Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:[email protected]...

26
Wietse de Boer NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:[email protected] Weerbaarheid

Transcript of Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:[email protected]...

Page 1: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Wietse de Boer

NIOO-KNAW (Microbieumlle Ecologie)

WUR (Bodemkwaliteit)

E-mailwdeboerniooknawnl

Weerbaarheid

Actoren

Activiteit Mechanisme

Gevolg Duur

Ziekteverwekkers

Ziekteverwekkers

Indringers

Verstoring

Weerstand en Veerkracht

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Stabiliteit Functie van weerstand en veerkracht

Ecologische Veerkracht

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

1 1000

Amerikaanse Vogelkers

Agressieve inheemse Pythium stammen

Inheemse Pathogenen beperken inheemse

Prunus uitbreiding

Inheemse Pathogenen =

Minder onderdrukking van Exotische Prunus

Reinhart et al (2003) Ecology Letters 6 1046-1050

bodemgemeenschap X

plantensoort A

-

+ bodemgemeenschap A

gt

gt

Plant-Bodem Terugkoppeling

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 2: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Actoren

Activiteit Mechanisme

Gevolg Duur

Ziekteverwekkers

Ziekteverwekkers

Indringers

Verstoring

Weerstand en Veerkracht

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Stabiliteit Functie van weerstand en veerkracht

Ecologische Veerkracht

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

1 1000

Amerikaanse Vogelkers

Agressieve inheemse Pythium stammen

Inheemse Pathogenen beperken inheemse

Prunus uitbreiding

Inheemse Pathogenen =

Minder onderdrukking van Exotische Prunus

Reinhart et al (2003) Ecology Letters 6 1046-1050

bodemgemeenschap X

plantensoort A

-

+ bodemgemeenschap A

gt

gt

Plant-Bodem Terugkoppeling

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 3: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Ziekteverwekkers

Indringers

Verstoring

Weerstand en Veerkracht

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Stabiliteit Functie van weerstand en veerkracht

Ecologische Veerkracht

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

1 1000

Amerikaanse Vogelkers

Agressieve inheemse Pythium stammen

Inheemse Pathogenen beperken inheemse

Prunus uitbreiding

Inheemse Pathogenen =

Minder onderdrukking van Exotische Prunus

Reinhart et al (2003) Ecology Letters 6 1046-1050

bodemgemeenschap X

plantensoort A

-

+ bodemgemeenschap A

gt

gt

Plant-Bodem Terugkoppeling

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 4: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Weerstand en Veerkracht

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Stabiliteit Functie van weerstand en veerkracht

Ecologische Veerkracht

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

1 1000

Amerikaanse Vogelkers

Agressieve inheemse Pythium stammen

Inheemse Pathogenen beperken inheemse

Prunus uitbreiding

Inheemse Pathogenen =

Minder onderdrukking van Exotische Prunus

Reinhart et al (2003) Ecology Letters 6 1046-1050

bodemgemeenschap X

plantensoort A

-

+ bodemgemeenschap A

gt

gt

Plant-Bodem Terugkoppeling

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 5: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Stabiliteit Functie van weerstand en veerkracht

Ecologische Veerkracht

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

1 1000

Amerikaanse Vogelkers

Agressieve inheemse Pythium stammen

Inheemse Pathogenen beperken inheemse

Prunus uitbreiding

Inheemse Pathogenen =

Minder onderdrukking van Exotische Prunus

Reinhart et al (2003) Ecology Letters 6 1046-1050

bodemgemeenschap X

plantensoort A

-

+ bodemgemeenschap A

gt

gt

Plant-Bodem Terugkoppeling

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 6: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

1 1000

Amerikaanse Vogelkers

Agressieve inheemse Pythium stammen

Inheemse Pathogenen beperken inheemse

Prunus uitbreiding

Inheemse Pathogenen =

Minder onderdrukking van Exotische Prunus

Reinhart et al (2003) Ecology Letters 6 1046-1050

bodemgemeenschap X

plantensoort A

-

+ bodemgemeenschap A

gt

gt

Plant-Bodem Terugkoppeling

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 7: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

1 1000

Amerikaanse Vogelkers

Agressieve inheemse Pythium stammen

Inheemse Pathogenen beperken inheemse

Prunus uitbreiding

Inheemse Pathogenen =

Minder onderdrukking van Exotische Prunus

Reinhart et al (2003) Ecology Letters 6 1046-1050

bodemgemeenschap X

plantensoort A

-

+ bodemgemeenschap A

gt

gt

Plant-Bodem Terugkoppeling

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 8: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Amerikaanse Vogelkers

Agressieve inheemse Pythium stammen

Inheemse Pathogenen beperken inheemse

Prunus uitbreiding

Inheemse Pathogenen =

Minder onderdrukking van Exotische Prunus

Reinhart et al (2003) Ecology Letters 6 1046-1050

bodemgemeenschap X

plantensoort A

-

+ bodemgemeenschap A

gt

gt

Plant-Bodem Terugkoppeling

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 9: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

bodemgemeenschap X

plantensoort A

-

+ bodemgemeenschap A

gt

gt

Plant-Bodem Terugkoppeling

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 10: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Bron Engelkes et al 2008 Nature

Exotics

Bron Morrieumln et al 2011 OIKOS

0

500

1000

1500

2000

2500

Range expanders Natives

tota

l p

lan

t p

ara

sit

ic n

em

ato

de

s p

er

po

t

pe

r g

ram

DW

ro

ot

Range expanders

Rel

atie

f b

od

emef

fect

Areaaluitbreiders Inheemse planten

NEUTRAAL NEGATIEF

Areaaluitbreiders Inheemse planten Pla

nte

net

end

e n

em

ato

den

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 11: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Weerbaarheid vegetatie tegen exoten

en rol van plantendiversiteit

Positieve Relatie

Succesvolle exoten concurrentiekrachtig of

eigen niche

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 12: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Herbivoren

Toename Predatoren

Afname bladluizen

Toename Planten diversiteit

Toename Aantal en

Diversiteit Bestuivers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 13: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Krauss et al (2011) Decreased Functional Diversity and Biological Pest Control in Conventional Compared to Organic Crop Fields PLoS ONE 6(5) e19502

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 14: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Verstoring door

Bodempathogenen

Gaeumannomyces graminis

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 15: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Plantendiversiteit amp

Weerbaarheid tegen Bodempathogenen

Mengteelt Gewasrotatie

Letourneau et al (2011) Does plant biodiversity benefit agroecosystems A synthetic review Ecological Applications 219-21

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 16: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Microbieumlle diversiteit amp

Weerbaarheid tegen Pathogenen

Bacterieumln Schimmels

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 17: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Totale aantallen 108 ndash 1010 per gram droge grond

Kweekbare aantallen 106 ndash 108 per gram droge gram grond

Kweekbare versus niet-kweekbare Bacterieumln

1 ndash 10

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 18: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Bacterieumlle Streepjescode

ATCG

Wat is een bacterie soort

Soort gt 97 overeenkomst

DNA direct uit bodem gt 97 overeenkomst = OTU

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 19: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Bosbodem

Roesch et al (2007) ISME Journal 1283-290

Ongeveer 2000 OTU`s per gram of landbouwbodem

Diversiteit bacterieumln in landbouwbodems

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 20: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Mendes et al (2011) Science 3321097-

Vergelijking ziektewerende en ziektegevoelige bodems

Rhizoctonia

bull Geen verschil in diversiteit

bull Geen verschil in samenstelling phyla

bull Verschil in samenstelling soorten

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 21: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Griffiths amp Philippot (2013) Insights into the Resistance and Resilience of Soil Microbial Communities FEMS Microbiology Reviews 37 (2) 112-129

Verstoring

Weer-baarheid

Gewas-opbrengst

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 22: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Rank of OTU (or Species) 1 1000 10

Veerkracht

bull Predatoren bullPathogenen bull Specialisten bull Organotrofen

Frequentie verdeling van Bacterie soorten

Antagonisten

Pathogenen

Organotrofen

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 23: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Verhoging Weerbaarheid met Biocontrole Microorganismen

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 24: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Vegetatie Exoot

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

MacDougall et al (2009) Plant invasions and the niche Journal Ecology 97 609-615

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 25: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Microbieumlle Gemeenschap

Biocontrole microbe

Nieuwe Niche

Concurrentie-kracht

Geen niche beschikbaar

Verstoring door Indringers

Concurrentie-kracht

Weerbaarheid - Biodiversiteit

1 1000

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben

Page 26: Weerbaarheid · NIOO-KNAW (Microbiële Ecologie) WUR (Bodemkwaliteit) E-mail:w.deboer@nioo.knaw.nl Weerbaarheid . Actoren Activiteit / Mechanisme Gevolg Duur Ziekteverwekkers . Ziekteverwekkers

Verhoging Weerbaarheid

Stimuleren van ldquobodem-

eigenrdquo biocontrole microben