Alternatieve Studiegids

Versie 5 29-06-14

Alternatieve Studiegids Studie- en OnderwijsGenootschap

Versie 5 29-06-14

Versie 5 29-06-14

Inleiding

De alternatieve studiegids vormt een aanvulling op de studiegids van het onderwijsinstituut. Vaak blijkt de officiële studiegids onvolledig, onduidelijk of oneerlijk te zijn. Deze alternatieve studiegids, aangeboden door het Studie- en OnderwijsGenootschap van V.C.M.W. Sigma, bevat de ervaringen en tips van studenten die de cursussen hebben gevolgd. In deze studiegids kun je lezen wat je van een cursus kan verwachten, hoe moeilijk de cursus wordt gevonden, welke literatuur je nu wel en niet echt moet aanschaffen en wat de beste manier is om je voor te bereiden op het tentamen. Ook bevat het in enkele gevallen tips van de docent die je kunnen helpen bij het leren van de stof. Desalniettemin blijft dit het werk van studenten en daarom dienen enkele zaken duidelijk te zijn voordat je gebruik maakt van deze studiegids:

Disclaimer

1) Aan informatie in deze alternatieve studiegids kunnen geen rechten worden ontleend.

2) De alternatieve studiegids is niet goedgekeurd door het onderwijsinstituut. Bij twijfel over officiële zaken omtrent cursussen dien je contact op te nemen met je studieadviseur.

3) De alternatieve studiegids is incompleet en wordt met regelmaat aangevuld of gewijzigd door het Studie- en OnderwijsGenootschap. Kijk voor de meest actuele versie op www.vcmw-sigma.nl.

4) De studiegids bevat meningen van studenten en kan daarom onjuiste of achterhaalde informatie bevatten. Neem bij twijfel over de inhoud contact op met het Studie- en OnderwijsGenootschap ([email protected]).

5) Indien je deze studiegids gebruikt voor het kiezen van cursussen en studiemethoden, houdt er dan rekening mee dat dit de informatie in deze gids kan afwijken van je eigen ervaring.

6) Voor correcties of aanvullingen kun je contact opnemen met het Studie- en Onderwijsgenootschap ([email protected]). Zij staan open voor aanvullingen en verbeteringen in de studiegids. Indien een cursus niet in de alternatieve studiegids vermeld staat, zouden wij graag input ontvangen.

Om het leesgemak te verhogen, bevat de alternatieve studiegids bladwijzers en kruisverwijzingen. De bladwijzers vind je aan de linker zijde in Adobe Acrobat door op het lintje te klikken. Indien een cursus uit deze alternatieve studiegids elders wordt vermeld, kun je op de naam of het paginanummer klikken om automatisch naar de pagina van deze cursus te springen.

http://www.vcmw-sigma.nl/

mailto:[email protected]

mailto:[email protected]

Versie 5 29-06-14

Curriculum 2014-2015

De grijsgearceerde cursussen zijn opgenomen in deze versie van de alternatieve studiegids.

Jaar 1

Kwartaal 1 Kwartaal 2 Kwartaal 3 Kwartaal 4 Chemische analyse Project biochemie Project reacties en

kinetiek Elektriciteit en magnetisme 1A

Atoom en molecuulbouw

Biochemische Processen

Reacties en kinetiek Thermodynamica project

Biomoleculen Moleculaire Structuur Thermodynamica Spectroscopische technieken

Mechanica 1A Wiskunde 2 Wiskunde 3 Milieuchemie en duurzaamheid

Mechanica 1B Mechanica 2A Elektriciteit en magnetisme 1B

Celbiofysica project

Wiskunde 1 Mechanica 2B Energiemetabolisme Aspecten van de MLW Elektriciteit en

magnetisme 2B Inleiding neuroscience Wiskunde 4 Fourier analyse en

mechanische golven Object oriëntatie

Jaar 2

Kwartaal 5 Kwartaal 6 Kwartaal 7 Kwartaal 8 DNA-technologie Kristalstructuur Quantummechanica 2 Chemische binding Statistiek Programmeren in

Matlab Fourier analyse Elektriciteit en

magnetisme 2A Anorganische chemie Mechanica 2A Microscopische

technieken Gecondenseerde materie

Lineaire algebra Practicum anorganische chemie

Toxicologie Biochemie-Moleculaire biologie II

Thermodynamica 2 Quantummechanica 1 Practicum NMR Synthese biomoleculen Bioinformatica A Algemene fysiologie Chemie en Samenleving Project synthese

biomoleculen Biochemie in de levende cel

MLW en samenleving Schrijfcursus Practicum gecondenseerde materie

Bioanorganische chemie

Genetica Chemical Neuroscience Schrijfcursus

Trillingen en golven Analytische mechanica Chemometrie Filosofie Fysisch practicum Adaptatiefysiologie Medische pathologie

Versie 5 29-06-14

Hersenen en gedrag: Sensorimotoriek

Neurobiologie

Human embryology & developmental biology

Evolutiebiologie

Neurofysica 1 Endocrinologie Celbiologie van dieren Project Spectroscopie Programmeren matlab

voor NW Psychofysica 1

Jaar 3

Kwartaal 9 Kwartaal 10 Kwartaal 11 Kwartaal 12 Chemische binding Atoom en

molecuulspectroscopie Chemometrie Academische vorming

Bioinformatica Stereoselectieve synthese

Humane en Ecologische Risicobeoordeling (HERA)

Practicum synthese

Organische Chemie Fysische organische chemie

Structuur, functie en bioinformatica

Schrijfcursus

Chemie en fysica van de atmosfeer

Kristalgroei Toxicology Filosofie

Magnetische resonantie Schrijfcursus Chemie en samenleving Filosofie Statistische

thermodynamica Metaalorganische chemie

Schrijfcursus Green Chemistry Schrijfcursus Bioanorganische chemie

Filosofie Single molecule studies

Pharmacochemie Geografische Informatiesystemen (GIS)

Chemical Neuroscience

Genomics in health and environment

Beleid, ondernemerschap en innovatie

Pathofysiologie van de nier

Neuroscience Immunologie Functional genomics Neurofysiologie van cognitive en gedrag

Neurodevelopment Moleculaire basis van ziekten

Fysiologie van micro-organismen

Medische biotechnologie

Cognitive neuroimaging

Milieuchemie & toxicologie

Nanobiotechnologie Vergelijkende genoomanalyse

Spectroscopie van biomoleculen

Molecular Principles of Development

Geschiedenis van de biologie

Neurobiofysica

Debating Science in Society

Versie 5 29-06-14

Inhoudsopgave Klik op een regel om naar de betreffende pagina te springen.

1. Kwartaal 1 ............................................................................................................................................. 8

1.1. Verplichte vakken .......................................................................................................................... 8

1.2. Keuze vakken .............................................................................................................................. 10

1.2.1. Organische Chemie ............................................................................................................. 10

1.2.2. Milieuchemie & toxicologie ................................................................................................ 12

2. Kwartaal 2 ........................................................................................................................................... 14

2.1. Verplichte vakken ........................................................................................................................ 14

2.1.1. Biochemische Processen ..................................................................................................... 14

2.1.2. Moleculaire Structuur ......................................................................................................... 16

2.1.3. Wiskunde 2 ......................................................................................................................... 18

2.2. Keuze vakken .............................................................................................................................. 20

2.2.1. Debating Science in Society ................................................................................................ 20

2.2.2. Fysische organische chemie ................................................................................................ 22

2.2.3. Geografische Informatiesystemen (GIS) ............................................................................. 24

2.2.4. Green Chemistry ................................................................................................................. 26

2.2.5. Immunologie ....................................................................................................................... 28

2.2.6. Molecular Principles of Development ................................................................................. 30

2.2.7. Nanobiotechnologie ............................................................................................................ 32

2.2.8. Stereoselectieve synthese .................................................................................................. 34

3. Kwartaal 3 ........................................................................................................................................... 36


3.2. Keuze vakken .............................................................................................................................. 38

3.2.1. Chemical Neuroscience ....................................................................................................... 38

3.2.2. Humane en Ecologische Risicobeoordeling (HERA) ............................................................ 40

3.2.3. Moleculaire basis van ziekten ............................................................................................. 42

3.2.4. Structuur, functie en bioinformatica .................................................................................. 44

Bijzonderheden: ...................................................................................................................................... 44

4. Kwartaal 4 ........................................................................................................................................... 46

Versie 5 29-06-14


4.2. Keuze vakken .............................................................................................................................. 48

4.2.1. Biochemie-Moleculaire biologie II ...................................................................................... 48

5. Niet in curriculum Moleculaire Wetenschappen 2014-2015 .............................................................. 50

5.1. Uit een vorige studiegids ............................................................................................................ 50

5.1.1. Klimaatverandering – Wetenschap & Beleid ...................................................................... 50

5.2. Uit de studiegids van een ander cluster ..................................................................................... 52

5.2.1. Water en Natuurbeheer ...................................................................................................... 52

6. Index .................................................................................................................................................... 54

6.1. Alfabetisch .................................................................................................................................. 54

6.2. Op cursuscode ............................................................................................................................. 55

Versie 5 29-06-14

1. Kwartaal 1

1.1. Verplichte vakken

Versie 5 29-06-14

Versie 5 29-06-14

1.2. Keuze vakken

1.2.1. Organische Chemie

Geschreven op: 18-6-2014 Gevolgd in: Kwartaal 1 – 2012-2013

Docenten:

Prof. dr. F.P.J.T. Rutjes Dr. J. Mecinovic

Voorkennis:

Atoom- en molecuulbouw, Moleculaire Structuur, Reacties en kinetiek en (project) synthese biomoleculen.

Beschrijving:

De cursus is een voortzetting van de vakken reacties en kinetiek en synthese biomoleculen. Het gaat dus om het uitbreiden van de kennis over synthese. Belangrijke onderwerpen zijn radicaalchemie, reacties met enolen, enolaten en carbonzuren. Ook belangrijk zijn neighbouring Group participatie en aromatische substitutie reacties. Het draait hierbij om de reactiecondities die nodig zijn voor de reacties, maar ook reactiemechanismen zijn van groot belang.

Werkvormen:

32 uur hoorcollege, 32 werkcollege: Bij de cursus lopen de werkvormen enigszins door elkaar. De cursus wordt in blokken van vier uur gegeven waarin er geen duidelijke scheiding is tussen het werkcollege en het hoorcollege. Er is bij het werkcollege niet heel veel begeleiding, behalve de docent van die dag. Een probleem is dit niet echt omdat de opgaven uit het boek komen, waarvan zeker een aantal studenten ook het antwoordenboek zullen hebben. Let wel op dat hierin vaak niet de volledige uitwerkingen staan die je op het tentamen wel moet kunnen geven. Het is aan te raden voor alle opgaven ook de mechanismen uit te tekenen.

Literatuur:

Organic chemistry, Paula Y. Bruice Study Guide and solutions manual for organic chemistry, Paula Y. Bruice

Deze boeken worden ook gebruikt voor reacties en kinetiek en synthese biomoleculen .

Tentaminering:

20 % van het cijfer wordt bepaald door tussentoetsen. Hiervan zijn er vier en worden afgenomen als meerkeuze toetsen op de computer. Na het maken krijg je meteen je cijfer terug. De hoogste drie cijfers

Versie 5 29-06-14

tellen vervolgens mee voor 20% van het eindcijfer. Belangrijk is dat deze toetsen maar een academisch jaar meetellen het jaar daarna moeten ze op nieuw gemaakt worden.

De overige 80% wordt bepaald door een schriftelijk tentamen.

Bijzonderheden:

De cursus is vooral interessant voor mensen die iets willen gaan doen met synthethische chemie. Deze is daarom zeer aan te raden voor studenten die op een van de organische afdelingen stage willen gaan lopen. Een deel van het college werd in het Engels gegeven, Dr. J. Mecinovic spreekt namelijk geen Nederlands. Vanaf collegejaar 2014-2015 wordt deze cursus volledig in het Engels gegeven.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

1.2.2. Milieuchemie & toxicologie

Geschreven op: 18-09-2013 Gevolgd in: Kwartaal 1-2012-2013

Docenten:

D. van de meent A. Hollander.

Voorkennis:

Geen voorkennis vereist. Voor degenen die Milieuchemie en Duurzaamheid hebben gevolgd, zal een deel al bekend zijn, waardoor dit vak gemakkelijker door te komen is.

Beschrijving:

Het vak behandeld alle basisbegrippen uit het milieurisicobeoordeling van chemische stoffen. Je rekent aan veel waardes om tot een antwoord te komen. Verder is er een college geweest waar je veel lineaire algebra moest toepassen: dit is wel lastig voor MLW’ers aangezien zij dit vak nooit hebben gehad. Het basis rekengereedschap van de milieurisicobeoordeling komt aan de komt aan de orde: simulatiemodellen, waarmee wordt voorspeld welke concentraties van een stof in lucht, water en bodem, voedsel moeten worden verwacht, gegeven een bekende (geschatte) emissie en de fysische en chemische eigenschappen van de stof. Wat is een massabalansvergelijking?

Werkvormen:

Hoorcollege, hierin word een heleboel stof verteld wat vaak niet terugkomt (zowel in het werkcollege als het tentamen niet).

Werkcollege, je moet iedere week je opdrachten inleveren (mag ook in tweetallen/drietallen). Deze opdrachten zijn prima te doen. Je moet voor de werkcollege een tekst zelf bestuderen. Vaak is dit te veel voor de gegeven hoeveelheid tijd. Veel van deze opgaves komen terug in je tentamen.

Literatuur:

Literatuur wordt aangereikt via Blackboard.

Tentaminering:

Openboek tentamen. Het tentamen bestond uit 65 open vragen. Na het tentamen gaf de docent aan dat dit toch wel teveel was en zou het reduceren. Alles was terug te vinden in de werkcollegevragen, boek of sheets. Het boek was geen verplichte aanschaf, maar voor het tentamen werd toch zeker wel aangeraden om alles uit te printen, aangezien er specifieke vragen kwamen over bepaalde pagina’s.

Bijzonderheden:

Versie 5 29-06-14

In het jaar 2012/2013 was dit vak alleen nog maar een 3ec vak alleen over milieuchemie. Volgend jaar is het een 6ec cursus met ook de toxicology erbij betrokken.

Het werd als heel storend ervaren hoe de docent les gaf. Vaak wist hij niet waar hij het over had, las saai de sheets voor en was erg onduidelijk over de taken die werden verwacht van de student.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

2. Kwartaal 2


2.1.1. Biochemische Processen

Geschreven op: Gevolgd in:

Docent:

dr. Hans Heus prof. dr. Ger Pruijn

Voorkennis:

Basis kennis die je op hebt gedaan bij biologie op de middelbare school en bij de cursus biomoleculen komen van pas bij biochemische processen.

Beschrijving:

De cursus Biochemische Processen is gericht op functionele aspecten van biomoleculen, met name nucleïnezuren en eiwitten. Deze cursus is nauw verbonden met de practicumcursus Project Biochemie, die ook in kwartaal 2 wordt gevolgd. Het doel van deze cursus is inzicht verschaffen in de werking van de moleculen die zich in levende cellen bevinden. Hierbij zal het accent liggen op de werking van enzymen en de processen waarbij nucleïnezuren en eiwitten gesynthetiseerd worden (zoals de citroenzuurcyclus). Daarnaast zal aandacht besteed worden aan de mechanismen waarmee cellen energie genereren. Bovendien zullen een aantal technieken, die toegepast kunnen worden om deze processen te bestuderen, behandeld worden.

Werkvormen:

16 uur hoorcollege

De colleges behandelen de stof die nog eens uitgebreid wordt behandeld in ‘Lehninger Principles of Biochemistry’. Af en toe zijn de hoorcolleges droog en langzaam omdat ze te diep ingaan op bepaalde onderwerpen, maar ze zijn zeker nodig omdat er duidelijk wordt gezegd wat tentamenstof is en wat niet.

8 uur werkcollege

De werkcolleges zijn onder ander handig om het boek eens grondig door te lezen, want het zijn flink veel pagina’s die je moet kennen voor het tentamen. Ook hebben de docenten studiedoelen opgezet, dit zijn vragen die je doormiddel van het boek te lezen kunt beantwoorden. Zo ben je toch wat intensiever bezig met de tekst waardoor het beter blijft hangen en krijg je een beeld van wat ze zouden kunnen vragen op het tentamen, hoe die vragen worden geformuleerd en hoe je antwoord er zou uit moeten zien.

Versie 5 29-06-14

Literatuur:

David L. Nelson, Micheal M. Cox, ‘Lehninger Principles of Biochemistry’ University of Wisconsin-Madison, 2008.

Het boek is zeer uitgebreid, goed gevisualiseerd en leest eenvoudig door. Omdat het zo uitgebreid verdiept is, kan het soms gebeuren dat je het overzicht verliest van wat je nu moet weten voor het tentamen en wat onnodige informatie is. Hiervoor zijn de studiedoelen erg handig. Door deze vragen te beantwoorden pik je de juiste informatie uit de tekst en kun je een aantal pagina’s tekst reduceren tot twee alinea’s.

Tentamenering:

Een gesloten boek tentamen die bestaat uit zo’n 60 meerkeuze vragen en 5 of 6 open vragen. Let wel op dat de twee gedeeltes even zwaar mee tellen voor je eindcijfer, dus de open vragen zijn individueel meer punten waard dan de meerkeuze vragen. Ook moet je erop bedacht zijn dat 25% procent van de juist beantwoorde meerkeuze vragen als het waarde worden weggelaten in je cijfering, omdat je deze score volgens kansberekening op goed geluk ook kon behalen. Daarbij moet je zeker zijn van je antwoord voordat je een antwoord aankruist, want de computer die dat gedeelte van het tentamen nakijkt rekent het fout wanneer er meer dan één antwoord ingekleurd is (ook al is de juiste ingekleurd en de verkeerde doorgekrast).

Tot slot is het handig de tussentijdse toets serieus te maken, omdat het voor een gedeelte mee telt voor het tentamencijfer.

Bijzonderheden:

-

Teacher Tips:

De docenten raden het aan om doorheen de cursus het boek goed bij te houden en hiervan notities te maken, anders moet je vlak voor het tentamen nog eens tien hoofdstukken gaan lezen. Onderschat niet de tijd die daarin gaat zitten!

Door de hoorcollege stof heen wil de docent nog wel eens verhullen wat zeker in het tentamen terugkomt en wat vergeten kan worden. Zo is het verstandig de gehele citroenzuurcyclus zo-goed-als uit het hoofd te kennen en veel af te weten van mechanismen zoals DNA-replicatie, RNA-synthese en transcriptie en eiwitsynthese. Hier komen zonder twijfel vragen over in het tentamen (met name open vragen).

Versie 5 29-06-14

2.1.2. Moleculaire Structuur


Docent:

Paul Kouwer

Voorkennis:

De begrippen en kennis die je hebt opgedaan bij Atoom en Molecuulbouw komen hier en daar te pas bij Moleculaire Structuur, maar over het algemeen is het een compleet nieuw vak.

Beschrijving:

Het vak wordt leuk lesgegeven met een tempo dat de docent aanpast aan het publiek, daar waar het moeizamer gaat wordt meer tijd voor genomen en eenvoudige dingen worden niet tot in ten treure verdiept. De onderwerpen zijn ook leuk, boeiend en enigszins eenvoudig. Van IR-, NMR- en massaspectra ontcijferen, tot het tekenen van 3D structuren en het opstellen van energieniveaus van verschillende conformaties. Voornamelijk ben je bezig met een beeld te krijgen van hoe de 3D structuur van moleculen eruit komen te zien op basis van spectra informatie en reacties die verschillende 3D voorkeuren hebben, dus het is een hele visuele cursus (veel tekenen, weinig rekenen).

De meeste opgaves zijn heel veel tekenwerk, dus zorg dat je genoeg papier en een volle pen bij je hebt!

Werkvormen:

Hoorcollege 18 uur

De hoorcolleges zijn leuk en boeien, je kunt zien dat Paul Kouwer houdt van zijn vak en dit goed over weet te brengen. Het tempo is aangepast aan het publiek, waardoor het heel goed te volgen is. Het enige nadeel is dat het vak op een vrijdag wordt gegeven, maar het is niet al te intensief dus is het met een lichte hoofdpijn en misselijkheid van donderdag nog goed vol te houden.

Werkcollege 10 uur

Door Pauls manier van vertellen ziet het er allemaal heel eenvoudig uit, maar toch is direct oefenen na het hoorcollege aan te raden. Anders gaat het gewoon het ene oor in en het ander oor uit. Door de opgaves te maken in de werkcolleges blijft de stof veel beter hangen, anders verlies je al gauw het overzicht en wordt het alsnog panieken voor het tentamen.

Computerpracticum 6 uur

Met behulp van verschillende programma’s worden de structuren van bepaalde moleculen opgehelderd en kun je oefenen met spectra lezen.

Versie 5 29-06-14

Responsiecollege 1 uur

Uitstekend voor laatste vragen en onduidelijkheden die je voor het tentamen nog mocht hebben. Ook al heb je zelf geen vragen kun je altijd naar het responsiecollege gaan, want iemand anders kan weer een hele goede vraag stellen waar je toch weer wat aan hebt.

Literatuur:

Paula Yurkanis Bruice, ‘Organic Chemistry’, University of California, Santa Barbara, 2011.

Paula Yurkanis Bruice, ‘Study Guide and Solution Manual Organic Chemistry’, University of California, Santa Barbara, 2011.

Het eerste boek is eenvoudig geschreven met veel plaatjes, wat wel nodig is bij zo’n visueel vak. De stof blijft goed hangen, wordt uitgebreid weergegeven en is op zo’n manier geschreven dat het snel leest.

Dit in tegenstelling tot het boek dat wordt gebruikt voor Atoom en Molecuulbouw, wat aanzienlijk langzamer leest en je totaal geen beeld geeft van de stof.

Het tweede boek bevat uitgebreide uitwerkingen van de opgaves van ‘Organic Chemistry’.

Het zijn twee extreem zware boeken, maar als je ze niet allebei meeneemt heeft het nauwelijks zin om naar de werkcolleges te gaan.

Tentamenering:

Het tentamen is een gesloten boek tentamen, waarbij de gevarieerde onderwerpen allemaal aan bod komen. Spectra’s worden gegeven waarbij een stof gezocht moet worden, of een stof wordt gegeven en een passend spectra moet worden gezocht (wat vaak in meerkeuze antwoorden wordt gevraagd). Ook zul je een aantal reacties met de te verwachten eindproducten en intermediairs helemaal moeten uittekenen. Verder wordt er ook vaak gevraagd om een energieniveau te tekenen van een Newman Projectie molecuul. Ook is het vereist dat je de triviale namen kent van de behandelde stoffen, anders zijn veel opgaves niet te maken.

Bijzonderheden:

-

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

2.1.3. Wiskunde 2


Docent:

drs. Wim Gielen

Voorkennis:

Enigszins gevoel en kennis over primitieveren en inhoud berekenen is zeker niet verkeerd.

Beschrijving:

Wiskunde 2 is weer een hele andere tak van sport en staat bijna helemaal los van wiskunde 1. De stijl van lesgeven is nog altijd gelijk: de poezen, de knuffel, de voorliefde voor whisky en de haat tegen spinnen komt nog altijd herhaaldelijk terug in Wims hoorcolleges en iedere week wordt gevuld door achtereenvolgens twee hoorcolleges, een werkcollege en een toets die je kan vrijspreken van het tentamen.

Toch is de stof een stuk pittiger en het tempo nog steeds even hoog (als het niet hoger is). Voor de math die-hards is het zeker haalbaar om hoge punten te scoren en het tentamen over te slaan, maar de cijfers zullen over het algemeen dalen en het aantal studenten dat het tentamen moet maken zal ongetwijfeld hoger zijn dan het aantal bij wiskunde 1.

Maar wees niet bang, veel studeren, je aandacht er goed bijhouden in de hoorcolleges (en dat begint al met aanwezig zijn!), je best doen in de werkcolleges en vooral niet in paniek raken en de moed verliezen en dan komt het goed. Voor je het weet heb je primitieveren onder de knie, kun je integralen opstellen van cirkels en parabolen en kun je de inhoud berekenen van de meest ingewikkelde 3D figuren.

Werkvormen:

Hoorcollege 12 uur

De hoorcolleges zijn alles behalve saai, Wim Gielen racet over de stof heen en betrekt al zijn katten, liters whisky en zijn knuffel er regelmatig bij. Zo blijft de stof goed hangen en ziet het er allemaal veel eenvoudiger uit.

Werkcollege 12 uur

Met de hoorcolleges alleen ga je het niet halen met de toetsjes en het tentamen, veel oefenen is zeker nodig. Ga daarom naar de werkcolleges en neem zelfstudie serieus. Vaak lukt het niet om alle oefen opgaves te maken en daarna nog naar struikelpuntjes te kijken met de assistent, dus zorg dat je al een beginnetje heb gemaakt aan het werkcollege voordat je er naar toe gaat.

Toetsen 8 stuks van 1 uur en een kwartier per stuk (10 uur in totaal)

Versie 5 29-06-14

Maak deze toetsen serieus, want ze kunnen je vrijstellen van het tentamen (dezelfde regeling als met wiskunde 1). Ook geven ze een beeld van je sterkere en zwakkere punten van wiskunde 2, wat je weer kan helpen met efficient leren voor het tentamen (mocht je die moeten maken). Bewaar de toetsjes met de uitwerkingen ook goed, want je mag ze bij het tentamen houden.

Literatuur:

Drs. W. Gielen, ‘Wiskunde 2’, Onderwijsinstituut Moleculaire Wetenschappen, 2013-2014. Dit dictaat zit zo bomvol met oefenopgaves en voorbeelden dat je geen andere literatuur meer nodig hebt. Soms slaat hij een paar stappen over in zijn uitwerking of gaat hij ervan uit dat je aspecten van wiskunde 1 al volledig uit je hoofd kent, maar hier zul je extra aandacht aan moeten besteden, stapsgewijs een som uitschrijven en af en toe terugbladeren door je ‘Wiskunde 1’ dictaat.

Tentamenering:

Een schriftelijk open boek tentamen, waarbij je hulpmiddelen zoals toetsjes en samenvattingen bij mag houden (doe dit ook want het kan je tentamen redden!). De eerstejaars van nu hebben en zwaarder dan de eerstejaars van 2012/2013, er mogen namelijk een select aantal toetsjes bijgehouden worden en bepaalde samenvattingen zijn niet toegestaan. Dit verandert ieder jaar weer een beetje. In ieder geval, neem mee wat je mee mag nemen!

Bijzonderheden:

-

Teachers Tips:

Bereid je voor op de hoorcolleges door alvast naar de opgaves te kijken, dit helpt je aanzienlijk om het tempo bij te houden (Wim Gielen raad het aan om zo’n 25% van de opgaves van te voren gemaakt te hebben).

De avond na het hoorcollege is het verstandig het hoofdstuk nogmaals door te nemen en wat opgaves te maken (Wim Gielen raad het aan om zo’n 50% van de opgaves van te voren gemaakt te hebben voordat het werkcollege begint).

Versie 5 29-06-14

2.2. Keuze vakken

2.2.1. Debating Science in Society


Docenten:

Dr. J.G. van den Born Dr. R.P. Verhoeff Dr. L. Landeweerd

Voorkennis:

Geen voorkennis vereist

Beschrijving:

Deze cursus is een introductie cursus voor de communicatie variant van de master en is bedoeld voor derdejaars bachelor studenten aan het FNWI. Dit wordt gedaan aan de hand van het klimaatprobleem, omdat dit voor iedereen bekend is en daarom makkelijk om de verschillende opvattingen mee uit te leggen. De onderwerpen die aanbod zijn is de verhouding, dus media, wetenschap en beleid. Hoe wetenschapscommunicatie toegepast en gebruikt kan worden en ook wat onzekerheid nu daadwerkelijk is.

Werkvormen:

Er wordt 7 uur hoorcollege gegeven. Hierin worden de hoofdzaken uitgelegd aan de hand van het klimaatmodel. Ook worden er gastcolleges gegeven.

Daarnaast is er ook 7 uur werkcollege waaraan je aan de vraagstukken kan werken.

Een belangrijk onderdeel van het college is het klimaatdebat. Hierbij word de situatie bij de Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC) aan toe gaat. Dit deel wordt samengedaan met de cursus Klimaatverandering: wetenschap en beleid. Voor dit debat moet je je verplaatsten in bepaalde groepen landen en hoe die ten opzichte van klimaatverandering staan.

Literatuur:

Bij de cursus word voornamelijk gebruik gemaakt van artikelen welke via blackboard ter beschikking worden gesteld. Er hoeft geen boek aangeschaft te worden.

Tentaminering:

Het vak wordt beoordeeld door middel van drie vragen die in de loop van het college naar voren komen. Deze drie vragen moeten in essay vorm beantwoord worden van ongeveer een kantje.

Versie 5 29-06-14

Bijzonderheden:

Het vak is dan in principe bedoelt voor mensen die er over nadenken mogelijk de communicatie variant van de master te gaan doen. Zelf kan ik het vak ook prima aanraden voor anderen, je krijgt namelijk een andere manier mee van het kijken naar de wetenschap.

Als je echter geen zin hebt om over klimaatsverandering college te krijgen zou ik het vak afraden.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

2.2.2. Fysische organische chemie


Docenten:

P.H.J Kouwer A.E. Rowan W.T.S. Huck

Voorkennis:

Volgens de studiegids niets, maar het begrijpen van het kinetiek deel van reactie & kinetiek en het vak thermodynamica is aan te raden.

Beschrijving:

Het vak heeft meerdere onderwerpen, maar heeft als hoofdonderwerp het doorgronden en begrijpen hoe en waarom bepaalde chemische reacties plaatsvinden. Zo gaat het over de kinetiek van reactie, verschillende soorten bindingen, ligand bindingen (bij eiwitten), lineair free energy relaties, host-guest chemie en zuur-base reacties.

Werkvormen:

Er is een hoorcollege en een werkcollege in de week. De hoorcollege zijn duidelijk en gebaseerd en volgen de lijn van het boek. De werkcolleges zijn echt een aanrader. De soorten vragen die hierin worden gesteld, lijken heel erg op vragen die je in het tentamen zal tegenkomen. Verder is het een goede manier om te controleren of je de stof in het hoorcollege goed hebt begrepen. Verder staat er extra oefenmateriaal in het boek inclusief antwoorden, mocht je een onderwerp meer willen begrijpen.

Literatuur:

Er staat het boek “Modern Physical Organic Chemistry” voor. Echter zijn de hoorcollege duidelijk genoeg. Het is een handig boek om dingen in na te lezen of zoals eerder genoemd voor extra oefenopgaves.

Tentaminering:

Het tentamen bestond uit vragen die leken op het werkcollege. Van ieder onderdeel kwamen vragen terug in het tentamen.

Bijzonderheden:

Dit vak is ook prima te volgen voor MLW’ers. Zeker als je iets meer de chemische kant op wilt gaan, is dit vak zeker een aanrader. Er komt wel wat wiskunde/berekenen in voor, maar is prima te doen.

Versie 5 29-06-14

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

2.2.3. Geografische Informatiesystemen (GIS)


Docenten:

A. Ragas A. Schipper A. Hollander

Voorkennis:


Beschrijving:

De cursus staat in het teken van het vaardig worden met het programma ArcGIS. Met dit programma wordt het mogelijk om kaarten te maken die ruimtelijke data op iedere mogelijke gewenste manier weergeeft. Je moet hierbij denken aan bijvoorbeeld concentratiegradiënten van cadmium in het overloopgebied van de Waal of markering van bufferzones voor de bescherming van het leefgebied van bedreigde diersoorten. Voor geïnteresseerden in milieuwetenschappen is dit een belangrijke cursus, aangezien het grafisch weergeven van ruimtelijk informatie geheid ooit op je pad zal komen. Wordt je geen GIS deskundige, dan is het nog altijd handig om de basisbeginselen te weten, zodat communicatie met de GIS-afdeling makkelijker verloopt en je de gewenste kaarten geleverd krijgt.

Werkvormen:

De cursus heeft een vaste opbouw, waarbij wordt begonnen met een inleidend hoorcollege. Hierna volgt een moment voor zelfstudie, waarbij hoofdstukken uit het boek doorgenomen moeten worden en opgaven moeten worden beantwoord. Vervolgens kom je in een intervisiegroep samen om onduidelijkheden te bespreken. Vragen waar je met je groep niet uit komt, plaats je in het forum op BlackBoard. Hier kunnen andere intervisiegroepjes op reageren ene r wordt van je verwacht dat je ook op vragen van andere intervisiegroepjes reageert. Vervolgens is er weer een samenkomst, waarbij de opdrachten kort worden besproken en de onbeantwoorde vragen in een open discussie met de docent worden beantwoord. Vervolgens ga je de theorie uit het boek toepassen tijdens het computerpracticum, waarbij je vragen kunt stellen aan aanwezig computerpractica begeleiders.

Literatuur:

An introduction to Geographical Information Systems - Heywood, Cornelius en Carver. Er wordt intensief gebruik gemaakt van dit boek tijdens de cursus, dus het is zeker het aanschaffen waard. Er wordt gewerkt met de vierde editie, maar in de cursushandleiding worden ook altijd verwijzingen gemaakt naar de derde en tweede editie. Wil je helemaal geld besparen, dan kan de slimme googlaar zo een pdf-versie vinden.

Versie 5 29-06-14

Tentaminering:

Gedurende het vak moet je drie individuele opdrachten inleveren die meetellen voor je eindcijfer. Het vak wordt afgesloten met een groepsproject, waarin je met je intervisiegroepje nog eens alle geleerde handelingen in een totaalproject leert toe te passen. Vervolgens moet je dit project afsluiten met een rapport en een presentatie.

Bijzonderheden:

Er komen veel biologen op de cursus af, dus als je verlegen bent in vreemd gezelschap, zorg dan voor een MLW/scheikunde-buddy. Door de uiterst uitgebreide online handleiding is het vak behoorlijk voorgekauwd. Je bent vaak ellendig lang bezig met allerlei operaties voor je een kaartje hebt gemaakt en als je de tussenstappen niet apart opslaat en je maakt onderweg een fout, dan kun je helemaal opnieuw beginnen. Het is zeldzaam dat iedereen hetzelfde resultaat heeft bij dezelfde opdracht, dus de stappen luisteren nauw.

Vanwege een beperkt aantal licenties kan het voorkomen dat je de software niet kunt gebruiken in de uren die hiervoor zijn ingeroosterd. Biologen zijn echte uitslapers, dus als je ’s ochtends op tijd begint, kun je mooi de hele dag aan de slag. Negeer de opmerkingen dat je het programma moet afsluiten als je niet bezig bent, zodat er licenties vrijkomen. Dit is een truc bedacht door mensen die te laat komen, zodat ze toch halverwege de dag aan de slag kunnen op de licentie waar jij ’s ochtends vroeg voor bent opgestaan. Overigens is het downloaden van de 60-dagen-gratis-probeerversie van de software ook geen slecht idee.

Als de cursus je echt goed bevalt, kun je eventueel een master sub-track doen in die richting.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

2.2.4. Green Chemistry


Docenten:

F.P.J.T. Rutjes R. van Zelm M. Hauck

Voorkennis:

Synthese biomoleculen

Beschrijving:

Tijdens dit vak leer je over de twaalf groene principes die je kunt toepassen bij het bedrijven van chemie. Aan de hand van verschillende reacties leer je herkennen waar verbetering kan plaatsvinden en hoe je de twaalf principes kunt gebruiken om chemische reacties groener te laten verlopen.

Werkvormen:

Er zijn zes onderwerpen die ieder beginnen met een hoorcollege van twee uur gevolgd door een werkgroepopdracht van zes uur. Deze werkgroepopdracht doe je in tweetallen, waarbij je wetenschappelijke literatuur krijgt aangereikt door de docent. De kennis die je hebt opgedaan over het onderwerp in het hoorcollege moet je toepassen op de literatuur. Vaak betekent dit dat je een reactie analyseert en kijkt op welke punten de reactie slecht scoort met betrekking tot milieubelasting. Hierbij maak je soms gebruik van specialistische software. Tijdens de laatste twee weken van de cursus krijg je een verbinding toegewezen waarvoor je een life cycle assesment gaat uitvoeren aan de hand van eerder opgedane kennis en het programma Simapro.

Literatuur:

Een studentenhandleiding en verscheidene wetenschappelijke artikelen worden aangeleverd door de docenten.

Tentaminering:

Iedere week presenteer je de bevindingen van je werkgroepopdracht. Deze tellen tezamen voor 20% mee in je eindcijfer. Het verslag en de presentatie van het project telt mee voor 40% en een afsluitend tentamen waarin theoretische kennis wordt getest, telt voor nog eens 40% mee.

Bijzonderheden:

De werkgroepopdrachten zijn kosten vaak meer dan 6 uur tijd om te voltooien. Dit zorgt ervoor dat voor deze cursus een hogere werklast wordt ervaren dan de 3EC doet vermoeden. Begin op tijd aan de

Versie 5 29-06-14

werkgroepopdracht en verwerk je bevindingen vanaf het begin al in een presentatie, zodat je niet dubbel werk hoeft uit te voeren.

Voor de software Simapro zijn enkele licenties beschikbaar die door de docenten worden verschaft. Deze software is uiterst kostbaar, dus wordt vanuit de vakgroep nogal wat geld uitgegeven voor deze cursus.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

2.2.5. Immunologie


Docenten:

Dr. J. van der Vlag (Coördinator) Prof. Dr. J. Berden Dr. M. van Deuren Prof. Dr. C. Figdor Prof. Dr. L. Hilbrands Dr. A. van der Meer Dr. F. Preijers Dr. A. van Spriel

Voorkennis:

Er is geen vereiste voorkennis.

Beschrijving:

Deze cursus wordt aangeboden door het Radboud UMC en een aantal docenten is dan ook werkzaam bij een klinische afdeling. Tijdens deze cursus wordt vrijwel het hele boek (Cellular and Molecular Immunology by A. K. Abbas) doorgewerkt. Er wordt dus een behoorlijk compleet beeld van het immuunsysteem verkregen, met alle bijbehorende celtypen, moleculen en activeringsmechanismes. Ook wordt de link gelegd met ziektes, zoals auto-immuunziekten, maar ook met kanker en het bestrijden van kanker met behulp van het immuunsysteem.

Werkvormen:

• 9 uur practicum

Een aantal thema’s worden verder uitgediept tijdens een practicum, waarbij onder andere verschillende soorten assays en andere experimentele technieken worden bestudeerd. Deze practica zijn verplicht en de antwoorden moeten direct na afloop ingeleverd worden.

• 12 uur hoorcollege

In de hoorcolleges wordt de stof vluchtig, maar begrijpelijk uitgelegd. Vaak zijn het korte colleges van drie kwartier en worden er meerdere thema’s per dag behandeld.

• 20 uur computerpracticum

Net als bij de practica wordt tijdens de computerpractica de experimentele kant van de immunologie belicht. Je moet bijvoorbeeld een experimentele opzet maken, of een FACS (Fluorescent Aided Cell Sorting) dataset analyseren. Ook het computerpracticum is verplicht en je moet je antwoorden

Versie 5 29-06-14

vaak diezelfde dag inleveren.

• 12 uur responsiecollege

Tijdens het responsiecollege is er gelegenheid om vragen te stellen over de stof en over de zelfstudieopdrachten.

• 104 uur zelfstudie

Voor dit vak staan veel uren zelfstudie ingeroosterd. Deze uren zijn bedoeld om in het boek in meer detail na te lezen wat er in het hoorcollege verteld is en om de zelfstudieopdrachten te maken.

Literatuur:

-

Tentaminering:

25% van het eindcijfer wordt bepaald door het gemiddelde van de cijfers voor de (computer)practica. 75% van het cijfer wordt behaald tijdens het tentamen.

Bijzonderheden:

Het tentamen is een multiple choice tentamen. Echter, voor elk fout antwoord krijg je punten aftrek. Tijdens het tentamen worden ook vragen gesteld over de stof uit de (computer)practica, dus niet alleen over de hoorcolleges en de zelfstudieopdrachten. Ook is er een maximum aantal deelnemers, namelijk 120, dus op tijd inschrijven is gewenst, aangezien dit vak ook door veel biologiestudenten gevolgd wordt. De cursus wordt in het Engels gegeven.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

2.2.6. Molecular Principles of Development


Docenten:

Dr. L. Kamminga Prof. G.J.C. Veenstra

Voorkennis:

Officieel Biochemie-Moleculaire biologie II en Human Embryology and Developmental Biology. Als je als MLW-er HEDB niet gevolgd hebt is het vak ook te doen, maar dan is het wel handig om (zoals ook geadviseerd wordt) jezelf eerst vertrouwd te maken met assenstelsels, kiemlagen en dergelijke. Daarvoor wordt het boek Human Embryology and Developmental Biology (Carlson), hoofdstuk 5 & 6 aangeraden.

Beschrijving:

De cursus zet de stadia en moleculaire mechanismen van de ontwikkeling van dieren, vooral zebravisjes en xenopus, uiteen. De bedoeling is uiteindelijk dat je de termen en mechanismen die daarbij komen kijken kunt uitleggen, en dat je dit toe kunt passen op experimentele resultaten (zoals staining experiments en knock-down experiments). Met dit laatste oefen je met het computerpracticum.

Werkvormen:

• 4 uur demonstratiepracticum

Aan het begin van het vak zit een kijk-en-tekenpracticum. Je observeert zebravisembryo’s en probeert het ontwikkelingsstadium te bepalen. Dit is een goede oefening, aangezien je het later tijdens het computerpracticum ook moet kunnen, maar wel een beetje saai aangezien je de embryo’s ook na moet tekenen.


De colleges worden gegeven aan de hand van het boek. Vrijwel alles is hierin terug te vinden, dus je kunt het vak in principe ook volgen zonder de colleges bij te wonen. De colleges worden wel goed gegeven: het Engels van de docenten is zeer goed en de colleges zijn onderhoudend.

• 16 uur computerpracticum

Het computerpracticum wordt nog volop geëvalueerd, omdat het nog maar één jaar gegeven is. Het bestaat uit experimentele resultaten die je moet interpreteren. Uiteindelijk is er ook een toets over. Aanwezigheid bij alle computerpractica is verplicht (3x oefenen en 1x toets).

• 8 uur werkcollege (“Q&A sessions”)

Versie 5 29-06-14

Elk onderdeel van het vak wordt afgesloten met een verplicht werkcollege. De vragen hiervoor komen gewoon uit het boek. In principe wordt verwacht dat je de vragen van tevoren maakt, maar in de praktijk is dat totaal niet nodig: dan heb je daar niets meer te doen. Zowel het computerpracticum als de Q&A sessions doe je in tweetallen. Bij aanvang van het vak schrijf je je via blackboard in als tweetal, en daarna werk je de rest van het kwartaal samen.

Literatuur:

-

Tentaminering:

80% van het eindcijfer wordt bepaald door het tentamen. De werkcollege-opdrachten zijn hier erg representatief voor, dus is het niet heel moeilijk voor te bereiden. De overige 20% van het cijfer komen van de computerpracticum-toets.

Bijzonderheden:

Er zit een interactieve component in de hoorcolleges: af en toe komen er vragentussendoor, die je kunt beantwoorden met je smartphone of tablet. De docent kan zien hoeveel procent van de studenten het goed had en hiermee bijhouden of de stof van die dag goed begrepen is. Dit systeem wordt ook gebruikt om het vak te evalueren: na de colleges krijg je de mogelijkheid om feedback te geven en nog een laatste vraag te beantwoorden om te zien of je alles goed begrepen hebt. Het nadeel is dat dit niet bij alle docenten even goed werkt: soms zijn de vragen te makkelijk en heeft het niet veel toegevoegde waarde.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

2.2.7. Nanobiotechnologie


Docenten:

R.E. Brock K.G. Blank J.C.M. van Hest

Voorkennis:

-

Beschrijving:

De cursus zal verschillende aspecten van toepassingen van nanobiotechnologie in medicijn-afgifte en diagnostiek behandelen, naast methoden en microsystemen die noodzakelijk zijn voor controle, manipulatie en analyse van nanostructuren. Het vak is opgedeeld in 4 blokken: deze gaan verschillende onderwerpen. Chemisch, biologische toepassen en microscopische technieken worden behandeld. Dit vak is voor zowel MLW’ers als scheikundigen goed te volgen. Het geeft een goed beeld van de huidige mogelijkheden van nanotechnologie. Een vak wat hierbij aansluit/overlapt is single molecule studies.

Werkvormen:

24 uur hoorcollege

Sinds 2012 wordt het vak opgenomen met een handcamera. De kwaliteit hiervan is niet geweldig. Dit wordt waarschijnlijk snel verbeterd zodat alles te volgen is via video. De colleges zijn je enige handvat voor de kennis. Er is geen dictaat of boek beschikbaar. De powerpoints op zich zijn vaak niet duidelijk genoeg als je het verhaal er niet bij hebt. Deze bestaan namelijk uit veel plaatjes en weinig uitleg.

16 uur practicum

Practicum is verplicht. Je doet 4 practica over verschillende afdelingen van zowel NCMLS en Huygens. Je hoeft hiervoor niets voor te bereiden en er zitten geen verslagen aan vast. Het wordt gebruikt om de stof beter te begrijpen en om je een beeld te geven van de mogelijkheden.

8 uur werkcollege

In de semi-verplichte werkgroepen wordt er aan de hand van artikelen gekeken of je theorie kan toepassen. Je krijgt vragen over het artikel, wat aansluit bij het college van die week.

6 uur responsie-college

Versie 5 29-06-14

Literatuur:

-

Tentaminering:

Er is een schriftelijk tentamen. Hierin wordt door iedere docent een aantal vragen gesteld gelijk verdeeld. Dit zijn redelijk gedetailleerde vragen over letterlijk de stof, maar ook enkele toepasvragen. Het tentamen is redelijk representatief, maar zeker niet al te moeilijk. Deze telt voor 50% mee, en je moet minimaal een 5 halen.

Ook een onderdeel is het schrijven van een script en het geven van een presentatie over een toegewezen artikel. Bij het script moet je je artikel in bredere context uitleggen en meer achtergrond informatie vergaren. Bij de presentatie moet je je artikel alleen maar presenteren. Je krijgt voor beide genoeg tijd, gezien het wordt ingepland met zelfstudie uren. Beide onderdelen tellen voor 25% mee en je moet minimaal een 5 halen.

Bijzonderheden:

Blank en Brock geven volgens velen moeilijk te volgen colleges. De stof is vrij droog. Verder is de organisatie niet heel goed geregeld, gezien er veel roosterwijzingen op het laatste moment plaatsvonden. Het is dus af te raden dit vak naast een ander vak op dezelfde dag te volgen.

Het grootste deel wat behandeld wordt over microscopen is in het vak microscopische technieken voor scheikundigen al behandeld. Echter wordt deze informatie wel verder uitgediept naar de specifieke toepassingen.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

2.2.8. Stereoselectieve synthese


Docenten:

F.P.J.T. Rutjes M.C. Feiters

Voorkennis:

Organische chemie

Beschrijving:

Dit vak is een vervolg op het vak organische chemie dat een kwartaal eerder gegeven wordt. De structuur van dit vak heeft er ook veel van weg. Er worden voornamelijk reacties behandeld waarmee je de stereochemie van een molecuul kunt sturen of waarbij deze van belang is.

Het is zeer goed te volgen voor scheikundigen en MLW’ers, zolang er affiniteit met organische chemie is. In principe wordt dit vak in het Engels gegeven, in de praktijk blijkt dit niet altijd het geval te zijn.

Werkvormen:

Hoorcollege 16 uur

Het hoorcollege behandeld alle stof en volgt nou op het boek dat hierbij gebruikt wordt. De colleges zijn helder en goed gegeven. Alleen de colleges van Martin Feiters worden door sommigen als saai beoordeeld. Het geeft een goed beeld van wat behandeld wordt en de colleges zijn echt nuttig.

Werkcollege 16 uur

Het werkcollege moet echt serieus gemaakt worden wil je het vak halen. De vragen zijn behoorlijk pittig en van hetzelfde niveau als de vragen van het tentamen. Daarnaast was de werkcollege assistent, Daniel Blanco-Ania, echt zeer betrokken en aan hem had je veel voor je tentamen.

Literatuur:

Clayden, Greeves, Warren and Wothers, Organic Chemistry, Oxford University Press 2001

Dit boek is zeer nuttig en behandeld de stof die je moet kennen. Het kan goed worden gebruikt als naslagwerk tijdens de werkcolleges en om uit te leren voor je tentamen.

Tentaminering:

De tentaminering bestaat uit een schriftelijk tentamen. Het niveau van de vragen is gelijk aan die uit het werkcollege en vooral belangrijk is dat je de reacties uit het college kent inclusief de reactiecondities.

Versie 5 29-06-14

Bijzonderheden:

-

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

3. Kwartaal 3


Versie 5 29-06-14

Versie 5 29-06-14

3.2. Keuze vakken

3.2.1. Chemical Neuroscience

Geschreven op: 23-6-2014 Gevolgd in:

Docenten:

A. Aschrafi

Voorkennis:

Geen.

Beschrijving:

Chemical Neuroscience is een inleidend vak over de hersenen, neurotransmitters en de invloed van verschillende drugs daarop. Daarnaast komen nog een aantal onderzoekstechnieken aan bod. Het vak is in eerste instantie bedoeld voor scheikundigen, dus biologische basiskennis over de hersenen komt ook aan bod. Voor andere studies is het vak zeker ook interessant, maar die kunnen sommige onderwerpen al gedeeltelijk behandeld hebben.

Werkvormen:


Je krijgt iedere week 2 uur hoorcollege

• 8-10 uur Journal club

Inclusief zelfstudie

Literatuur:

Basic Neurochemistry, Eighth Edition: Principles of Molecular, Cellular, and Medical Neurobiology http://www.sciencedirect.com/science/book/9780123749475#ancp1

Dit boek kon in 2013-2014 niet geleverd worden. Relevante hoofdstukken kwamen op internet, maar werden alsnog nauwelijks gebruikt.

Tentamenering:

Journal club: Je moet in drietallen een presentatie geven over een wetenschappelijk artikel.

Essay: Over het onderwerp van je presentatie moet je ook een kort essay inleveren. (Met de uitgeschreven tekst van je presentie ben je er al bijna.)

http://www.sciencedirect.com/science/book/9780123749475#ancp1

Versie 5 29-06-14

Tentamen: Er is ook een tentamen. Hierbij is het van belang om de powerpoints goed te kennen.

Bijzonderheden:

Het is met nadruk een inleidend vak. Als je al wel neuro-voorkennis hebt, zul je minder nieuwe dingen leren. De hoeveelheid werk per EC verhouding is bij dit vak bijzonder gunstig.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

3.2.2. Humane en Ecologische Risicobeoordeling (HERA)


Docenten:

M.A.J. Huijbregts A.M.J. Ragas

Voorkennis:


Beschrijving:

Deze cursus is een combinatie van Toxicologie, Miliechemie en Duurzaamheid en Milieuchemie en Toxicologie. Stapsgewijs wordt de milieuprobleemketen behandeld waarbij meer diepgang wordt aangebracht dan in voorgenoemde cursussen. Ook is meer aandacht voor ecotoxiciteit, waarbij dus wordt gekeken naar toxiciteit voor planten, dieren en de voedselketen als geheel. De eerste helft van de cursus zal bekend voorkomen bij degene die voorgenoemde cursussen gevolgd hebben. Tegen de tweede helft van de cursus komen een hoop nieuwe dingen aan bod. De cursus als geheel is de meest complete cursus als het gaat om milieuchemie en milieu/humane toxicologie.

Werkvormen:

Hoorcolleges: De hoorcolleges zijn een goede inleiding, maar niet uiterst informatief. Zeker niet de eerste weken. Tijdens de hoorcolleges worden regelmatig vragen gesteld aan de aanwezigen. Participatie wordt zeer op prijs gesteld en stilte absoluut niet.

Werkcolleges: Maak deze zorgvuldig. Ze zijn een goede oefening op het tentamen. Het scheelt als je bepaalde berekeningen al een keer hebt uitgevoerd. Dan hoef je namelijk alleen nog maar het gebruikte recept te volgen en dit scheelt tijd.

Responsiecolleges: Afhankelijk van het onderwerp kunnen deze heel handig zijn. Er worden geen uitwerkingen geleverd van de werkcolleges, dus als je een vraag hebt over een opgave moet je deze zeker stellen tijdens deze responsiecolleges en zorg dat je het antwoord goed opschrijft. Het kan voorkomen dat een tentamenvraag sterk lijkt op een werkcollegeopgave.

Project: In het project wordt een risicoanalyse uitgevoerd van een bepaalde milieugevaarlijke stof. Alle aspecten van de eerste weken komen hierin voorbij. Er wordt van je verwacht dat je de probleemketen opdeelt in stukken en verdeelt onder de groepsleden. Dit is echter erg onwerkbaar, omdat je de resultaten van onderdeel A nodig hebt voor onderdeel B. Hak dus de keten in grotere stukken en werk met meerdere mensen aan één stuk. Houd er rekening mee dat een deel van het project midden in een tentamenweek gepland kan zijn.

Versie 5 29-06-14

Literatuur:

Literatuur wordt verstrekt via Blackboard. Aanvullend wordt verwezen naar Risk Assessment of Chemicals: an Introduction van C.J. van Leeuwen. Dit is een peperduur boek waarvan enkele exemplaren in het studielandschap staan. Excerpten worden via blackboard in pdf geleverd, maar het kan soms fijn zijn om dit boek even te raadplegen voor de volledige tekst. Goed googlen levert ook een pdf-versie.

Tentaminering:

De cursus wordt afgesloten met een groepsproject en een open boek tentamen. Het project is omvangrijk en een hoop werk. Aan het eind zal hierover een korte presentatie gehouden moeite worden. Houd rekening met kritische vragen. Ook het open boek tentamen kan pittig zijn, ook al mag je alles erbij houden. Het helpt als je de werkcolleges serieus maakt en zodoende oefent met de stof, want veel vragen zijn heel specifieke toepassingsvragen. Er worden geen proeftentamens verstrekt en het is SOG ook niet toegestaan deze te verstrekken. Ze bestaan wel.

Bijzonderheden:

Dit vak is verplicht als je een stage of master aan de afdeling milieukunde wil doen.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

3.2.3. Moleculaire basis van ziekten


Docenten:

R. Brock (maar je krijgt college van ongeveer 20 verschillende docenten)

Voorkennis:


Beschrijving:

Deze cursus is opgebouwd in drie delen: genetica, immunologie en metabolisme. Het genetica en immunologie deel overlapt voor een groot deel met de cursussen Genetica en immunologie. Omdat je te maken hebt met verschillende docenten die het vak geven, zijn ze niet op de hoogte van wat de andere docenten al hebben uitgelegd. Verder is er de ervaring dat, omdat het docenten van de medische faculteit zijn, ze niet weten wat de voorkennis van MLW’er zijn. Het vak geeft niet veel diepgang in het moleculaire aspect, maar is heel klinisch/ medisch benaderd.

Werkvormen:

16 uur computerpracticum

Het computerpracticum is gewoon een werkcollege waarbij je vragen moet maken. Deze zijn gewoon bedoeld om je kennis op te halen over genetica en je kennis van het hoorcollege toe te passen op vragen

18 uur hoorcollege

De hoorcolleges worden opgenomen. Zoals eerder genoemd is er veel overlap in de stof die in de colleges wordt verteld. De colleges zijn goed te volgen.


Hierin worden vragen besproken die over de stof gaan. De vragen lijken op vragen die in het tentamen gesteld kunnen worden. Het zijn zowel kennisvragen als toepasvragen, waardoor je goed kan controleren of je de stof goed hebt begrepen en kan toepassen.

Literatuur:

Er is geen literatuur beschikbaar bij dit vak. Daarom is het sterk aan te raden om de colleges te volgen. Er is een samenvatting beschikbaar gesteld via het vak, maar deze is niet volledig en nog gebaseerd op de oude inhoud van het vak.

Tentaminering:

Versie 5 29-06-14

Het tentamen bestaat uit ongeveer 20 open vragen, waarbij over ieder college een vraag gaat. Dit zorgt er wel voor dat het tentamen goed representatief is voor het vak. In het jaar 2012/2013 waren er echter wel veel vragen letterlijk hetzelfde als die uit oefententamen uit de syllabus. Er zitten verschillende vragen bij zoals letterlijke kennisweetjes, maar ook het zelf bedenken van experimenten.

Bijzonderheden:

-

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

3.2.4. Structuur, functie en bioinformatica


Docenten:

G. Vriend

Voorkennis:

Bioinformatica 1

Beschrijving:

Structuur, functie en bioinformatica bouwt eigenlijk voort op de bioinformatica cursus die in het tweede jaar wordt gegeven. Het gaat over vouwingsmotieven, structurele aspecten zoals transcriptie, transmembraan signaal-transductie and transport en mobiliteit. Ook gaat het over verschillende bioinformatica methoden (moleculaire dynamica, machine learning, homologie modeleren, force fields).

Werkvormen:

120 uur computerpracticum

Je bent van kwart over negen tot vijf aanwezig en in die tijd doe je veel opgaves en lees je veel theorie, zoals ook bij bioinformatica A. Op deze manier behandel je de stof en leer je het ook gelijk toe te passen

16 uur hoorcollege

De hoorcolleges worden tussendoor gegeven. Hierbij wordt de stof behandeld.

Literatuur:

Er is geen literatuur nodig voor dit vak. Alles staat op de site van het vak.

Tentaminering:

Project:

In het project ben je twee weken bezig met het toepassen van alle theorie die je hebt gehad. In groepjes van ongeveer vijf mensen schrijf je een verslag over een proteïne.

Tentamen:

Er is ook een tentamen. Deze bestaat voor een deel uit al gebruikte vragen die op de site staat, en verder nieuwe vragen. Het tentamen lijkt op dat van bioinformatica A.

Bijzonderheden:

Versie 5 29-06-14

Meestal volgen maar een aantal mensen dit vak. Daarom zit je maar met een stuk of tien mensen bij het CMBI en krijg je af en toe ook 1 op 1 les van Vriend zelf.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

4. Kwartaal 4


Versie 5 29-06-14

Versie 5 29-06-14

4.2. Keuze vakken

4.2.1. Biochemie-Moleculaire biologie II


Docenten:

G.J.M. Pruijn H.G. Stunnenberg G.J.C. Veenstra C. Logie J.H.A. Martens R.C. Bartfai

Voorkennis:

Biomoleculen, Biochemische Processen, DNA-technologie.

Beschrijving:

Het vak gaat voornamelijk over alle aspecten van DNA. Het vak wordt gegeven door 4 docenten die allen een eigen onderwerp hebben:

DNA-structuur, replicatie, recombinatie en repair

Regulatie van transcriptie bij prokaryoten en eukaryoten en transcript verwerking bij eurkaryoten

Cel-autonome controle van de celcyclus

Kanker

De onderwerpen sluiten goed bij elkaar aan, zodat het een goed geheel wordt. De opbouw is erg goed, want er wordt begonnen met de basics van DNA en het hele proces wat DNA daarna ondergaat wordt uitgelegd. Het vak is ook beschikbaar voor scheikundigen, maar dit is echter af te raden, tenzij biomoleculen goed beviel. Het is een heel erg biologisch vak.

Werkvormen:

24 uur hoorcollege

Hierin wordt alle tentamen stof behandeld. De colleges worden niet opgenomen. Je kan veel nalezen in het boek, maar aanwezigheid is zeker aan te raden.

1.2 uur individuele begeleiding

Versie 5 29-06-14

4.2 uur presentatie door studenten

28.2 uur projectwerk

Je krijgt een artikel waar je een presentatie over moet geven. Je krijg een middag waarbij je met de docent overlegd wat je niet begrijpt en hoe je het moet aanpakken verder en of je het artikel snapt. Verder is alles op eigen verantwoordelijkheid en zelf inplannen.


10 uur werkcollege

Voor het werkcollege beantwoord je vragen over het college. Deze antwoorden zijn terug te vinden in het boek of in de collegesheet. Deze worden daarna in kleine groepjes besproken in 2 uur. Deze werkcolleges zijn om de week. Het is een handige manier om wat onderdelen van de stof te begrijpen.

Literatuur:

In het boek staat duidelijk alle stof uitgelegd dat in de college wordt uitgelegd. Het is dus een goede manier om alles op na te zoeken.

Tentaminering:

Er is een schriftelijk tentamen. Hierin wordt door iedere docent een aantal vragen gesteld gelijk verdeeld. Dit zijn redelijk gedetailleerde vragen over letterlijk de stof. Het is een representatief tentamen over alle onderwerpen.

Bijzonderheden:

Journal club: Dit is het geven van een presentatie over een artikel over een onderwerp wat wordt besproken in de colleges.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

5. Niet in curriculum Moleculaire Wetenschappen 2014-2015

5.1. Uit een vorige studiegids

5.1.1. Klimaatverandering – Wetenschap & Beleid


Docenten:

A. Bregman

Voorkennis:


Beschrijving:

In deze cursus wordt klimaatverandering vooral kritisch benaderd. Kritisch vanuit economisch perspectief, waarbij je leert dat niet altijd voorzorgsmaatregelen worden genomen met het ergste scenario voor ogen. Daarnaast is er ook ruimte voor wetenschappelijke kritiek. Bij welke wetenschappelijke ‘feiten’ kunnen kanttekeningen geplaatst worden? Het is verfrissend om eens een cursus te volgen waarbij klimaatverandering niet als vaststaand feit wordt beschouwd. Alleen al daarom is het een interessante cursus voor geïnteresseerde in milieuwetenschappen. Daarnaast is dit één van de weinige cursussen waarbij een duidelijk link wordt gelegd tussen wetenschap en beleid. Beleid op wereldschaal, zoals in het IPCC, maar ook beleid op regionale schaal, zoals bijvoorbeeld in de vaak overstromende stad Dordrecht.

Werkvormen:

Hoorcolleges: Er zijn 16 uur aan hoorcolleges gepland, met onder andere praatjes van externen. De colleges hebben een goede informatiedichtheid, zijn goed te volgen en interessant door het enthousiasme van Bram.

Werkcolleges: Deze helpen met het voorbereiden op het tentamen en om nog eens kritisch in de stof te duiken. Er wordt een bonuspunt uitgedeeld op basis van de kwaliteit van ingeleverde werkcolleges. Toch is het vak ook goed te doen zonder enig werkcollege te maken dankzij de goede hoorcolleges en het duidelijke boek.

Literatuur:

Er is in het verleden gebruik gemaakt van het boek The Science and Politics of Global Climate Change van Dessler en Parson, maar in de huidige officiële studiegids staat deze niet meer als literatuur vermeld. Het boek is praktisch in voorbereiding op de toets, maar kan gemist worden als je de hoorcolleges volgt en de beschikbare samenvatting doorleest.

Versie 5 29-06-14

Tentaminering:

Voorheen was dit een gesloten boek tentamen, maar in de huidige officiële studiegids wordt hier vaag over gedaan. Zoals al gezegd, tellen ook uitwerkingen van werkcolleges mee als bonuspunt

Bijzonderheden:

Aan het eind van de cursus vind een klimaatdebat plaats waarin je in een landenblok wordt gezet en je moet verdiepen in de standpunten van dit landenblok. Vervolgens wordt een regel uit een IPCC rapport genomen en samen met je landenblokgenoten probeer je deze regel in jouw voordeel om te schrijven (of je laat het zo). Vervolgens ga je proberen te lobbyen bij andere landenblokken om een meerderheid te vinden voor jouw standpunt. Dit is erg leuk om te doen en zelfs mensen die niet van debatteren houden, werden bloedfanatiek. Dat wil je dus niet missen. Verder kan het zijn dat Bram als Nederlands afgevaardigde van de IPCC gaat lobbyen onder studenten voor klusjes m.b.t. het IPCC. Dit kan een interessante ervaring zijn, wat je ook nog studiepunten kan opleveren. Al met al een interessante cursus voor mensen die beleidvoering interessant vinden, met nadruk op het klimaat.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

5.2. Uit de studiegids van een ander cluster

5.2.1. Water en Natuurbeheer


Docenten:

H.J.R. Lenders R.S.E.W. Leuven J.J.C.W. van Delft A.J.M. Smits W.C.E.P. Verberk

Voorkennis:

Geen voorkennis vereist. De cursus is net te doen voor MLW’ers en scheikundigen. Alles wat té biologisch is, moet je even aan één van je groepsgenoten vragen.

Beschrijving:

De cursus gaat in op alles wat komt kijken bij water en natte natuurgebieden. Het begin is theoretisch, waarbij aandacht is voor onderscheid tussen verschillende soorten natuurtypen, maar ook visies op natuurbeleid en natuurbeheer. Vervolgens wordt veel aandacht besteed aan de middelen die je nodig hebt en kunt gebruiken om de natuur in te richten naar gunstigere omstandigheden of volgens een beleidsplan. De cursus heeft uiterst weinig overlap met MLW of scheikunde. Het enige wat er een beetje op aansluit zijn de ver-thema’s, zoals verzuring, vermesting en vervuiling met schadelijke stoffen. Dit is dan wel uiteraard sterk toegespitst op aquatische systemen. Kort door de bocht zijn er voor moleculaire wetenschappers maar drie redenen aan te wijzen om dit vak te doen: 1) voor de lol, 2) uit milieukundig interesse of 3) voor de (6!) studiepunten.

Werkvormen:

Eens per week is er een hoorcollege, al dan niet gegeven door een gastdocent. De rest van de tijd is bestemd voor het doornemen van het boek en het maken van bijbehorende opgaven, waarvoor responsiecolleges gepland staan. Verder werk je met een groepje aan het opstellen van een beheerplan voor een bepaald natuurgebied, waarbij ieder groepje een eigen invalshoek meekrijgt. Houdt er rekening mee dat een deel van deze groepsopdracht midden in een tentamenweek gepland kan zijn. Vóór de groepsopdracht vind nog een excursie plaats naar relevante waterprojecten. Zorg dat je aanwezig bent en let goed op, want er kunnen tentamenvragen over gesteld worden.

Literatuur:

In de cursus wordt gebruik gemaakt van het uiterst gedateerde boek Natuurbeheer- en ontwikkeling. Dit boek is van de hand van onder andere de hoofddocent. Omdat hij zo’n gedateerd boek niet verplicht wil

Versie 5 29-06-14

stellen, maar wel wil gebruiken, stelt hij de boeken gratis beschikbaar aan de deelnemers. Je mag het boek zelfs houden na afloop van de cursus.

Tentaminering:

Het eindcijfer wordt bepaald op basis van een open boek tentamen en de groepsopdracht. Met een serieuze werkhouding (aanwezigheid hoorcolleges+excursie en maken van werkcolleges) is het tentamen goed te doen. De groepsopdracht kan veel tijd in gaan zitten en gaat makkelijk over de 20 blz.’s heen. De resultaten moeten ook gepresenteerd worden.

Bijzonderheden:

Omdat dit een duidelijk biologenvak is, zul je vrij eenzaam zijn bij deze cursus. Als je biologenschuw bent, zorg dan voor een MLW/scheikunde-buddy. Groepjes worden tijdens het eerste college onderling gevormd, dus je hoeft niet bang te zijn dat je dan in aparte groepjes terecht komt. Heb je biologengroepsgenoten lief, want je zult hun planten en dierenkennis vaak kunnen gebruiken tijdens het groepswerk.

Teacher Tips:

-

Versie 5 29-06-14

6. Index

6.1. Alfabetisch

Klik op de cursusnaam of het paginanummer om naar de betreffende pagina te springen. Cursusnaam Paginanummer Biochemie-Moleculaire biologie II 48 Biochemische Processen 14 Chemical Neuroscience 38 Debating Science in Society 20 Fysische organische chemie 20 Geografische Informatiesystemen (GIS) 24 Green Chemistry 26 Humane en Ecologische Risicobeoordeling (HERA) 38 Immunologie 28 Klimaatverandering – Wetenschap & Beleid 50 Milieuchemie & toxicologie 10 Moleculaire basis van ziekten 42 Moleculaire Structuur 16 Molecular Principles of Development 30 Nanobiotechnologie 28 Organische Chemie 10 Stereoselectieve synthese 34 Structuur, functie en bioinformatica 44 Water en Natuurbeheer 52 Wiskunde 2 18

Versie 5 29-06-14

6.2. Op cursuscode

Klik op de cursusnaam of het paginanummer om naar de betreffende pagina te springen.

Cursuscode Cursusnaam Paginanummer BB017C Biochemie-Moleculaire biologie II 48 BB019B Immunologie 28 BB048B Molecular Principles of Development 30 BB082B Milieuchemie & toxicologie 10 FC0042B Debating Science in Society 20 GCSE001 Klimaatverandering – Wetenschap & Beleid 50 MB021B Geografische Informatiesystemen (GIS) 24 MB023B Water en Natuurbeheer 52 MB024C Humane en Ecologische Risicobeoordeling (HERA) 38 MOL009 Wiskunde 2 18 MOL013 Biochemische Processen 14 MOL055 Moleculaire basis van ziekten 42 MOL066 Structuur, functie en bioinformatica 44 MOL078 Nanobiotechnologie 28 MOL080 Moleculaire Structuur 16 MOL091 Green Chemistry 26 MOL093 Stereoselectieve synthese 34 MOL094 Fysische organische chemie 20 MOL095 Organische Chemie 10 MOL097 Chemical Neuroscience 38

Alternatieve Studiegids

Documents

Transcript of Alternatieve Studiegids