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Chihuahua, Chih. A 23 de enero del 2017 H. Comisión Dictaminadora Presente Por Este medio hago de su conocimiento las actividades inherentes a mis actividades como Técnico Titular B: Administración del Clúster de cómputo Científico del CIMAV. Administración del servidor de Computo Científico del Dr. José Andrés Matutes Aquino. Administración de los servidores de Computo Científico del Dr. Antonino Pérez Hernández. Apoyo a alumnos de maestría y Doctorado con instalación y configuración de herramientas de software de simulación Computacional. Mantenimiento y desarrollo del Sistema de Monitoreo de Calidad del Aire (SMCA). Soporte en la Administración del clúster de Cómputo Científico de la facultad de químicas de la universidad Autónoma de Chihuahua. Soporte en la Administración del clúster de Cómputo Científico de la facultad de ingeniería Mochis de la universidad Autónoma de Sinaloa. Soporte al área de sistemas con la implementación de sistema de control de acceso para los equipos de videoconferencias.
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Chihuahua, Chih. A 23 de enero del 2017
H. Comisión DictaminadoraPresente
Por Este medio hago de su conocimiento las actividades inherentes a mis actividades como Técnico Titular B:
Administración del Clúster de cómputo Científico del CIMAV.
Administración del servidor de Computo Científico del Dr. José Andrés Matutes Aquino.
Administración de los servidores de Computo Científico del Dr. Antonino Pérez Hernández.
Apoyo a alumnos de maestría y Doctorado con instalación y configuración de herramientas de software de simulación Computacional.
Mantenimiento y desarrollo del Sistema de Monitoreo de Calidad del Aire (SMCA).
Soporte en la Administración del clúster de Cómputo Científico de la facultad de químicas de la universidad Autónoma de Chihuahua.
Soporte en la Administración del clúster de Cómputo Científico de la facultad de ingeniería Mochis de la universidad Autónoma de Sinaloa.
Soporte al área de sistemas con la implementación de sistema de control de acceso para los equipos de videoconferencias.
Coordinación del desarrollo del software Material Properties Open Database (MPOD).
Atte:
M.I.S.C. Rodrigo Domínguez GarcíaDpto. de Sistemas.
Clúster de computo CientíficoEl cluster de Computo Cientifico se encuentra configurado como se muestra en la siguiente figura.
Cluster tipo Beowulf
896 CPUs y 19968 cuda cores
CaracterísticasNodo maestro (1)Procesador: 1 Intel Xeon 6 Cores X5650 @ 2.66 GHzMemoria : 12 GB
Nodo de Almacenamiento (1)Procesador: 2 Intel Xeon 8 Cores E5-2650 @ 2.0 GHzMemoria: 64 GBAlmacenamiento: 12 TB
Nodo con GPUs (1)Procesador: 2 Intel Xeon 10 Cores E5-2640 @2.40GHzMemoria: 512 GBGPUs: 4 x NVIDIA Tesla K80 24GB (19968 nucleos CUDA)Almacenamiento: 2 TB
Nodos Esclavo (48)Núcleos de Procesamiento: 896Memoria: 3328 GB (4GB x núcleo)Procesador: 8 nodos con 2 Intel Xeon 6 Cores X5650 @2.67GHz
20 nodos con 2 Intel Xeon 8 Cores E5-2670 @2.60GHz24 nodos con 2 Intel Xeon 10 Cores E5-2640 @2.40GHz
Sistema operativoLinux Centos 6.4 x86_64
Sistema de colas.Torque 2.5.2Maui 3.3
Aplicaciones Instaladas.Wien2KGaussianQuantum espresso.Material Studio VaspAbinitAmberTool
Tareas de administración:Instalación y Configuración de los nodos.Configuración y administración de la Red infiniband y GigaEthernet.Creación y administración de usuarios.Monitoreo del espacio de almacenamiento y cola de Tareas.Instalación y optimización de la librerías de Computo científico.Soporte a usuarios para la ejecución de cálculos.Adaptación e integración de las aplicaciones para su ejecución en el clúster.
Usuarios:Dr. Francisco EspinosaDr. Mario Daniel Glossman MitnikDr. Andrés Manuel Garay TapiaDra. Norma Rosario Flores Holguín Dr. Luis Edmundo Fuentes CobasDra. María Elena Montero CabreraDra. Martha Teresita Ochoa LaraDr. Víctor Manuel Orozco CarmonaDr. José Alberto Duarte Moller
Cálculos enviados 2013 5119alejandra.garcia 926andres.garay 954curso1 15curso10 1curso11 4curso2 7curso3 11
curso4 4curso5 10curso6 10curso7 9curso8 13curso9 10daniel.glossman 1552espinosa 580javier.camarillo 5nano.ecastillo 9nano.fastivia 14nano.hramirez 64nano.jsantos 15nano.vmruiz 13norma.flores 535ruy2311 66test 292
2014 5540alejandra.garcia 230alfredo.aguilar 9andres.garay 1294cimav.alumno1 145cimav.alumno2 49cimav.alumno3 421cristina.maldonado 1daniel.carballo 244daniel.glossman 1594diana.carrillo 1espinosa 412luis.fuentes 3martha.ochoa 3miriam.santos 15nano.fastivia 2nano.vmruiz 31norma.flores 993ruy2311 80test 13
2015 10720alejandra.garcia 4alfredo.aguilar 92andres.garay 12arnold.gonzalez 256cimav.alumno1 664cimav.alumno2 441cimav.alumno3 796cimav.alumno4 114cristina.maldonado 93daniel.carballo 220daniel.glossman 5402
enrique.sosa 46espinosa 532francisco.paraguay 34jalil.carreno 10luis.fuentes 486manuel.pinion 8martha.ochoa 74miriam.santos 0norma.flores 318pierre.bertin 81ruy2311 186victor.orozco 130yosi.venegas 721
2016 11706alberto.duarte 183alfredo.aguilar 146arnold.gonzalez 248cimav.alumno1 28cimav.alumno2 142cimav.alumno3 291cimav.alumno4 34cristina.maldonado 3daniel.carballo 450daniel.glossman 6941elena.montero 228Espinosa 393jalil.carreno 194luis.fuentes 1279manuel.pinion 362martha.ochoa 366norma.flores 156ruy2311 80Test 85victor.orozco 86yosi.venegas 11
Servidores de Computo Científico del Dr. Antonino Pérez Hernández.
El clúster de Computo del Dr. Antonino se encuentra configurado como se muestra en la siguiente figura.
Esquema de utilización del clúster
Para la implementación de este clúster se definió una red virtual (VLAN) para optimizar las tasas de transferencia entre los clientes locales y el nodo maestro, además de configurarse un Gateway de salida a internet, lo cliente remotos tienen acceso al nodo maestro con una sesión grafica a través de internet.
CaracterísticasNodo Maestro
36 GB de memoria ram.2 procesadores hexacore Intel Xeon E5649 @ 2.53GHz
.
3 Nodos de cómputo (36 nucleos de procesamiento , 144 GB de RAM)48 GB de memoria ram.2 procesadores hexacore Intel Xeon E5649 @ 2.53GHz
.
Sistema operativoLinux Centos 6.2 x86_64
Aplicaciones Instaladas.Ansys Fluent
Tareas de administración:Instalación y Configuración de los nodos.Configuración y administración de la Red infiniband y GigaEthernet.Creación y administración de usuarios.Monitoreo del espacio de almacenamiento y servicios de acceso remoto.Instalación y optimización de la librerías de Cómputo científico.Soporte a usuarios para la ejecución de cálculos.Adaptación e integración de las aplicaciones para su ejecución en el clúster.Administración del Gateway de internetAdministración de la vlan de cómputo científico.
Mantenimiento y desarrollo del Sistema de Monitoreo de Calidad del Aire.
A continuación se muestran los diagramas de conexión del sistema de obtención de datos.
Tareas administrativas:Monitoreo de los procesos de adquisición de datos.Administración de la base de Datos.Administración de la página Web para el despliegue de datos.Monitoreo de los procesos de Envió de datos al Sistema Nacional de Información de la Calidad del Aire (SINAICA).
Datos mostrados en la Pagina Web http://smca.cimav.edu.mx Se muestra los datos en tiempo real de los equipos. Histórico seleccionable por horas/días/mes histograma de los datos históricos.
Widget Calidad del Aire http://smca.cimav.edu.mx/central.jsPor solicitud de Dirección de Desarrollo Urbano se desarrollo un componente que permitiera mostrar los datos de la estación de monitoreo desde cualquier pagina web.
Reporte para la intranet http://smca.cimav.edu.mx/intranet/
Acceso al portal y menu de seleccion de datos para el reporte
Resultado del reporte
Datalogger residente en el servidor de la Base de Datos con conexión a SINAICA
Soporte en la Administración del clúster de computo Científico de la facultad de químicas de la universidad
Autónoma de Chihuahua.
Cluster tipo beowulfCaracterísticas IP 148.229.192.100 PORT 65535
Nodo Maestro1 GB de memoria ram.1 Procesador QuadCore Intel Q6600 @ 2.40GHz
6 Nodos de cómputo (48 núcleos de procesamiento, 120 GB de RAM)20 GB de memoria ram.2 procesadores QuadCore Intel Xeon E5345 @ 2.33GHz
Sistema operativoCentos 6.4
Aplicaciones Instaladas.AbinitFEFF 8.4
GaussianQuantum espresso.
Tareas de administración:Instalación y Configuración de los nodos.Configuración y administración de la red Giga Ethernet.Creación y administración de usuarios.Monitoreo del espacio de almacenamiento y servicios de acceso remoto.Instalación y optimización de la librerías de Computo científico.Soporte a usuarios para la ejecución de cálculos.Adaptación e integración de las aplicaciones para su ejecución en el clúster.
Sistema de colas.Torque 2.5.2Maui 3.3
Usuarios:Departamento de Química Computacional
Soporte en la Administración del clúster de Cómputo Científico de la facultad de ingeniería Mochis de la universidad Autónoma de Sinaloa.
Soporte al área de sistemas con la implementación de sistema de
control de acceso para los equipos
de
videoconferencias.
Problemática por lo cual se implemento la solución. Los equipos de Videoconferencias recibían llamadas de usuarios no autorizados, lo cual molestaba a los participantes de las sesiones activas por el ruido generado por el tono de marcado.
Firewall
Transparente
Equipo de
videoconferencias
Internet
Administrador
Pagina de administración del firewall transparente http://prometeo.cimav.edu.mx:8080/vc/login
Pagina de Login
Panel de administración para dar de alta y buscar IPs en el White lists
Material Properties Open Database (MPOD).
Ante la necesidad por parte de la comunidad científica, empresarial, profesional y estudiantil de contar con una fuente de información de propiedades físicas de libre acceso, surge la aplicación web MPOD, la cual permitirá ofrecer una base de datos gratuita y libre, donde se podrá encontrar información de propiedades físicas de una gran cantidad de materiales diferentes, para facilitar la comprensión de alguna propiedad física específica y su comportamiento en un material. Además, la aplicación web cuenta con la función de graficar su superficie 3D, brindando una herramienta interactiva y visual al usuario.
ActividadesAnálisis y rediseño del sistema actual mpodbeta.cimav.edu.mx.Implementación de componentes para graficar las superficies 3D utilizando la librería Plotlib.Coordinación de las actividades de desarrollo del becario Alfredo Ledezma a cargo del Dr. Luis Fuentes.
