Pati ë nten in getallen: een verrassend perspectief op de wiskunde

56
Patiënten in getallen: een verrassend perspectief op de wiskunde Natasha M. Maurits Afdeling Neurologie BCN-NeuroImaging Center Universitair Medisch Centrum Groningen [email protected] www.signalanalysis.net Nationale Wiskunde Dagen, 5-6 februari 2010

description

Pati ë nten in getallen: een verrassend perspectief op de wiskunde. Natasha M. Maurits Afdeling Neurologie BCN-NeuroImaging Center Universitair Medisch Centrum Groningen [email protected] www.signalanalysis.net. Nationale Wiskunde Dagen, 5-6 februari 2010. ?. - PowerPoint PPT Presentation

Transcript of Pati ë nten in getallen: een verrassend perspectief op de wiskunde

Page 1: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Patiënten in getallen: een verrassend perspectief

op de wiskunde

Natasha M. Maurits

Afdeling NeurologieBCN-NeuroImaging Center

Universitair Medisch Centrum Groningen

[email protected]

Nationale Wiskunde Dagen, 5-6 februari 2010

Page 2: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

?

Een bezoek aan de medisch specialist ….

Page 3: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

bloeddruk temperatuur lengte

Page 4: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

140/90 mmHg 1.72 m39.5 °C

bloeddruk temperatuur lengte

Page 5: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

140/90 mmHg 1.72 m39.5 °C

bloeddruk temperatuur lengte

Page 6: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde
Page 7: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Hoe weet een arts dit nu?

Zijn de uitslagen normaal?

Wijzen de uitslagen op een bepaalde aandoening?

Page 8: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

College carroussel april 2009:

9 VWO-4 scholieren meten zenuwgeleidingssnelheid

snelheid temperatuur

49.2 m/s 30 C

53.4 m/s 30 C

60.7 m/s 31 C

57.8 m/s 32 C

51.0 m/s 30 C

65.1 m/s 32 C

52.9 m/s 29 C

58.0 m/s 33 C

47.8 m/s 28 C

Zijn dit normale waarden? Waarom wel? Waarom niet?

Page 9: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Medisch technologische ontwikkelingen

DNA sequencinghoge resolutie MRImultikanaals EEG

Technische mogelijkheden nemen sneller toe dan de kennis erover

Van Maanen, NTvG 151:36, 2007

Page 10: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Wiskunde op de afdeling Klinische Neurofysiologie

EEG: hersenactiviteit EMG: spier- en zenuwactiviteit

Duplex/TCD: bloedstroming

(3D) vaatechografie

spier- en zenuwechografie

(multikanaals) EEG

EMG

simultaan EEG-EMG-fMRI

rTMS

getallen

meten

analyseren

modelleren

diagnostiek?1

10001000000

Page 11: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Helpen bij het stellen van een snelle en juiste diagnose

Moderne onderzoekstechnieken leveren getallen

Hoe nu van getallen naar diagnose?

Via ‘nuttige samenvattingen van de toestand van de patiënt’

→ Biomarkers

Wiskunde in de hedendaagse geneeskunde

Page 12: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Nuttige biomarker?

• verwachte waarde in gezonden en patiënten bekend

• veranderingen in biomarker bij verschuiving van gezond naar ziek bekend

• specificiteit bekend

• betrouwbaar en herhaalbaar te meten

• meting niet te belastend voor patiënt

Page 13: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Nuttige biomarker?

• verwachte waarde in gezonden en patiënten bekendNormaalwaarden nodig

• veranderingen in biomarker bij verschuiving van gezond naar ziek bekend

• specificiteit bekend

• betrouwbaar en herhaalbaar te meten

• meting niet te belastend voor patiënt

Page 14: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Van getallen naar biomarker

Voorbeeld van één getal naar biomarker:

spierkracht bij kinderen

Voorbeeld van veel getallen naar biomarker:

spierechografie

Voorbeeld van veel getallen naar biomarker:

effecten veroudering op motoriek

Voorbeeld van heel veel getallen naar biomarker:

onderscheid tremoren

Page 15: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Van getallen naar biomarker

Voorbeeld van één getal naar biomarker:

spierkracht bij kinderen

Voorbeeld van veel getallen naar biomarker:

spierechografie

Voorbeeld van veel getallen naar biomarker:

effecten veroudering op motoriek

Voorbeeld van heel veel getallen naar biomarker:

onderscheid tremoren

Hoe gebruik je hier wiskunde bij?

Page 16: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Voorbeeld van één getal naar biomarker: spierkracht bij kinderen

Beenakker et al., Neuromusc. Disord. 11:441, 2001

Belangrijke vragen: hoe krijg je een representatieve steekproef?hoe zorg je voor betrouwbare resultaten?wat is nu normaal?

• meisjes° jongens

Leeftijd in maanden Gewicht in kg

Page 17: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Voorbeeld van één getal naar biomarker: spierkracht bij kinderen

Beenakker et al., Neuromusc. Disord. 11:441, 2001

Belangrijke vragen: hoe krijg je een representatieve steekproef?hoe zorg je voor betrouwbare resultaten?wat is nu normaal?

• meisjes° jongens

Leeftijd in maanden Gewicht in kg

Beschrijvende statistiek

Page 18: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Voorbeeld van veel getallen naar biomarker: spierechografie

Page 19: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Normale spier Spierziekte Zenuwziekte

28 jaar 51 jaar: myositis 68 jaar: ALS

1 plaatje bestaat uit miljoenen getallen: datareductie nodig!

Hoe vat je ‘witheid’ en ‘vlekkerigheid’ in 1 getal samen?

Spierechografie: gezond en ziek

Page 20: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Op kleur genormaliseerd beeld

Uitwerking

Page 21: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Op kleur genormaliseerd beeld

Uitwerking

Page 22: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

grijswaarde = gem. pixelwaarde = 105.30

Oppervlak = 3.56 cm2Op kleur genormaliseerd beeld

Uitwerking

Page 23: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

grijswaarde = gem. pixelwaarde = 105.30

Oppervlak = 3.56 cm2Op kleur genormaliseerd beeld

Automatisch tellen witte oppervlak: pixel waarde > 170: 0.28 cm2

White-area index: 0.28/3.56=0.08

Uitwerking

Page 24: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Sobel filter

grijswaarde = gem. pixelwaarde = 105.30

Oppervlak = 3.56 cm2Op kleur genormaliseerd beeld

Automatisch tellen witte oppervlak: pixel waarde > 170: 0.28 cm2

White-area index: 0.28/3.56=0.08

Uitwerking

Page 25: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Sobel filter

grijswaarde = gem. pixelwaarde = 105.30

Oppervlak = 3.56 cm2Op kleur genormaliseerd beeld

Automatisch tellen witte oppervlak: pixel waarde > 170: 0.28 cm2

White-area index: 0.28/3.56=0.08

Uitwerking

Page 26: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Sobel filter

grijswaarde = gem. pixelwaarde = 105.30

Oppervlak = 3.56 cm2Op kleur genormaliseerd beeld

Automatisch tellen witte oppervlak: pixel waarde > 170: 0.28 cm2

White-area index: 0.28/3.56=0.08

Automatisch tellen # witte gebiedjes met pixel waarde > 197: 35 gebiedenInhomogeniteits index: 35/3.56=9.83

Uitwerking

Page 27: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

grijswaarde = gem. pixelwaarde = 105.30

Oppervlak = 3.56 cm2Op kleur genormaliseerd beeld

Automatisch tellen witte oppervlak: pixel waarde > 170: 0.28 cm2

White-area index: 0.28/3.56 = 0.08

Automatisch tellen # witte gebiedjes met pixel waarde > 197: 35 gebiedenInhomogeniteits index: 35/3.56 = 9.83

Uitwerking

Page 28: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Deviation from normal inhomogeneity index (stand. dev.)

86420-2-4

Dev

iatio

n fr

om

nor

ma

l de

nsity

(st

and

. dev

.)6

5

4

3

2

1

0

-1

neuropathic biceps

myopathic biceps

Nuttige biomarker?

o.a. specificiteit & sensitiviteit

% normaal in gezonden% afwijkend in patienten

Page 29: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Deviation from normal inhomogeneity index (stand. dev.)

86420-2-4

Dev

iatio

n fr

om

nor

ma

l de

nsity

(st

and

. dev

.)6

5

4

3

2

1

0

-1

neuropathic biceps

myopathic biceps

Nuttige biomarker?

o.a. specificiteit & sensitiviteit

% normaal in gezonden% afwijkend in patienten

Beschrijvende statistiekFilters

Page 30: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Voorbeeld van veel getallen naar biomarker: effecten veroudering op motoriek

40 cirkels in elke richting, 200 datapunten per cirkel

Page 31: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Hoe vat je de kinematische gegevens samen in 1 getal?

doel

cursor

X

Y

feitelijke beweging

X: verplaatsing in flexie-extensie richtingY: verplaatsing in radiaal-ulnair richting

voorgeschreven beweging

hoek

Page 32: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Afgeleide = RC raaklijn aan kromme = t

f

f(t)

Hoeksnelheid is afgeleide van hoekpositie = verandering in hoek per verstreken tijd

Standaard deviatie van hoeksnelheid = maat voor snelheidsvariabiliteit

Idem voor positie en fout

Page 33: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Afgeleide = RC raaklijn aan kromme = t

f

f(t)

DifferentiaalrekeningBeschrijvende statistiek

Hoeksnelheid is afgeleide van hoekpositie = verandering in hoek per verstreken tijd

Standaard deviatie van hoeksnelheid = maat voor snelheidsvariabiliteit

Idem voor positie en fout

Page 34: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

jong oud

positie

snelheid

fout

jong oud

sens/spec 69%

sens/spec 75%

Nuttige biomarker?

o.a. specificiteit & sensitiviteit

variabiliteit

Page 35: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Voorbeeld van heel veel getallen naar biomarker: onderscheid tremoren

Meneer S, 59 jaar

Trilt vanaf zijn 30e jaar bij uitstrekken, niet in rust

De tremor komt in de familie voor

Page 36: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

tremor type meest aanwezig tijdens

frequentie (Hz) effect van gewicht (ant)agonist spieractivatie

versterkt fysiologisch houding 5-12 lagere frequentie synchroon

essentieel houding 4-12 geen variabel

Parkinson rust 4-7 geen alternerend

orthostatisch staan 13-18 geen synchroon

psychogeen variabel variabel, typisch 4-7 lagere amplitude synchroon

Wat voor tremor is dit?Classificatie van tremoren

Page 37: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

tremor type meest aanwezig tijdens

frequentie (Hz) effect van gewicht (ant)agonist spieractivatie

versterkt fysiologisch houding 5-12 lagere frequentie synchroon

essentieel houding 4-12 geen variabel

Parkinson rust 4-7 geen alternerend

orthostatisch staan 13-18 geen synchroon

psychogeen variabel variabel, typisch 4-7 lagere amplitude synchroon

Wat voor tremor is dit?Classificatie van tremoren

Getallen! Wiskunde behulpzaam bij diagnostiek?

Page 38: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

biceps

triceps

Meten met behulp van oppervlakte electromyografie

Spieraanspanning tijdens top-neus test

Page 39: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Hoe bepaal je uit het EMG signaal met welke frequentie je te maken hebt?

tremor type meest aanwezig tijdens

frequentie (Hz) effect van gewicht (ant)agonist spieractivatie

versterkt fysiologisch houding 5-12 lagere frequentie synchroon

essentieel houding 4-12 geen variabel

Parkinson rust 4-7 geen alternerend

orthostatisch staan 13-18 geen synchroon

psychogeen variabel variabel, typisch 4-7 lagere amplitude synchroon

Page 40: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Hoe bepaal je uit het EMG signaal met welke frequentie je te maken hebt?

tremor type meest aanwezig tijdens

frequentie (Hz) effect van gewicht (ant)agonist spieractivatie

versterkt fysiologisch houding 5-12 lagere frequentie synchroon

essentieel houding 4-12 geen variabel

Parkinson rust 4-7 geen alternerend

orthostatisch staan 13-18 geen synchroon

psychogeen variabel variabel, typisch 4-7 lagere amplitude synchroon

Van het tijds naar het frequentiedomein: spectraal/Fourier analyse

Page 41: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Spectraal analyse

Gebaseerd op decompositie van signaal in (co)sinussen van verschillende frequenties

3

Page 42: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Tijdsdomein (signaal) Frequentie domein (spectrum)

Vierkante golf

sinus

http://www.ztecinstruments.com/feature-focus/fft

Spectraal analyse

Page 43: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

EMG tijdens top-neus test Spectrum (FFT) van EMG

Page 44: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

EMG tijdens top-neus test Spectrum (FFT) van EMG

piekfrequentie = 6.8 Hz

Page 45: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

EMG tijdens top-neus test Spectrum (FFT) van EMG

piekfrequentie = 6.8 Hz

tremor type meest aanwezig tijdens

frequentie (Hz) effect van gewicht (ant)agonist spieractivatie

versterkt fysiologisch houding 5-12 lagere frequentie synchroon

essentieel houding 4-12 geen variabel

Parkinson rust 4-7 geen alternerend

orthostatisch staan 13-18 geen synchroon

psychogeen variabel variabel, typisch 4-7 lagere amplitude synchroon

Page 46: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

FCMTE: irregulair, 8 – 20 Hz, EMG-bursts < 50 ms

ET: regulair, 5 – 7 Hz, EMG-bursts > 50 ms

Wetenschappelijk onderzoek: wat als de tremoren overlappen in frequentie en klinisch is er geen

onderscheid?

Page 47: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

1. Achtergrondinformatie: FCMTE corticale origine, ET wrs. niet

2. Onderzoek verband tussen corticale hersenactiviteit en spieractiviteit

3. EEG back-averaging?EEG-EMG coherentie?

Kunnen ET en FCMTE ook nog van elkaar onderscheiden worden op basis van een

tremorregistratie?

Page 48: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

EEG backaveraging

EMG van FCMTE patient

Coherentie analyse

tijd

EEG

EMG

Page 49: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Coherentie

• Lineair verband tussen twee signalen x en y

• 0 = geen koppeling; 1 = identiek signaal

• Coherentie duidt op functioneel verband

kruisspectrum

autospectra

Page 50: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Coherentie

• Lineair verband tussen twee signalen x en y

• 0 = geen koppeling; 1 = identiek signaal

• Coherentie duidt op functioneel verband

kruisspectrum

autospectra

22

22

2

yyxx

yyxx

ss

sr

ii

ii

yyxx

xy

Vgl Pearson correlatiecoefficient

coherentie = correlatie in het frequentie domein

Page 51: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

EEG-EMG coherentie

Ext

FDI

Motorcortex, C3

R hand - C3

R pols ext - C3

Page 52: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

EMG-EMG coherentie

Ext

FDI

vinger – pols buiger

Motorcortex, C3

R vinger - C3

R pols buiger - C3

Page 53: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Meting

Multi-kanaals EEG

EMG rechts• polsbuigers• vingerspier

Hand uitstrekken

Page 54: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

 

0.00

0.05

0.10

0.15

0.20

0.25

0.30

0.35

0.40

0.45

0.50

0 5 10 15 20 25 30 35

0.00

0.05

0.10

0.15

0.20

0.25

0.30

0.35

0.40

0.45

0.50

0 5 10 15 20 25 30 35

Corticomusculair Intermusculair

FCMTE - ET - gezonden

coherentie coherentie

frequentie frequentie

Uitwerking

hersenen - spier spier - spier

Page 55: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Onderscheid FCMTE en ET o.b.v spier-spier coherentie

4 – 8 Hz band

8 – 30 Hz band

Gem. coh.

Gem. coh.

FCMTE 0.117 0.159

ET 0.084 0.011

control 0.012 0.016

4- 8 Hz: FCMTE en ET > controle

8- 30 Hz: FCMTE > ET en controle

Klinische waarde

Page 56: Pati ë nten in getallen:  een verrassend perspectief  op de wiskunde

Samenvatting

Patienten in getallen: wiskunde in de KNF praktijk

Voorbeeld 1: spierkracht

Statistiek

Voorbeeld 2: spierechografie

Statistiek & signaalanalyse (filteren)

Voorbeeld 3: motoriek bij veroudering

Differentiaalrekening & statistiek

Voorbeeld 4: onderscheid tremoren

Signaalanalyse (Fourier- & coherentieanalyse)