Company

LOGO

XAcircY DỰNG PHẦN MỀM

QUẢN LYacute CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA CAacuteC GIỐNG

VẬT NUOcircI VAgrave CAcircY TRỒNG Ở VIỆT NAM

TS Phạm Hạ Thủy

Dương Thị Hải Yến

Đại học Nocircng nghiệp Hagrave Nội

NỘI DUNG

Mở đầu

Sự cần thiết xacircy dựng CSDL về CTPT caacutec

giống vật nuocirci amp cacircy trồng của Việt Nam

Khaacutei niệm chỉ thị phacircn tử

Nội dung xacircy dựng

Giới thiệu PM quản lyacute CSDL chỉ thị phacircn tử của

cacircy luacutea ở ĐH Nocircng Nghiệp HN

Mở đầu

Trecircn Thế giới vagrave Việt Nam việc ứng dụng kỹ thuật ldquochỉ thị phacircn

tửrdquo(molecular marker) vagraveo việc nghiecircn cứu sinh học y sinh vagrave đặc

biệt trong lĩnh vực nocircng nghiệp đatilde đem lại nhiều thagravenh quả to lớn

Coacute nhiều loại ldquochỉ thị phacircn tửrdquo gắn với một chức năng hoặc sự

biến đổi gen coacute trong một caacute thể dẫn tới caacute thể đoacute coacute những tiacutenh

trạng nhất định Việc phaacutet hiện caacutec chỉ thị phacircn tử nagravey cho ta nhiều

thocircng tin cần thiết đối với một caacute thể

Người ta coacute thể sử dụng caacutec thiacute nghiệm để phaacutet hiện caacutec chỉ thị

phacircn tử nagravey Đối với mỗi chỉ thị phacircn tử thigrave coacute một qui trigravenh thiacute

nghiệm riecircng biệt đocirci khi cần chi phiacute lớn để tigravem ra được qui trigravenh thiacute

nghiệm thiacutech hợp

Việc tập hợp lưu trữ caacutec thocircng tin về chỉ thị phacircn tử cugraveng với

caacutec chỉ số kỹ thuật liecircn quan trong một cơ sở dữ liệu (CSDL) để

thuận tiện cho việc tigravem kiếm sử dụng lagrave hết sức cần thiết

Tổng quan tigravenh higravenh nghiecircn cứu

Tigravenh higravenh nghiecircn cứu nước ngoagravei Trong y học sử dụng để phaacutet hiện vagrave điều trị caacutec bệnh hiểm nghegraveo như ung

thư (Sidransky D 2002)[3]

Trong nocircng nghiệp lựa chọn caacutec giống luacutea khaacuteng bệnh rầy nacircu (Jie

Hu2010) [1]

Coacute nhiều CSDL chuyecircn biệt về chỉ thị phacircn tử được xacircy dựng tugravey theo lĩnh

vực aacutep dụng

Viện khoa học quốc gia về nocircng nghiệp của Hagraven Quốc (The National

Academy of Agricultural Science (NAAS) đatilde xacircy dựng một hệ CSDL caacutec

chỉ thị phacircn tử của cacircy luacutea dựa trecircn nền web (ChangKug Kim Ung Han

Yoon GangSeob Lee 2009)[2]

Trong năm 2013 Trung tacircm Thocircng tin Cocircng nghệ sinh học nocircng nghiệp

quốc gia (NABIC) của Nhật xacircy dựng lại một cơ sở dữ liệu chỉ thị phacircn tử

dựa trecircn web cho nguồn gen hữu iacutech [3]

Ngoagravei ra cograven nhiều caacutec hệ CSDL khaacutec như Kazusa Marker Database chứa

CSDL về chỉ thị phacircn tử của một số giống cacircy trồng như lạc khoai

tacircyhoặc Hệ Gramenehellip

NỘI DUNG

Mở đầu

Sự cần thiết xacircy dựng CSDL về CTPT caacutec

giống vật nuocirci amp cacircy trồng của Việt Nam

Khaacutei niệm chỉ thị phacircn tử

Nội dung xacircy dựng

Giới thiệu PM quản lyacute CSDL chỉ thị phacircn tử của

cacircy luacutea ở ĐH Nocircng Nghiệp HN

Mở đầu

Trecircn Thế giới vagrave Việt Nam việc ứng dụng kỹ thuật ldquochỉ thị phacircn

tửrdquo(molecular marker) vagraveo việc nghiecircn cứu sinh học y sinh vagrave đặc

biệt trong lĩnh vực nocircng nghiệp đatilde đem lại nhiều thagravenh quả to lớn

Coacute nhiều loại ldquochỉ thị phacircn tửrdquo gắn với một chức năng hoặc sự

biến đổi gen coacute trong một caacute thể dẫn tới caacute thể đoacute coacute những tiacutenh

trạng nhất định Việc phaacutet hiện caacutec chỉ thị phacircn tử nagravey cho ta nhiều

thocircng tin cần thiết đối với một caacute thể

Người ta coacute thể sử dụng caacutec thiacute nghiệm để phaacutet hiện caacutec chỉ thị

phacircn tử nagravey Đối với mỗi chỉ thị phacircn tử thigrave coacute một qui trigravenh thiacute

nghiệm riecircng biệt đocirci khi cần chi phiacute lớn để tigravem ra được qui trigravenh thiacute

nghiệm thiacutech hợp

Việc tập hợp lưu trữ caacutec thocircng tin về chỉ thị phacircn tử cugraveng với

caacutec chỉ số kỹ thuật liecircn quan trong một cơ sở dữ liệu (CSDL) để

thuận tiện cho việc tigravem kiếm sử dụng lagrave hết sức cần thiết

Tổng quan tigravenh higravenh nghiecircn cứu

Tigravenh higravenh nghiecircn cứu nước ngoagravei Trong y học sử dụng để phaacutet hiện vagrave điều trị caacutec bệnh hiểm nghegraveo như ung

thư (Sidransky D 2002)[3]

Trong nocircng nghiệp lựa chọn caacutec giống luacutea khaacuteng bệnh rầy nacircu (Jie

Hu2010) [1]

Coacute nhiều CSDL chuyecircn biệt về chỉ thị phacircn tử được xacircy dựng tugravey theo lĩnh

vực aacutep dụng

Viện khoa học quốc gia về nocircng nghiệp của Hagraven Quốc (The National

Academy of Agricultural Science (NAAS) đatilde xacircy dựng một hệ CSDL caacutec

chỉ thị phacircn tử của cacircy luacutea dựa trecircn nền web (ChangKug Kim Ung Han

Yoon GangSeob Lee 2009)[2]

Trong năm 2013 Trung tacircm Thocircng tin Cocircng nghệ sinh học nocircng nghiệp

quốc gia (NABIC) của Nhật xacircy dựng lại một cơ sở dữ liệu chỉ thị phacircn tử

dựa trecircn web cho nguồn gen hữu iacutech [3]

Ngoagravei ra cograven nhiều caacutec hệ CSDL khaacutec như Kazusa Marker Database chứa

CSDL về chỉ thị phacircn tử của một số giống cacircy trồng như lạc khoai

tacircyhoặc Hệ Gramenehellip

Mở đầu

Trecircn Thế giới vagrave Việt Nam việc ứng dụng kỹ thuật ldquochỉ thị phacircn

tửrdquo(molecular marker) vagraveo việc nghiecircn cứu sinh học y sinh vagrave đặc

biệt trong lĩnh vực nocircng nghiệp đatilde đem lại nhiều thagravenh quả to lớn

Coacute nhiều loại ldquochỉ thị phacircn tửrdquo gắn với một chức năng hoặc sự

biến đổi gen coacute trong một caacute thể dẫn tới caacute thể đoacute coacute những tiacutenh

trạng nhất định Việc phaacutet hiện caacutec chỉ thị phacircn tử nagravey cho ta nhiều

thocircng tin cần thiết đối với một caacute thể

Người ta coacute thể sử dụng caacutec thiacute nghiệm để phaacutet hiện caacutec chỉ thị

phacircn tử nagravey Đối với mỗi chỉ thị phacircn tử thigrave coacute một qui trigravenh thiacute

nghiệm riecircng biệt đocirci khi cần chi phiacute lớn để tigravem ra được qui trigravenh thiacute

nghiệm thiacutech hợp

Việc tập hợp lưu trữ caacutec thocircng tin về chỉ thị phacircn tử cugraveng với

caacutec chỉ số kỹ thuật liecircn quan trong một cơ sở dữ liệu (CSDL) để

thuận tiện cho việc tigravem kiếm sử dụng lagrave hết sức cần thiết

Tổng quan tigravenh higravenh nghiecircn cứu

Tigravenh higravenh nghiecircn cứu nước ngoagravei Trong y học sử dụng để phaacutet hiện vagrave điều trị caacutec bệnh hiểm nghegraveo như ung

thư (Sidransky D 2002)[3]

Trong nocircng nghiệp lựa chọn caacutec giống luacutea khaacuteng bệnh rầy nacircu (Jie

Hu2010) [1]

Coacute nhiều CSDL chuyecircn biệt về chỉ thị phacircn tử được xacircy dựng tugravey theo lĩnh

vực aacutep dụng

Viện khoa học quốc gia về nocircng nghiệp của Hagraven Quốc (The National

Academy of Agricultural Science (NAAS) đatilde xacircy dựng một hệ CSDL caacutec

chỉ thị phacircn tử của cacircy luacutea dựa trecircn nền web (ChangKug Kim Ung Han

Yoon GangSeob Lee 2009)[2]

Trong năm 2013 Trung tacircm Thocircng tin Cocircng nghệ sinh học nocircng nghiệp

quốc gia (NABIC) của Nhật xacircy dựng lại một cơ sở dữ liệu chỉ thị phacircn tử

dựa trecircn web cho nguồn gen hữu iacutech [3]

Ngoagravei ra cograven nhiều caacutec hệ CSDL khaacutec như Kazusa Marker Database chứa

CSDL về chỉ thị phacircn tử của một số giống cacircy trồng như lạc khoai

tacircyhoặc Hệ Gramenehellip

Tổng quan tigravenh higravenh nghiecircn cứu

Tigravenh higravenh nghiecircn cứu nước ngoagravei Trong y học sử dụng để phaacutet hiện vagrave điều trị caacutec bệnh hiểm nghegraveo như ung

thư (Sidransky D 2002)[3]

Trong nocircng nghiệp lựa chọn caacutec giống luacutea khaacuteng bệnh rầy nacircu (Jie

Hu2010) [1]

Coacute nhiều CSDL chuyecircn biệt về chỉ thị phacircn tử được xacircy dựng tugravey theo lĩnh

vực aacutep dụng

Viện khoa học quốc gia về nocircng nghiệp của Hagraven Quốc (The National

Academy of Agricultural Science (NAAS) đatilde xacircy dựng một hệ CSDL caacutec

chỉ thị phacircn tử của cacircy luacutea dựa trecircn nền web (ChangKug Kim Ung Han

Yoon GangSeob Lee 2009)[2]

Trong năm 2013 Trung tacircm Thocircng tin Cocircng nghệ sinh học nocircng nghiệp

quốc gia (NABIC) của Nhật xacircy dựng lại một cơ sở dữ liệu chỉ thị phacircn tử

dựa trecircn web cho nguồn gen hữu iacutech [3]

Ngoagravei ra cograven nhiều caacutec hệ CSDL khaacutec như Kazusa Marker Database chứa

CSDL về chỉ thị phacircn tử của một số giống cacircy trồng như lạc khoai

tacircyhoặc Hệ Gramenehellip

Tổng quan tigravenh higravenh nghiecircn cứu

Tigravenh higravenh trong nước

Trong những năm gần đacircy caacutec nhagrave khoa học chuacute yacute nghiecircn cứu sử

dụng chỉ thị phacircn tử trong việc chọn caacutec giống luacutea thơm (Phan Hữu Tocircn

Tống Văn Hải 2010)[7] nghiecircn cứu tiacutenh đa dạng di truyền của đậu tương

(Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea 2010) [5] chuẩn đoaacuten

bệnh cho tocircm he (Nguyễn Chiacute Thuận 2005) [6]

- Phạm Thị Bảy vagrave cộng sự đatilde phacircn tiacutech phacircn tử AND của caacutec dograveng

luacutea chọn lọc đatilde phaacutet hiện dograveng B12 mang đoạn AND dagravei 1200bp lagrave đoạn

AND liecircn kết chặt chẽ với gen khaacuteng Pi-2(t) vagrave dograveng B12 khaacuteng 100 với

4 nogravei nấm lacircy bệnh

- Lưu Thị Ngọc Huyền Vũ Đức Quang vagrave cộng sự đatilde lập bản đồ phacircn

tử cho 3 gen khaacuteng rầy nacircuhellip

Caacutec thocircng tin về chỉ thị phacircn tử mới chỉ được lưu trữ tản maacutet ở caacutec

cocircng trigravenh nghiecircn cứu chưa coacute một cơ sở dữ liệu chuyecircn biệt về chỉ thị

phacircn tử

Sự cần thiết phải xacircy dựng CSDL CTPT

của Việt Nam

Nếu coacute sẵn caacutec CSDL về CTPT thigrave caacutec nhagrave nghiecircn cứu dễ

dagraveng sử dụng caacutec thocircng tin vagraveo cocircng việc của migravenh giảm bớt

thời gian vagrave chi phiacute

Mặc dugrave trecircn thế giới coacute nhiều CSDL sinh học vagrave chỉ thị phacircn tử

riecircng biệt nhưng việc truy cập ngagravey cagraveng trở necircn khoacute khăn vagrave

phải chi phiacute

Caacutec giống vật nuocirci cacircy trồng ở Việt Nam coacute đặc thugrave riecircng do

vậy caacutec CTPT cũng coacute sự khaacutec biệt

Cần phải coacute caacutec CSDL về CTPT riecircng của VN để coacute thể chủ

động khai thaacutec sử dụnghellip

Việt Nam coacute đủ nhacircn lực vagrave khả năng để xacircy dựng riecircng những

CSDL nagravey

GIỚI THIỆU VỀ CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

Chỉ thị phacircn tử

(Molecular Marker) được xaacutec

định như chỉ thị di truyền

(Genetic Markers) lagrave một gen

hoặc đoạn trigravenh tự DNA magrave vị

triacute của chuacuteng đatilde được biết

trecircn một nhiễm sắc thể magrave coacute

thể được sử dụng để xaacutec

định đặc tiacutenh của caacutec caacute thể

hay caacutec loagravei

The DNA sequences and length of the Thinopyrum elongatum 7E

chromosome-specific molecular marker M7E_No2

Cấu truacutec DNA vagrave chiều dagravei của chỉ thị phacircn tử M7E_No2 trecircn nhiễm sắc thể 7E

của giống luacutea migrave dại Thinopyrum elongatum ndash liecircn quan đến tiacutenh khaacuteng rầy vagrave

bệnh rỉ seacutet

Caacutec kiểu của chỉ thị phacircn tử

RFLP Marker (Restriction fragment length polymorphism markers)

SSLP Marker (Simple sequence length polymorphism markers)

AFLP Marker (Amplified fragment length polymorphism markers)

RAPD Marker (Random amplification of polymorphic DNA markers)

VNTR Marker (Variable number tandem repeat markers)

SNP Marker ( Single nucleotide polymorphism markers)

STR Marker (Short tandem repeat markers)

Đối với mỗi kiểu chỉ thị phacircn tử sẽ coacute một quy trigravenhthiacute nghiệm vagrave primer đặc hiệu để phaacutet hiện (coacute thể baogồm caacutec bước taacutech chiết vật liệu di truyền khuếch đạiPCR phacircn tiacutech trigravenh tự bằng điện di hoặc phương phaacutepkhaacutec)

KỸ THUẬT KHUẾCH ĐẠI PCR

bull PCR lagrave chữ viết tắt của cụm từ Polymerase Chain Reaction

được dịch ở một vagravei saacutech lagrave Phản ứng chuỗi trugraveng hợp cũng

coacute saacutech gọi lagrave phản ứng khuếch đại gen PCR lagrave một kỹ thuật

phổ biến trong sinh học phacircn tử nhằm khuếch đại (tạo ra nhiều

bản sao) một đoạn DNA magrave khocircng cần sử dụng caacutec sinh vật

sống như E coli hay nấm men PCR được sử dụng trong caacutec

nghiecircn cứu sinh học vagrave y học phục vụ nhiều mục điacutech khaacutec

nhau như phaacutet hiện caacutec bệnh di truyền nhận dạng chẩn đoaacuten

những bệnh nhiễm trugraveng taacutech dograveng gene vagrave xaacutec định huyết

thống chọn giốnghellip

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrpdfPCRpdf

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrprinciplespcranihtml

XAcircY DỰNG

CƠ SỞ DỮ LiỆU CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

Sự cần thiết phải xacircy dựng CSDL CTPT

của Việt Nam

Nếu coacute sẵn caacutec CSDL về CTPT thigrave caacutec nhagrave nghiecircn cứu dễ

dagraveng sử dụng caacutec thocircng tin vagraveo cocircng việc của migravenh giảm bớt

thời gian vagrave chi phiacute

Mặc dugrave trecircn thế giới coacute nhiều CSDL sinh học vagrave chỉ thị phacircn tử

riecircng biệt nhưng việc truy cập ngagravey cagraveng trở necircn khoacute khăn vagrave

phải chi phiacute

Caacutec giống vật nuocirci cacircy trồng ở Việt Nam coacute đặc thugrave riecircng do

vậy caacutec CTPT cũng coacute sự khaacutec biệt

Cần phải coacute caacutec CSDL về CTPT riecircng của VN để coacute thể chủ

động khai thaacutec sử dụnghellip

Việt Nam coacute đủ nhacircn lực vagrave khả năng để xacircy dựng riecircng những

CSDL nagravey

GIỚI THIỆU VỀ CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

Chỉ thị phacircn tử

(Molecular Marker) được xaacutec

định như chỉ thị di truyền

(Genetic Markers) lagrave một gen

hoặc đoạn trigravenh tự DNA magrave vị

triacute của chuacuteng đatilde được biết

trecircn một nhiễm sắc thể magrave coacute

thể được sử dụng để xaacutec

định đặc tiacutenh của caacutec caacute thể

hay caacutec loagravei

The DNA sequences and length of the Thinopyrum elongatum 7E

chromosome-specific molecular marker M7E_No2

Cấu truacutec DNA vagrave chiều dagravei của chỉ thị phacircn tử M7E_No2 trecircn nhiễm sắc thể 7E

của giống luacutea migrave dại Thinopyrum elongatum ndash liecircn quan đến tiacutenh khaacuteng rầy vagrave

bệnh rỉ seacutet

Caacutec kiểu của chỉ thị phacircn tử

RFLP Marker (Restriction fragment length polymorphism markers)

SSLP Marker (Simple sequence length polymorphism markers)

AFLP Marker (Amplified fragment length polymorphism markers)

RAPD Marker (Random amplification of polymorphic DNA markers)

VNTR Marker (Variable number tandem repeat markers)

SNP Marker ( Single nucleotide polymorphism markers)

STR Marker (Short tandem repeat markers)

Đối với mỗi kiểu chỉ thị phacircn tử sẽ coacute một quy trigravenhthiacute nghiệm vagrave primer đặc hiệu để phaacutet hiện (coacute thể baogồm caacutec bước taacutech chiết vật liệu di truyền khuếch đạiPCR phacircn tiacutech trigravenh tự bằng điện di hoặc phương phaacutepkhaacutec)

KỸ THUẬT KHUẾCH ĐẠI PCR

bull PCR lagrave chữ viết tắt của cụm từ Polymerase Chain Reaction

được dịch ở một vagravei saacutech lagrave Phản ứng chuỗi trugraveng hợp cũng

coacute saacutech gọi lagrave phản ứng khuếch đại gen PCR lagrave một kỹ thuật

phổ biến trong sinh học phacircn tử nhằm khuếch đại (tạo ra nhiều

bản sao) một đoạn DNA magrave khocircng cần sử dụng caacutec sinh vật

sống như E coli hay nấm men PCR được sử dụng trong caacutec

nghiecircn cứu sinh học vagrave y học phục vụ nhiều mục điacutech khaacutec

nhau như phaacutet hiện caacutec bệnh di truyền nhận dạng chẩn đoaacuten

những bệnh nhiễm trugraveng taacutech dograveng gene vagrave xaacutec định huyết

thống chọn giốnghellip

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrpdfPCRpdf

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrprinciplespcranihtml

XAcircY DỰNG

CƠ SỞ DỮ LiỆU CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

GIỚI THIỆU VỀ CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

Chỉ thị phacircn tử

(Molecular Marker) được xaacutec

định như chỉ thị di truyền

(Genetic Markers) lagrave một gen

hoặc đoạn trigravenh tự DNA magrave vị

triacute của chuacuteng đatilde được biết

trecircn một nhiễm sắc thể magrave coacute

thể được sử dụng để xaacutec

định đặc tiacutenh của caacutec caacute thể

hay caacutec loagravei

The DNA sequences and length of the Thinopyrum elongatum 7E

chromosome-specific molecular marker M7E_No2

Cấu truacutec DNA vagrave chiều dagravei của chỉ thị phacircn tử M7E_No2 trecircn nhiễm sắc thể 7E

của giống luacutea migrave dại Thinopyrum elongatum ndash liecircn quan đến tiacutenh khaacuteng rầy vagrave

bệnh rỉ seacutet

Caacutec kiểu của chỉ thị phacircn tử

RFLP Marker (Restriction fragment length polymorphism markers)

SSLP Marker (Simple sequence length polymorphism markers)

AFLP Marker (Amplified fragment length polymorphism markers)

RAPD Marker (Random amplification of polymorphic DNA markers)

VNTR Marker (Variable number tandem repeat markers)

SNP Marker ( Single nucleotide polymorphism markers)

STR Marker (Short tandem repeat markers)

Đối với mỗi kiểu chỉ thị phacircn tử sẽ coacute một quy trigravenhthiacute nghiệm vagrave primer đặc hiệu để phaacutet hiện (coacute thể baogồm caacutec bước taacutech chiết vật liệu di truyền khuếch đạiPCR phacircn tiacutech trigravenh tự bằng điện di hoặc phương phaacutepkhaacutec)

KỸ THUẬT KHUẾCH ĐẠI PCR

bull PCR lagrave chữ viết tắt của cụm từ Polymerase Chain Reaction

được dịch ở một vagravei saacutech lagrave Phản ứng chuỗi trugraveng hợp cũng

coacute saacutech gọi lagrave phản ứng khuếch đại gen PCR lagrave một kỹ thuật

phổ biến trong sinh học phacircn tử nhằm khuếch đại (tạo ra nhiều

bản sao) một đoạn DNA magrave khocircng cần sử dụng caacutec sinh vật

sống như E coli hay nấm men PCR được sử dụng trong caacutec

nghiecircn cứu sinh học vagrave y học phục vụ nhiều mục điacutech khaacutec

nhau như phaacutet hiện caacutec bệnh di truyền nhận dạng chẩn đoaacuten

những bệnh nhiễm trugraveng taacutech dograveng gene vagrave xaacutec định huyết

thống chọn giốnghellip

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrpdfPCRpdf

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrprinciplespcranihtml

XAcircY DỰNG

CƠ SỞ DỮ LiỆU CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

The DNA sequences and length of the Thinopyrum elongatum 7E

chromosome-specific molecular marker M7E_No2

Cấu truacutec DNA vagrave chiều dagravei của chỉ thị phacircn tử M7E_No2 trecircn nhiễm sắc thể 7E

của giống luacutea migrave dại Thinopyrum elongatum ndash liecircn quan đến tiacutenh khaacuteng rầy vagrave

bệnh rỉ seacutet

Caacutec kiểu của chỉ thị phacircn tử

RFLP Marker (Restriction fragment length polymorphism markers)

SSLP Marker (Simple sequence length polymorphism markers)

AFLP Marker (Amplified fragment length polymorphism markers)

RAPD Marker (Random amplification of polymorphic DNA markers)

VNTR Marker (Variable number tandem repeat markers)

SNP Marker ( Single nucleotide polymorphism markers)

STR Marker (Short tandem repeat markers)

Đối với mỗi kiểu chỉ thị phacircn tử sẽ coacute một quy trigravenhthiacute nghiệm vagrave primer đặc hiệu để phaacutet hiện (coacute thể baogồm caacutec bước taacutech chiết vật liệu di truyền khuếch đạiPCR phacircn tiacutech trigravenh tự bằng điện di hoặc phương phaacutepkhaacutec)

KỸ THUẬT KHUẾCH ĐẠI PCR

bull PCR lagrave chữ viết tắt của cụm từ Polymerase Chain Reaction

được dịch ở một vagravei saacutech lagrave Phản ứng chuỗi trugraveng hợp cũng

coacute saacutech gọi lagrave phản ứng khuếch đại gen PCR lagrave một kỹ thuật

phổ biến trong sinh học phacircn tử nhằm khuếch đại (tạo ra nhiều

bản sao) một đoạn DNA magrave khocircng cần sử dụng caacutec sinh vật

sống như E coli hay nấm men PCR được sử dụng trong caacutec

nghiecircn cứu sinh học vagrave y học phục vụ nhiều mục điacutech khaacutec

nhau như phaacutet hiện caacutec bệnh di truyền nhận dạng chẩn đoaacuten

những bệnh nhiễm trugraveng taacutech dograveng gene vagrave xaacutec định huyết

thống chọn giốnghellip

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrpdfPCRpdf

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrprinciplespcranihtml

XAcircY DỰNG

CƠ SỞ DỮ LiỆU CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

Caacutec kiểu của chỉ thị phacircn tử

RFLP Marker (Restriction fragment length polymorphism markers)

SSLP Marker (Simple sequence length polymorphism markers)

AFLP Marker (Amplified fragment length polymorphism markers)

RAPD Marker (Random amplification of polymorphic DNA markers)

VNTR Marker (Variable number tandem repeat markers)

SNP Marker ( Single nucleotide polymorphism markers)

STR Marker (Short tandem repeat markers)

Đối với mỗi kiểu chỉ thị phacircn tử sẽ coacute một quy trigravenhthiacute nghiệm vagrave primer đặc hiệu để phaacutet hiện (coacute thể baogồm caacutec bước taacutech chiết vật liệu di truyền khuếch đạiPCR phacircn tiacutech trigravenh tự bằng điện di hoặc phương phaacutepkhaacutec)

KỸ THUẬT KHUẾCH ĐẠI PCR

bull PCR lagrave chữ viết tắt của cụm từ Polymerase Chain Reaction

được dịch ở một vagravei saacutech lagrave Phản ứng chuỗi trugraveng hợp cũng

coacute saacutech gọi lagrave phản ứng khuếch đại gen PCR lagrave một kỹ thuật

phổ biến trong sinh học phacircn tử nhằm khuếch đại (tạo ra nhiều

bản sao) một đoạn DNA magrave khocircng cần sử dụng caacutec sinh vật

sống như E coli hay nấm men PCR được sử dụng trong caacutec

nghiecircn cứu sinh học vagrave y học phục vụ nhiều mục điacutech khaacutec

nhau như phaacutet hiện caacutec bệnh di truyền nhận dạng chẩn đoaacuten

những bệnh nhiễm trugraveng taacutech dograveng gene vagrave xaacutec định huyết

thống chọn giốnghellip

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrpdfPCRpdf

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrprinciplespcranihtml

XAcircY DỰNG

CƠ SỞ DỮ LiỆU CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

KỸ THUẬT KHUẾCH ĐẠI PCR

bull PCR lagrave chữ viết tắt của cụm từ Polymerase Chain Reaction

được dịch ở một vagravei saacutech lagrave Phản ứng chuỗi trugraveng hợp cũng

coacute saacutech gọi lagrave phản ứng khuếch đại gen PCR lagrave một kỹ thuật

phổ biến trong sinh học phacircn tử nhằm khuếch đại (tạo ra nhiều

bản sao) một đoạn DNA magrave khocircng cần sử dụng caacutec sinh vật

sống như E coli hay nấm men PCR được sử dụng trong caacutec

nghiecircn cứu sinh học vagrave y học phục vụ nhiều mục điacutech khaacutec

nhau như phaacutet hiện caacutec bệnh di truyền nhận dạng chẩn đoaacuten

những bệnh nhiễm trugraveng taacutech dograveng gene vagrave xaacutec định huyết

thống chọn giốnghellip

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrpdfPCRpdf

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrprinciplespcranihtml

XAcircY DỰNG

CƠ SỞ DỮ LiỆU CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrpdfPCRpdf

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrprinciplespcranihtml

XAcircY DỰNG

CƠ SỞ DỮ LiỆU CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

KỸ THUẬT PCR

httpusersugentbe~avierstrprinciplespcranihtml

XAcircY DỰNG

CƠ SỞ DỮ LiỆU CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

XAcircY DỰNG

CƠ SỞ DỮ LiỆU CHỈ THỊ PHAcircN TỬ

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

bull MỘT SỐ CSDL CHỈ THỊ PHAcircN TỬ CỦA

NƯỚC NGOAgraveI ĐANG ĐƯỢC XAcircY DỰNG

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

CmMDb A Versatile Database for Cucumis

meloMicrosatellite Markers and Other

Horticulture Crop Research

bull Published online 2015 Apr 17 doi 101371journalpone0118630

bull PMCID PMC4401682

Abtract

TheCucumis melo L microsatellite database

(CmMDbhttp65181125102cmmdb2indexhtml) encompasses

39072 SSR markers along with its motif repeat motif length motif

sequence marker ID motif type and chromosomal locations The

database is featured with novel automated primer designing facility

to meet the needs of wet lab researchers CmMDb is a freely

available web resource that facilitates the researchers to select the

most appropriate markers for marker-assisted selection in melons

and to improve breeding strategies

CerealsDB web-site

bull The CerealsDB web-site was created by members of the

Functional Genomics Group at the University of Bristol

The site provides a range of facilities for the study of the

wheat genome The site has been designed with

breeders in mind and we hope that is will be easy and

straightforward to use Principally the site is aimed at

those who wish to obtain information about SNP

markers eg the sequence upon which they are based

obtain primers used for their identification identify the

haplotypes of common UK varieties These publicly

funded resources are available as an on-line searchable

database

bull The last update to the database was Februrary 2015

NABIC marker database A molecular markers

information network of agricultural cropsChang-Kug Kim

bull Abstractbull In 2013 National Agricultural Biotechnology Information Center

(NABIC) reconstructs a molecular marker database for useful

genetic resources The web-based marker database consists of

three major functional categories map viewer RSN marker and

gene annotation It provides 7250 marker locations 3301 RSN

marker property 3280 molecular marker annotation information in

agricultural plants The individual molecular marker provides

information such as marker name expressed sequence tag number

gene definition and general marker information This updated

marker-based database provides useful information through a user-

friendly web interface that assisted in tracing any new structures of

the chromosomes and gene positional functions using specific

molecular markers

NABIC marker database A molecular markers

information network of agricultural cropsChang-Kug Kim

bull Abstractbull In 2013 National Agricultural Biotechnology Information Center

(NABIC) reconstructs a molecular marker database for useful

genetic resources The web-based marker database consists of

three major functional categories map viewer RSN marker and

gene annotation It provides 7250 marker locations 3301 RSN

marker property 3280 molecular marker annotation information in

agricultural plants The individual molecular marker provides

information such as marker name expressed sequence tag number

gene definition and general marker information This updated

marker-based database provides useful information through a user-

friendly web interface that assisted in tracing any new structures of

the chromosomes and gene positional functions using specific

molecular markers

PlantMarkersmdasha database of predicted molecular

markers from plantsStephen Rudd1 Heiko Schoof23 and Klaus Mayer3

bull ABSTRACT

bull Molecular markers are required in a broad spectrum of gene

screening approaches ranging from gene-mapping within traditional

lsquoforwardrsquo-genetics approaches through QTL identification studies to

genotyping and haplotyping studies As we enter the post-genomics

era the need for genetic markers does not diminish even in the

species with fully sequenced genomes PlantMarkers is a genetic

marker database that contains a comprehensive pool of predicted

molecular markers We have adopted contemporary techniques to

identify putative single nucleotide polymorphism (SNP) simple

sequence repeat (SSR) and conserved orthologue set markers A

systematic approach to identify as broad a range of putative markers

has been undertaken by screening the available openSputnik

Xacircy dựng phần mềm quản lyacute CSDL

về chỉ thị phacircn tử

Caacutec thocircng tin cần lưu giữ trong CSDL

- Chỉ số ID

- Tecircn của chỉ thị phacircn tử

- Kiểu chỉ thị phacircn tử (SNP RFLP markerhellip)

- Vị triacute trecircn nhiễm sắc thể

- Trigravenh tự mồi xuocirci (fwd primer seq)

- Trigravenh tự mồi ngược (rev primer seq)

- Điều kiện cho phản ứng PCR

- Tecircn của loagravei (vật nuocirci cacircy trồng)

- Tiacutenh trạng của vật nuocirci cacircy trồng liecircn quan

- Tagravei liệu baacuteo caacuteo liecircn quan (toacutem tắt hoặc toagraven văn)

Thu thập vagrave tổ chức thocircng tin

Caacutec thocircng tin về chỉ thị phacircn tử được thu thập vagrave

chọn lọc từ caacutec nguồn sau

Từ caacutec baacuteo caacuteo của caacutec nghiecircn cứu trong vagrave ngoagravei

nước

Từ caacutec CSDL coacute sẵn của caacutec tổ chức khoa học coacute

uy tiacuten (viacute dụ NCBI UniProthellip)

Caacutec dữ liệu thocircng tin thu thập được sẽ được xử lyacute

ruacutet ra caacutec thocircng tin cần thiết cho một chỉ thị phacircn tử

được lưu trữ

Cocircng cụ xacircy dựng - Mocirci trường cagravei đặt

Phần mềm nagravey coacute thể được xacircy dựng bằng một ngocircn

ngữ lập trigravenh web như ASPNET PHPhellip

Hệ điều hagravenh WINDOWS LINUXhellip

Cagravei đặt trecircn một maacutey chủ được kết nối với mạng nội

bộ hoặc internet để cho người dugraveng (được pheacutep) coacute

thể truy cập vagraveo sử dụng khai thaacutec

Caacutec lĩnh vực sử dụng nghiecircn cứu chăn nuocirci trồng

trọt nghiecircn cứu khoa học giảng dạy vagrave học tậphellip

Giới thiệu phần mềm quản lyacute

CTPT của cacircy luacutea

Được xacircy dựng thử nghiệm trong năm 2013

Thocircng tin được thu thập chủ yếu từ caacutec cocircng trigravenh

nghiecircn cứu của caacutec nhagrave khoa học trong nước vagrave Đại

học Nocircng nghiệp Hagrave Nội

Caacutec chức năng chiacutenh của chương trigravenh

1 Cập nhật lưu trữ caacutec thocircng tin cơ bản của caacutec

chỉ thị CTPT của cacircy luacutea ở Việt Nam

2 Tigravem kiếm tra cứu caacutec CTPT theo kiểu tecircn caacutec

cocircng trigravenh nghiecircn cứu liecircn quan

Phần mềm đatilde được cagravei đặt vagrave chạy thử nghiệm

thagravenh cocircng trecircn maacutey chủ của Khoa CNTT ndash ĐH NNHN

Một số giao diện của phần mềm

Giao diện chiacutenh

Giao diện tigravem kiếm theo tecircn CTPT

Giao diện tigravem kiếm theo kiểu CTPT

Kết luận

Việc sử dụng kỹ thuật chỉ thị phacircn tử trong lựa chọn giống

vật nuocirci vagrave cacircy trồng cho năng suất cao vagrave chịu chống bệnh lagrave

kỹ thuật phổ biến ở nước ngoagravei ở Việt Nam mới chỉ bước

đầu

Việc xacircy dựng caacutec CSDL về CTPP của caacutec giống vật nuocirci

vagrave cacircy trồng coacute yacute nghĩa đặt biệt đối với việc phaacutet triển sản xuất

nocircng nghiệp cũng như lĩnh vực nghiecircn cứu tin sinh học ở VN

Từng bước xacircy dựng CSDL cho từng giống cacircy trồng vagrave

vật nuocirci

Đogravei hỏi sự cộng taacutec của nhiều nhagrave nghiecircn cứu trong vagrave

nước ngoagravei

Tagravei liệu tham khảo

[1]Jie Hu Xin Li Changjun Wu Changju Yang Hongxia Hua Guanjun GaoJinghua Xiao Yuqi

ng He (2010) ldquoPyramiding and evaluation of the brown planthopper resistance

genes Bph14and Bph15 in hybrid ricerdquo Molecular BreedingVolume 29 Number 1 61-

69 DOI 101007s11032-010-9526-x

[2] Kim ChangKug Yoon UngHan Lee GangSeob Lee HwanKi Kim YongHwan Hahn JangHo

(2009) ldquoRice genetic marker database An identification of single nucleotide polymorphism

(SNP) and quantitative trait loci (QTL) markerrdquo African Journal of Biotechnology Vol 8 (13) pp

2963-2967 6 July 2009

[3] Kim et al (2013) ldquoNABIC marker database A molecular markers information network of

agricultural cropsrdquoBioinformation 9(17) 887-888 (2013)

[4] Sidransky D (2002) ldquoEmerging molecular markers of cancerrdquo Nat Rev Cancer 2002

Mar2(3)210-219

[5] Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea(2010) ldquoPhacircn tiacutech tiacutenh đa dạng di truyền

của đậu tương bằng chỉ thị phacircn tử SSRrdquo Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4

638 - 646

[6] Nguyễn Chiacute Thuận (2005) Nghiecircn cứu ứng dụng chỉ thị phacircn tử chẩn đoaacuten bệnh ở tocircm he

(Penaeus spp) nuocirci tại Việt Nam Kỷ yếu hội thảo toagraven quốc về nghiecircn cứu vagrave ứng dụng khoa

học cocircng nghệ nuocirci trồng thủy sản 2005Số 0 751 - 759

[7] Phan Hữu Tocircn Tống Văn Hải (2010) Sagraveng lọc caacutec giống luacutea coacute chứa gen mugravei thơm bằng

chỉ thị phacircn tử Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4 646 - 652

Thu thập vagrave tổ chức thocircng tin

Caacutec thocircng tin về chỉ thị phacircn tử được thu thập vagrave

chọn lọc từ caacutec nguồn sau

Từ caacutec baacuteo caacuteo của caacutec nghiecircn cứu trong vagrave ngoagravei

nước

Từ caacutec CSDL coacute sẵn của caacutec tổ chức khoa học coacute

uy tiacuten (viacute dụ NCBI UniProthellip)

Caacutec dữ liệu thocircng tin thu thập được sẽ được xử lyacute

ruacutet ra caacutec thocircng tin cần thiết cho một chỉ thị phacircn tử

được lưu trữ

Cocircng cụ xacircy dựng - Mocirci trường cagravei đặt

Phần mềm nagravey coacute thể được xacircy dựng bằng một ngocircn

ngữ lập trigravenh web như ASPNET PHPhellip

Hệ điều hagravenh WINDOWS LINUXhellip

Cagravei đặt trecircn một maacutey chủ được kết nối với mạng nội

bộ hoặc internet để cho người dugraveng (được pheacutep) coacute

thể truy cập vagraveo sử dụng khai thaacutec

Caacutec lĩnh vực sử dụng nghiecircn cứu chăn nuocirci trồng

trọt nghiecircn cứu khoa học giảng dạy vagrave học tậphellip

Giới thiệu phần mềm quản lyacute

CTPT của cacircy luacutea

Được xacircy dựng thử nghiệm trong năm 2013

Thocircng tin được thu thập chủ yếu từ caacutec cocircng trigravenh

nghiecircn cứu của caacutec nhagrave khoa học trong nước vagrave Đại

học Nocircng nghiệp Hagrave Nội

Caacutec chức năng chiacutenh của chương trigravenh

1 Cập nhật lưu trữ caacutec thocircng tin cơ bản của caacutec

chỉ thị CTPT của cacircy luacutea ở Việt Nam

2 Tigravem kiếm tra cứu caacutec CTPT theo kiểu tecircn caacutec

cocircng trigravenh nghiecircn cứu liecircn quan

Phần mềm đatilde được cagravei đặt vagrave chạy thử nghiệm

thagravenh cocircng trecircn maacutey chủ của Khoa CNTT ndash ĐH NNHN

Một số giao diện của phần mềm

Giao diện chiacutenh

Giao diện tigravem kiếm theo tecircn CTPT

Giao diện tigravem kiếm theo kiểu CTPT

Kết luận

Việc sử dụng kỹ thuật chỉ thị phacircn tử trong lựa chọn giống

vật nuocirci vagrave cacircy trồng cho năng suất cao vagrave chịu chống bệnh lagrave

kỹ thuật phổ biến ở nước ngoagravei ở Việt Nam mới chỉ bước

đầu

Việc xacircy dựng caacutec CSDL về CTPP của caacutec giống vật nuocirci

vagrave cacircy trồng coacute yacute nghĩa đặt biệt đối với việc phaacutet triển sản xuất

nocircng nghiệp cũng như lĩnh vực nghiecircn cứu tin sinh học ở VN

Từng bước xacircy dựng CSDL cho từng giống cacircy trồng vagrave

vật nuocirci

Đogravei hỏi sự cộng taacutec của nhiều nhagrave nghiecircn cứu trong vagrave

nước ngoagravei

Tagravei liệu tham khảo

[1]Jie Hu Xin Li Changjun Wu Changju Yang Hongxia Hua Guanjun GaoJinghua Xiao Yuqi

ng He (2010) ldquoPyramiding and evaluation of the brown planthopper resistance

genes Bph14and Bph15 in hybrid ricerdquo Molecular BreedingVolume 29 Number 1 61-

69 DOI 101007s11032-010-9526-x

[2] Kim ChangKug Yoon UngHan Lee GangSeob Lee HwanKi Kim YongHwan Hahn JangHo

(2009) ldquoRice genetic marker database An identification of single nucleotide polymorphism

(SNP) and quantitative trait loci (QTL) markerrdquo African Journal of Biotechnology Vol 8 (13) pp

2963-2967 6 July 2009

[3] Kim et al (2013) ldquoNABIC marker database A molecular markers information network of

agricultural cropsrdquoBioinformation 9(17) 887-888 (2013)

[4] Sidransky D (2002) ldquoEmerging molecular markers of cancerrdquo Nat Rev Cancer 2002

Mar2(3)210-219

[5] Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea(2010) ldquoPhacircn tiacutech tiacutenh đa dạng di truyền

của đậu tương bằng chỉ thị phacircn tử SSRrdquo Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4

638 - 646

[6] Nguyễn Chiacute Thuận (2005) Nghiecircn cứu ứng dụng chỉ thị phacircn tử chẩn đoaacuten bệnh ở tocircm he

(Penaeus spp) nuocirci tại Việt Nam Kỷ yếu hội thảo toagraven quốc về nghiecircn cứu vagrave ứng dụng khoa

học cocircng nghệ nuocirci trồng thủy sản 2005Số 0 751 - 759

[7] Phan Hữu Tocircn Tống Văn Hải (2010) Sagraveng lọc caacutec giống luacutea coacute chứa gen mugravei thơm bằng

chỉ thị phacircn tử Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4 646 - 652

Cocircng cụ xacircy dựng - Mocirci trường cagravei đặt

Phần mềm nagravey coacute thể được xacircy dựng bằng một ngocircn

ngữ lập trigravenh web như ASPNET PHPhellip

Hệ điều hagravenh WINDOWS LINUXhellip

Cagravei đặt trecircn một maacutey chủ được kết nối với mạng nội

bộ hoặc internet để cho người dugraveng (được pheacutep) coacute

thể truy cập vagraveo sử dụng khai thaacutec

Caacutec lĩnh vực sử dụng nghiecircn cứu chăn nuocirci trồng

trọt nghiecircn cứu khoa học giảng dạy vagrave học tậphellip

Giới thiệu phần mềm quản lyacute

CTPT của cacircy luacutea

Được xacircy dựng thử nghiệm trong năm 2013

Thocircng tin được thu thập chủ yếu từ caacutec cocircng trigravenh

nghiecircn cứu của caacutec nhagrave khoa học trong nước vagrave Đại

học Nocircng nghiệp Hagrave Nội

Caacutec chức năng chiacutenh của chương trigravenh

1 Cập nhật lưu trữ caacutec thocircng tin cơ bản của caacutec

chỉ thị CTPT của cacircy luacutea ở Việt Nam

2 Tigravem kiếm tra cứu caacutec CTPT theo kiểu tecircn caacutec

cocircng trigravenh nghiecircn cứu liecircn quan

Phần mềm đatilde được cagravei đặt vagrave chạy thử nghiệm

thagravenh cocircng trecircn maacutey chủ của Khoa CNTT ndash ĐH NNHN

Một số giao diện của phần mềm

Giao diện chiacutenh

Giao diện tigravem kiếm theo tecircn CTPT

Giao diện tigravem kiếm theo kiểu CTPT

Kết luận

Việc sử dụng kỹ thuật chỉ thị phacircn tử trong lựa chọn giống

vật nuocirci vagrave cacircy trồng cho năng suất cao vagrave chịu chống bệnh lagrave

kỹ thuật phổ biến ở nước ngoagravei ở Việt Nam mới chỉ bước

đầu

Việc xacircy dựng caacutec CSDL về CTPP của caacutec giống vật nuocirci

vagrave cacircy trồng coacute yacute nghĩa đặt biệt đối với việc phaacutet triển sản xuất

nocircng nghiệp cũng như lĩnh vực nghiecircn cứu tin sinh học ở VN

Từng bước xacircy dựng CSDL cho từng giống cacircy trồng vagrave

vật nuocirci

Đogravei hỏi sự cộng taacutec của nhiều nhagrave nghiecircn cứu trong vagrave

nước ngoagravei

Tagravei liệu tham khảo

[1]Jie Hu Xin Li Changjun Wu Changju Yang Hongxia Hua Guanjun GaoJinghua Xiao Yuqi

ng He (2010) ldquoPyramiding and evaluation of the brown planthopper resistance

genes Bph14and Bph15 in hybrid ricerdquo Molecular BreedingVolume 29 Number 1 61-

69 DOI 101007s11032-010-9526-x

[2] Kim ChangKug Yoon UngHan Lee GangSeob Lee HwanKi Kim YongHwan Hahn JangHo

(2009) ldquoRice genetic marker database An identification of single nucleotide polymorphism

(SNP) and quantitative trait loci (QTL) markerrdquo African Journal of Biotechnology Vol 8 (13) pp

2963-2967 6 July 2009

[3] Kim et al (2013) ldquoNABIC marker database A molecular markers information network of

agricultural cropsrdquoBioinformation 9(17) 887-888 (2013)

[4] Sidransky D (2002) ldquoEmerging molecular markers of cancerrdquo Nat Rev Cancer 2002

Mar2(3)210-219

[5] Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea(2010) ldquoPhacircn tiacutech tiacutenh đa dạng di truyền

của đậu tương bằng chỉ thị phacircn tử SSRrdquo Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4

638 - 646

[6] Nguyễn Chiacute Thuận (2005) Nghiecircn cứu ứng dụng chỉ thị phacircn tử chẩn đoaacuten bệnh ở tocircm he

(Penaeus spp) nuocirci tại Việt Nam Kỷ yếu hội thảo toagraven quốc về nghiecircn cứu vagrave ứng dụng khoa

học cocircng nghệ nuocirci trồng thủy sản 2005Số 0 751 - 759

[7] Phan Hữu Tocircn Tống Văn Hải (2010) Sagraveng lọc caacutec giống luacutea coacute chứa gen mugravei thơm bằng

chỉ thị phacircn tử Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4 646 - 652

Giới thiệu phần mềm quản lyacute

CTPT của cacircy luacutea

Được xacircy dựng thử nghiệm trong năm 2013

Thocircng tin được thu thập chủ yếu từ caacutec cocircng trigravenh

nghiecircn cứu của caacutec nhagrave khoa học trong nước vagrave Đại

học Nocircng nghiệp Hagrave Nội

Caacutec chức năng chiacutenh của chương trigravenh

1 Cập nhật lưu trữ caacutec thocircng tin cơ bản của caacutec

chỉ thị CTPT của cacircy luacutea ở Việt Nam

2 Tigravem kiếm tra cứu caacutec CTPT theo kiểu tecircn caacutec

cocircng trigravenh nghiecircn cứu liecircn quan

Phần mềm đatilde được cagravei đặt vagrave chạy thử nghiệm

thagravenh cocircng trecircn maacutey chủ của Khoa CNTT ndash ĐH NNHN

Một số giao diện của phần mềm

Giao diện chiacutenh

Giao diện tigravem kiếm theo tecircn CTPT

Giao diện tigravem kiếm theo kiểu CTPT

Kết luận

Việc sử dụng kỹ thuật chỉ thị phacircn tử trong lựa chọn giống

vật nuocirci vagrave cacircy trồng cho năng suất cao vagrave chịu chống bệnh lagrave

kỹ thuật phổ biến ở nước ngoagravei ở Việt Nam mới chỉ bước

đầu

Việc xacircy dựng caacutec CSDL về CTPP của caacutec giống vật nuocirci

vagrave cacircy trồng coacute yacute nghĩa đặt biệt đối với việc phaacutet triển sản xuất

nocircng nghiệp cũng như lĩnh vực nghiecircn cứu tin sinh học ở VN

Từng bước xacircy dựng CSDL cho từng giống cacircy trồng vagrave

vật nuocirci

Đogravei hỏi sự cộng taacutec của nhiều nhagrave nghiecircn cứu trong vagrave

nước ngoagravei

Tagravei liệu tham khảo

[1]Jie Hu Xin Li Changjun Wu Changju Yang Hongxia Hua Guanjun GaoJinghua Xiao Yuqi

ng He (2010) ldquoPyramiding and evaluation of the brown planthopper resistance

genes Bph14and Bph15 in hybrid ricerdquo Molecular BreedingVolume 29 Number 1 61-

69 DOI 101007s11032-010-9526-x

[2] Kim ChangKug Yoon UngHan Lee GangSeob Lee HwanKi Kim YongHwan Hahn JangHo

(2009) ldquoRice genetic marker database An identification of single nucleotide polymorphism

(SNP) and quantitative trait loci (QTL) markerrdquo African Journal of Biotechnology Vol 8 (13) pp

2963-2967 6 July 2009

[3] Kim et al (2013) ldquoNABIC marker database A molecular markers information network of

agricultural cropsrdquoBioinformation 9(17) 887-888 (2013)

[4] Sidransky D (2002) ldquoEmerging molecular markers of cancerrdquo Nat Rev Cancer 2002

Mar2(3)210-219

[5] Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea(2010) ldquoPhacircn tiacutech tiacutenh đa dạng di truyền

của đậu tương bằng chỉ thị phacircn tử SSRrdquo Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4

638 - 646

[6] Nguyễn Chiacute Thuận (2005) Nghiecircn cứu ứng dụng chỉ thị phacircn tử chẩn đoaacuten bệnh ở tocircm he

(Penaeus spp) nuocirci tại Việt Nam Kỷ yếu hội thảo toagraven quốc về nghiecircn cứu vagrave ứng dụng khoa

học cocircng nghệ nuocirci trồng thủy sản 2005Số 0 751 - 759

[7] Phan Hữu Tocircn Tống Văn Hải (2010) Sagraveng lọc caacutec giống luacutea coacute chứa gen mugravei thơm bằng

chỉ thị phacircn tử Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4 646 - 652

Một số giao diện của phần mềm

Giao diện chiacutenh

Giao diện tigravem kiếm theo tecircn CTPT

Giao diện tigravem kiếm theo kiểu CTPT

Kết luận

Việc sử dụng kỹ thuật chỉ thị phacircn tử trong lựa chọn giống

vật nuocirci vagrave cacircy trồng cho năng suất cao vagrave chịu chống bệnh lagrave

kỹ thuật phổ biến ở nước ngoagravei ở Việt Nam mới chỉ bước

đầu

Việc xacircy dựng caacutec CSDL về CTPP của caacutec giống vật nuocirci

vagrave cacircy trồng coacute yacute nghĩa đặt biệt đối với việc phaacutet triển sản xuất

nocircng nghiệp cũng như lĩnh vực nghiecircn cứu tin sinh học ở VN

Từng bước xacircy dựng CSDL cho từng giống cacircy trồng vagrave

vật nuocirci

Đogravei hỏi sự cộng taacutec của nhiều nhagrave nghiecircn cứu trong vagrave

nước ngoagravei

Tagravei liệu tham khảo

[1]Jie Hu Xin Li Changjun Wu Changju Yang Hongxia Hua Guanjun GaoJinghua Xiao Yuqi

ng He (2010) ldquoPyramiding and evaluation of the brown planthopper resistance

genes Bph14and Bph15 in hybrid ricerdquo Molecular BreedingVolume 29 Number 1 61-

69 DOI 101007s11032-010-9526-x

[2] Kim ChangKug Yoon UngHan Lee GangSeob Lee HwanKi Kim YongHwan Hahn JangHo

(2009) ldquoRice genetic marker database An identification of single nucleotide polymorphism

(SNP) and quantitative trait loci (QTL) markerrdquo African Journal of Biotechnology Vol 8 (13) pp

2963-2967 6 July 2009

[3] Kim et al (2013) ldquoNABIC marker database A molecular markers information network of

agricultural cropsrdquoBioinformation 9(17) 887-888 (2013)

[4] Sidransky D (2002) ldquoEmerging molecular markers of cancerrdquo Nat Rev Cancer 2002

Mar2(3)210-219

[5] Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea(2010) ldquoPhacircn tiacutech tiacutenh đa dạng di truyền

của đậu tương bằng chỉ thị phacircn tử SSRrdquo Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4

638 - 646

[6] Nguyễn Chiacute Thuận (2005) Nghiecircn cứu ứng dụng chỉ thị phacircn tử chẩn đoaacuten bệnh ở tocircm he

(Penaeus spp) nuocirci tại Việt Nam Kỷ yếu hội thảo toagraven quốc về nghiecircn cứu vagrave ứng dụng khoa

học cocircng nghệ nuocirci trồng thủy sản 2005Số 0 751 - 759

[7] Phan Hữu Tocircn Tống Văn Hải (2010) Sagraveng lọc caacutec giống luacutea coacute chứa gen mugravei thơm bằng

chỉ thị phacircn tử Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4 646 - 652

Giao diện tigravem kiếm theo tecircn CTPT

Giao diện tigravem kiếm theo kiểu CTPT

Kết luận

Việc sử dụng kỹ thuật chỉ thị phacircn tử trong lựa chọn giống

vật nuocirci vagrave cacircy trồng cho năng suất cao vagrave chịu chống bệnh lagrave

kỹ thuật phổ biến ở nước ngoagravei ở Việt Nam mới chỉ bước

đầu

Việc xacircy dựng caacutec CSDL về CTPP của caacutec giống vật nuocirci

vagrave cacircy trồng coacute yacute nghĩa đặt biệt đối với việc phaacutet triển sản xuất

nocircng nghiệp cũng như lĩnh vực nghiecircn cứu tin sinh học ở VN

Từng bước xacircy dựng CSDL cho từng giống cacircy trồng vagrave

vật nuocirci

Đogravei hỏi sự cộng taacutec của nhiều nhagrave nghiecircn cứu trong vagrave

nước ngoagravei

Tagravei liệu tham khảo

[1]Jie Hu Xin Li Changjun Wu Changju Yang Hongxia Hua Guanjun GaoJinghua Xiao Yuqi

ng He (2010) ldquoPyramiding and evaluation of the brown planthopper resistance

genes Bph14and Bph15 in hybrid ricerdquo Molecular BreedingVolume 29 Number 1 61-

69 DOI 101007s11032-010-9526-x

[2] Kim ChangKug Yoon UngHan Lee GangSeob Lee HwanKi Kim YongHwan Hahn JangHo

(2009) ldquoRice genetic marker database An identification of single nucleotide polymorphism

(SNP) and quantitative trait loci (QTL) markerrdquo African Journal of Biotechnology Vol 8 (13) pp

2963-2967 6 July 2009

[3] Kim et al (2013) ldquoNABIC marker database A molecular markers information network of

agricultural cropsrdquoBioinformation 9(17) 887-888 (2013)

[4] Sidransky D (2002) ldquoEmerging molecular markers of cancerrdquo Nat Rev Cancer 2002

Mar2(3)210-219

[5] Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea(2010) ldquoPhacircn tiacutech tiacutenh đa dạng di truyền

của đậu tương bằng chỉ thị phacircn tử SSRrdquo Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4

638 - 646

[6] Nguyễn Chiacute Thuận (2005) Nghiecircn cứu ứng dụng chỉ thị phacircn tử chẩn đoaacuten bệnh ở tocircm he

(Penaeus spp) nuocirci tại Việt Nam Kỷ yếu hội thảo toagraven quốc về nghiecircn cứu vagrave ứng dụng khoa

học cocircng nghệ nuocirci trồng thủy sản 2005Số 0 751 - 759

[7] Phan Hữu Tocircn Tống Văn Hải (2010) Sagraveng lọc caacutec giống luacutea coacute chứa gen mugravei thơm bằng

chỉ thị phacircn tử Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4 646 - 652

Giao diện tigravem kiếm theo kiểu CTPT

Kết luận

Việc sử dụng kỹ thuật chỉ thị phacircn tử trong lựa chọn giống

vật nuocirci vagrave cacircy trồng cho năng suất cao vagrave chịu chống bệnh lagrave

kỹ thuật phổ biến ở nước ngoagravei ở Việt Nam mới chỉ bước

đầu

Việc xacircy dựng caacutec CSDL về CTPP của caacutec giống vật nuocirci

vagrave cacircy trồng coacute yacute nghĩa đặt biệt đối với việc phaacutet triển sản xuất

nocircng nghiệp cũng như lĩnh vực nghiecircn cứu tin sinh học ở VN

Từng bước xacircy dựng CSDL cho từng giống cacircy trồng vagrave

vật nuocirci

Đogravei hỏi sự cộng taacutec của nhiều nhagrave nghiecircn cứu trong vagrave

nước ngoagravei

Tagravei liệu tham khảo

[1]Jie Hu Xin Li Changjun Wu Changju Yang Hongxia Hua Guanjun GaoJinghua Xiao Yuqi

ng He (2010) ldquoPyramiding and evaluation of the brown planthopper resistance

genes Bph14and Bph15 in hybrid ricerdquo Molecular BreedingVolume 29 Number 1 61-

69 DOI 101007s11032-010-9526-x

[2] Kim ChangKug Yoon UngHan Lee GangSeob Lee HwanKi Kim YongHwan Hahn JangHo

(2009) ldquoRice genetic marker database An identification of single nucleotide polymorphism

(SNP) and quantitative trait loci (QTL) markerrdquo African Journal of Biotechnology Vol 8 (13) pp

2963-2967 6 July 2009

[3] Kim et al (2013) ldquoNABIC marker database A molecular markers information network of

agricultural cropsrdquoBioinformation 9(17) 887-888 (2013)

[4] Sidransky D (2002) ldquoEmerging molecular markers of cancerrdquo Nat Rev Cancer 2002

Mar2(3)210-219

[5] Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea(2010) ldquoPhacircn tiacutech tiacutenh đa dạng di truyền

của đậu tương bằng chỉ thị phacircn tử SSRrdquo Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4

638 - 646

[6] Nguyễn Chiacute Thuận (2005) Nghiecircn cứu ứng dụng chỉ thị phacircn tử chẩn đoaacuten bệnh ở tocircm he

(Penaeus spp) nuocirci tại Việt Nam Kỷ yếu hội thảo toagraven quốc về nghiecircn cứu vagrave ứng dụng khoa

học cocircng nghệ nuocirci trồng thủy sản 2005Số 0 751 - 759

[7] Phan Hữu Tocircn Tống Văn Hải (2010) Sagraveng lọc caacutec giống luacutea coacute chứa gen mugravei thơm bằng

chỉ thị phacircn tử Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4 646 - 652

Kết luận

Việc sử dụng kỹ thuật chỉ thị phacircn tử trong lựa chọn giống

vật nuocirci vagrave cacircy trồng cho năng suất cao vagrave chịu chống bệnh lagrave

kỹ thuật phổ biến ở nước ngoagravei ở Việt Nam mới chỉ bước

đầu

Việc xacircy dựng caacutec CSDL về CTPP của caacutec giống vật nuocirci

vagrave cacircy trồng coacute yacute nghĩa đặt biệt đối với việc phaacutet triển sản xuất

nocircng nghiệp cũng như lĩnh vực nghiecircn cứu tin sinh học ở VN

Từng bước xacircy dựng CSDL cho từng giống cacircy trồng vagrave

vật nuocirci

Đogravei hỏi sự cộng taacutec của nhiều nhagrave nghiecircn cứu trong vagrave

nước ngoagravei

Tagravei liệu tham khảo

[1]Jie Hu Xin Li Changjun Wu Changju Yang Hongxia Hua Guanjun GaoJinghua Xiao Yuqi

ng He (2010) ldquoPyramiding and evaluation of the brown planthopper resistance

genes Bph14and Bph15 in hybrid ricerdquo Molecular BreedingVolume 29 Number 1 61-

69 DOI 101007s11032-010-9526-x

[2] Kim ChangKug Yoon UngHan Lee GangSeob Lee HwanKi Kim YongHwan Hahn JangHo

(2009) ldquoRice genetic marker database An identification of single nucleotide polymorphism

(SNP) and quantitative trait loci (QTL) markerrdquo African Journal of Biotechnology Vol 8 (13) pp

2963-2967 6 July 2009

[3] Kim et al (2013) ldquoNABIC marker database A molecular markers information network of

agricultural cropsrdquoBioinformation 9(17) 887-888 (2013)

[4] Sidransky D (2002) ldquoEmerging molecular markers of cancerrdquo Nat Rev Cancer 2002

Mar2(3)210-219

[5] Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea(2010) ldquoPhacircn tiacutech tiacutenh đa dạng di truyền

của đậu tương bằng chỉ thị phacircn tử SSRrdquo Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4

638 - 646

[6] Nguyễn Chiacute Thuận (2005) Nghiecircn cứu ứng dụng chỉ thị phacircn tử chẩn đoaacuten bệnh ở tocircm he

(Penaeus spp) nuocirci tại Việt Nam Kỷ yếu hội thảo toagraven quốc về nghiecircn cứu vagrave ứng dụng khoa

học cocircng nghệ nuocirci trồng thủy sản 2005Số 0 751 - 759

[7] Phan Hữu Tocircn Tống Văn Hải (2010) Sagraveng lọc caacutec giống luacutea coacute chứa gen mugravei thơm bằng

chỉ thị phacircn tử Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4 646 - 652

Tagravei liệu tham khảo

[1]Jie Hu Xin Li Changjun Wu Changju Yang Hongxia Hua Guanjun GaoJinghua Xiao Yuqi

ng He (2010) ldquoPyramiding and evaluation of the brown planthopper resistance

genes Bph14and Bph15 in hybrid ricerdquo Molecular BreedingVolume 29 Number 1 61-

69 DOI 101007s11032-010-9526-x

[2] Kim ChangKug Yoon UngHan Lee GangSeob Lee HwanKi Kim YongHwan Hahn JangHo

(2009) ldquoRice genetic marker database An identification of single nucleotide polymorphism

(SNP) and quantitative trait loci (QTL) markerrdquo African Journal of Biotechnology Vol 8 (13) pp

2963-2967 6 July 2009

[3] Kim et al (2013) ldquoNABIC marker database A molecular markers information network of

agricultural cropsrdquoBioinformation 9(17) 887-888 (2013)

[4] Sidransky D (2002) ldquoEmerging molecular markers of cancerrdquo Nat Rev Cancer 2002

Mar2(3)210-219

[5] Triệu Thị Thịnh Vũ Thị Thuacutey Hằng Vũ Đigravenh Hogravea(2010) ldquoPhacircn tiacutech tiacutenh đa dạng di truyền

của đậu tương bằng chỉ thị phacircn tử SSRrdquo Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4

638 - 646

[6] Nguyễn Chiacute Thuận (2005) Nghiecircn cứu ứng dụng chỉ thị phacircn tử chẩn đoaacuten bệnh ở tocircm he

(Penaeus spp) nuocirci tại Việt Nam Kỷ yếu hội thảo toagraven quốc về nghiecircn cứu vagrave ứng dụng khoa

học cocircng nghệ nuocirci trồng thủy sản 2005Số 0 751 - 759

[7] Phan Hữu Tocircn Tống Văn Hải (2010) Sagraveng lọc caacutec giống luacutea coacute chứa gen mugravei thơm bằng

chỉ thị phacircn tử Tạp chiacute Khoa học vagrave Phaacutet triển 2010 Tập 8 số 4 646 - 652

Company

LOGO

bull Bp base pair

bull Mer đơn vị đo chiều dagravei

bull 10-mer độ dagravei 10 base

bull Mas Marker-assisted selection

bull Bp base pair

bull Mer đơn vị đo chiều dagravei

bull 10-mer độ dagravei 10 base

bull Mas Marker-assisted selection