tests Tests asked  for by the physician will be executed  in the  laboratory.  It  is always  important to check whether the material sent  in for analysis has been witdrawn and delivered  in a proper way, related to the techniques that have te be performed. If not,  investigation might be useless, because results can not be trusted. The physician should be informed immediately when this situation occurs. Tests will be performed under GLP conditions, implying amongst others that the used apparatus and other lab devices have been validated and that applied reagents are used under validated conditions.  The numerical  results of  the  tests are, especially  in  the pediatric setting, compared with  ranges of normal  values  obtained  by  performing  the  same  tests  on  material  obtained  from  healthy  age‐matched  controls.  Quantitative  data  measured  below  the  sensitivity  threshold  of  the  test  are reported as being below that threshold (which not neccesarily means that the value is zero).  The tests and resulting data are controlled, results are compared with the age‐dependent range of normal values and  interpreted by experienced  lab technicians/staff. Finally, the data are authorized by  a  person  familiar with  the  tests  before  officially  reporting  to  the  physican, who will  have  an overview of all data generated by different labs in EZIS (Electronisch Ziekenhuis Informatie Systeem). Qualitative data are usually described pointing to the characteristics that are addressed by applying a particular qualitative test.    Diagnosis report: Step 2: Make a  list of data generated by the  laboratory tests, put these data  in perspective by also listing  the  corresponding  range  of  age‐matched  normal  values  (if  applicable),  and  indicate which values are outside  this  range  (increased or decreased)  If applicable, shortly describe  the  resuls of a qualitative test.  Interpretation and conclusions The most difficult, but also most  challenging and  certainly most  relevant,  task  is  to  interprete  the new data  resulting  from  the  tests  in  the  context of  the questions posed by  the physician and  the already  known  findings  from  previous  laboratory  investigations  and  clinical  observations  and examinations. To  this end,  it  is essential  to have  some  knowledge of  the area of  immune  related disorders possibly involved. 

Page 31: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

27 

 

 Diagnosis report: Step 3: Interprete the results of the tests in a way relevant to the physician. This means that you will point to parts of the data supporting or dismissing the questions/suggestions raised by the physician and  shortly  give arguments  for  your  conclusion.  In addtion,  it  is  important  to address  unexpected results because these may lead to new insights and contribute to reach a diagnosis.  And next? The conclusions from the tests, may give rise to a change of insights leading to explore an alternative from  the differential diagnosis  list constructed by  the physician. Alternatively,  the conclusions may lead to a proposal to perform additional tests to investigate more in depth the clues arising from the results of the performed tests. Also, you may conclude that the test results are (in)conclusive.   Diagnosis report:       Step 4: Based on your  interpretation and conclusions, you decide whether additional  investigations are required. Motivate your decision and, if you consider further diagnostic tests or research useful or essential, put  forward  your  suggestion  regarding  the  test(s)  to be performed and  the  reason why. Indicate the nature of the material (blood, plasma,serum,  urine, saliva, bone marrow, biopsy, others) that  is  required  to  execute  the  investigations.  If  you  consider  the  results of  the performed  test  (s) conclusive,  and if relevant, advise an appropriate therapy to the physician. If you consider the results inconclusive, give an advice how to proceed.      Diagnosis report instructions:  Prepare  Diagnosis  report  on  clinical  cases  provided  on  Blackboard  according  to  the  instructions above which are summarized as follows: 1. Summarize  the most  important  laboratory results  (raw data) of  the requested  tests. Point out 

both remarkable, unexpected data and the results relevant for specific clinical question.  2. Summarize the clinical  information (relevant history taking/ physical examination and/or other 

diagnostic test results) in no more than two sentences. Make up your differential diagnosis and estimate  the pre‐test probability  (highly  suspected,  suspected, not  suspected)  for  the  specific disease tested for.  

3. Combine  the  clinical  information  with  the  laboratory  data  and  estimate  the  post‐test probability. Use estimates of the test sensitivity and the specificity in order to estimate the risk of false positive and false negative test results. Take  into account the type of specimen, timing of  sampling, and  if appropriate,  sample handling/transport conditions  that may have affected the test result.  

4. Clearly formulate your conclusion / interpretation of the data relevant for the clinician.  5. If relevant, add a suggestion  for additional diagnostic testing  (if appropriate,  list your updated 

differential diagnosis, and/or follow‐up samples). If relevant, advise the optimal specimen (e.g. serology, biopsy, etc) and/or timing of sampling.  

6. Advise an appropriate therapy, if relevant.   

Test element  Formative (pass/fail)  

   

Page 32: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

28 

 

Tuesday 9 September Theme:   Macrophage activation and cytotoxicity  Self‐study  8.30‐9.30 hour 

Prepare case studies and lectures of this morning 

 Case study   9.30 – 10.30 hour Title  Case report of patient with hemophagocytosis Instructor  Dr. A. Lankester MD / Dr. R. Bredius MD (Dept. of Paediatrics) Goals  Various  immune  defects  lead  to  susceptibility  of  patients  to  a  syndrome  called 

hemophagocytosis (HLH). HLH  is a severe  inflammatory response to a trigger, often an  infection  leading  to  macrophage  activation  and  cytopenias  due  to hemophagocytosis. A defect  in cytotoxicity   and clearance of  infections causes  this inflammatory  response.  Examples  of  these  defects will  be  presented,  i.e.  X‐linked lymphoproliferative  syndrome,  Hemophagocytic  lymphohistiocytosis,  Chediak‐Higashi Syndrome. 

Literature  Parham Hst 2: 2.21, Fig 2.47. 2.4 Preparation  See case studies at Blackboard.  Lecture    10.30‐11.30 hour Title    Mendellian susceptibility for mycobacterial infections Instructor  Dr. E. van de Vosse (Dept. Of Infectious Disease) Goals   Non‐tuberculous,  environmental  mycobacteria  do  not  cause  disease  in 

immunocompetent  individuals,  while  these  can  cause  severe,  life‐threatening infections in people with Mendelian susceptibility to mycobacterial disease (MSMD). In  contrast  to  susceptibility  to M.  tuberculosis, which  is  due  to  a  combination  of many  genetic  and  environmental  factors,  MSMD  is  a  primary  immunodeficiency caused by heritable monogenic mutations. Several MSMD cases will be presented as well as the genes and pathways involved. 

Preparation  See case studies at Blackboard.  Self‐study  11.30 – 17.00 hour 

Continue on Diagnosis report on clinical cases provided on Blackboard.  

   

Page 33: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

29 

 

Wednesday 10 September  09.30    DEADLINE Diagnosis report (formative test) 

 Theme:   Inflammation and tolerance in the gut  Self‐study  8.30‐9.30 hour 

Prepare case studies and lectures of this morning 

 Case study   9.30 – 10.30 hour Title  Inflammatory bowel disease Instructor  Dr. L. Mearin MD/ Dr. J. Schweizer MD (Dept. of Paediatrics) Goals  Case presentation on colitis ulcerosa and Crohn's disease. Literature  Parham Hst. 12: 12.1, Fig. 12.2; Hst. 9: 9.4, 9.9, 9.11‐9.16, 9.20 Fig. 9.9, 9.22‐9.25 Preparation  See case studies at Blackboard.  Lecture    10.30‐11.30 hour Title    Celiac disease: sandwiched between adaptive and innate immunity Instructor  Prof. dr. F. Koning  (Dept. of Immunohematology) Goals   Celiac  disease  is  caused  by  an  uncontrolled  immune  reaction  against  the  dietary 

gluten  proteins  present  in wheat,  barley  and  rye.  The  disease  has  a  strong  HLA‐association, virtually all patients are either HLA‐DQ2 and/or HLA‐DQ8 positive, which is explained by the observation that these HLA‐molecules can bind (modified) gluten‐derived  peptides  and  trigger  adaptive  CD4  T  cell  responses  in  the  lamina  propria.  Concomitantly,  innate  immune responses  in the epithelium contribute to the tissue remodelling  and  cause epithelia  cell damage. During  the  seminar  I will discuss  the nature and molecular basis  for  the  induction of  the deleterious  immune  responses and how cross‐talk between the lamina propria and epithelial compartment results in disease pathogenesis. 

Literature  Parham Hst. 12: 12.1, Fig. 12.2;   Dariusz Stepniak and Frits Koning. Celiac Disease: sandwiched between innate and adaptive immunity. Human Immunology 67: 460‐468 (2006) 

 Self‐study  11.30 – 15.30 hour 

Prepare case studies and questions for the workgroup, posted on Blackboard.  Work group   15.30 – 17.30 hour Instructors  Dr. J. Schweizer MD; Dr. R. Bredius MD (Dept. of Paediatrics); Dr. H.H. Smits (Dept. 

of Parasitology)  Test element  Formative (pass/fail)           

Page 34: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

30 

 

Information Workgroup  In the workgroup primary immunodeficiencies (PID) cases will be discussed with clinicians. The case histories and the immunological introduction can be found on blackboard. Preparation of the workgroup is essential. Use sources such as Up to Date and Parham for preparation of the workgroup.   For each case the following questions need to be addressed: 

1. Immunological background Which immunodeficiency is present in this patient?  Explain what part of the immune system is causing this disease?  

 2. Clinical picture 

What kind of problems can be encountered in patients with this deficiency and why is that? What is the typical disease presentation and what complications can be expected? 

 3. Diagnosis 

How is the disease diagnosed and what is the differential diagnosis?  

4. Management How is the disease managed and treated, and what preventive measures are helpful? 

  Thursday 11 September Self‐study  8.30‐17.00 hour 

Prepare written exam; Example questions are posted at Blackboard.  

Friday 12 September Self‐study  8.30‐17.00 hour 

Prepare written exam; Example questions are posted at Blackboard.  Written exam   13.30 ‐15.30 hour Test element  Summative (10% of final mark)    

Page 35: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

31 

 

 

Time Activity Title Teacher Material

8.30 – 8.45 LectureIntroduction to the module 

immune‐mediated diseasesDr. H.H. Smits

8.45 – 10.30 LectureGeneral overview of the immune 

systemProf dr. P.S. Hiemstra

Parham: Hst. 1: 1.4‐

1.6, 1.7 Fig. 1.7‐

1.12. Hst. 3: 

Complete, 

including all 

figures

Parham Hst. 2: 2.2, 

2.4. 2.5, 2.13, 2.14 

Fig: 2.5, 2.9, 2.10, 

2.27, 2.33 

Case studies: see 

blackboard

11.30 – 12.30 Lecture Innate immunity and PRR Dr. P. Nibbering

Parham Hst. 2: 

2.10, 2.11, 2.12 Fig 

2.19, 2.24

13:30‐17:30 Self studySee case studies and quizzes at 

Blackboard

8:30‐9:30 Self studyPrepare case studies and lectures 

of this morning

Parham Hst. 5: 5.2‐

5.4, Fig. 5.1, 5.5. 

Hst. 8: Fig. 8.37

Case studies: see 

blackboard

10.30‐11.30 Lecture Role of B cells in infections Dr. M.C. van Zelm

Parham Hst. 4: 4.8‐

4.16 Fig. 4.2, 4.5, 

4.17, 4.20, 4.30, 

4.32

11.30‐12.30 Self study Written case studies

13:30‐17:0 Self studySee case studies and quizzes at 

Blackboard

8:30‐9:30 Self studyPrepare case studies and lectures 

of this morning

Parham Hst. 5: 5.7‐

5.15 5.17 Fig. 5.13‐

5.14, 5.20, 5.23, 

5.25. Hst. 8: 8.13‐

8.18 Fig. 8.1, 8.27, 

8.34, 8.37; Hst. 13: 

13.24 Fig.13.35

Case studies: see 

blackboard

10.30‐11.30 LectureDCs in Ag presentation/T cell 

activationDr. T. van Hall

Parham Hst. 5: 5.7‐

5.15 5.17 Fig. 5.13‐

5.14, 5.20, 5.23, 

5.25. Hst. 8: 8.13‐

8.18 Fig. 8.1, 8.27, 

8.34, 8.37; Hst. 13: 

13.24 Fig.13.35

11:30‐12:30 Self‐study Written case studies

13:30‐15:30 self study Prepare work group

15.30 – 17.30 Work group Case reports and questionsDr. V. Bekker, Dr. R. Bredius, 

Dr. H.H. Smits 

Prepare case

studies and

questions, posted

on Blackboard

8:30‐9:30 Self study Prepare laboratory visit

10:00‐11:30 LaboratoriesIntroduction to a dedicated set of 

laboratory techniquesSee Blackboard

11.30–12.30 LectureClinical immunology diagnosis 

reportsDr. M. van Tol

12:30‐17:30 FreeInauguration of the student 

societies

Monday

01‐sep‐14

Free: Opening of the academic year

Tuesday

Wednesday

02‐sep‐14

10.30‐11.30 Case study Deficiencies in innate immunity

03‐sep‐14

Dr. V. Bekker

9.30‐10.30 Case studyDeficiencies of the adaptive 

immune system

Dr. A. Lankester / Dr. R. 

Bredius

Friday

05‐sep‐14

Thursday

04‐sep‐14

9.30‐10.30 Case study heamolytic disease Dr. E. Loprione

Page 36: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

32 

 

 

Time Activity Title Teacher Material

8:30‐9:30 Self studyPrepare case studies and lectures 

of this morning

9.30 – 10.30 Case studyAuto‐immune and auto‐

inflammatory diseasesDr. P. Hissink Muller

Case studies: see 

blackboard

10.30‐11.30 LectureAdaptive immunity and RA: how do 

they connect?Prof dr. R. Toes

11.30‐12:30 Self studyPrepare oral presentation on the 

lab visits

13.30 – 15.30 Oral presentations Oral presentations  on lab visitsGuidelines on 

Blackboard

15:30‐17:30 Self study Prepare Diagnosis  report

8:30‐9:30 Self studyPrepare case studies and lectures 

of this morning

Parham Hst 2:

2.21, Fig 2.47. 2.4

Case studies: see 

blackboard

10.30‐11.30 LectureMendelian susceptibility for 

mycobacterial infectionsDr. E. van de Vosse

Case studies: see 

blackboard

11:30‐17:30 Self‐study Prepare Diagnosis  report

8:30‐9:30 Self study Finalize Diagnosis  report

Parham Hst. 12: 

12.1, Fig. 12.2; Hst. 

9: 9.4, 9.9, 9.11‐

9.16, 9.20 Fig. 9.9, 

9.22‐9.25

Case studies: see 

blackboard

Parham Hst. 12: 

12.1, Fig. 12.2

Dariusz Stepniak 

and Frits Koning. 

Celiac Disease: 

sandwiched 

between innate 

and adaptive 

immunity. Human 

Immunology 67: 

460‐468 (2006)

11:30‐15:30 Self‐studyPrepare case studies and 

questions for the workgroup

15.30 – 17.30 Work group Case reports and questionsDr. V. Bekker, Dr. R. Bredius, 

Dr. H.H. Smits 

Prepare case 

studies and 

questions, posted 

on Blackboard

Prepare written exam

Example questions  are posted at 

Blackboard

Prepare written exam

Example questions  are posted at 

Blackboard

13:30‐15:30 Written exam

Monday

08‐sep‐14

Tuesday

09‐sep‐14

9.30 – 10.30 Case study Patient with hemophagocytosisDr. A. Lankester / Dr. R. 

Bredius

Wednesday

10‐sep‐14

9.30 – 10.30 Case study Inflammatory bowel disease Dr. L. Mearin / Dr. J. Schweizer

10.30‐11.30 Lecture

Celiac disease: sandwiched 

between adaptive and innate 

immunity

Prof. dr. F. Koning

Thursday

11‐sep‐14

8:30‐17:30 Self study

Friday

12‐sep‐14

8:30‐13:30 Self study

Page 37: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

33 

 

Diagnostics in immunological disorders 

 

Coordinator(s):  Dr. J.A. Bakker (AKCL), Dr. B.E.P.B Ballieux (AKCL) Other teachers involved:  Dr. C.M. Cobbaert (AKCL), Dr. M.D.J. van Tol (Paediatrics) 

                                                                                                                                                                                               

Background  

The  clinical  laboratory  plays  an  essential  role  in  the  diagnostics  and  follow‐up  of    immunological diseases. An  expanding  number  of  (validated)  laboratory  test  and  techniques  provide  results  and interpretative comments to the clinicians demanding these tests.  The aim of  this week  is  to get  insight  in  the  role of  the  laboratory  scientist  in  the chain of clinical decision making. First a general overview of laboratory diagnostics will be presented, with emphasis on aspects of quality, methodology and traceability of the methods and the analytes. Specific aspects of laboratory methods in immunology will be the topic of a second lecture, where remaining lectures will    focus on  laboratory diagnostics of  immunologic diseases, both cellular and humoral  immunity will  be  highlighted  in  this  respect.  Laboratory  diagnostics  for  rheumatology,  allergic  disease, vasculitis, neuro‐immunological disease, haematological diseases and others will be presented.   In this week, we will start with the preparation of the written report, which will be finalized in week 8. From four clinical disciplines, a casus will be presented to the students (MG, SLE, Allergy, a‐Hus). Each student will receive a specific student case and during week 3‐7, the knowledge on the specific case will be intensified on a diverse range of aspects including taking a patient’s history, performing literature  search,  knowledge  of  diagnostic  methods,  treatment  options  etc.  During  this  week, students will learn more about diagnostic tests from their specific casus during the laboratory visits. Week 8 is completely dedicated to write this individual report. 

 After receiving the patient case in this week, groups of students with the same case prepare a short oral  presentation  about  the  symptoms  of  the  disease,  the  underlying  immunological mechanisms that cause the symptoms, and the diagnostics tools used to establish the disorder. Feedback will be provided by the corresponding clinician and will be used to prepare the final report.                  

Page 38: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

34 

 

Case reports:  Monday 15 September    9.00‐10 

Instructor:  All mentors involved in guiding students in this assignment 

Goal:  During this presentation the mentors/tutors will present the patient case. Students will be divided into groups ( 4 groups of 3) and by the end of the week the group will give a first overview of the case. The final INDIVIDUAL report must be handed in at Friday 17th of October. 

Lecture   Monday 15 September    10:15‐12:15                       Instructor:  Dr. C.M. Cobbaert, Clinical chemist                                               Title:    Evidence based use of medical tests in laboratory medicine  

Goal:   Understanding  the  selection,  utilization  and  interpretation  of medical  (diagnostic) tests and the role of laboratory medicine 

 In  order  to  justify  the  use  of  medical  tests  in  clinical  practice,  regulators  and healthcare payers are  increasingly demanding evidence that medical tests  improve  patient  outcome.  Young medical  doctors  should  be  aware  about  the movement towards evidence based  test utilization of medical  tests  in  this era of high demand and decreasing healthcare budgets. Medical tests should only be used if knowing the test  result  relates  to  better  patient  outcome  (consequentialism).  To  that  end, medical doctors and medical students should be aware of the drivers behind proper medical test selection, utilization and interpretation.  

Frameworks  have  been  developed  encompassing  all  essential  elements  for evaluating added value and clinical usefulness of medical  tests,  such as  the one of Horvath AR et al. [1]. Firstly, the analytical  performance of medical tests (specificity, analytical sensitivity, linearity, reproducibility, …) has to be aligned with the purpose (diagnosis, follow up, prognosis or risk classification) and role of the medical test  in the  specific  clinical  pathway.  Secondly,  the  clinical  performance  of medical  tests needs to be established in terms of sensitivity, specificity, predictive value, reference values or medical decision  limits, gender‐,  race‐ or age‐dependence, ….,  taking  into account the intended use. Thirdly, the  clinical utility and incremental added value of the medical test for patient care should be clarified. Fourthly, if introduced in clinical practice,  the medical  test  should be  cost‐effective,  i.e.  it  should be able  to  reduce expensive or  invasive  testing.  If  relevant, consideration should also be given  to  the fact whether the increase in quality adjusted life years (QALY) justifies the increased cost related to the medical test. Finally, the general impact of introducing a medical test should be regarded. The mere availability of a medical test may put  individuals under psychological pressure to do this test, individually or by peer.  

The  cyclical  framework  for  test  evaluation  [1]  emphasizes  the  central  role  of  the medical  test  in  the  clinical  pathway,  the  interdependency  of  the  different components,  and  that  clinical  effectiveness  data  should  be  fed  back  to  refine analytical and clinical performance of tests to achieve improved outcomes. 

 Preparation:  To extend your knowledge  in order  to understand and appreciate  this  lecture,  the 

following  educational  papers  from  the  literature  are  advised  for  reading.                        Horvath AR, Lord SJ, StJohn A, Sandberg S, Cobbaert CM, Lorenz S, Monaghan PJ, Verhagen‐Kamerbeek  WD,  Ebert  C,  Bossuyt  PM.  Test  Evaluation  Working  Group  of  the  European Federation of Clinical Chemistry Laboratory Medicine. From biomarkers to medical tests: the changing landscape of test evaluation. Clin Chim Acta. 2014 PMID: 24076255.  

Page 39: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

35 

 

Lecture   Tuesday 16 September    09:00‐11:00                       Instructor:  Dr. B.E.P. Ballieux                              Title:    Immunoassays beyond immunology. Assay characteristics and quality issues 

Goal:  From the publication of the first radioimmunoassay in 1960 the use of immunoassays has rapidly expanded in clinical immunology and clinical chemistry. These techniques enabled specific analysis of proteins and low molecular weight hormones in the nano‐ and pico‐molar range. Further improvements, non‐radioactive techniques, the introduction of monoclonal antibodies in the 80’s and automation have resulted in robust assays with analytical variations close to those of conventional clinical chemistry assays. Despite their overall sensitivity and specificity, antigen polymorphism, antigen degradation and cross‐reactivity due to structural similarity with the analyte have hampered the use of immunoassays in certain applications. Furthermore circulating immune complexes, heterophilic antibodies and antigen excess create challenges in assay development and laboratory professionals have an educating role is clarifying these caveats to their clinical staff. Comparability of assays between assay developers is one of the current challenges in clinical chemistry and immunology. Worldwide standardisation of immunoassays is guided by working groups of the international societies for clinical chemistry, immunology and endocrinology. For this purpose new chromatography‐mass spectrometry reference methods are being developed in combination with international reference preparations. Where those are not available harmonisation of assays is being pursued. 

 Preparation:  To refresh and/or extend you knowledge in order to understand and appreciate this 

lecture, the following educational papers from the literature are advised for reading. 

Zegers  I  and  Schimmel H.  Clinical  Chemistry  2014.  To Harmonize  and  Standardize: Making Measurement Results Comparable   

Miller WG  et  al.  Clinical  Chemistry  2011.  Roadmap  for  Harmonization  of  Clinical Laboratory Measurement Procedures            

Spencer  C1,  Petrovic  I,  Fatemi  S.  JCEM  2011.  Current  thyroglobulin  autoantibody (TgAb) assays often fail to detect interfering TgAb that can result in the reporting of falsely low/undetectable serum Tg IMA values for patients with differentiated thyroid cancer.  

            

Page 40: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

36 

 

Lecture   Wednesday 17 September   09:00‐11:00                       Instructor:  Dr. J.A. Bakker                                                             Title:    Laboratory diagnostics in immunological disease  

Goal:   Diseases in which the immune system is involved are clinically heterogeneous, presenting as a systemic disease, affecting several organs, or restricted to a specific site. Laboratory diagnostics are often required to support a clinical diagnosis.   

  The scope of the immunological laboratory is the detection and classification of diseases with involvement of  the immune system: detection of autoantibodies in the case of systemic diseases like rheumatoid arthritis (RA), scleroderma , systemic lupus erythematosus (SLE) and vasculitis.  Antibodies against tissue antigens are responsible for coeliac disease, a disease which is aggravated by the consumption of gluten from the diet. Classification and quantification of M‐proteins in serum is used to detect patients with multiple myeloma . Complement activation is often the case in immunological disease, measurement of complement factors and functionality of the complement activation pathways are laboratory tools to detect aberrant complement consumption. Allergic disease is classified by the detection of antibodies against (classes of) allergens, present in our environment or in food.  

  Clinical cases will be used to illustrate the use of the different laboratory techniques for the detection and classification of immunological diseases.  

 Preparation:   To refresh and/or extend you knowledge in order to understand and appreciate this 

lecture, the following educational papers from the literature are advised for reading. 

Vavricka S, R, Burri E, Beglinger C, Degen L, Manz M, Serum Protein Electrophoresis: An Underused but Very Useful Test. Digestion 2009;79:203‐210 

Elio Tonutti, Nicola Bizzaro, Diagnosis and classification of celiac disease and gluten sensitivity, Autoimmunity Reviews, Volume 13, Issues 4–5, Pages 472‐476 

Robert G. Hamilton, Clinical laboratory assessment of immediate‐type hypersensitivity, Journal of Allergy and Clinical Immunology, Volume 125, Issue 2, Supplement 2, Pages S284‐S296  

Mahler M, Meroni PL, Bossuyt X, Fritzler MJ. Current concepts and future directions for the assessment of autoantibodies to cellular antigens referred to as anti‐nuclear antibodies.J Immunol Res. 2014;2014:315179. doi: 10.1155/2014/315179. Epub 2014 Apr 27.  

Nilsson B, Ekdahl KN. Complement diagnostics: concepts, indications, and practical guidelines. Clin Dev Immunol. 2012;2012:962702. doi: 10.1155/2012/962702. Epub 2012 Nov12 

         

Page 41: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

37 

 

Lecture   Thursday 18 September   9.00‐11.00                       Instructor:  Dr. M.J.D. van Tol, Dept. of Pediatrics                                                                                              Title:    Lymphocyte characterisation in immunological diagnostics                              

Goal:  Not  surprisingly,  phenotypic  and  functional  characterisation  of  lymphocytes  is  a central part in the diagnosis of patients suspected of disorders affecting the immune system. In addition, investigation of lymphocytes (and other cells involved in immune defence) contributes to the understanding of the aetiology of  immune diseases and the monitoring of the effect of therapy. 

Techniques applied  to study  lymphocyte phenotype and  function will be presented and  their  application  in  the  diagnosis  of  primary  immunodeficiencies  (PID) will  be illustrated  in  this  lecture.  Emphasis  will  be  laid  on  flow  cytometry  (also  called fluorescence  activated  cell  sorting,  FACS)  enabling  characterisation of  lymphocytes with respect to their lineage, differentiation stage and activation state, based on the cell  surface  expression  of  certain  proteins.  After  stimulation  of  cells  in  culture followed by  intra‐ or extracellular  staining, FACS  is  instrumental  in  investigation of the  function of  cells,  e.g.,  their  capability  to produce  and  secrete  soluble proteins such  as  cytokines,  to  express  activation  markers,  and  to  proliferate.    Also,  the principle  of  lymphocyte  proliferation  tests  as  measured  by  3H‐thymidine incorporation will shortly be addressed. 

Next,  the  strategy  applied  to  diagnose  primary  immunodeficiencies  (PID)  will  be discussed. Signs and symptoms pointing towards PID will be addressed with a focus on  infectious  problems,  because  the  type  of  agent(s)  causing  severe,  recurrent  or atypical infections may give a clue of the distinct pathway of the immune system that is impaired due to a possible genetic defect in a component relevant to that pathway. The role of laboratory techniques like FACS and in vitro lymphocyte proliferation will be  illustrated  in the diagnosis of three PID cases,  i.e., X‐linked agammaglobulinemia (XLA), severe combined immunodeficiency (SCID) and hyper‐IgM syndrome (HIGM).  

Preparation:   To refresh and/or extend you knowledge in order to understand and appreciate this lecture, the following parts of the Parham textbook and educational papers from the literature are advised for reading. 

Parham, The immune system, 3rd edition. Chapter 6: B cell development:  Fig. 6.25 (p. 183) and summary section (p. 182); Chapter 8: T cell subsets and  function: Fig. 8.27  (p. 234) and Th2‐B cell  interaction: Fig. 8.37  (p. 241); Chapter 9: Th2‐B cell  interaction: Fig. 9.9  (p. 255), Production  Ig classes during  life: Fig. 9.24 (p. 268); Chapter 10: T‐cell differentiation: Fig. 10.29 (p. 314). Read as an  introduction  to  inherited  immunodeficiency diseases: Chapter 11, sections 11‐8 (Fig. 11.9), 11‐9, 11‐11 XLA, Fig. 11.11) , 11‐12 (X‐linked hyper IgM) and 11‐15 (only part about SCID). 

 

Driessen and van der Burg. Primary antibody deficiencies. Eur J Pediatrics, 2011; 170: 693‐702.                                                        

Van der Burg and Gennery. The expanding  clinical and  immunological  spectrum of severe combined immunodeficiency. Eur J Pediatrics, 2011; 170: 561‐571.                 

De  Vries  and  Driessen.  Primary  immunodeficiencies  in  children:  a  diagnostic challenge. Eur J Pediatrics, 2011; 170: 169‐177. 

Page 42: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

38 

 

Presentation case  Thursday 19 September   14‐00‐17.00                              Instructor:    Dr. M.J.D. van Tol, Dept. of Pediatrics                                                                                    Goal:      Students will present a first draft/overview of their clinical case  

During this presentation students present the set‐up for their casus to see if they understand which topics must be addressed in the final written report regarding the casus. Students will prepare and present this presentation per group (not individually). Students will gain more information of the specific disease during the upcoming weeks. The final INDIVIDUAL report must be handed in at Friday 17th of October. 

Essential components of the case: 

Introduction of the disease: o Symptoms o Questions for taking patients history o Immunological mechanism behind the disease (needs extra focus!) o Relation between defective immune system and complaints o Differential diagnosis (which symptoms/elements could also be presented in other 

diseases; which tests to use to exclude differential diagnosis) 

Diagnostic tests: o What kind of test(s) is appropriate o What is the principle of the test o Show typical test result (including a “normal response”) o Explain how these results should be interpreted 

Therapeutic plan o What kind of therapy o What is the underlying immunological principle of this therapy o How can you check if the therapy is effective? 

 IMPORTANT:  The idea behind this presentation is that the mentors can give feedback on the set‐

up of the casus which the students present. The emphasis must be on the underlying immunological mechanisms and that the students show that they understand how the diagnostic tests work. However, detailed information about the disease will be provided in the weeks hereafter. 

 Study goals The student can • use basic knowledge on clinical laboratory diagnostics • show  familiarity  with  the  issues  on  quality,  methodology  and  traceability  in  laboratory 

diagnostics • explain  the  techniques  used  in  immunology  and  the  (dis)advantages  of  these  methods,  i.e. 

flowcytometry, ELISA, protein assays, immunohistological techniques (Scholar) • use  laboratory  diagnostics  in  the  clinical  practice  of  Rheumatology,  Allergy,  Haematology, 

Neurology, Nephrology, Paediatrics, and Pulmonology (Medical expert) •  understand the limitations of laboratory diagnostics in resolving complex disease patterns. 

create a diagnostic plan by evaluation of laboratory techniques that could be applied based on a differential  diagnosis  and motivate why  this  technique  is  appropriate  to  be  able  to  diagnose correctly (Medical expert) 

interpret  results  from diagnostic  tests and  subsequently  translate which  immunological defects might underlie the results 

perform  independently  literature  research  based  on  a  specific  patient  case  and  select  three relevant  papers  to  report  the  immunological  defects  and  corresponding  diagnostic  tests  and results of the patient case in detail (Scholar) 

Page 43: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

39 

 

Study materials  Articles will be provided on Blackboard.  • Tietz Textbook  of Clinical Chemistry and Molecular Diagnostics, 5th edition by Carl A. Burtis PhD, 

Edward R. Ashwood MD, David E. Bruns MD. (2011) Saunders ISBN: 978‐1‐4160‐6164‐9 • Roitt's Essential  Immunology,  Includes Desktop Edition, 12th edition Peter  J. Delves,  Seamus  J. 

Martin, Dennis R. Burton, Ivan M. Roitt (2011) Wiley‐Blackwell ISBN: 978‐1‐118‐23287‐3 • Essentials of Clinical  Immunology, 6th Edition Helen Chapel, Mansel Haeney,  Siraj Misbah, Neil 

Snowden (2014) Wiley‐Blackwell ISBN : 978‐1‐118‐48785‐3 • Zegers,  I.,  et  al.  (2013).  "The  Importance  of  Commutability  of  Reference  Materials  Used  as 

Calibrators: The Example of Ceruloplasmin." Clinical Chemistry 59(9): 1322‐1329 • C.G. Fraser Biological Variation: From Principle to Practice  (2001) AACC Press • Ichihara,  K.  "Statistical  considerations  for  harmonization  of  the  global  multicenter  study  on 

reference values." Clinica Chimica Acta(2014) http://dx.doi.org/10.1016/j.cca.2014.01.025 • Senolt,  L.,  et  al.  (2014).  "Laboratory  biomarkers  or  imaging  in  the  diagnostics  of  rheumatoid 

arthritis?" BMC Medicine 12(1): 49 • Steinman,  L.  (2013).  Weighing  In  On  Autoimmune  Disease:  'Hub‐and‐spoke'  T  cell  traffic  in 

autoimmunity. Nature Medicine, 19(2), 139‐141. doi:10.1038/nm.3088 • Anaya,  J.‐M.  (2012).  "Common  mechanisms  of  autoimmune  diseases  (the  autoimmune 

tautology)." Autoimmunity Reviews 11(11): 781‐784  Contact hours:  

Clinicians of the respective discipline (4x) will provide the students with a patient casus  

Lectures Introduction laboratory medicine 

Lectures Laboratory testing in immunological disease 

Laboratory visit 

Short presentations (4x) by groups of maximal 5 students about their specific patient case  Self‐study hours:  

Prepare oral presentation 

Start with the final written report   Evaluation: Short oral presentation in a group about specific patient case, explaining immunological mechanisms 

and diagnostics (p/f), see guidelines below program  

 

 

 

 

 

 

Page 44: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

40 

 

Laboratory visit related to clinical cases: 

Group 1  Laboratory techniques involved in SLE diagnostics and follow‐up  

Indirect immune fluorescence tests and immunoassays are the cornerstones for the detection of 

autoantibodies involved in SLE. These techniques will be demonstrated and the students have to 

perform the analyses (in part) and give an interpretation of the results in relation to the clinical case. 

Group 2 Laboratory techniques in the diagnosis of Myasthenia gravis  

Laboratory diagnosis of MG is based on the detection of certain antibodies. RIA methods will be 

demonstrated and ELISA techniques performed.  

Group 3 Atypical HUS and complement  

Laboratory techniques for complement analyses will be demonstrated and (in part) the students will 

perform the analyses. Interpretation of laboratory results in complement disorders in general and 

aHUS particularly will be discussed. 

Group 4 Allergy: laboratory techniques and pitfalls 

Allergy diagnostics will be performed, both screening assays and detection of specific allergens. The 

interpretation of the results will be discussed in relation to clinical symptoms.  

REMARK:   Standard operating procedures for the different laboratory techniques will be available 

(electronically) at the start of week 3.  

  Guidelines Assignments: 

 Oral presentation casus  • Prepare a presentation of ~20 min and include appropriate images • Explain symptoms of the disease (differential diagnosis?) • Explain immune mechanism behind the disease • Explain the application of the diagnostic test (medical conditions) • Explain the principle of the diagnostic test  • Show a typical test result (including the range of a ‘normal’ response) • Explain how these results should be interpreted • Therapeutic plan  Detailed program and study material: Week 3:  

Page 45: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

41 

 

         

    

Time Activity Title Teacher

9:00‐10:00 Distribution patient case

Distribution and small (10 min) 

presentation of MG, SLE, aHUS, and 

Allergy)

Dr. D. van der Woude / Dr. J. 

de Vries‐Bouwstra, Dr. J.J. 

Plomp, prof. Dr. J.J. 

Verschuuren, Dr. J.G. 

Koopmans, Dr. A. Slats, Dr. O. 

Teng, Dr. A. de Vries

10:15 – 12:15 LectureEvidence bases use of medical 

tests in laboratory scienceDr. C.M. Cobbaert

13:30 – 15:00Group 1: Laboratory visit                    

SLE

 Clinical Chemistry Laboratory / 

Immunology unitDr. J.A.. Bakker

15:00 – 17:30 Self‐study Work on patient case

9:00 – 11:00 Lecture

Immunoassays beyond 

immunology: Assay characteristics 

and quality issues

Dr. B.E.P. Ballieux

13:30 – 15:00Group I1: Laboratory visit:                 

aHUS

 Clinical Chemistry Laboratory / 

Immunology unitDr. J.A.. Bakker

15:00 – 17:30 Self‐study Work on patient case

9:00 – 11:00 LectureLaboratory diagnostics in 

immunological disease IIDr. J.A, Bakker

13:30 – 15:00Group II1: Laboratory visit:                

Allergy

 Clinical Chemistry Laboratory / 

Immunology unitDr. J.A.. Bakker

15:00 – 17:30 Self‐study Work on patient case

9:00‐11:00 Lecture Lymphocyte characterisation in 

immunological diagnostics Dr. M.J.D. van Tol

13:30 – 15:00Group IV: Laboratory visit:                 

MG

 Clinical Chemistry Laboratory / 

Immunology unitDr. J.A.. Bakker

15:00 – 17:30 Self‐study Work on patient case

9:00‐12:00 Self studyPreparation of presentation case

studies

14:00‐14:45 MGProf. dr. J.J.G.M. Verschuuren,  

Dr. J.J. Plomp

14:45‐15:30 SLEDr. D. van der Woude                      

Dr. J. de Vries‐Bouwstra

15:30‐16:15 aHUS Dr. O. Teng, Dr. A. de Vries

16:15‐17:00 AllergyDr. J.G. Koopmans,                           

Dr. A. Slats

Monday

15‐sep‐14

Tuesday

16‐sep‐14

Wednesday

17‐sep‐14

Thursday

18‐sep‐14

Friday

19‐sep‐14

Student presentations

Page 46: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

42 

 

Neuro‐immunology 

 

Clinical coordinator:  Prof. Dr. J.J.G.M. Verschuuren (Neurology) Scientific coordinator:  Dr. J.J. Plomp (Neurology) Other teachers involved:  Dr. U.A. Badrising (Neurology)   Drs. A.F. Lipka (Neurology) 

Dr. E.L.E.M. Bollen (Neurology)   

Background  

Neuroimmunology  is  concerned with  interactions  between  the  immune  system  and  the  nervous system. Disturbances  in  these mechanisms  can  lead  to neurological disease. The  field  is  relatively young;  immune  system  involvement  in many of  the neuroimmunological disorders has only been recognized  for  the  last  few  decades.  It  is  also  a  rapidly  developing  field;  many  aspects  of  the pathogenic  mechanisms  are  nowadays  being  discovered  with  the  aid  of  modern  genetic  and immunological  research methods.  As  a  result,  specific  drug  therapies  are  currently  beginning  to emerge.  However,  in  many  neuroimmunological  disorders  the  underlying  (auto)immune  and neuropathogenic disease mechanisms  are  still poorly understood and  therapies are  insufficient or accompanied by considerable side effects.   For long it was thought that the central nervous system (CNS) was completely protected from entry of  immune  cells,  immune  mediator  molecules  and  antibodies  by  the  blood‐brain  barrier  (BBB). Similarly, nerves  in the peripheral nervous system  (PNS) were  thought to be protected by a blood‐nerve barrier (BNB). Both barriers are mainly formed by the microvascular endothelial cells which are strongly attached  to each other  through  tight  junction molecules, preventing passage of  cells and large molecules from the blood into the neuronal tissue. However, recent findings have changed this view as  it seems that many of the neuroimmunological disorders have an  initial phase  in which the BBB or BNB becomes  injured  and  allows  for  leakage of  immune  factors  into  the nervous  system. Subsequently  neuropathogenic  effects  take  place which  lead  to  the  neurological  symptoms.  The neuromuscular  junction, forming the synaptic contact between a motor axon and a skeletal muscle fibre,  is extra vulnerable  for autoimmune attack as  it  lacks a BNB. The  resulting damage will block neurotransmission and thus lead to muscle weakness.  Myasthenia  Gravis  (MG)  and  Lambert‐Eaton  myasthenic  syndrome  (LEMS)  (Prof.  Dr.  J.J.G.M. Verschuuren) MG  is  an  acquired  autoimmune  disorder  in  which  autoantibodies  attack  crucial  membrane components of  the neuromuscular  junction  (NMJ),  the  synapse which  transmit  impulses  from  the motor  nerve  onto  the  muscle  fibre.  The  resulting  transmission  block  causes  fatigable  muscle weakness.  As  for most  autoimmune  disorders,  the  immuno‐etiology  leading  to  the  loss  of  self‐tolerance  in MG  is poorly understood and  likely  involves  interplay of  (immuno)genetic, epigenetic and  environmental  factors. Most MG  patient  have  antibodies  against  postsynaptic  acetylcholine receptors at the NMJ. Administration of  immunosuppressants and cholinesterase‐inhibitors are the main drug treatments. About 15% of the MG patients have no acetylcholine receptor antibodies. In recent years, antibodies to other NMJ membrane proteins have been shown for an increasing part of these patients. 

LEMS  is  a  rare  disorder,  clinically  distinct  from MG.  There  are  antibodies  against  presynaptic calcium channels at the NMJ, causing block of acetylcholine release. About 50% of LEMS patients has an underlying small‐cell lung cancer. Treatment options are limited. 

Page 47: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

43 

 

 Inclusion‐body myositis (IBM) (Dr. UA Badrising) IBM  is  the most  common acquired muscle disease  in people aged >45 years. There  is progressive muscle weakness  causing  serious disability. Together with dermatomyositis  and polymyositis,  IBM belongs to a group of  idiopathic  inflammatory myopathies, with  inflammatory  infiltrates  in skeletal muscle.  Diagnosis  is made  upon  the  clinical  features  in  combination  with  typical muscle  biopsy features,  including  invasion of non‐necrotic  fibres by mononuclear  cells,  vacuolated muscle  fibres and  intracellular  amyloid  deposits.  Treatment  options  are  very  limited.  Although  IBM  is  less responsive  to  immunomodulatory  therapy  as  compared  to  the  other  forms  of myositis  there  are several  indications  that  the  immune  system  plays  an  important  pathogenic  role.  Very  recently, specific autoantibodies have been found associated, but it is still unknown whether these are causing the disease.  Guillain‐Barré  syndrome  (GBS)  and  chronic  inflammatory  demyelinating  polyneuropathy  (CIDP) (Drs. AF Lipka) GBS  is an acute and potentially  severe neurological disorder, hallmarked by paralysis and  sensory disturbances. Often the disease is preceded by an microbial infection, which most likely triggers the production of anti‐microbial antibodies  that have  the ability  to cross‐react with antigens of motor and  sensory  peripheral  nerves.  Several  types  of  auto‐antibodies  have  been  discovered,  including antibodies against gangliosides, which are neuronal membrane components. The disease  is mostly self‐limiting with rather good recovery, but a  large part of patients needs to be ventilated for some period. Often  there  is demyelinization of nerves. Main  treatments are  the  removal of  IgG  through plasma‐exchange  and  intravenous  administration  of  large  amounts  of  human  immunoglobulins, believed to neutralize the pathogenic antibodies. There is also a chronic variant of the disease, CIDP, which is treated more or less similarly.      Multiple sclerosis (MS) (Dr. E.L.E.M. Bollen) MS is an autoimmune disease characterized by chronic inflammation and demyelination of axons in the CNS  and occasionally  also  the PNS. Clinical presentation  and  course of  the disease  are highly variable.  Common  symptoms  include  numbness,  weakness,  visual  disturbances,  diplopia, coordination and gait disturbances, etc. The majority of patients has a relapsing and remitting course but in a smaller part the symptoms progress. Diagnosis is mainly clinical with the aid of MRI; there is no  laboratory  test. There  is no definite cure  for MS, but  immunomodulatory drugs are often used, including beta‐interferons in certain cases.  Neuromuscular junction (NMJ) laboratory demonstration (Dr. J.J. Plomp) You will visit  in small groups of students our  laboratory  in which function and morphology of NMJs are studied. In this demonstration we will explain to you how we can experimentally analyze NMJs in muscle preparations of experimental animals and muscle biopsies of human patients. The visit will include  hands‐on  practice with micro‐electrode  study  of  the  synaptic  electrophysiological  signals which underlie neurotransmission in the NMJ. Furthermore, you will get the opportunity to observe NMJs under a fluorescence microscope.   Summary program Neuro‐immunology week:  In  this  Neuro‐immunology  course  week  we  will  focus  on  the  symptoms,  diagnosis, (immuno‐)etiology, epidemiology, pathophysiology and current and emerging treatments of several prototypical  neuro‐immunological  disorders.  The  topics  cover  the  most  important  areas  of  the nervous  system: 1) multiple  sclerosis  (MS), a  chronic autoimmune disease of  (mainly)  the CNS, 2) Guillain‐Barré syndrome (GBS) and chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy (CIDP) which are an acute and a chronic variant of PNS autoimmunity, respectively, and 3) myasthenia gravis (MG) 

Page 48: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

44 

 

and  Lambert‐Eaton  myasthenic  syndrome  (LEMS),  autoimmune  disorders  of  the  neuromuscular junction. Besides the CNS and PNS, also skeletal muscle can be the target of autoimmunity. Patients with these types of disease are suffering from muscle weakness and are also diagnosed and treated by  the  neurologist.  In  this  course week we will  also  teach  you  on  an  example  of  such  a muscle disorder, inclusion body myositis (IBM).   The  study  program  for  each  disorder  encompasses  self‐study  of  relevant  literature,  a  patient demonstration, a lecture and a workgroup. There will be visit to the neuromuscular synapse research laboratory. Groups of maximal 5 students will together produce a review‐like report on one of the neuro‐immunological disorder  topics. This has  to be handed  in at  the end of  the week and will be evaluated.  

 Study goals 

 The student can 

diagnose  a  patient  by  taking  a  patient’s  history with  a  patient  suspected  to  suffer  from  an neurological immunological disorder 

determine  the defects of  the  immune  system  that might underlie  the complaints of a patient diagnosed with an neuro‐immunological disorder 

relate the mechanism of disease of a systemic auto‐immune disease to neuronal involvement by understanding the defect immune components related to the disorder 

develop a therapeutic plan based on results from diagnostic tests from week 3 and neurological laboratory tests to confirm a neurological disorder and describe a  laboratory test to check the effect of the intervention. 

perform independently literature research based on a specific patient casus and select relevant review articles  to  report  the  immunological background of  the patient  casus  in detail  for  the report in this week and in week 8   

Study materials  Book: The immune system (Peter Parham) Suggested review article reading (pdf's will be put on Blackboard): 

 Diamond et al. Losing your nerves? Maybe it’s the antibodies. Nat Rev Immunol 2009;9: 449. 

 Kamm and Zettl. Autoimmune disorders affecting both the central and peripheral nervous system. Autoimmun Rev 2012;11:196. 

 Kanda. Biology of the blood–nerve barrier and  its alteration  in  immune mediated neuropathies. J Neurol Neurosurg Psychiatry 2013;84:208. 

  Kieseier  et  al.  Autoimmune  diseases  of  the  peripheral  nervous  system.  Autoimmun  Rev 2012;11:191. 

 Machado et al. Update in inclusion body myositis. Curr Opin Rheumatol 2013;25:763. 

 Muldoon et al. Immunologic privilege in the central nervous system and the blood–brain barrier. J Cereb Blood Flow Metab 2013;33:13. 

 Peltier and Donofrio. Chronic  inflammatory demyelinating polyradiculoneuropathy: from bench to bedside. Semin Neurol 2012;32:187. 

 Selmi et al. A clear look at the neuroimmunology of multiple sclerosis and beyond. Autoimmun Rev 2012;11:159. 

  Titulaer  et  al.  Lancet  Neurol  2011;10:1098.  Lambert‐Eaton myasthenic  syndrome:  from  clinical characteristics to therapeutic strategies. 

Page 49: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

45 

 

  Verschuuren  et  al.  Pathophysiology  of myasthenia  gravis  with  antibodies  to  the  acetylcholine receptor, muscle‐specific kinase and low‐density lipoprotein receptor‐related protein 4. Autoimmun Rev 2013;12:918.   Contact hours:  

Patient demonstration followed by a lecture:   1) MG, LEMS: Prof. dr. J.J.G.M. Verschuuren   2) IBM: Dr. U.A. Badrising   3) MS: Dr. E.L.E.M. Bollen   4) GBS/CIDP: Dr. A.F. Lipka 

Work group   1) MG, LEMS: Prof. dr. J.J.G.M. Verschuuren   2) IBM: Dr. U.A. Badrising   3) MS: Dr. E.L.E.M. Bollen 

4) GBS/CIDP: Dr. A.F. Lipka 

Laboratory visit to the neuromuscular synapse research laboratory: Dr. J.J. Plomp   Self‐study hours:  

Prepare  for  patient  demonstration  and  workgroups  by  reading  about  neuro‐immunological disorders and suggested review articles 

Prepare a review report in groups of maximal 5 students about one neuro‐immunological disease   Evaluation:  

Written report (Passed/Failed), see guidelines below program  Guidelines written report: 

 Review report   

Students with MG casus for the report of week 8 should choose this week another neuro‐immunological disorder 

In groups of max 5 students, one report (900‐1100 words) will be prepared consisting of: o Background disease and symptoms (~200 words) o Diagnosis (~200 words) o Pathophysiology (~200 words) o State of art laboratory research (~200 words) o Treatment (~200 words) o Every student will prepare one chapter and each part is evaluated (passed/failed) 

separately       

Page 50: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

46 

 

Detailed program and study material: Week 4:  

 

Time Activity Title Teacher

9:00‐11:00 Self‐study Prepare topic today (MS)

11:00 ‐11:45 Lecture MS Bollen

11:45 ‐ 12:15 Patient demonstration MS Bollen

12:15 ‐ 13:15 Break

13:15 ‐ 14:30 Workgroup MS Bollen

14:30 ‐ 15:00 Break

15:00 ‐ 16:30 Group 1: Laboratory visit NMJ research laboratory visit Plomp

15:00 ‐ 17:30 Self‐study Work on report/prepare 

tomorrow's topic

9:00‐11:00 Self‐study Prepare topic today (MG and LEMS)

11:00 ‐11:45 Lecture MG and LEMS Verschuuren

11:45 ‐ 12:15 Patient demonstration MG and LEMS Verschuuren

12:15 ‐ 13:15 Break

13:15 ‐ 14:30 Workgroup MG and LEMS Verschuuren

14:30 ‐ 15:00 Break

15:00 ‐ 16:30 Group 2: Laboratory visit NMJ research laboratory visit Plomp

15:00 ‐ 17:30 Self‐study Work on report/prepare 

tomorrow's topic

13:30 ‐ 14:15 Lecture IBM Badrising

14:30 ‐ 15:00  Patient demonstration IBM Badrising

15:00‐16:15 Workgroup IBM Badrising 

16:30‐17:00 Group 3: Laboratory visit   Plomp

9:00‐11:00 Self‐study Prepare topic today (GBS and CIDP)

11:00 ‐11:45 Lecture GBS and CIDP Lipka

11:45 ‐ 12:15 Patient demonstration GBS and CIDP Lipka

12:15 ‐ 13:15 Break

13:15 ‐ 14:30 Workgroup GBS and CIDP Lipka

14:30 ‐ 15:00 Break

15:00 ‐ 16:30 Group 4: Laboratory visit NMJ research laboratory visit Plomp

15:00 ‐ 17:30 Self‐study Work on report/prepare 

tomorrow's topic

9:00‐17:30 Self‐study Prepare report

Thursday

25‐sep‐14

Friday

26‐sep‐14

Monday

22‐sep‐14

Tuesday

23‐sep‐14

Wednesday

24‐sep‐14

Page 51: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

47 

 

2. Rheumatology 

 

Clinical coordinator:  Dr. J.K. de Vries‐Bouwstra (Rheumatology) Scientific coordinator:  Dr. M. Bax (Rheumatology)/Dr. K.L.L. Habets (Rheumatology) Other teachers involved:  Dr. D. van der Woude (Rheumatology)   Prof dr. R.E.M. Toes (Rheumatology)   Dr. F.A. van Gaalen (Rheumatology) 

Prof. dr. T.W.J. Huizinga (Rheumatology))  

Background  

The  field  of  rheumatology  concerns  the  care  of  patients  with  immune‐mediated  chronic inflammatory diseases. As  such,  clinical  rheumatology  composes  an essential part of  the ½ minor clinical  immunology.  The  development  of  new  targeted,  biologic  therapies,  like  TNFα‐  blockers, during  the past decades  resulted  in  enormous  improvement of patients  suffering  from  rheumatic diseases. Development of these drugs is a direct result from increasing knowledge on the cellular and molecular basis of  immune  responses, perfectly demonstrating  the  relevance of knowledge on  the pathophysiologic background of immune mediated diseases.  Summary program Rheumatology week:  During the week that you will visit the department of Rheumatology, four chronic immune mediated diseases with different  immunological backgrounds will be demonstrated and discussed  in detail:1. Rheumatoid  arthritis,  2.  Systemic  Lupus  Erythematosus,  3.  Spondyloarthritis    and  4.  Systemic Sclerosis. Four groups of students will be formed; each group will focus on one of the four diseases during the rest of the week. At the end of the week, you will give a presentation on novel insights in the pathogenetic background of the specific disease and propose a possible novel drug targets based on your knowledge of pathophysiology. As all lectures and presentations will be scheduled with the whole group, you will assemble knowledge on all of the four diseases.   On  the  first  day  lectures  are  scheduled  providing  an  introduction  on  each  of  these  diseases  by experts  in  the  field.  Following  these  presentations,  you will  be  provided with  literature  on  basic pathophysiology  of  the  different  diseases,  as well  as  a  clinical  case  study  describing  the  specific clinical features in relation to the immunologic background. The second day 4 patients suffering from these disease will participate  in a clinical case demonstration. Students will get  the opportunity  to perform medical history taking and  limited physical examination (skin,  joints). Following these case demonstrations  each  group  of  students  will  receive  a  recent  article  on  new  insights  in  the immunological background of  the specific disease. These articles will  form  the cornerstone  for  the final  presentation.  In  addition,  students will  visit  the  rheumatology  laboratory  and  participate  in incubation of the anti‐cyclic citrullinated peptide (ACPA) ELISA.   The third day comprises a clinical round in rheumatology: students will visit the day care department where  patients  with  active  disease  and/  or  limitations  in  everyday  activities  are  treated  by  a multidisciplinary  team  consisting of  a  rheumatologist,  a  specialised nurse,  a physical  therapist,  an occupational therapist and a social worker. Also, students will get the opportunity to perform a joint puncture  on  joint models,  and  nailfold  capillaroscopy will  be  demonstrated  (a  diagnostic  tool  in Raynaud’s phenomenon). After the clinical round, students will visit the laboratory again to read‐out the ACPA test. 

Page 52: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

48 

 

On  the  fourth day,  in  the afternoon, all  students will give a presentation on novel  insights on  the immunologic  background  of  specific  disease  they  focussed  on,  concluding  with  a  proposal  for development of innovative therapy.  Study goals  The student can 

diagnose a patient by performing an anamnesis with a patient suffering from joint pain (Medical expert) 

perform  independently  literature  research  based  on  a  specific  patient  casus  and  select  three relevant papers to report the immunological background of the patient casus in detail. (Academic) 

determine  the  pathogenic mechanism(s)  based  on  literature  research  that might  underlie  the complaints of a patient diagnosed with a rheumatic disease 

relate  the mechanism  of  disease  of  a  systemic  auto‐immune  disease  to  joint  involvement  by understanding the defect immune components related to the disorder 

develop  a  therapeutic plan based on  results  from diagnostic  tests of week 3  and describe  the method to check the effect of the intervention 

 Study materials  

The immune system (Peter Parham) 

Case studies  from  immunology – clinical case studies and disease pathophysiology  (Strober and Gottesman, 2009 (Blackboard) 

RA, SLE, Scleroderma, and SpA; specific chapters from EULAR compendium on rheumatic diseases (Blackboard) 

Case studies in immunology (Geha 2011): RA and SLE (Blackboard) 

Recent published articles (Blackboard)  Contact hours:  

Lectures and distribution recent literature on immunological background of rheumatic diseases 1) RA 

  2) SLE   3) SpA   4) Scleroderma 

Consult demonstration with  four patients suffering  from  four different rheumatic diseases,  final diagnosis after discussion by students with help from clinicians 

Clinical rounds RAZ (Reumatologie ambulante zorg) 

Joint puncture (on joint models) 

Nailfold capillaroscopy 

Laboratory visit detection of auto‐antibodies 

Presentations  of  groups  of  max  5  students  about  one  rheumatic  disease  (RA,  SLE,  SpA, Scleroderma) and new drug  targets prepared with  recent  literature and knowledge obtained  in previous days 

 Self‐study hours:  • Read  Immunological  background  of  all  demonstrated  rheumatic  disorders  (RA,  SLE,  SpA, 

Scleroderma) • Read recent literature break through articles • Prepare a presentation about possible new drug targets for specific rheumatic diseases 

Page 53: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

49 

 

 Evaluation: 

Oral presentation about one rheumatic disease and drug targets in groups of maximal 5 students (p/f), see guidelines below program 

 Guidelines oral presentation: 

 Oral presentation rheumatic disease:  

Students with SLE casus for the report of week 8 should choose this week another rheumatic disease 

In groups of max 5 students, one presentation of ~20 minutes will be prepared consisting of: 

Background disease and symptoms  

Diagnosis 

Immunological background of disease 

State of art laboratory research 

Treatment 

Every student will prepare one part of the presentation and three persons will present while the 

two others will answer the questions in the discussion. Each student is evaluated separately 

(passed/failed) 

                               

Page 54: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

50 

 

Detailed program:  Week 5:  

   

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Time Activity Title Teacher

9:00‐9:30 Lecture Lecture RA Prof. dr R.E.M. Toes

9:30‐10:00 Lecture Lecture SLE Dr. D. van der Woude

10:00‐10:30 Lecture Lecture SpA Dr. F.A. van Gaalen

10:30‐11:00 Lecture Lecture Scleroderma Dr. J.K. de Vries‐Bouwstra

11:00‐11:15 Distribution review articles

11:00‐17:00 Self‐studySelf‐study immunology behind 

arthritic diseases

9:00:11.00 Patient demonstrations

Interactive Consult 

demonstrations 4 patients with 

different diseases

Dr. D. van der Woude and dr. 

J.K. de Vries‐Bouwstra

11:00‐11:15 Distribution article for case study

11:00‐13:00 Laboratory visit part I

Introduction on commonly used 

tests  for autoantibodies  + 

incubation CCP ELISA

dr. L.A. Trouw

13:00‐17:00 Self‐study Read literature and prepare 

presentation

9:00‐12:00 Clinical roundMultidisciplinary day care, joint

puncture, nailfold capillaroscopy 

Dr. D. Van der Woude/                     

Dr J. de Vries‐Bouwstra

12:00‐13:00 Break

13:00‐14:00 Laboratory visit part II Read‐out and analyse CCP ELISA Dr. L.A. Trouw

14:00‐17:00 Self‐study Read literature and prepare 

presentation

9:00‐13:00 Self‐study Read literature and prepare

presentation

13:00‐13:30 Student presentation RA Prof dr. R.E.M. Toes

13:30‐14:00 Student presentation SLE Dr. D. van der Woude

14:00‐14:30 Break

14:30‐15:00 Student presentation SpA Dr. F.A. van Gaalen

15:00‐15:30 Student presentation Scleroderma Dr. J.K. de Vries‐Bouwstra

15:30‐16:00 Evaluation of the presentations all mentors

Thursday

02‐Oct‐2014

Student presentations

Friday

03‐Oct‐2014

Free day: Leids ontzet

Monday

29‐sep‐14

Tuesday

30‐sep‐14

Wednesday

01‐Oct‐2014

Page 55: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

51 

 

3. Pulmonology 

 

Clinical coordinator:  Prof. dr. C. Taube Scientific coordinator:  Prof. dr. P.S. Hiemstra Other teachers involved:   Dr. S. de Kleijn, Dr. J. Stolk, Ir. R. Schot, Dr. B.C. Stoel, Dr. L.N.A. Willems, 

Drs. P. Khedoe, Drs. G.D. Amatngalim, Drs. Y. van Wijck, Mw. B.C.M. Bos‐van Noort, Dr. A.M. Slats, Mw. A. van Schadewijk, Drs. E.P.M. van der Vlugt, Drs. M. Zarcone, Dr. J.G Koopmans 

  Background The immune system is critically involved in a large numbers of diseases, including infectious diseases, chronic  inflammatory diseases  such as allergies and auto‐immune diseases, and  cancer. Therefore detailed knowledge of  the  immune  system  is essential  for optimal diagnosis and patient care, and crucial for the development of new  insights and treatment options based on basic, translational as well  as  clinical  research.  The  availability  of  new  biologicals  such  as  monoclonal  antibodies  to modulate  the  immune  system  (in  addition  to more  traditional  anti‐inflammatory  treatment  and vaccination strategies  for  infectious diseases) offers novel strategies  for treatment of patients with diseases  associated  with  substantial morbidity  and mortality.  Inhibition  of  the  pro‐inflammatory cytokine  TNF‐α  with  the  afore  mentioned  biologicals  has  been  successfully  introduced  as  an important treatment for large numbers of patients with rheumatoid arthritis. Importantly, treatment options  based  on modulation  of  e.g.  IgE  and  cytokine  activity  are  now  also  introduced  for  the treatment of chronic inflammatory lung diseases.   Summary program Pulmonology week: In  this week we will  largely  focus on asthma and chronic obstructive  lung disease  (COPD). We will start by covering the basics: anatomy, physiology, cell biology and immunology of the lung. Following an  introduction  into  asthma  and  COPD,  patient  demonstrations  and  discussions  of  diagnostic procedures will be used to link theory to clinical practice. Next we will discuss the pros and cons of in vitro cell culture models, and  in vivo human and animal models,  to explore how  these can help us provide new  insight and define novel drug targets for asthma and COPD. Finally we will discuss the impact of the environment, life style and genetics on development of asthma and COPD. 

 Study goals The student can 

diagnose a patient suffering from oppression by taking a patient’s history. (Medical expert) 

determine  the  pathogenic  mechanism(s)  that  might  underlie  the  complaints  of  a  patient diagnosed with an airway disorder and define immunological differences between asthma, COPD and allergy 

create a diagnostic plan by evaluation of laboratory techniques that could be applied to be able to diagnose  airway  inflammations  correctly,  and  motivate  why  this  technique  is  appropriate. (Medical expert) 

develop a diagnostic and therapeutic plan for an allergy, asthma, and COPD patient and describe the method to check the effect of the intervention. 

present  convincingly  the  immunological  disorders  underlying  lung  diseases  and  novel  research directions and immunological therapeutics based on a literature 

  

Page 56: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

52 

 

Study materials 

The immune system (Peter Parham) 

Allergy handbook (Dept of Pulmonology) 

Pathophysiology of disease by Mc Phee: Chapter Pulmonary disease  (except pulmonary edema and lung embolism) 

Recent published articles (Blackboard)   (1)   Barnes  PJ.  Immunology  of  asthma  and  chronic  obstructive  pulmonary  disease.  Nat  Rev 

Immunol 2008 Mar;8(3):183‐92.   (2)   Wenzel  SE. Asthma  phenotypes:  the  evolution  from  clinical  to molecular  approaches. Nat 

Med 2012 May 4;18(5):716‐25.   (3)   Heederik D, von Mutius E. Does diversity of environmental microbial exposure matter for the 

occurrence  of  allergy  and  asthma?  Journal  of  Allergy  and  Clinical  Immunology  2012 Jul;130(1):44‐50. 

(4)   Brusselle GG,  Joos GF, Bracke KR. New  insights  into  the  immunology of chronic obstructive pulmonary disease. The Lancet 2011 Sep 10;378(9795):1015‐26. 

  Contact hours: 

Lectures  and  distribution  of  (review)  papers  about  immunological  mechanisms  and pathophysiology in different airway diseases and current concepts in novel therapeutics as well as novel research directions 

Interactive consult demonstrations with patient suffering from airway disease  

Practical demonstration of diagnostic and research tools  

Microscopic analysis of lung tissue 

Interactive mini‐symposium 

Student presentations  

 Self‐study hours: • Study  recent  research  articles  and  review  articles  about  the  immunological mechanism behind 

asthma,  COPD  and  allergic  airway  disease,  and  novel  immunological  therapeutics  in  asthma, COPD, and allergic airway disease 

• Divide  the  students  over  three  groups  and  they  have  to  prepare  a  presentation  about immunological mechanisms, novel  research directions, and novel  immunological  therapeutics  in Asthma, Allergic disease, COPD. 

  Evaluation: Oral  presentation  about  one  airway  disease  in  groups  of maximal  5  students  (p/f),  see  guideline below program   Guidelines oral presentation: Oral presentation Pulmonology:  

Students with Allergy case for the report of week 8 should choose this week another airway disease 

In groups of students, one presentation of ~30 minutes will be prepared based on mini 

symposium 

Each student is evaluated separately (passed/failed) 

  

Page 57: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

53 

 

Detailed program: Week 6:  

  

Time Activity Title Teacher

9:00‐10:30Anatomy and Physiology of the 

lungDr. L.N.A. Willems

10:30‐11:00 Questions and break

11:00‐12:00Cell biology and host defense of 

the lungProf. dr. P.S. Hiemstra

12:00‐13:00

Introduction COPD and asthma  

and distribution of self‐study 

material

Prof. dr. C. Taube

13:00‐17:00 Self‐study Immunology of asthma and COPD

9:00‐9:30 Questions self‐study Prof. dr. P.S. Hiemstra and 

Prof. dr. C. Taube

9:30‐11:00 Patient demonstration

Interactive consult 

demonstrations of patients with 

asthma  and COPD

Dr. J. Stolk, Prof. dr. C. Taube, 

Dr. L.N.A. Willems

11:00‐11:15 Break

11:15‐13:00 Diagnostics

Diagnostic procedures: allergy, 

lung function, and imaging and 

distribution self‐study literature

Prof. dr. P.S. Hiemstra, Dr. J. 

Stolk, Ir. R. Schot, Dr. B.C. 

Stoel

13:00‐17:00 Self‐study Read literature and prepare 

presentation

9:00‐9:45In vivo models for allergic airways 

diseaseDr. S. de Kleijn

9:45‐10:30 In vivo models for COPD Drs. P. Khedoe

10:30‐11:15Cell culture models in asthma and 

COPD

Drs. G.D. Amatngalim and 

Drs. Y. van Wijck 

11:15‐12:00

Clinical research in asthma and 

COPD: pitfalls  and practical 

aspects

B.C.M. Bos‐van Noort, Dr. A.M. 

Slats, Dr. J. Stolk

12:00‐12:30 Break

12:30‐13:30 Lunch meeting Lunch meeting: PulmoScience

13:30‐14:15 Laboratory Microscopic analysis of lung tissue Mw. A. van Schadewijk

14:15‐17:00 Self‐study Read literature

9:00‐13:00 Symposium

Interactive mini‐symposium: Life 

style, genetics and inflammatory 

lung diseases.

Prof. dr. P.S. Hiemstra, Prof. 

dr. C. Taube, Drs. E.P.M. van 

der Vlugt, Drs. M. Zarcone

13:00‐13:30 Break

13:30‐17:00 Self‐study 

Reading literature and 

preparation of presentations 

based on mini‐symposium

9:00‐10:00 Question hour for presentations Prof. dr. P.S. Hiemstra

10:00‐11:30 Self‐study Preparation of presentations

11:30‐13:00 Students presentations

13:00‐13:30 Break

13:30‐15:00 Student presentations

Prof. dr. P.S. Hiemstra, Dr. S. 

de Kleijn, Prof. dr. C. Taube, 

Dr. L.N.A. Willems

Lectures

Thursday 09‐Oct‐2014

Friday 10‐Oct‐2014

Monday 06‐Oct‐2014

Lectures

Tuesday 07‐Oct‐2014

Wednesday 08‐Oct‐2014

Page 58: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

54 

 

4. Nephrology 

 

Clinical coordinator:  Dr. A.P.J. de Vries (Nephrology) Scientific coordinator:  Prof. dr. C. van Kooten (Nephrology) Other teachers involved:  Prof. dr. J.W. de Fijter (Nephrology), Prof. Dr. T. Rabelink (Nephrology), 

Prof. dr. A.F. Cohen (Nephrology), Dr. M.E.J. Reinders (Nephrology), Dr. D.L. Roelen (Immunohematology and blood transfusion), Dr. Y.K.O. Teng (Nephrology), Drs. H. Bouwsma (Nephrology), Dr. M. de Boer (Infectious diseases), Dr. F. Kroon (Infectious diseases), Drs. D.J.A.R. Moes (KFT) 

  Background 

 The primary glomerulopathies are often auto‐immune diseases with an immunologic response to self in  the kidney. Activation of  the  innate  (complement) and/or acquired  immune  systems  (B‐cells, T‐cells) play an  important role  in glomerular pathology.  In  the past century,  lack of understanding of the involved pathophysiological pathways lead to induction treatments that consisted largely of non‐targeted  therapy with  corticosteroids  (prednisolone)  or  chemotherapy  (cyclophosphamide).  These non‐directed treatments resulted in serious side‐effects and toxicity, such as opportunistic infection, metabolic  complications, and  increased  risk of malignancy. Steroid‐sparing maintenance  strategies were developed with the advent of novel oral immunosuppressants from the transplant setting such as azathioprine and mycophenolate. These steroid‐sparing alternatives have often a less toxic profile and were a significant  improvement of the nephrologist’s therapeutic armamentarium. Over recent decades, growing insight in the biomolecular pathways of the immune system and kidney disease has resulted in novel therapeutic antibodies (“biologicals”) that often target more specific pathways with less  unwanted  side‐effects.  Still,  it  remains  a  challenge  for  the  nephrologist  to  navigate  between over‐ and under‐immunosuppression as biomarkers to precisely monitor immune status and disease activity are often lacking. Since immunosuppression merely suppresses and not cures disease, a large portion of patients will still progress to end‐stage renal disease.  Kidney  transplantation has become a  successful  renal  replacement  therapy  for patients with end‐stage  renal  disease,  and  is  a model  of  allo‐immunity.  Over  the  past  three  decades,  advances  in histocompatibility testing and immunosuppressive drug therapy have led to dramatic declines in the incidence of acute  rejection  in  the  first  few months after  transplantation. As a  result, 1‐year graft survival has increased substantially, and attention has shifted towards reducing the incidence of late allograft failure. Increased and better immunosuppressive drugs take their toll as viral and malignant complications. Death with  a  functioning  allograft  and  chronic  rejection  cause  the majority of  late allograft  failures nowadays. Because much of  the mortality  in  the  late post‐transplantation period can be directly or indirectly linked to complications of immunosuppression, a number of studies have examined whether one or more agents can be safely withdrawn. This strategy is designed to capture the early benefit of acute  rejection without paying  the price of  long‐term  toxicity but still avoiding chronic  rejection.  It  would  seem  that  more  specific  therapeutic  regimens  might  require  better therapeutic drug monitoring or even more  targeted  therapy or  tailor‐made  to  individual patients. Alternatively, more detailed knowledge of allo‐immunity may reveal non‐variant points that can be more  universally  targeted.  Thus,  donor‐specific  tolerance,  defined  as  a  state  of  systemic  non‐responsiveness to allograft without the need for immunosuppressive drugs, is still the “holy grail” of transplantation.   

Page 59: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

55 

 

Summary program Nephrology week:  In  this  week  you  will  get  general  understanding  of  auto‐immunity,  allo‐immunity, immunosuppression, and associated complications from a clinical nephrology perspective.  

 Study goals  The student can 

understand  the  immunological  mechanism(s)  that  underlie  a  selection  of  immune‐mediated kidney diseases 

describe medical presentation,  serology and histopathology  to clinically diagnose a  selection of immune‐mediated kidney diseases (Medical expert) 

describe the biology of the  immune system and understand the concepts of auto‐immunity and allo‐immunity 

understand the  immunological mechanism(s) that underlie transplant tolerance or rejection and describe the relevance of immunogenetics and tissue typing 

determine  the pathogenic mechanism(s)  that might underlie  transplant rejection or acceptation and predict the change of acceptation of a donor organ in a specific patient casus 

define selected auto‐immune nephritic disorders and explain if a kidney transplantation would be beneficial for the specific patient (Medical expert) 

describe  various  classes  of  immunosuppressive  drugs  to  treat  kidney  disease  and  prevent rejection after transplantation,  including the role of therapeutic drug monitoring and the role of targeted therapy with biologicals (Medical expert) 

describe side‐effects of immunosuppression such as opportunistic infections. 

develop a  therapeutic plan based on  results  from diagnostic  tests and  corresponding diagnosis (complement disorder (a‐Hus) and SLE casus received in week 3) (Medical expert, Academic) 

explain and report the mechanism of action and clinical evidence, effectiveness, and safety based on recent literature of an immunomodulatory agent used in transplantation or clinical nephrology (Academic and Medical expert) 

understand the patient perspective of chronic immunosuppressive therapy (Medical expert)  Preparation  Medical students: It is expected that students will recapitulate relevant subthemes on: 

- Year  1:  from  Basis  to Homeostasis:  construction  and  function  of  kidneys,  glomerular  and tubular functions 

- Year 2: Mechanism of disease: immunity, pathology, transplantation - Year 2: Chest and Kidney: primary glomerulonephritis 

 Biomedical sciences students: 

- Year 2: Immunology. - Year 2: Human pathology: nephropathology and clinical nephrology   

Study materials (see Blackboard) Core Books (relevant chapters from): The immune system (Peter Parham) Kumar, Clinical Medicine, 8th Edition,   

Page 60: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

56 

 

Advised Books (relevant chapters from) Feehally, Comprehensive Clinical Nephrology, 4th Edition Hricik, Primer on Transplantation, 3rd Edition  Roitt, Essential Immunology, 12th Edition  References that might be used to study specific topics or prepare the report: 1) Noris M et al. Atypical haemolytic uremic syndrome. N Engl J Med 2009; 361(17): 1676‐87. 2) Legendre CM et al. Terminal complement  inhibitor eculizumab  in atypical haemolytic uremic syndrome. N Engl  J Med 2013; 368(23): 2169‐81. 3) Ardissino G et al. Discontinuation of eculizumab maintenance treatment for atypical haemolytic uremic syndrome: a report of 10 cases. Am J Kidn Disease 2014; doi: 10.1053/j.ajkd.2014.01.434 4) Nishimura J et al. Genetic variants in C5 and poor response to eculizumab. N Engl J Med 2014; 270(7): 632‐9. 5) Rovin BH et al. Lupus nephritis: the evolving role of novel therapeutics. Am J Kidn Dis 2014;63(4):677‐90. 6) Borchers AT et al. Lupus nephritis: a critical review. Autoimmun Rev 2012; 12:174‐194 7) Jones et al. Rituximab vs. Cyclophosphamide in ANCA‐associated renal vasculitis. N Engl J Med. 2010; 363:211‐220. 8) Stone et al. Rituximab vs. Cyclophosphamide for ANCA‐associated vasculitis. N Engl J Med 2010; 363: 221‐232. 9) Nankivell BJ et al. Rejection of the kidney allograft. N Engl J Med 2010; 363: 1451‐62. 10) Halloran PF. Immunosuppressive drugs for kidney transplantation. N Engl J Med 2004; 351: 2715‐29. 11) Susal C et al. Current role of human leukocyte antigen matching in kidney transplantation. Curr Opin Organ Transplant 2013; 18(4): 438‐44. 12) Becker LE et al. Kidney transplantation across HLA and ABO antibody barriers. Curr Opin Organ Transplant 2013; 18(4): 445‐54. 13) Hanaway et al. Alemtuzumab induction in renal transplantation. N Engl J Med 2011; 364: 1909‐19. 14) Garnock‐Jones KP. Belatacept: in adult kidney transplant recipients. BioDrugs 2012; 26(6):413‐24.  15) Vincenti F et al. Costimulation blockade with belatacept in renal transplantation. N Engl J Med 2005; 353‐770‐781 16) Loupy et al. Complement binding anti‐HLA antibodies and kidney allograft survival. N Engl J Med 2013; 369:1215‐1226 17) Fishman JA. Infection in solid‐organ transplant recipients. N Engl J Med 2007; 357: 2601‐14 18) Stock P et al. Outcomes of kidney transplantation in HIV‐infected recipients. N Engl J Med 2010; 363: 2004‐2014. 19)  Moes  DJ  et  al.  Effect  op  CYP3A4*22,  CYP3A5*3,  CYP3A  combined  genotypes  on  cyclosporine,  everolimus,  and  tacrolimus pharmacokinetics in renal transplantation. CPT Pharmacometrics Syst Pharmacol 2014; 12.; e100 doi: 10.1038/psp.2013.78 

 Contact hours: 

Lectures 

Histopathology rounds 

Clinical Rounds on the Nephrology or Transplant ward  

 Self‐study hours: • Read about nephritic disorders and transplantation • Focus  on  one  immune modulatory  agent  (belatacept,  belimumab,  eculizumab,  alemtuzumab, 

rituximab,  or  ATG)  to  prepare  an  individual  report  about  the working mechanism  and  clinical evidence, effectiveness, and safety with recent literature and other information sources 

  Evaluation: Individually written  report on one  immune modulatory agent  (belatacept, belimumab, eculizumab, alemtuzumab, rituximab, or ATG) about the working mechanism, clinical evidence, effectiveness, and safety (p/f), see guidelines below program.   Guidelines written report (Passed/Failed): All students will write individually a small report (900‐1100 words) about one target therapy 

(belatacept, belimumab, eculizumab, alemtuzumab, rituximab, or ATG). Topics to be included in the 

report: 

• working mechanism  

• clinical evidence 

• effectiveness 

• safety 

Page 61: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

57 

 

Detailed program:  Week 7:  

  

Time Activity Title Teacher Literature

9:00‐10:00 Introduction to Clinical Nephrology Dr. A.P.J. de VriesKumar, 

Feehally

10:00‐11:00 SLE nephritis dr. Y.K.O TengFeehally, 

refs 5+6

11:00‐12:00 Complement‐related renal disease Dr. A.P.J. de VriesFeehally, 

refs 1‐4

12:00‐13:00 Break

13:00‐14:00 Lecture ANCA‐vasculitis Prof. dr. T. RabelinkFeehally, 

refs 7+8

14:00‐14:30Handing out assignment on target 

therapyDr. A.P.J. de Vries

14:00‐17:30 Self‐study

9:00‐10:00 Immunogenetics and HLA Dr. D. RoelenHricik, refs 

11, 12, 16

10:00‐11:00Allo‐immunity and tolerance in 

solid organ transplantationProf. dr. C. van Kooten

Hricik, refs 

9, 10,11

11:00‐12:00Belatacept in kidney 

transplantationDrs. H. Bouwsma refs 14,15

12:00‐13:00 Break

13:00‐14:00Immunosuppressive drugs in 

nephrology/transplantationProf. dr. A.F. Cohen

Refs 5, 6, 7, 

8,10, 13, 14, 

15

14:00‐15:00 Therapeutic drug monitoring Drs. D.J. Moes Hricik, ref 19

14:00‐17:30 Self‐study

9:00‐10:00Rejection and cell therapy in renal 

transplantationDr. M. Reinders

Hricik, refs 

9, 10, 13, 16

10:00‐11:00Viral infection (CMV/BK) in organ 

transplantationDrs. D. Soonawala Hricik, ref 17

11:00‐13:30 Self study

13:30‐14:00 Histopathology roundsHistopathology rounds; renal 

pathologist, all nephrologists

14:00‐15:30 Self study

15:30‐16:30 LecturePCP and fungal infections after 

solid organ transplantationDr. M. de Boer Hricik, ref 17

16:30‐17:30 Self‐study

9:00‐13:00 Self study

13:00‐14:00 Lectures HIV and Renal Transplantation Dr. F. Kroon refs 17, 18

14:00‐15:00 Clinical roundsClinical Rounds on the Nephrology 

or Transplant ward

Drs. H. Bouwsma                                 

Dr. A.P.J. de Vries

14:30‐17:30 Self study

9:00‐17:30 Self study

17:30 Hand in written report

Friday 17‐Oct‐2014

Lecture

Wednesday 15‐Oct‐2014

Lectures

Thursday 16‐Oct‐2014

Monday 13‐Oct‐2014

Lectures

Tuesday 14‐Oct‐2014

Lectures

Page 62: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

58 

 

5. Write final report patient case 

 

Clinical coordinators:  Dr. R.G.M. Bredius (Paediatrics), Dr. A.C. Lankester (Paediatrics) Scientific coordinators:  Dr. M. Bax (Rheumatology) Other teachers involved:  Dr. J.J. Plomp (Neurology), Prof Dr. J.J.G.M. Verschuuren (Neurology), Dr. 

D. van der Woude (Rheumatology), Dr. J.K. de Vries (Rheumatology), Dr. O. Teng (Nephrology), Dr. A. de Vries ((Nephrology),  Dr. J.G. Koopmans (Pulmonology), Dr. A. Slats (Pulmonology) 

  

Summary of this week:  

At  the  beginning  of  week  3,  the  students  have  chosen  one  immunological  disease  out  of  four different diseases  (MG,  SLE,  aHUS, Allergy). At  the  end of week  3,  in  groups of  students,  a  short presentation has been  given  to obtain  feedback  from  the  corresponding  clinicians  to prepare  the final report.  In weeks 3‐7,  information on  the specific disease has been collected, and  this week  is completely dedicated to write the final report.   Study goals 

 The student can 

perform  independently  literature  research based on a  specific  immunological disease and select relevant papers to analyse and report the  immunological background of the patient casus in detail (Academic). 

relate  the  mechanism  of  disease  of  a  systemic  auto‐immune  disease  to  organ  specific involvement by understanding the defect immune components related to the disorder. 

create  a  diagnostic  plan  by  evaluation  of  laboratory  techniques  based  on  a  differential diagnosis  and  motivate  why  these  techniques  are  appropriate  to  be  able  to  diagnose correctly in this particular patient case. 

interpret  results  from  diagnostic  tests  and  subsequently  translate  which  immunological defects might underlie the results, and relate them to symptoms and complaints as gathered via patients’ history. 

develop a therapeutic plan for the specific casus based on results from diagnostic tests and corresponding diagnosis and describe the method to check the effect of the intervention.  

  

Study materials  Book: The immune system (Peter Parham) Other materials that are posted on Blackboard of the previous weeks Literature obtained by independent literature research   Contact hours:  If necessary, the student can contact the corresponding clinician in case of questions.   

Page 63: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

59 

 

Self‐study hours:  This whole week is dedicated to write the final report.   Evaluation:  The  final  report will  be  evaluated  by  the  two  corresponding  clinicians  (1:1)  and  the mark  (0‐10) counts for 60% of the final mark.   Guidelines for the final written report: 

 Instruction for students: 

 

Disease: MG/SLE/Allergy/aHus 

 

1. Introduction disease: 100‐150 words 2. Immunological mechanism  behind  disease  (+  figure  and  implementation  of  at  least  three 

relevant  research papers  found by  independent  literature  search) and  relation  to  involved organ: 600‐800 words 

3. Relation defective immune mechanisms and complaints patient: 200‐250 words 4. Questions for taking the patients history: 250‐300 words 5. Diagnostic plan and predicted results: 300‐400 words  6. Therapeutic plan and method to check the effect: 300‐400 words 

 

Instruction for teachers: 

 

1. Introduction disease (100‐150 words): 0‐0.5 pnt 2. Immunological mechanism behind disease (600‐800 words):  

In‐depth explanation of pathogenic immunological components of disease 0‐2.0 pnt 

clear summary picture of involved immune mechanisms 0‐1.0 pnt 

collection and implementation of relevant research papers  0‐1.0 ptn  3. Relation defective immune mechanisms and complaints patient (200‐250 words): 0‐0.5 4. Questions for taking the patients history: 250‐300 words 0‐1.0 pnt 5. Diagnostic plan and predicted results: 300‐400 words 0‐2.0 pnt 6. Therapeutic plan and method to check the effect: 300‐400 words 0‐2.0 pnt 

Page 64: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

60 

 

6. Innovative therapies 

 Clinical coordinators:  Dr. R.G.M. Bredius MD (Paediatrics); Dr. A.C. Lankester MD (Paediatrics) Scientific coordinators:  Dr. B.G.A. Guigas (Parasitology) Other teachers involved:  Dr. I. de Nooijer (LURIS), Dr. A. Aartsma‐Rus (HG), Prof dr. F.J. Staal (IHB), 

Prof dr. Guchelaar H.‐K. (KFT), Dr. K. Schimmel (KFT), Prof dr. D.P. Engberts (Dept. Ethics & Law), Dr. M. de Vries (KJC), Prof. dr. R.M. Maizels (Edinburgh, UK), Dr. J. Vellinga (Crucell), and all teachers from the combined half minor as tutors to guide the grant proposals 

 Background:  In the past modules of the half minor  ‘Infections,  Immunity and  Immune modulation’ the students got  an  introduction  to  the  complexity  of  the  immune  system  and  the  delicacy  of  the  fine‐tuned balance between  inflammation and  tolerance based on symptoms and problems  faced by patients with (inherited) immunodeficiencies. Host‐pathogen interactions with the immune system have been explained, the concepts of vaccinology and the consequences of dysfunctional and pathogen‐driven modulation  of  the  immune  system  have  also  been  extensively  discussed.  At  the  same  time,  the concept of bad  and  good microbes has been  introduced, discussing  the potential health effect of certain commensals, such as the microbiota and/or helminths. During the modules of the half minor ‘clinical  immunology’  clinical  symptoms  and  the  inflammatory  responses  of  various  non‐communicable  diseases  have  been  discussed  as  well  as  current  therapeutic  strategies.  Now  the moment has  come  to  integrate  the  gained  knowledge of  the  two half minors  in  this  last module where  innovative  therapies will  be  discussed.  Examples will  be  provided  of  bright  new  ideas  and novel  treatment  opportunities  In  addition,  the  various  steps  for  setting  up  clinical  trials  will  be explained,  including ethical  considerations,  law  legislations and  intellectual property. The  students will be introduced to bench‐to‐bedside examples of translational researches and will visit the LUMC pharmacy manufacture and a biotech company of the Leiden Bioscience Park. Finally, students will set‐up  their own  grant proposal  in  their  immune disease  area of  choice  and defend  this during  a symposium on the last day of the module.  Learning objectives: The student can:               

Transfer  immunological knowledge gained during  the previous modules  (in  the  ‘Infections, Vaccines and Immune Modulation’ minor) to the students of the ‘Clinical Immunology’ minor  

Describe  the  crucial  ethical  and  regulatory  steps  necessary  in  developing  innovative therapies for immunological and/or infectious diseases.  

Perform  self‐directed  literature  searches  to obtain  relevant  information on  immunological and/or microbiological diseases                      

Analyse  the  current  therapeutic  options  for  treating  an  immunological  and/or  infectious disease and present the pros/cons of treatment   

Propose an  innovative  therapeutic strategy  that may be developed,  for  targeting a specific immunological and/or infectious disease. 

     

Page 65: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

61 

 

Contact hours (10 hours over 2 weeks): ‐Lectures on bring Innovative therapies (IT) into the clinic:   1) Philosophy and ethics   2) How to develop a clinical trial   3) Intellectual property & IT 

4) From bench to bedside: examples of translational IT   5) New approaches for vaccination   6) Pre‐ and probiotics for immune diseases  ‐ Interaction hours (10 hours over 2 weeks): ‐ Site visit 

1) One company involved in IT from the Leiden Bioscience Park    2) LUMC pharmacy manufacture  ‐ Scientific symposium on “Communicable and non‐communicable diseases”  ‐ Presentations of  the students about their grant proposal (they work in couples; one from IIP and one from CI)   Self‐study hours (~40 hours): Hours of self‐study devoted to preparation of grant proposal and final oral presentation Prepare Round Table discussion: “Towards personalized medicine for IT: pro and cons”  Evaluation: 

‐ Work groups (p/f) ‐ Poster presentation of the grant proposal (summative)  

                             

Page 66: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

62 

 

Day to Day program Monday 27 October  Lecture   9.30 – 10.30 hour  Title    Introduction to the module immune‐mediated diseases  Instructor   Dr. B. Guigas (Dept. of Parasitology)  Goals     Explain the content, the learning objectives and the assignments for this module  Assign tutors:   The students are grouped in pairs (one from Clinical Immunology and one from 

Infections, Vaccines and Immune modulation) and assigned to a specific tutor. Together they will develop a grant proposal on an innovative therapeutic strategy for a specific immunological or infectious disease. At the last day of this module, the idea for the grant proposal is presented by a poster during a common symposium. The student pairs will be mentored by their dedicated tutor and will have at least 4 feed‐back moments on their grant proposal. Guidelines for the grant proposal and the poster presentation and the final list of tutors are provided below and/or on Blackboard. Topics include Type 1 diabetes, Metabolic syndrome, Systemic lupus erythematosus, Kidney Transplantation, Asthma, COPD, respiratory allergy, Myasthenia gravis, X‐linked agammaglobulinemia, SCID, Rheumatoid arthritis, Inflammatory Bowel disease, Crohn's disease, Recurrent diarrhea, Celiac disease (Gluten syndrome), HIV, Malaria, Bacterial infections, Schistosomiasis, Paediatric orphan diseases  

Test   summative (30% of final mark): grant proposal idea + poster +poster presentation  Feedback   10.30 – 12.00 hour  Instructor   Assigned tutors (see list on Blackboard)  

Meet the tutors for guidance on the research grant proposal and poster presentation  

Guidelines for the Grant Proposal   Description  Each group (two students) will build an original research grant proposal in which a gene/protein/signalling module/cell/tissue/… is proposed as a target for innovative therapeutic development in a immune disease‐orientated specific context. Students should formulate their research proposal based on current literature, new data, tempting viewpoints, and will be helped through recurrent interaction with their respective tutors. In the symposium at the end of the course each group will give a poster presentation of the proposal they intend to develop.   General aim  Imagine that you have discovered a target/method/process and now try to obtain a research contract from an institute, a funding/charity organization or a company for therapeutic development. Thus, try to first present an as attractive/innovative project as possible, and next give an as positive enthusiastic in‐depth presentation as you can that would convince a sceptical scientific board from these organizations.   Advices  Try to answer (some of) the following questions: What is the (basic) science behind the idea? How was this target/process/approach discovered/developed/validated? What will be the therapeutic indication? Is there already proof of principle in animal models or how would you go about it to obtain such knowledge? What is the approach that you envision for drug discovery, therapeutic and clinical development? Why is it a good target/process/method? Are there anticipated side effects? How is this target/process/method better than the products that are already on the market? Is there 

Page 67: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

63 

 

a market/will the drug/method/process make money? Also discuss potential opportunities and strategies for personalized treatment.  

 Guidelines for the poster creation and presentation   General aim  The poster is aimed for presenting your research grant proposal and generating active discussion with the audience. You will also be encouraged to participate in the discussions from other presenters.   Format  Prepare the poster in landscape Powerpoint format (an empty template will be provided on Blackboard). The poster may be structured, possibly but not mandatorily, as follows: title, introduction, aim/objectives, experimental approaches, expected results/outcomes and potential translation to human disease. Pay extra attention to the visibility, readability and originality of your poster in general and the figures in particular.   Design and layout advices  • Less is more. Be clear and concise with poster design and content.  • Make it obvious to the viewer how to progressively view the poster. The poster generally should read from left to right, and top to bottom. Numbering the individuals panels, or connecting them with arrows might be an option for a "guidance system".  • Keep the text brief (no more than one‐fourth of the poster space) and readable from couple of meters away. Use "visuals" (graphs, photographs, schematics, maps, etc.) to tell your "story".  • Cite and reference any sources of information other than your own.  Presentation  All the posters should be ready from printing (on a USB stick or uploaded on Blackboard) before Thursday Nov 6th 1pm. During the symposium, the posters will be mounted and presented using both Powerpoint and a poster walk. For the Powerpoint presentation, 15 minutes will be allocated for each couple of students: 5 min to present their poster, followed by a ~ 10 min discussion. Following the presentations, there will be a poster walk in which 1 student will be answering questions at his/her poster while the other student will walk around and ask questions/grade the posters of the other grant proposals. Halfway the poster walk, students will switch places so all students had individual time to a) answer questions at their poster and b) walk around and ask questions/evaluate.  Assessment criteria  • Structure and feasibility of the grant idea outline  • Presence of a contingency plan  • Clarity and grammar of the writing  • Quality/originality of supportive graphical elements  • Presentation skills (concision, structured talk and capacity to bring forward the idea in limited time;   eagerness/enthusiasm 'to sell' your idea)  • Discussion (capacity to answer scientific questions and coping with 'criticism')    

   

Page 68: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

64 

 

Tuesday 28 October  Lecture   08.30 – 09.30 hour  Title     Organizing Clinical Research, a Routemap  Instructor   Dr. L. Duits‐Veltrop (Dept. of Clinical Pharmacy and Toxicology)  

Goals After research on new therapies or procedures in the laboratory, the most promising experimental treatments are moved into clinical trials. In these trials new ways will be studied to prevent, detect or treat disease or to improvement a standard therapy. But what do you have to do before you can include your first volunteer? It is more than sending 15 forms to the ethical committee, but where to start in the labyrinth of clinical research.  

Literature   To be announced on Blackboard   Lecture   9.30 – 10.30 hour  Title     Gene therapy, a risky business?  Instructor   Dr. G. van Willigen (Dept. of Safety and the Environment)  

Goals In the presentation / discussion session a few recent gene therapy protocols will be shortly introduced. The students should identify the risks of the studies (for the patient and the environment) a suggest measures to mitigate the identified risks.  

Literature   To be announced on Blackboard   Lecture   10.30 – 11.30 hour  Title   Antisense‐mediated exon skipping: An approach with therapeutic potential for 

Duchenne muscular dystrophy and other diseases  Instructor   Dr. A. Aartsma‐Rus (Dept. of Human Genetics)  

Goals Mistakes and alterations in the pre‐mRNA splicing process underlie many genetic and acquired diseases. Antisense oligonucleotides (small pieces of modified DNA) can be used to manipulate splicing. This approach has advanced into the clinical trial phase for Duchenne muscular dystrophy, but also has therapeutic potential for many other diseases.  

Literatures   Spitali P & Aartsma‐Rus A. Splice modulating therapies for human disease. Cell. 148(6):1085‐8, 2012  Aartsma‐Rus A. Antisense‐mediated modulation of splicing: therapeutic implications for Duchenne muscular dystrophy. RNA Biol. 7(4):453‐61, 2010  

Self‐study   11.30 – 12.30 hour  Prepare research grant proposal/poster presentation  

 Symposium   13.00 – 17.00 hour  Lectures from national and international speakers on communicable and non‐communicable diseases, including a keynote lecture from Prof. dr. Rick Maizels (Institute of Immunology and Infection Research, University of Edinburgh, Edinburgh, United Kingdom)  Program  “At the Intersection of our major challenges: from communicable to non‐communicable diseases”  13.00: Prof. dr. Rudi Westendorp (LAVA) ‐ The epidemiologic transition  13.45: Prof. dr. Tari Haahtela (Helsinki University Hospital) ‐ The biodiversity hypothesis  14.30: Prof. dr. Maria Yazdanbakhsh (LUMC) ‐ Changing immune responses along the rural‐urban gradient  15.00: Dr. Bruno Guigas (LUMC) ‐ Helminth infections and metabolic disorders  15.45: Prof. dr. Rick Maizels (Edinburgh University) ‐ Parasites and Immunity: Evolutionary Insights into the Diseases of Modernity  16.30: Eurolife Medal and Drinks 

Page 69: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

65 

 

Wednesday 29 October Lecture   8.30 – 10.00 hour  Title     Intellectual property & Innovative therapies  Instructor   Dr. I. de Nooijer (LURIS)  Goals   The lecture will provide a general introduction to Intellectual Property Law. What 

does it do, why and how does it achieve its aim? In addition it will explain the way patent law works in a more detailed manner, emphasizing the specific elements in patent law.  

Literature   Annette Kur & Thomas Dreier. Book European Intellectual Property Law. Edward Elgar 2013  http://www.wipo.int/export/sites/www/freepublications/en/intproperty/489/wipo_pub_489.pdf   

Break    10.00‐10.30 hour   Lecture   10.30 – 11.30 hour  Title     From bench to benchside: Stem cell‐based gene therapy for SCID  Instructor   Prof. dr. F. Staal (Dept. of Immunohematology and Blood Transfusion)  Goals   The Mesenchymal Stem Cell therapy program has shown that MSC’s may be able to 

modulate in‐vivo immune responses in the setting of allogeneic stem cell transplantation or autoimmune disorders. This program is close to translation to clinical application and currently been studied in (randomized) clinical trials, notably for children suffering from severe combined immunodeficiency (SCID).  

Literature   Mikkers H, …, Staal FJ. Induced pluripotent stem cells and severe combined immunodeficiency: merely disease modeling or potentially a novel cure? Pediatr Res. 71(4 Pt 2):427‐32, 2012  Pike‐Overzet K, …, Staal FJ. Correction of murine Rag1 deficiency by self‐inactivating lentiviral vector‐mediated gene transfer. Leukemia. 25(9):1471‐83, 2011   

Lecture   11.30 – 12.30 hour  Title     An EU FP7 project towards the development of novel helminth vaccines  Instructor   Dr. C.H. Hokke (Dept. of Parasitology)  Goals   To date no effective vaccines for helminth infections exist. Classical approaches 

where an abundant antigen expressed as a recombinant protein is used for immunisation to induce protective antibodies so far fail. Some reasons for this may be that a) helminths apply sophisticated strategies to modulate and regulate the immune system of the host, rendering vaccination in an infected population ineffective b) the vaccine targets and the life stages in which they are expressed have not been chosen correctly c) the recombinant expression systems used do not take into account the proper glycosylation of the protein d) the protective mechanisms against helminths are insufficiently understood. Presented and discussed will be the outline and template of the EU‐FP7 project TheSchistoVac in which a pipeline of vaccine target discovery and in vitro/in vivo pre‐clinical testing is applied to address the above questions and develop novel vaccine candidates and strategies for schistosomiasis and related helminth infections.  

Literature   1) Hewitson JP, Maizels RM. Vaccination against helminth parasite infections. Expert Rev Vaccines. 2014 Mar 7. PubMed PMID: 24606541.  2) Mo AX, Agosti JM, Walson JL, Hall BF, Gordon L. Schistosomiasis elimination strategies and potential role of a vaccine in achieving global health goals. Am J Trop Med Hyg. 2014 Jan;90(1):54‐60. 3) www.theschistova.eu  

Page 70: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

66 

 

 Feedback   13.30 – 14.30 hour  Instructor   Assigned tutors (see list on Blackboard)  

Meet the tutors for guidance on the research grant proposal  Self‐study   14.30 – 17.00 hour    Prepare research grant proposal/poster presentation   

Thursday 30 October  Self‐study   8.30 – 10.30 hour  

Prepare Pros and Cons statements for Round table discussion  Round table   10.30 – 12.30 hour  Title     Towards personalized medicine for IT: pro and cons  Instructors   Dr. B. Guigas (Dept of Parasitology); Dr. R. Bredius MD (Dept of Paediatrics); Dr. 

Leen ‘t Hart (Dept of Molecular Epidemiology and Molecular Cell Biology)  Goals   Each half of the student group will have to defend a pro or con statement, 

respectively  Pros: “Personalized medicine is the future of health care”  Cons: “Personalized medicine is ethically borderline and reflects the lack of innovative therapies from the industry”  

Test     formative (pass/fail)   Self‐study   13.30 – 17.30 hour  

Prepare research grant proposal/poster presentation  

 Friday 31 October  Site visit   8.30 – 11.30 hour  

Site visit and discussion with CEO and/or R&D head of an innovative start‐up from the Leiden BiosciencePark   

Feedback   11.30 – 12.30 hour  Instructor   Assigned tutors (see list on Blackboard)  

Meet the tutors for guidance on the research grant proposal   

Self‐study 13.30 – 17.30 hour  Prepare research grant proposal/poster presentation 

 

          

Page 71: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

67 

 

Monday 3 November  Self‐study   8.30 – 10.30 hour  

Prepare research grant proposal/poster presentation  Lecture   10.30 – 11.30 hour  Title     Pre‐ and probiotics for immune diseases  Instructor   Prof dr. H. Savelkoul (Dept. of Cell Biology & Immunology, Wageningen) (speaker to 

be confirmed)  Goals   Probiotics have formed a vital part of Mediterranean and Middle Eastern diets for 

thousands of years, in the form of fermented milk and vegetable products such as yogurt and pickles. They are credited, in part, for the relatively low rates of chronic, age‐related diseases that prevail in those regions. Now, research is catching up with this traditional wisdom in the form of accelerated scientific investigations into the broad spectrum health benefits of probiotics. Probiotics are beneficial organisms, most of which are normally found in the healthy human gastrointestinal tract. Probiotics can restore and rebalance your gut microbiome, strengthening its ability to interact with your immune system in many ways. These friendly bacteria stimulate healthy immune surveillance, boosting populations of cells that seek out and destroy infecting organisms and cancers. They upregulate inflammatory cytokines during the acute stage of an infection, cancer, or other threat to your body’s integrity, but they also contribute to suppression of the inflammatory response as the threat fades. The use of probiotics holds great promise for treatment of many immune‐related disorders, but what is truly effective and where do we stand?  

Literature   TA Oelschlaeger, Mechanisms of probiotic actions – A review, Int J Med Microbiol, (2010); 300 (1): 57–62  Quigley EMM, Prebiotics and probiotics; modifying and mining the microbiota, Pharmacological Research, 2010, 61(3): 213–218  Aureli et al, Probiotics and health: An evidence‐based review, PharmacologicalResearch, 2011, 63(5): 366‐376   

Lecture   11.30 – 12.30 hour  Title     Innovative therapies: new approaches for vaccination  Instructor   Dr. J. Vellinga (Crucell)  Goals   Crucell are developing prophylactic and therapeutic vaccines against a number of 

infectious diseases. Several of the vaccines in development in Crucell are based on replication deficient adenoviral vectors but we are also focusing on vaccines based on live‐attenuated viruses and whole inactivated viruses. The research involves antigen discovery and design, technology development, manufacturing and characterization of prototype vaccines.  

Literature   NA   Self‐study   13.30 – 17.30 hour  

Prepare research grant proposal/poster presentation 

      

Page 72: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

68 

 

Tuesday 4 November  Site visit   8.30 – 10.30 hour  Instructor   Prof. dr. Henk‐Jan Guchelaar & Dr. Kirsten Schimmel (Dept. of Clinical Pharmacy 

and Toxicology)  Goals   Each half of the student group will visit the pharmacy drug manufacture and will get 

an introduction on how this important LUMC facility is currently involved in the development of IT  

Feedback   10.30 – 11.30 hour  Instructor   Assigned tutors (see list on Blackboard)  

Meet the tutors for guidance on the research grant proposal  Self‐study   11.30 – 17.30 hour  

Prepare research grant proposal/poster presentation  

 Wednesday 5 November  Self‐study  8.30 – 10.00 hour  

Prepare ‘Journal Club’ lecture: read abstract and result section of the 3‐4 articles  Lecture   10.00 – 11.30 hour  Title     Hot topics in innovative therapies: recent highlights from high‐ranking journals  Instructor   Postdocs from various groups involved in the ½ minor  Goals   3‐4 cutting‐edge publications on IT for immune diseases published in high‐ranking 

journals in 2014 will be presented and discussed with the students  Literature   To be announced on Blackboard   Lecture   11.30 – 12.30 hour  Title     Dealing with minor age for IT  Instructor   Dr. M. de Vries (Dept. of Pediatrics)  Goals   Dealing with minors in experimental studies give rise to considerable ethical issues. 

Minors deserve well designed drugs, dosing regimens suitable for children and good research. On the other hand regulators have to take care of the protection of this group against non‐ethical studies. The Dutch law for scientific research in minors (WMO) is currently under debate. These and other ethical issues of studies in minors will be discussed in this lecture.  

Literature   To be announced on Blackboard   Self‐study   13.30 – 17.30 hour  

Prepare research grant proposal/poster presentation   

   

Page 73: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

69 

 

Thursday 6 November  Self‐study   8.30 – 17.30 hour  

Prepare research grant proposal/poster presentation  DEADLINE poster printing: 1.30am; see on Blackboard  

 Friday 7 November  Final symposium   8.30 – 16.00 hour  Instructor     All the tutors involved in students guidance  Goals   The mark for the poster presentation will be an average of the evaluation of 

all tutors present plus the mark from the assigned personal tutor (1:1 ratio). The students will also evaluate and rank all the posters using a written anonymous form. The poster with the highest rank will receive a poster award.  

 

 

Program Symposium (either in Burumazaal or in the Foyer):  

8.30‐9.00   Poster hanging group 1 and 2 (in the foyer) 

9.00‐11.00   Poster presentation group 1 (PowerPoint presentation)       

    (15 min per group; 5 min presentation + 10 min discussion) 

11.00‐12.00   Poster viewing and discussion at the poster group 1:               

1 student will stay at the poster while the other one is doing a poster walk. Halfway 

the poster viewing, students will switch. 

12.00‐13.00   Break 

13.00‐15.00   Poster presentation group 2 (PowerPoint presentation)       

    (15 min per group; 5 min presentation + 10 min discussion) 

15.00‐16.00   Poster viewing and discussion at the poster group 1:               

1 student will stay at the poster while the other one is doing a poster walk. Halfway 

the poster viewing, students will switch. 

16.00                 Poster prize, Awards, Drinks 

Test Summative (30%): Grant proposal idea + poster + oral presentation  

         

Page 74: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

70 

 

Week 9:  

 

Time Activity Title Teacher

9.30‐10.30 LectureIntroduction to Module innovative 

therapiesDr. B.G.A. Guigas

10.30‐12.00 Tutorial Meet the Mentors  All tutors

12:30‐17:30 Self‐studyPrepare symposium/Grant 

proposal

8.30‐9.30 LectureOrganizing Clinical Research, a 

routemapDr. L. Duits‐Veltrop

9.30‐10.30Lecture gen therapy, a  risky business? Dr. G. van Willigen

10.30‐11.30 Lecture

Antisense‐mediated exon 

skipping: An approach with 

therapeutic potential for 

Duchenne muscular dystrophy and 

other diseases

Dr. A. Aartsma‐Rus

11.30‐13.00 Self studyPrepare Symposium/Grant 

proposal

13.00‐13.45 Symposium The epidemiologic transition Prof. dr. R. Westendorp

13.45‐14.30 The biodiversity hypothesis Prof. DRr. T. Haahtela

14.30‐15.00changing immune responses along 

the rural‐urban gradientProf. Dr. Yazdanbakhsh

15.00‐15.45Helminth infections and metabolic 

disordersDr. B. Guigas

15.45‐16.30 Parasites and immunity Prof. Dr/ R. Maizels

16.30 Eurolife Medal and drinkls

8.30‐10.00 LectureInnovative therapies: intellectual 

property & EU/US regulationsMr. I. de Nooijer

10.00‐10.30 Break

10.30‐11.30 LectureFrom bench to benchside: Stem 

cell‐based gene therapy for SCIDProf dr. F.J. Staal

11.30‐12.30 Lecture

An EU FP7 project towards the 

development of novel helminth 

vaccines

Dr. C.H. Hokke

13.30‐14.30 Tutorial Meet the Mentors All tutors

14:30‐17:30 Self studyPrepare Symposium/Grant 

proposal

8:30‐10:30 Self‐study Prepare round table discussion

10.30‐12.30 WorkgroupTowards personalized medicine for 

IT: pro and cons

 Dr. B. Guigas, Dr. R. Bredius, 

Dr. L.M. ‘t Hart

13:30‐17:30 Self studyPrepare Symposium/Grant 

proposal

8.30‐11.30 Site visitSite Visit Leiden BiosciencePark: 

Innovative Startup

11.30‐12.30 Tutorial Meet the Mentors All tutors

13:30‐17:30 Self studyPrepare Symposium/Grant 

proposal

Tuesday

28‐Oct‐2014

Monday

27‐Oct‐2014

Friday

31‐Oct‐2014

Thursday

30‐Oct‐2014

Wednesday

29‐Oct‐2014

Page 75: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

71 

 

Week 10:  

 

 

Time Activity Title Teacher

8.30‐10.30 Self studyPrepare Symposium/Grant 

proposal

10.30‐11.30 LecturePre‐ and probiotics for immune 

diseasesProf dr. H. Savelkoul

11.30‐12.30 LectureInnovative therapies: new 

approaches for vaccinationDr. J. Vellinga

13.30‐17.30 Self studyPrepare Symposium/Grant 

proposal

8.30‐10.30 Site visitSite Visit: Pharmacy manufacture 

at LUMC

Prof dr. H.J. Guchelaar (KFT), 

Dr. K. Schimmel (KFT)

10.30‐11.30 Tutorial Meet the Mentors  All tutors

11.30‐17.30 Self study

8.30‐10.00 Self study

Prepare ‘Journal Club’ lecture: 

read abstract and result section of 

the 3‐4 articles

10.00‐11.30 WorkgroupHot topics in innovative therapies: 

4 high‐ranking papersPost‐docs various groups

11.30‐12.30 Lecture Dealing with minor age for IT Dr. M. de Vries

13.30‐17.30 Self studyPrepare Symposium/Grant 

proposal

8.30‐17.30 Self studyPrepare Symposium/Grant 

proposal

8.30‐12.00 Symposium study group 1‐10 all tutors

13.00‐17.00 Symposium study group 11‐20 All tutors

Thursday

06‐nov‐14

Friday

07‐nov‐14

Monday

03‐nov‐14

Tuesday

04‐nov‐14

Wednesday

05‐nov‐14

Page 76: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

72 

 

Appendix A – Instructions for Final report week 8 

 

Instruction for students: 

 

Disease: MG/SLE/Allergy/aHus 

 

1. Introduction disease: 100‐150 words 2. Immunological mechanism  behind  disease  (+  figure  and  implementation  of  at  least  three 

relevant  research papers  found by  independent  literature  search) and  relation  to  involved organ: 600‐800 words 

3. Relation defective immune mechanisms and complaints patient: 200‐250 words 4. Questions for taking the patients history: 250‐300 words 5. Differential diagnosis: 250‐300 words 6. Diagnostic plan and predicted results: 300‐400 words  7. Therapeutic plan and method to check the effect: 300‐400 words 

 

Instruction for teachers: 

 

1. Introduction disease (100‐150 words): 0‐0.5 pnt 2. Immunological mechanism behind disease (600‐800 words):  

In‐depth explanation of pathogenic immunological components of disease 0‐2.0 pnt 

clear summary picture of involved immune mechanisms 0‐1.0 pnt 

collection and implementation of relevant research papers  0‐1.0 ptn  3. Relation defective immune mechanisms and complaints patient (200‐250 words): 0‐0.5 4. Questions for taking the patients history: 250‐300 words 0‐1.0 pnt 5. Differential diagnosis: 

a. Which  elements of  the presented  case  could  also be presented  in other diseases:            0‐0.5 pnt 

b. Which  additional  diagnostics  test would  you  order  to  discriminate  to  exclude  the differential diagnosis: 0‐0.5 pnt 

6. Diagnostic plan and predicted results: 300‐400 words 0‐1.5 pnt 7. Therapeutic plan and method to check the effect: 300‐400 words 0‐1.5 pnt 

   

Page 77: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

73 

 

Appendix B – Guidelines grant proposal poster presentation  

Description  Each group (two students) will build an original research grant proposal in which a gene/protein/signalling module/cell/tissue/… is proposed as a target for innovative therapeutic development in a immune disease‐orientated specific context. Students should formulate their research proposal based on current literature, new data, tempting viewpoints, and will be helped through recurrent interaction with their respective tutors. In the symposium at the end of the course each group will give a poster presentation of the proposal they intend to develop.   General aim  Imagine that you have discovered a target/method/process and now try to obtain a research contract from an institute, a funding/charity organization or a company for therapeutic development. Thus, try to first present an as attractive/innovative project as possible, and next give an as positive enthusiastic in‐depth presentation as you can that would convince a sceptical scientific board from these organizations.   Advices  Try to answer (some of) the following questions: What is the (basic) science behind the idea? How was this target/process/approach discovered/developed/validated? What will be the therapeutic indication? Is there already proof of principle in animal models or how would you go about it to obtain such knowledge? What is the approach that you envision for drug discovery, therapeutic and clinical development? Why is it a good target/process/method? Are there anticipated side effects? How is this target/process/method better than the products that are already on the market? Is there a market/will the drug/method/process make money? Also discuss potential opportunities and strategies for personalized treatment.  

 Guidelines for the poster creation and presentation   General aim  The poster is aimed for presenting your research grant proposal and generating active discussion with the audience. You will also be encouraged to participate in the discussions from other presenters.   Format  Prepare the poster in landscape Powerpoint format (an empty template will be provided on Blackboard). The poster may be structured, possibly but not mandatorily, as follows: title, introduction, aim/objectives, experimental approaches, expected results/outcomes and potential translation to human disease. Pay extra attention to the visibility, readability and originality of your poster in general and the figures in particular.   Design and layout advices  • Less is more. Be clear and concise with poster design and content.  • Make it obvious to the viewer how to progressively view the poster. The poster generally should read from left to right, and top to bottom. Numbering the individuals panels, or connecting them with arrows might be an option for a "guidance system".  • Keep the text brief (no more than one‐fourth of the poster space) and readable from couple of meters away. Use "visuals" (graphs, photographs, schematics, maps, etc.) to tell your "story".  • Cite and reference any sources of information other than your own.  

Page 78: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

74 

 

Presentation  All the posters should be ready from printing (on a USB stick or uploaded on Blackboard) before Thursday Nov 6th 1pm. During the symposium, the posters will be mounted and presented using both Powerpoint and a poster walk. For the Powerpoint presentation, 15 minutes will be allocated for each couple of students: 5 min to present their poster, followed by a ~ 10 min discussion. Following the presentations, there will be a poster walk in which 1 student will be answering questions at his/her poster while the other student will walk around and ask questions/grade the posters of the other grant proposals. Halfway the poster walk, students will switch places so all students had individual time to a) answer questions at their poster and b) walk around and ask questions/evaluate.  Assessment criteria  • Structure and feasibility of the grant idea outline  • Presence of a contingency plan  • Clarity and grammar of the writing  • Quality/originality of supportive graphical elements  • Presentation skills (concision, structured talk and capacity to bring forward the idea in limited time;   eagerness/enthusiasm 'to sell' your idea)  • Discussion (capacity to answer scientific questions and coping with 'criticism')     

Page 79: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

75 

 

Appendix C ‐ Assessment form  

Half minor: 

Name student: 

 

Exam  Mark Weight Passed/Failed*  Final**

Week 1+2     

Open question exam    0.1  

*Diagnosis report     

*Oral presentation laboratory     

Week 3‐8     

*Oral presentation patient casus     

*Report Neuro‐immunology     

*Oral presentation Rheumatology     

*Oral presentation Pulmonology     

*Report Nephrology     

**Final report (Week 8)    0.6  

Week 9+10     

Grant proposal poster topic teacher     

Grant proposal poster Week 9/10 

teacher 

   

Average two teachers    0.3  

Total     

**Final     

 

*At least 5/7 have to be Passed 

**To pass this half minor, both final report and final mark should be >5,5. 

Page 80: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

76 

 

Appendix D – Guideline diagnosis report (Passed/Failed)  

1. Summarize the most important laboratory results (raw data) of the requested tests. Point out both 

remarkable, unexpected data and the results relevant for the specific clinical question. (1 point) 

2.  Summarize  the  clinical  information  (relevant  history  taking/  physical  examination  and/or  other 

diagnostic  test  results)  in  no more  than  two  sentences. Make  up  your  differential  diagnosis  and 

estimate the pre‐test probability (highly suspected, suspected, not suspected) for the specific disease 

tested for. (1 point) 

3. Combine the clinical  information with the  laboratory data and estimate the post‐test probability. 

Use estimates of the test sensitivity and the specificity in order to estimate the risk of false positive 

and  false negative  test  results. Take  into account  the  type of  specimen,  timing of  sampling, and  if 

appropriate, sample handling/transport conditions that may have affected the test result. (3 points) 

4. Clearly formulate your conclusion / interpretation of the data relevant for the clinician. (3 points) 

5.  If  relevant,  add  a  suggestion  for  additional diagnostic  testing  (if  appropriate,  list  your updated 

differential  diagnosis,  and/or  follow‐up  samples).  If  relevant,  advise  the  optimal  specimen  (e.g. 

serology, biopsy, etc.) and/or timing of sampling. (1 point) 

6. Advise an appropriate therapy, if relevant. (1 point) 

Page 81: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

77 

 

Appendix E – Oral presentation lab visit (Passed/Failed) 

 

6. Prepare a presentation of 10‐15 min and include appropriate images 7. Explain the application of the diagnostic test (medical conditions) 8. Explain the principle of the diagnostic test  9. Show a typical test result (including the range of a ‘normal’ response) 10. Explain how these results should be interpreted 

Page 82: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

78 

 

Appendix F – Oral presentation patient casus (Passed/Failed) 

 

1. Prepare  a presentation  in  groups of maximal  5  students of  ~20 min  and  include  appropriate images 

2. Explain symptoms of the disease 3. Explain immune mechanism behind the disease 4. Explain the application of the diagnostic test (medical conditions) 5. Explain the principle of the diagnostic test  6. Show a typical test result (including the range of a ‘normal’ response) 7. Explain how these results should be interpreted 

 

   

Page 83: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

79 

 

Appendix G – Report neuro‐immunology (Passed/Failed) 

 

Review report  

Students  with MG  casus  for  the  report  of  week  8  should  choose  this  week  another  neuro‐immunological disorder 

In groups of max 5 students, one report (900‐1100 words) will be prepared consisting of: 

Background disease and symptoms (~200 words) 

Diagnosis (~200 words) 

Pathophysiology ((~200 words) 

State of art laboratory research (~200 words) 

Treatment (~200 words) 

Every student will prepare one chapter and each part is evaluated (passed/failed) separately 

 

Page 84: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

80 

 

Appendix  H  –  Guidelines  Oral  presentation  rheumatic  disease 

(Passed/Failed): 

 

Students with  SLE  casus  for  the  report of week 8  should  choose  this week  another  rheumatic disease 

In groups of max 5 students, one presentation of ~20 minutes will be prepared consisting of: 

Background disease and symptoms  

Diagnosis 

Immunological background of disease 

State of art laboratory research 

Treatment 

Every student will prepare one part of the presentation and three persons will present while the two 

others  will  answer  the  questions  in  the  discussion.  Each  student  is  evaluated  separately 

(passed/failed)

Page 85: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

81 

 

Appendix I – Oral presentation Pulmonology (Passed/Failed) 

 

Oral presentation Pulmonology:  

Students with  Allergy  case  for  the  report  of week  8  should  choose  this week  another  airway disease 

In  groups  of  students,  one  presentation  of  ~30  minutes  will  be  prepared  based  on  mini 

symposium 

Each student is evaluated separately 

 

Page 86: Module Book Clinical Immunology - med.unhas.ac.id · Clinical Immunology Module coordinators: Dr. M. Bax LUMC, Department of Rheumatology Email: m.bax@lumc.nl Dr. R.G.M. Bredius LUMC,

82 

 

Appendix J – Report nephrology (Passed/Failed) 

 

All  students  will  write  individually  a  small  report  (900‐1100  words)  about  one  target  therapy 

(belatacept, belimumab, eculizumab, alemtuzumab, rituximab, or ATG). Topics to be included in the 

report: 

• working mechanism  

• clinical evidence 

• effectiveness 

• safety