BIO210 .Sistem Klasifikasi • Klasifikasi alami ... • Sistem Filogenetik ... (empire) yang...

download BIO210 .Sistem Klasifikasi • Klasifikasi alami ... • Sistem Filogenetik ... (empire) yang kingdom

of 52

  • date post

    11-Mar-2019
  • Category

    Documents

  • view

    222
  • download

    0

Embed Size (px)

Transcript of BIO210 .Sistem Klasifikasi • Klasifikasi alami ... • Sistem Filogenetik ... (empire) yang...

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

BIO210 MikrobiologiBIO210 Mikrobiologi

Dr. Dwi SuryantoProf. Dr. Erman MunirNunuk Priyani, M.Sc.

Dr. Dwi SuryantoProf. Dr. Erman MunirNunuk Priyani, M.Sc.

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY Kuliah 11-12.

PROKARYOT, EUKARYOT, DAN VIRUS

Fosil sel bakteri dalam benruk stromatolit berusia 3.5-3.8triliun milyar tahun ditemukan di lapisan batuan terbentukoleh gabungan sedimen mineral menjadi lapisanmikrobial.

Bakteri pertama mungkin bersifat anaerobik. Sianobakter aerob mungkin berkembang sekitar 2.5-3.0

miliar tahun lalu. Sel eukayot modern muncul dariprokaryot sekitar 1.4 miliar tahun lalu.

Perkembangan kloroplast dan mitokondria melibatkaninvaginasi membran plasma dan rangkaian pembentukanruang atau simbiosisnya.

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Stromatolit

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Urutan taksonomi dari jenis, genus, famili, ordo, kelas,dan kerajaan.

Ahli mikrobiologi sering menggunakan yang kurangformal seperti grup (seksi) berdasarkan deskrispsi (misalmetanogen, bakteri ungu, bakteri asam laktat, dll.)

Spesies bakteri tidak dibatasi berdasar kepadakompatibilitas reproduksi seksual.

Spesies bakteri adalah koleksi strain (galur) yang memilikibanyak sifat stabil dan berbeda secara signifikan dari grupgalur lain.

Galur adalah populasi organisme yang berasal dari satuorganisme atau kultur murni isolat.

Urutan Taksonomi

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Genus adalah sekelompok atau lebih jenis yang jelasterpisah dari genus lain.

Sistem binomial dalam tatnama yang diajukan olehCarolus Linnaeus digunakan dengan nama genus ditulisdalam huruf besar sedang epitetum spesifikum tidak,keduanya ditulis miring (italik) contoh Escherichia coli.

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Sistem Klasifikasi

Klasifikasi alami: mengatur organisme dalam kelompokyang anggotanya memiliki kesamaan sifat danmerefleksikan sebanyak mungkin keadaan alami biologiorganisme.

Sistem Fenetik kelompok organisme bersama berdasarkesamaan umum.Seringkali sistem alami didasarkan pada sifat bersama.Tidak tergantung pada analisis filogenetik.Sistem terbaik membandingkan sebanyak mungkinatribut.

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Sistem Filogenetik (filetik) kelompok organisme bersamadidasarkan pada hubungan evolusioner.

Sulit untuk bakteri karena kekurangan catatan fosil. Pembandingan langsung bahan genetik dan produk gen

seperti rRNA dan protein dapat menyelesaikan masalahini (kronometer molekuler?)

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Escherichia coli Methanococcus vannielle Saccharomyces cerevisiae

eubacteria archaea eukarya

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Pekerjaan Carl Woose dan kaloboratornya menyarankanbahwa organisme termasuk salah satu dari 3 domain(empire) yang kingdom tradisional terdistribusi didalamnya.Eukarya: semua organisme eukaryotik.Bacteria (Eubacteria): termasuk semua organismeprokaryotik dengan rRNA eubacteria dan lipid membranterutama terdiri dari diasil gliserol eter.Archaea: termasuk organisme prokaryotik denganarchaeobacterial rRNA dan lipid membran terdiriterutama oleh isoprenoid gliserol dieter atau derivatdigliserol tetraeter.

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Pohon filogeni universal

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Filogeni Archaea

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Filogeni Eubacteria

Sifat Utama Yang Digunakan Dalam Taksonomi

Sifat Klasik Sifat morfologi mudah dianalisis, stabil secara genetik, dan

tidak bervariasi banyak jika terjadi perubahan lingkungan. Sifat fisiologi dan metabolik berhubungan langsung

dengan enzim dan transport protein (produk gen) danoleh karenanya menyediakan perbandingan tak langsungdari genom mikroba.

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO

LOG

YFA

CU

LTY

OF

MA

THE

MA

TIC

SA

ND

NA

TUR

AL

SCIE

NC

ES

NO

RTH

SUM

ATR

AU

NIV

ER

SITY

Sifat ekologi termasuk pola siklus hidup, hubungansimbiosis, kemampuan menyebabkan penyakit, habitat,dan kebutuhan pertumbuhan.

Analisis genetik mencakup telaah pertukaran genkromosomal melalui transformasi dan konyugasi; prosesini jarang terjadi lintas genus; harus diperhatikan untukmenghindari kesalahan karena sifat yang dibawa plasmid.

DE

PAR

TME

NT

OF

BIO