Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

16
Dimitri Brosens & Bart Goossens Informatie & Datacentrum INBO OMGAAN MET ONDERZOEKSDATA: INBO

description

 

Transcript of Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

Page 1: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

Dimitri Brosens & Bart Goossens

Informatie & Datacentrum INBO

OMGAAN MET ONDERZOEKSDATA: INBO

Page 3: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

3

Beheer van onderzoeksinformatie: PURE

Page 4: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

4

Beheer van onderzoeksinformatie: PURE

Grafiek van relaties

Page 5: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

5

Beheer van ruwe data: Welke data

INBO onderzoeksdata

Observaties

Human observation &

Machine observation

Remote sensing

Vegetatieopnames

INBOveg

Page 6: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

6

Beheer van ruwe data: Welke data

INBO onderzoeksdata

Verzameld materiaal Roadkill & Afvangsten & Bevissing

Analyse data (DNA

sequenties…) –e-DNA

–Haarstalen

–Swabstalen

– Faeces

–Bodemstalen

- Waterstalen

Page 7: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

7

INBO Referentiedata

Checklists Referentielijsten naar voorkomen species in een bepaald geografisch gebied

Rode lijsten Rode lijst van de Zoogdieren

Referentielijsten naar status en voorkomen in een bepaald geografisch gebied

Geografische GIS data GIS (Kaartlagen)

“Taxonomische lijsten” Catalogue of LIFE

Beheer van ruwe data: Welke data

Page 8: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

8

Beheer onderzoeksdata

Observaties

Human observation

NBN datamodel (Recorder6)

SQL databank (Microsoft SQL server)

Werkblad & Access ( )

Machine observation

Lifewatch applicaties

SQL databank

DATA warehouse

Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer

Page 9: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

9

Vegetatieopnames

INBOveg

Webapplicatie met achterliggende databank

https://data.inbo.be/inboveg/ViewHome.form

Verzameld materiaal Roadkill & Afvangsten & Bevissing

-> SQL databank (Microsoft server)

Werkblad & Access ()

Beheer van ruwe data: Centraal Data Beheer

Page 10: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

10

Labo data (Analyse, laboresultaten…) –e-DNA

–Haarstalen

–Swabstalen

– Faeces

–Bodemstalen

- Waterstalen

Laboratory information management system (LIMS)

Beheer van ruwe data: Centraal data beheer

Page 11: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

11

Beheer referentiedata Checklists

Rode lijsten

Taxonomische lijsten

INBO NAMESERVER (SQL server)

Geografische GIS data

GIS data server (GIS team)

Beheer van ruwe data: Centraal data beheer

Page 12: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

SD 5: Het INBO beheert gegevens en maakt ze toegankelijk.

Het INBO fungeert als draaischijf voor het gegevensbeheer. Daarbij zoekt

het INBO naar geschikte manieren om aan gegevensverzameling te doen

en om gegevens te ontsluiten en toegankelijk te maken.

12

Beheer van ruwe data: Data Publiceren

Page 13: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

13

Data Publiceren

Onderzoeksinformatie

Pure Portal (webservices)

Biodiversiteitsdata

• Primary Occurrence data & Checklists

• Standaardiseren

• Darwin Core

• Metadata optimaliseren

• EML

• Publiceren

• IPT (integrated publishing toolkit)

• Darwin Core Archives

Page 14: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

14

Data Publiceren

Andere manieren

• Dryad Data Digital Repository • Flexibel ivm het data formaat

• Past in de “manuscript indienen“workflow

• Gegevens particulier beschikbaar tijdens de peer review

• Toestaan van beperkte embargo tijd

• Gegevens zijn gekoppeld van en naar gespecialiseerde data repositories (vb. GBIF of

GenBank ) .

• Wijst Digital Object Identifiers ( DOI ) aan gegevens

• Bevordert de zichtbaarheid van gegevens

• Data gepubliceerd onder CC0, geen wettelijke belemmering om data te hergebruiken

• Inhoud wordt actief beheerd .

• Datafiles kunnen bijgewerkt worden indien nodig

• Bewaring van de data op lange termijn ...

• Webservices • Pure webservices

• GBIF webservices

• In volle ontwikkeling

Page 15: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

15

Data Publiceren

Data policy

Voorgestelde richtlijnen

1 Alle data verzameld in opdracht van het (EV) INBO kunnen in principe ontsloten worden, met toepassing van de uitzonderingsgronden zoals bepaald in het decreet betreffende openbaarheid van bestuur (2004-03-26, Artikel 15).

2 Data die geassocieerd zijn met een wetenschappelijk artikel worden ontsloten bij publicatie.

3 Ruwe data worden ontsloten indien technisch haalbaar. Onderzoekers kunnen gebruik maken van een embargo tot 18 maanden na het verzamelen. Sommige projecten kunnen een versnelde (= geen embargo) of verplichte data-ontsluiting vereisen.

4 Data worden steeds ontsloten als open data, zoals gedefinieerd door de Open Knowledge Foundation.

Page 16: Omgaan met onderzoeksdata in inbo (Dimitri Brosens)

INBO als data Publisher

INBO is data publisher in het GBIF netwerk

Publiceren via ITP van Darwin Core Archives

Ondersteuning door het Belgisch Biodiversiteitsplatform (GBIF node)

• Belgische GBIF Data Publishers

16