Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger...

17
Genetisch onderzoek anno 2018 1 Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen [email protected] www.genetica-antwerpen.be

Transcript of Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger...

Page 1: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Genetisch onderzoek anno 2018

1

Prof Dr Geert Mortier

Centrum Medische Genetica [email protected]

www.genetica-antwerpen.be

Page 2: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

• waarom genetisch onderzoek verrichten?

• frequente indicaties voor genetisch onderzoek?

• welke genetische onderzoeken zijn mogelijk?

• hoe een genetisch onderzoek aanvragen?

Genetisch onderzoek

2

Page 3: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Waarom genetisch onderzoek verrichten ?

• om een diagnose te bevestigen

• wanneer het kennen van het genetisch defect

belangrijk is voor aanpak en behandeling

• om genetisch advies te kunnen verlenen

(herhalingsrisico’s)

• om prenataal onderzoek te kunnen aanbieden

3

Page 4: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

4

• onverklaarde cognitieve problemen bij het kind

• verschillende aangeboren afwijkingen

• voorkomen van kanker in de familie

• neurologische aandoeningen (dementie….)

• doormaken van meerdere miskramen

• onvruchtbaarheid; niet doormaken van de puberteit

• zelfde aandoening bij verschillende familieleden

• vermoeden van zeldzame aandoening

• echografische afwijkingen tijdens de zwangerschap

• bloedverwantschap

Frequente indicaties voor genetisch onderzoek ?

Page 5: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Diagnostisch onderzoek

= stellen van een diagnose

Down syndroom5

Page 6: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Dragerschapsonderzoek

= nakijken of een gezond individu drager is voor een

genetische aandoening

mucoviscidose

6

- gericht dragerschapsonderzoek (“cascade carrier testing”):

= voor bepaalde aandoening reeds gekend in familie

- dragerschapsscreening (“carrier screening”):

= geen familiale antecedenten; geen verhoogd risico

Page 7: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Predictief of presymptomatisch onderzoek

= nakijken of een gezond individu risico loopt om later

een genetische aandoening te krijgen

Ziekte van HuntingtonFamiliaal borstkanker

7

Page 8: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Prenataal onderzoek

= opsporen van een genetische aandoening bij het ongeboren kind

vlokkentest op 11 weken

vruchtwaterpunctie op 15 weken

8

Page 9: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Preïmplantatie genetische diagnostiek

= opsporen van een genetische aandoening bij het embryo voor

implantatie

9

Page 10: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Niet-invasieve prenatale test (NIPT)

10NIPT in genetische centra is uitgebreider dan in meeste labo’s klinische biologie:

genoomwijde NIPT versus “targeted” NIPT

Page 11: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Vooruitgang in de onderzoeksmethoden voor analyse van de chromosomen

11karyotype FISH

array

Page 12: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Sequenering van het DNA (Sanger methode)

12

Page 13: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Karyotyping Sangersequencin

g

Array

Van eerste naar tweede generatie sequenering

FISH Next generation sequencing

(NGS)

3 miljard $

1000 $

2010-

13

Page 14: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Voornaamste toepassingen van NGS

14

WES: “whole exome sequencing” – exoom sequenering

Exoom: - alle genen

- slechts 2-3% van het genoom

- 80 % van mutaties voor zeldzame ziekten

Page 15: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

15

Voornaamste toepassingen van NGS

Genpanels:

verzameling van genen voor één welbepaalde aandoening

of groep van aandoeningen

Page 16: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

Hoe een genetisch onderzoek aanvragen?

16

www.genetica-antwerpen.be

Page 17: Prof Dr Geert Mortier Centrum Medische Genetica Antwerpen · Sequenering van het DNA (Sanger methode) 12. Karyotyping Sanger sequencin g Array Van eerste naar tweede generatie sequenering

DANK VOOR UW AANDACHT

17